金属有机化合物\(\def\h填{\hskip5em}\def\hfil{\hski p3em}\def\eqno#1{\hfil{#1}}\)

期刊徽标晶体学
通信
国际标准编号:2056-9890

聚[hexa­aqua­tri-μ-丙二酸二脱氢酶(III)]

华南师范大学化学与环境学院,广州510006,中华人民共和国
*通信电子邮件:zhqfang77@yahoo.com.cn

(收到日期:2008年4月24日; 2008年5月27日接受; 在线2008年6月7日)

标题化合物[Dy2(C)H(H)2O(运行)4)(H)2O)6]n个形成由水合镝离子和丙二酸配体组成的配位聚合物结构。非对称单元,有一个镝离子、一个半丙二酸配体和三个水分子。每个Dy该原子由来自四个丙二酸配体的六个O原子和三个水分子配位,并显示出三角-棱柱配位几何结构。丙二酸配体采用两种配位方式,连接镝中心形成三维配位聚合物。这种聚合物中广泛的氢键网络增强了结构稳定性。

相关文献

有关相关文献,请参阅:Iglesias等。(2003[Iglesias,S.、Castillo,O.、Luque,A.和Romaan,P.(2003)。《无机化学学报》,349,273-278。]); 基姆等。(2003【Kim,J.C.,Jo,H.,Lough,A.J.,Cho,J.,Lee,U.&Pyun,S.Y.(2003),《无机化学通讯》第6期,第474-477页。】); 莫尔顿和扎沃特科(2001)【Moulton,B.&Zaworotko,M.J.(2001),《化学评论》第101期,1629-1658页。】).

【方案一】

实验

水晶数据
  • [戴2(C)H(H)2O(运行)4)(H)2O)6]

  • M(M)第页= 739.23

  • 单诊所,C2/c(c)

  • = 17.1805 (2) Å

  • b条= 12.3124 (1) Å

  • c(c)= 11.1541 (1) Å

  • β= 127.52 (2)°

  • V(V)= 1871.4 (5) Å

  • Z轴= 4

  • K(K)α辐射

  • μ=8.02毫米−1

  • T型=296(2)K

  • 0.11×0.10×0.08毫米

数据收集
  • 布鲁克APEXII区域探测器衍射仪

  • 吸收校正:多次扫描(4月2日; 布鲁克,2004[Bruker(2004).APEX2。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊])T型最小值= 0.435,T型最大值= 0.529

  • 10051测量反射

  • 2136个独立反射

  • 2001年反思> 2σ()

  • R(右)整数= 0.023

精炼
  • R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.019

  • 水风险(F类2) = 0.053

  • S公司= 1.07

  • 2136次反射

  • 132个参数

  • 10个约束

  • 受约束的氢原子参数

  • Δρ最大值=0.91埃−3

  • Δρ最小值=-0.51埃−3

表1
氢键几何形状(λ,°)

D类-H月A类 D类-H(H) H月A类 D类A类 D类-H月A类
O1公司W公司-上半年W公司05年1月 0.82 2.04 2.854 (4) 172
O1公司W公司-氢气W公司●臭氧ii(ii) 0.81 1.94 2.729(4) 165
氧气W公司-H3级W公司●臭氧 0.82 1.95 2.761(4) 170
臭氧W公司-H6型W公司●O4 0.81 2.02 2.802 (4) 160
臭氧W公司-H6型W公司●臭氧 0.81 2.59 3.291 (4) 144
臭氧W公司-H5型W公司●氧气iv(四) 0.81 1.96 2.738 (4) 161
对称代码:(i)[x-{\script{1\over 2}},-y+{\script{1\ over 2{},z-{\script}1\over2}}]; (ii)[-x+{\script{1\over 2}},-y+{\sscript{1\ever 2}{,-z]; (iii)[x,-y,z+{\script{1\over 2}}]; (iv)[-x+{\script{1\over 2}},-y+{\sscript{1\ever 2}{,-z+1].

数据收集:4月2日(布鲁克,2004年[Bruker(2004),APEX2。Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊]); 细胞精细化: 4月2日; 数据缩减:4月2日; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 分子图形:(斯佩克,2003年【Spek,A.L.(2003),《应用结晶杂志》,第36期,第7-13页。】)和SHELXTL公司(谢尔德里克,2008年[Sheldrick,G.M.(2008),《水晶学报》,A64112-122。]); 用于准备出版材料的软件:SHELXL97型.

