有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

4,4′-二甲基-2,2′-[(3-氮杂戊烷-1,5-二基)双(硝基甲基碘)]二酚

西安建筑科技大学理学院,中国西安710055b条西安利邦药业有限公司,中国西安710086
*通信电子邮件:fangfangdang@yahoo.com.cn

(收到日期:2008年6月14日; 2008年6月22日接受; 2008年6月28日在线)

晶体结构标题Schiff base,C20H(H)25N个O(运行)2分子两端的水杨醛亚胺基团基本上是平面的,它们之间的二面角为84.94(3)°。分子内O-H…N氢键较强,分子间N-H…O氢键较弱。

相关文献

有关文献,请参阅:罗德里格斯·德·巴巴林等。(1994[罗德里格斯·德·巴巴林(Rodriguez de Barbarin,C.O.)、贝利(Bailey,N.A.)、芬顿(Fenton,D.E.&He,Q.)(1994)。《无机化学学报》,219205-207。]).

【方案一】

实验

水晶数据
  • C类20H(H)25N个O(运行)2

  • M(M)第页=339.43

  • 正交各向异性,P(P) c(c) 21

  • =9.132(4)Å

  • b条= 5.834 (3) Å

  • c(c)= 34.365 (16) Å

  • V(V)= 1830.8 (15) Å

  • Z轴= 4

  • K(K)α辐射

  • μ=0.08毫米−1

  • =296(2)K

  • 0.34×0.32×0.28毫米

数据收集
  • Bruker APEXII区域探测器衍射仪

  • 吸收校正:多扫描(SADABS公司; 谢尔德里克,1996年[Sheldrick,G.M.(1996),SADABS,德国哥廷根大学。])最小值= 0.970,最大值= 0.981

  • 14593次测量反射

  • 2125个独立反射

  • 1867次反射> 2σ()

  • R(右)整数= 0.031

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.037

  • 水风险(F类2) = 0.108

  • S公司= 1.07

  • 2125次反射

  • 228个参数

  • 1个约束

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=0.15埃−3

  • Δρ最小值=-0.18埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-小时 H月A类 D类A类 D类-H月A类
O1-H1型A类●N1 0.82 1.89 2.614 (4) 146
氧气-氢气A类●氮气 0.82 1.88 2.602 (3) 146
编号3-H3A类2010年1月 0.86 2.54 3.140 (3) 128
对称代码:(i)x个-1中,z(z).

数据收集:APEX2型(布鲁克,2004年[Bruker(2004),APEX2和SAINT.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊市]); 细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2004年[Bruker(2004),APEX2和SAINT.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊市]); 数据缩减:圣保罗; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司.

支持信息


注释顶部

据报道,Schiff-碱配体中酚酸基配位的锌可以作为亲核剂催化酯水解(Rodriguez de Barbarin等。,1994年)。这些结果促使我们研究通过还原获得的线性胺酚配体希夫碱,与相应产品相比,它们具有更大的灵活性、更好的水溶性和对水解分解的惰性希夫碱。虽然已经报道了它们与过渡金属和主族金属的一些配合物,但这些Schiff-base配体的晶体结构仍然相对未被探索。所以我们在这里展示晶体结构标题化合物的,N个N个’-双(5-甲基亚水杨基)-1,5-二氨基-3-氮杂戊烷,(I)。

(I)的分子结构如图1所示。化合物(I)是典型的具有正常几何参数的水杨醛希夫衍生物。连接到C-C-N-C-C主干末端的两个悬挂部件采用顺式构象。N3原子呈四面体特殊用途 杂交,而两个酰胺氮原子则显示为平面特殊用途2 杂交。C8-N1和C13-N2键显示出预期的双键特征。在我们的例子中,水杨醛亚胺部分几乎是平面的。水杨醛亚胺基团之间的二面角为84.94(3)°。这个晶体结构(I)通过分子内O-H··N氢键和分子间N-H··O氢键稳定(表1)。

相关文献顶部

有关文献,请参阅:罗德里格斯·德·巴巴林等。(1994).

实验顶部

N个-将(2-氨基乙基)乙烷-1,2-二胺(0.01 mol,1.03 g)和2-羟基-5-甲基苯甲醛(0.02 mol,2.72 g)溶解在乙醇中,并将溶液回流1 h。蒸发后,将粗产物从乙醇中重结晶两次,得到纯黄色产物。收益率:80.5%。计算。对于C20H(H)25N个O(运行)2:C 70.77,H 7.42,N 12.38;发现:C 71.02,H 7.47,N 12.27%。

精炼顶部

所有氢原子都是从不同的傅里叶图中定位的。然后将H原子放置在几何理想位置(C-H=0.93–0.97 Au,O-H=0.82 Au和N-H=0.86 Au),并约束其骑在其母原子上U型国际标准化组织(H) =1.2U型等式(C,N)或1.5U型等式(O) ●●●●。如果没有重要的反常散射结果,弗里德尔对被合并了。

计算详细信息顶部

数据收集:APEX2型(布鲁克,2004);细胞精细化: 圣保罗(布鲁克,2004);数据缩减:圣保罗(布鲁克,2004);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。(I)的结构,显示了30%概率位移椭球体和原子编号方案。
4,4'-二甲基-2,2'-[(3-氮杂戊烷-1,5-二基)双(腈基甲基亚胺)]二苯酚顶部
水晶数据 顶部
C类20H(H)25N个O(运行)2F类(000) = 728
M(M)第页= 339.43D类x个=1.231毫克负极
正交各向异性,P(P)c(c)21K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
大厅符号:P2c-2ac2105次反射的单元参数
= 9.132 (4) Åθ= 1.0–27.5°
b条= 5.834 (3) ŵ=0.08毫米负极1
c(c)= 34.365 (16) Å=296千
V(V)= 1830.8 (15) Å块,黄色
Z轴= 40.34×0.32×0.28毫米
数据收集 顶部
Bruker APEXII区域探测器
衍射仪
2125个独立反射
辐射源:细焦点密封管1867次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.031
ϕω扫描θ最大值= 27.5°,θ最小值= 2.4°
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
小时=负极1111
最小值= 0.970,最大值= 0.981k个=负极77
14593次测量反射=负极4444
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.037氢站点位置:根据邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.108受约束的氢原子参数
S公司= 1.07 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0588P(P))2+ 0.2052P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
2125次反射(Δ/σ)最大值< 0.001
228个参数Δρ最大值=0.15埃负极
1个约束Δρ最小值=负极0.18埃负极
水晶数据 顶部
C类20H(H)25N个O(运行)2V(V)= 1830.8 (15) Å
M(M)第页= 339.43Z轴= 4
正交各向异性,P(P)c(c)21K(K)α辐射
= 9.132 (4) ŵ=0.08毫米负极1
b条= 5.834 (3) Å=296千
c(c)= 34.365 (16) Å0.34×0.32×0.28毫米
数据收集 顶部
Bruker APEXII区域探测器
衍射仪
2125个独立反射
吸收校正:多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
1867次反射> 2σ()
最小值= 0.970,最大值= 0.981R(右)整数= 0.031
14593次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0371个约束
水风险(F类2) = 0.108受约束的氢原子参数
S公司=1.07Δρ最大值=0.15埃负极
2125次反射Δρ最小值=负极0.18埃负极
228个参数
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单元e.s.d.单独考虑;只有当e.s.d.的胞内参数由晶体对称性定义时,才使用它们之间的相关性。单元e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2在统计上大约是基于F类、和R(右)-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式
O1公司0.8321 (3)1.4932 (4)0.36346 (6)0.0766(7)
甲型H1A0.88621.41810.34930.115*
氧气0.7661 (2)0.0213 (3)0.18913 (5)0.0594 (5)
过氧化氢0.83050.09600.19990.089*
N1型1.0105 (2)1.1600 (4)0.34511 (6)0.0506 (5)
氮气0.9202 (2)0.3855 (3)0.20445 (5)0.0479 (4)
N3号机组1.0062 (2)0.7202 (3)0.29474 (6)0.0520 (5)
H3A型1.02100.65830.31710.062*
C1类0.8251 (3)1.0370 (4)0.43648 (7)0.0455 (5)
H1C型0.86860.89600.44160.055*
指挥与控制0.6782 (4)0.9888 (6)0.49830 (9)0.0762 (9)
过氧化氢0.75440.88300.50510.114*
过氧化氢0.58950.90590.49310.114*
过氧化氢0.66221.09330.51950.114*
C3类0.7226 (3)1.1209 (4)0.46259 (7)0.0495 (6)
补体第四成份0.6605 (3)1.3338 (5)0.45429 (7)0.0545 (6)
H4A型0.59231.39470.47150.065*
C5级0.6967 (3)1.4566 (4)0.42153 (8)0.0563 (6)