支持信息


注释顶部

近几十年来,超分子结构的分子自组装受到了广泛关注(Kim等。, 2003; 伊格莱西亚斯等。, 2003; Moulton&Zaworotko,2001年)。这种系统的结构和性质取决于中心金属离子和桥接构建块的配位和几何偏好,以及较弱的非共价相互作用的影响,如氢键和π-π叠加相互作用。最近,我们通过Dy(NO)的水热反应获得了标题化合物(I))在碱性水溶液中与丙二酸反应。

如图1所示,在非对称单元复合物(I),每个Dy中心由来自四个丙二酸配体的六个羧基O原子和三个水分子配位。这两种独特的丙二酸配体充当两种螯合和桥接模式:一种位于反转中心,使用每个羧酸基团与两个Dy键合离子;一种是使用三个羧基O原子配位到两个Dy六元螯合环离子,相邻的Dy··Dy分离度分别为4.303(3)、6.600(1)和6.982(2)Au。配体连接镝中心形成三维配位聚合物,该聚合物也通过广泛的氢键相互作用网络稳定(图2;表1)。

相关文献顶部

有关相关文献,请参阅:Iglesias等。(2003); 基姆等。(2003); Moulton和Zaworotko(2001)。

实验顶部

Dy(NO)混合物)将(0.1 mmol)、丙二酸(0.15 mmol),NaOH(0.1 mmov),水(10 ml)剧烈搅拌20 min,然后密封在衬有特氟隆的不锈钢高压釜(20 ml,容量)中。将高压釜加热至433 K并保持7天,然后在5 K h下冷却至室温-1从而获得无色嵌段晶体。

精炼顶部

水H原子暂时位于差分傅立叶图中,并在O–H=0.82Å和H··H=1.30Å的距离约束下进行了精细化U型国际标准化组织(H) =1.5U型等式(O) ,然后被视为骑行模式。碳键H原子被放置在计算位置,并被视为骑在母体C原子上,C-H=0.97ºU型国际标准化组织(H) =1.2U型等式(C) ●●●●。

计算详细信息顶部

数据收集:4月2日(布鲁克,2004);细胞精细化: 4月2日(布鲁克,2004);数据缩减:4月2日(布鲁克,2004);用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,2008);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,2008);分子图形:(斯佩克,2003)和SHELXTL公司(谢尔德里克,2008);用于准备出版材料的软件:SHELXL97型(谢尔德里克,2008)。

数字顶部
[图1] 图1。显示原子编号方案的分子结构。在30%概率水平上绘制的位移椭球体。为了清楚起见,省略了H原子。[对称码:(i)1-x,y,3/2-y;(ii)1/2-x,y-1/2,1/2-z;(iii)1/2-x,1/2-y,1-z]
[图2] 图2。分子包装显示分子内/分子间氢键相互作用为虚线。
聚[hexaquatri-µ-丙二酸二异丙酯(III)]顶部
水晶数据 顶部
[戴2(C)H(H)2O(运行)4)(H)2O)6]F类(000) = 1392
M(M)第页= 739.23D类x个=2.624毫克米
单诊所,C2/c(c)K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
大厅符号:-C 2yc6377次反射的细胞参数
= 17.1805 (2) Åθ= 1.7–28.0°
b条= 12.3124 (1) ŵ=8.02毫米1
c(c)= 11.1541 (1) ÅT型=296千
β=127.52(2)°块状,无色
V(V)= 1871.4 (5) Å0.11×0.10×0.08毫米
Z轴= 4
数据收集 顶部
Bruker APEXII区域探测器
衍射仪
2136个独立反射
辐射源:细焦点密封管2001年反思> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.023
ϕω扫描θ最大值= 27.5°,θ最小值= 2.2°
吸收校正:多扫描
(4月2日; 布鲁克,2004年)
小时=2220
T型最小值= 0.435,T型最大值= 0.529k=1515
10051测量反射=1214
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:满二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.020氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.053受约束的氢原子参数
S公司= 1.07 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0241P(P))2+ 12.727P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
2136次反射(Δ/σ)最大值=0.001
132个参数Δρ最大值=0.91埃
10个约束Δρ最小值=0.51埃
水晶数据 顶部
[戴2(C)H(H)2O(运行)4)(H)2O)6]V(V)= 1871.4 (5) Å
M(M)第页= 739.23Z轴= 4
单诊所,C2/c(c)K(K)α辐射
= 17.1805 (2) ŵ=8.02毫米1
b条= 12.3124 (1) ÅT型=296千
c(c)= 11.1541 (1) Å0.11×0.10×0.08毫米
β= 127.52 (2)°
数据收集 顶部
Bruker APEXII区域探测器
衍射仪
2136个独立反射
吸收校正:多扫描
(4月2日; 布鲁克,2004年)
2001年反思> 2σ()
T型最小值= 0.435,T型最大值= 0.529R(右)整数= 0.023
10051测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.02010个约束
水风险(F类2)=0.053受约束的氢原子参数
S公司= 1.07 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0241P(P))2+ 12.727P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
2136次反射Δρ最大值=0.91埃
132个参数Δρ最小值=0.51埃
特殊细节 顶部

几何图形.所有e.s.d.(除了两个l.s.平面之间二面角中的e.s.d.)均使用全协方差矩阵进行估计。在估计e.s.d.的距离、角度和扭转角时,单独考虑单元e.s.d;只有当e.s.d.的胞内参数由晶体对称性定义时,才使用它们之间的相关性。细胞e.s.d.的近似(各向同性)处理用于估计涉及l.s.平面的e.s.d。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,带有F类负值设置为零F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2在统计上大约是基于F类、和R(右)-基于所有数据的因素将更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
x个z(z)U型国际标准化组织*/U型等式开路特性。(<1)
C1类0.3116 (3)0.3839 (3)0.2419 (4)0.0139 (7)
C20.3805 (3)0.3285 (3)0.2198 (5)0.0174 (7)
过氧化氢0.44620.33250.31480.021美元*
过氧化氢0.38080.37040.14640.021*
C3类0.3607 (3)0.2110 (3)0.1686 (4)0.0137 (7)
补体第四成份0.4246 (2)0.2993 (3)0.6243 (4)0.0119 (7)
C5型0.50000.3747 (4)0.75000.0135 (10)
H5A型0.47030.42050.78290.016*0.50
H5B型0.52970.42050.71710.016*0.50
第1天0.283235 (12)0.148077 (13)0.379865 (19)0.01461 (7)
O1公司0.2989 (2)0.4832 (2)0.2144 (4)0.0268 (6)
氧气0.2741 (2)0.3315 (2)0.2918 (3)0.0165 (5)
臭氧0.3717(2)0.1844(2)0.0723 (3)0.0256 (6)
第4页0.3355 (2)0.14437 (19)0.2259 (3)0.0200 (6)
O5公司0.44917 (18)0.2424(2)0.5591 (3)0.0192 (5)
O6公司0.34060 (17)0.2909 (2)0.5918(3)0.0144 (5)
O1瓦0.1257 (2)0.1789 (2)0.1179 (3)0.0226 (6)
H1W(高度)0.07850.20290.11000.034*
H2W(氢气)0.13690.22300.07560.034*
O2瓦0.4141(3)0.0048 (3)0.4897 (5)0.0435 (10)
高3瓦0.40880.05120.52380.065*
H4W型0.47000.02530.55380.065*
O3瓦0.3194 (2)0.0640 (2)0.6116 (4)0.0322 (7)
H6瓦0.32940.00030.63330.048*
H5W型0.30190.08890.65930.048*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
C1类0.0179 (17)0.0087 (15)0.0121(17)0.0002(13)0.0077 (15)0.0012 (13)
C20.0267 (19)0.0119 (16)0.024 (2)0.0038 (14)0.0211 (18)0.0010 (14)
C3类0.0166 (17)0.0121 (16)0.0163 (18)0.0007 (13)0.0119 (15)0.0004 (13)
补体第四成份0.0099 (15)0.0139 (16)0.0082 (16)0.0002 (12)0.0037 (14)0.0026 (13)
C5型0.010 (2)0.011 (2)0.014 (2)00.005 (2)0
第1天0.01901 (10)0.01230 (10)0.01759 (11)0.00036 (6)0.01376 (8)0.00016 (6)
O1公司0.0366 (17)0.0102 (12)0.0372 (18)0.0042 (11)0.0244 (15)0.0062 (12)
氧气0.0249 (14)0.0116 (12)0.0203 (14)0.0034 (10)0.0175 (12)0.0027 (10)
臭氧0.0474(18)0.0187(14)0.0288 (16)0.0005(13)0.0326(16)0.0014 (12)
第4页0.0366 (16)0.0100 (12)0.0276 (16)0.0013 (10)0.0270 (14)0.0012 (10)
O5公司0.0137 (12)0.0264 (14)0.0183 (13)0.0008 (10)0.0102 (11)0.0068 (11)
O6公司0.0104 (11)0.0196 (13)0.0131 (12)0.0015 (9)0.0072 (10)0.0016 (10)
O1瓦0.0206(14)0.0300 (15)0.0198 (15)0.0003 (12)0.0137 (12)0.0065 (12)
O2瓦0.0431 (19)0.0277 (17)0.085 (3)0.0166 (15)0.052 (2)0.0281 (18)
O3瓦0.063 (2)0.0176 (14)0.0415 (19)0.0177 (14)0.0450 (18)0.0154 (13)