H5A型0.65261.59770.41700.068*
C6级0.7992 (3)1.3710 (4)0.39506 (7)0.0487 (5)
抄送70.8657 (2)1.1551(4)0.40291(6)0.0399 (5)
抄送80.9752 (2)1.0605 (4)0.37676 (7)0.0437 (5)
H8A型1.02080.92330.38330.052*
C91.1263(3)1.0645 (5)0.32037 (7)0.0584 (7)
H9A型1.18360.95600.33540.070*
H9B型1.19111.18710.31220.070*
C10号机组1.0648 (3)0.9444 (4)0.28455 (7)0.0532 (6)
H10A型0.98791.03760.27320.064*
H10B型1.14160.92660.26530.064*
C11号机组0.9210 (3)0.6085 (4)0.26450 (6)0.0472 (5)
H11A型0.84770.71520.25500.057*
H11B型0.86980.47880.27580.057*
第12项1.0123 (3)0.5243 (5)0.23003 (7)0.0521 (6)
H12A型1.05100.65430.21580.063*
第12页1.09400.43350.23940.063*
第13页0.8784 (3)0.4705 (4)0.17204(7)0.0441 (5)
H13A型0.91250.61430.16470.053*
第14项0.7784 (2)0.3473 (3)0.14626 (6)0.0412 (5)
第15页0.7306 (3)0.4500 (4)0.11167 (7)0.0466 (5)
高度15a0.76830.59250.10480.056*
第16号0.5766 (4)0.4651 (6)0.05050 (9)0.0746 (8)
H16A型0.47340.43990.04740.112*
H16B型0.62790.40360.02850.112*
H16C型0.59550.62660.05240.112*
第17页0.6291 (3)0.3464 (4)0.08737 (7)0.0519 (6)
第18号0.5756(3)0.1310(4)0.09836 (8)0.0562 (6)
H18A型0.50740.05820.08250.067*
第19号0.6215 (3)0.0237 (4)0.13212 (8)0.0534(6)
H19A型0.5838负极0.11930.13870.064*
C20个0.7242 (3)0.1288 (4)0.15635 (7)0.0448 (5)
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
O1公司0.0892 (16)0.0680 (11)0.0725 (13)0.0077 (11)0.0161 (12)0.0338 (10)
氧气0.0733 (12)0.0477 (9)0.0574 (10)0.0009 (8)0.0025 (9)0.0103 (8)
N1型0.0448 (10)0.0629 (12)0.0440 (10)负极0.0085 (9)0.0049 (8)负极0.0061 (9)
氮气0.0467(10)0.0535 (11)0.0434 (10)0.0017 (9)0.0034 (9)负极0.0054 (9)
N3号机组0.0551 (11)0.0628 (12)0.0381 (9)负极0.0069 (10)负极0.0017 (9)0.0057 (9)
C1类0.0484 (13)0.0446 (11)0.0435 (12)0.0005 (9)负极0.0054 (10)0.0057 (9)
指挥与控制0.091 (2)0.085 (2)0.0526 (15)负极0.0057 (18)0.0175 (17)0.0134 (15)
C3类0.0516 (14)0.0570(13)0.0400(12)负极0.0081 (11)0.0041 (10)0.0013 (10)
补体第四成份0.0518 (14)0.0562 (14)0.0554 (14)负极0.0016 (11)0.0111 (11)负极0.0116(11)
C5级0.0554 (15)0.0471 (12)0.0664 (16)0.0058 (11)0.0051 (13)0.0010 (11)
C6级0.0491 (13)0.0460 (12)0.0511 (12)负极0.0032 (10)负极0.0004 (10)0.0066 (10)
抄送70.0378 (11)0.0429 (10)0.0391 (11)负极0.0038 (8)负极0.0007 (9)负极0.0001 (8)
抄送80.0377 (11)0.0502 (12)0.0432 (11)负极0.0037 (9)负极0.0034 (9)负极0.0039 (9)
C90.0437 (13)0.0815 (17)0.0501 (13)负极0.0115 (13)0.0066 (11)负极0.0145 (13)
C10号机组0.0551 (14)0.0640 (14)0.0405 (12)负极0.0100 (11)0.0078 (11)负极0.0025 (11)
C11号机组0.0450 (12)0.0540 (12)0.0427 (12)负极0.0070 (10)0.0053 (10)负极0.0001 (10)
第12项0.0410 (11)0.0667 (14)0.0487 (13)0.0014(11)0.0006 (10)负极0.0066(11)
第13页0.0424 (11)0.0437(11)0.0463 (12)负极0.0010 (9)0.0062 (9)负极0.0030 (9)
第14项0.0428 (11)0.0384 (10)0.0422 (11)0.0013 (9)0.0085(9)负极0.0041 (9)
第15页0.0522 (13)0.0417 (11)0.0460 (12)负极0.0025 (10)0.0059 (10)负极0.0008 (9)
第16号0.089 (2)0.083 (2)0.0516 (15)负极0.0001 (18)负极0.0152 (15)0.0008(14)
第17页0.0567 (15)0.0551 (13)0.0438 (12)0.0038 (11)0.0019 (11)负极0.0057 (10)