几何参数(λ,º) 顶部
C1-O1型1.247 (4)二氧化二Dy1-O42.375(3)
C1-O2型1.256 (4)Dy1-O22.430 (2)
C1-C2类1.512 (5)镝-O62.452 (2)
C2-C3型1.516 (5)镝-O3W2.487 (3)
C2-H2A型0.9700镝-O2W2.513 (3)
C2-H2B型0.9700Dy1-O1W型2.524 (3)
C3-O3型1.243 (4)镝-O52.555 (3)
C3-O4型1.266(4)镝-O62.610 (2)
C4-O5型1.254 (4)O1W至H1W0.8155
C4-O6型1.260 (4)O1W-H2W型0.8146
C4-C5型1.514 (4)第2周至第3周0.8184
C5-C4类1.514 (4)O2W-H4W型0.8133
C5-H5A型0.9700O3W-H6W型0.8149
C5-H5B型0.9700O3W-H5W型0.8144
Dy1-O1型ii(ii)2.326(3)
O1-C1-O2123.5 (3)O4-Dy1-O1W型77.10 (10)
O1-C1-C2型116.0 (3)O2-Dy1-O1W型68.42 (9)
O2-C1-C2型120.4 (3)O6公司-Dy1-O1W型72.58 (9)
C1-C2-C3118.3 (3)O3W-Dy1-O1W型132.74 (10)
C1-C2-H2A107.7O2W-Dy1-O1W型132.85 (12)
C3-C2-H2A107.7O1公司ii(ii)-镝-O5146.20 (10)
C1-C2-H2B107.7O4-Dy1-O5型80.87 (9)
C3-C2-H2B107.7O2-Dy1-O5号机组70.15(9)
H2A-C2-H2B型107.1O6公司-镝-O5113.70 (8)
臭氧-C3-O4123.0 (3)O3W-Dy1-O585.58 (10)
臭氧-C3-C2117.3 (3)O2W-Dy1-O5型72.37 (10)
O4-C3-C2119.7 (3)O1W-Dy1-O5型137.36 (9)
O5-C4-O6型121.2 (3)O1公司ii(ii)-镝-O6141.99 (9)
O5-C4-C5型118.7 (3)O4-Dy1-O6124.57 (8)
O6-C4-C5型120.1 (3)O2-Dy1-O6号机组68.62 (8)
C4-C5-C4104.4 (4)O6公司-镝-O663.60 (9)
C4-C5-H5A型110.9O3W-Dy1-O6型67.78 (9)
补体第四成份-C5-H5A型110.9O2W-Dy1-O6型107.42 (11)
C4-C5-H5B型110.9O1W-Dy1-O6型119.61(9)
补体第四成份-C5-H5B型110.9O5-Dy1-O6型50.15 (8)
H5A-C5-H5B型108.9C1-O1-Dy1iv(四)159.0 (3)
O1公司ii(ii)-镝-O492.80 (10)C1-O2-Dy1型137.0 (2)
O1公司ii(ii)-Dy1-O2139.15 (10)C3-O4-Dy1138.4 (2)
O4-Dy1-O271.67(8)C4-O5-Dy1型95.7 (2)
O1公司ii(ii)-镝-O689.46 (9)C4-O6-Dy1型150.4 (2)
O4-Dy1-O6型147.09 (9)C4-O6-Dy1型92.9 (2)
O2-Dy1-O6号机组85.38 (8)第1天-O6-Dy1型116.40 (9)
O1公司ii(ii)-镝-O3W78.76 (11)Dy1-O1W-H1W型118.3
O4-Dy1-O3W型141.16 (9)Dy1-O1W-H2W型107.9
O2-Dy1-O3W型136.14 (9)H1W-O1W-H2W型105.4
O6公司-镝-O3W71.36 (9)Dy1-O2W-H3W型119.8
O1公司ii(ii)-镝-O2W73.98 (11)Dy1-O2W-H4W型115.9
O4-Dy1-O2W型73.66 (10)H3W-O2W-H4W型105.1
O2-Dy1-O2W型131.94 (9)Dy1-O3W-H6W型126
O6公司-二氧化二氮137.86 (9)Dy1-O3W-H5W型124.4
O3W-Dy1-O2W型67.55 (10)H6W-O3W-H5W型105.5
O1公司ii(ii)-Dy1-O1W型71.37 (10)
对称代码:(i)x个+1,,z(z)+3/2;(ii)x个+1/2,1/2,z(z)+1/2; (iii)x个+1/2,+1/2,z(z)+1; (iv)x个+1/2,+1/2,z(z)+1/2.
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O1公司W公司-上半年W公司···O5公司v(v)0.822.042.854 (4)172
O1公司W公司-氢气W公司···臭氧不及物动词0.811.942.729 (4)165
氧气W公司-H3级W公司···臭氧vii(七)0.821.952.761 (4)170
臭氧W公司-H6型W公司···O4号机组vii(七)0.812.022.802 (4)160
臭氧W公司-H6型W公司···臭氧vii(七)0.812.593.291 (4)144
臭氧W公司-H5型W公司···氧气0.811.962.738 (4)161
对称代码:(iii)x个+1/2,+1/2,z(z)+1; (v)x个1/2,+1/2,z(z)1/2; (vi)x个+1/2,+1/2,z(z); (vii)x个,,z(z)+1/2.