第18号0.0580 (15)0.0545 (14)0.0559 (15)负极0.0049 (11)0.0013 (12)负极0.0167 (12)
第19号0.0575 (15)0.0396 (11)0.0632 (15)负极0.0071 (10)0.0107 (12)负极0.0086 (11)
C20个0.0494 (12)0.0386 (11)0.0463 (12)0.0021 (9)0.0108 (10)负极0.0029 (9)
几何参数(λ,º) 顶部
O1-C6型1.333 (3)C9-H9A型0.9700
O1-H1A型0.8200C9-H9B型0.9700
O2-C20型1.345 (3)C10-H10A型0.9700
氧气-H2A0.8200C10-H10B型0.9700
N1-C8型1.274 (3)C11-C12号机组1.530 (3)
N1-C9型1.467(3)C11-H11A型0.9700
N2-C13型1.277 (3)C11-H11B型0.9700
N2-C12型1.461(3)C12-H12A型0.9700
编号3-C111.453 (3)C12-H12B型0.9700
N3-C10型1.456 (3)C13至C141.461 (3)
N3-H3A型0.8600C13-H13A型0.9300
C1至C31.386(3)C8-H8A型0.9300
C1-C7号机组1.394 (3)C14-C15号1.401 (3)
C1-H1C型0.9300C14-C20型1.411 (3)
C2-C3型1.505 (4)2015年至2017年1.386(3)
C2-H2B型0.9600C15-H15A型0.9300
C2-H2C型0.9600C16-C17号1.521 (4)
C2-H2D型0.9600C16-H16A型0.9600
C3-C4型1.395 (4)C16-H16B型0.9600
C4-C5型1.375 (4)C16-H16C型0.9600
C4-H4A型0.9300C17-C18型1.400 (4)
C5至C61.397 (3)第18页至第19页1.383 (4)
C5-H5A型0.9300C18-H18A型0.9300
C6至C71.424 (3)C19-C20型1.396 (3)
C7-C8号机组1.453 (3)C19年1月19日0.9300
C9-C10型1.524 (3)
C6-O1-H1A型109.5编号:N3-C11-C12113.95 (19)
C20-O2-H2A型109.5N3-C11-H11A型108.8
C8-N1-C9型120.3 (2)C12-C11-H11A型108.8
C13-N2-C12型118.8 (2)N3-C11-H11B型108.8
C11-N3-C10型115.3 (2)C12-C11-H11B型108.8
C11-N3-H3A型122.3H11A-C11-H11B型107.7
C10-N3-H3A型122.3N2-C12-C11型109.28 (19)
C3-C1-C7型122.7(2)N2-C12-H12A型109.8
C3-C1-H1C118.6C11-C12-H12A型109.8
C7-C1-H1C型118.6N2-C12-H12B型109.8
C3-C2-H2B109.5C11-C12-H12B型109.8
C3-C2-H2C109.5H12A-C12-H12B型108.3
H2B-C2-H2C型109.5N2-C13-C14121.6 (2)
C3-C2-H2D109.5N2-C13-H13A型119.2
H2B-C2-H2D型109.5C14-C13-H13A型119.2
H2C-C2-H2D型109.5N1-C8-C7型121.9 (2)
C1-C3-C4117.2 (2)N1-C8-H8A型119
C1-C3-C2型122.0 (2)C7-C8-H8A型119
C4-C3-C2型120.9 (2)C15-C14-C20型119.0 (2)
C5-C4-C3122.3 (2)C15-C14-C13型119.9 (2)
C5-C4-H4A118.9C20-C14-C13型121.0 (2)
C3-C4-H4A型118.9C17-C15-C14型122.2 (2)
C4-C5-C6120.5 (2)C17-C15-H15A型118.9
C4-C5-H5A型119.7C14-C15-H15A型118.9
C6-C5-H5A型119.7C17-C16-H16A型109.5
O1-C6-C5型119.4 (2)C17-C16-H16B型109.5
O1-C6-C7型122.0 (2)H16A-C16-H16B109.5
C5-C6-C7118.6 (2)C17-C16-H16C型109.5
C1-C7-C6118.7 (2)H16A-C16-H16C型109.5
C1-C7-C8型120.4 (2)H16B-C16-H16C型109.5
C6-C7-C8型120.8 (2)C15-C17-C18型117.5 (2)
N1-C9-C10型112.2 (2)C15-C17-C16120.9 (2)
N1-C9-H9A型109.2C18-C17-C16121.5 (3)
C10-C9-H9A型109.2C19-C18-C17121.8 (2)
N1-C9-H9B型109.2C19-C18-H18A型119.1
C10-C9-H9B型109.2C17-C18-H18A型119.1
H9A-C9-H9B107.9C18-C19-C20型120.3 (2)
编号3-C10-C9110.8 (2)C18-C19-H19A型119.8
N3-C10-H10A型109.5C20-C19-H19A型119.8
C9-C10-H10A109.5氧气-C20-C19119.1 (2)
N3-C10-H10B型109.5O2-C20-C14型121.8 (2)
C9-C10-H10B109.5C19-C20-C14号119.1 (2)
H10A-C10-H10B108.1
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-小时···A类D类-小时H(H)···A类D类···A类D类-小时···A类
O1-H1型A类···1个0.821.892.614 (4)146
氧气-氢气A类···氮气0.821.882.602 (3)146
编号3-H3A类···O1公司0.862.543.140 (3)128
对称代码:(i)x个负极1,z(z).

实验细节

水晶数据
化学配方C类20H(H)25N个O(运行)2
M(M)第页339.43
晶体系统,空间组正交各向异性,P(P)c(c)21
温度(K)296
b条c(c)(Å)9.132(4)、5.834(3)、34.365(16)
V(V)(Å))1830.8 (15)
Z轴4
辐射类型K(K)α
µ(毫米负极1)0.08
晶体尺寸(mm)0.34 × 0.32 × 0.28
数据收集
衍射仪Bruker APEXII区域探测器
衍射仪
吸收校正多扫描
(SADABS公司; 谢尔德里克,1996)
最小值最大值0.970, 0.981
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
14593, 2125, 1867
R(右)整数0.031
(罪θ/λ)最大值(Å)负极1)0.649
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.037, 0.108, 1.07
反射次数2125
参数数量228
约束装置数量1
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eó)负极)0.15,负极0.18

计算机程序:APEX2型(布鲁克,2004),圣保罗(布鲁克,2004),SHELXS97标准(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-小时···A类D类-小时H(H)···A类D类···A类D类-小时···A类
O1-H1A···N10.821.892.614 (4)146
O2-H2A···N20.821.882.602 (3)146
N3-H3A··O10.862.543.140 (3)128
对称代码:(i)x个负极1,z(z).
 

致谢

感谢西安建筑科技大学博士项目启动基金(DB12051)的资助。

工具书类

第一次引用布鲁克(2004)。APEX2型圣保罗.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
第一次引用Rodriguez de Barbarin,C.O.,Bailey,N.A.,Fenton,D.E.&He,Q.(1994)。无机烟囱。学报219, 205–207. CSD公司 交叉参考 中国科学院 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(1996)。SADABS公司德国哥廷根大学。 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者

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