实验细节

水晶数据
化学配方[戴2(C)H(H)2O(运行)4)(H)2O)6]
M(M)第页739.23
晶体系统,空间组单诊所,C2/c(c)
温度(K)296
,b条,c(c)(Å)17.1805 (2), 12.3124 (1), 11.1541 (1)
β(°)127.52 (2)
V(V))1871.4 (5)
Z轴4
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)8.02
晶体尺寸(mm)0.11 × 0.10 × 0.08
数据收集
衍射仪Bruker APEXII区域探测器
衍射仪
吸收校正多扫描
(4月2日; 布鲁克,2004年)
T型最小值,T型最大值0.435, 0.529
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
10051, 2136, 2001
R(右)整数0.023
(罪θ/λ)最大值1)0.650
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.020, 0.053, 1.07
反射次数2136
参数数量132
约束装置数量10
氢原子处理受约束的氢原子参数
w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0241P(P))2+12月27日P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.91之间,0.51

计算机程序:4月2日(布鲁克,2004),SHELXS97标准(谢尔德里克,2008),SHELXL97型(谢尔德里克,2008),(斯佩克,2003)和SHELXTL公司(谢尔德里克,2008)。

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
O1W-H1W··O50.822.042.854 (4)172.1
O1W-H2W···O3ii(ii)0.811.942.729 (4)164.5
O2W-H3W···O30.821.952.761 (4)169.7
O3W-H6W··O40.812.022.802 (4)160
O3W-H6W···O30.812.593.291 (4)144.4
O3W-H5W··O2iv(四)0.811.962.738 (4)161
对称代码:(i)x个1/2,+1/2,z(z)1/2; (ii)x个+1/2,+1/2,z(z); (iii)x个,,z(z)+1/2; (iv)x个+1/2,+1/2,z(z)+1.
 

致谢

作者感谢华南师范大学对这项工作的支持。

工具书类

第一次引用布鲁克(2004)。4月2日.Bruker AXS Inc.,美国威斯康星州麦迪逊谷歌学者
第一次引用Iglesias,S.、Castillo,O.、Luque,A.和Romaan,P.(2003)。Inorg.化学。学报,349, 273–278. 科学网 CSD公司 交叉参考 中国科学院 谷歌学者
第一次引用Kim,J.C.、Jo,H.、Lough,A.J.、Cho,J.、Lee,U.和Pyun,S.Y.(2003)。无机化学。Commun公司。 6, 474–477. 科学网 CSD公司 交叉参考 中国科学院 谷歌学者
第一次引用Moulton,B.和Zaworotko,M.J.(2001年)。化学。版次。 101, 1629–1658. 科学网 交叉参考 公共医学 中国科学院 谷歌学者
第一次引用Sheldrick,G.M.(2008)。《水晶学报》。A类64, 112–122. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者
第一次引用Spek,A.L.(2003)。J.应用。克里斯特。 36, 7–13. 科学网 交叉参考 中国科学院 IUCr日志 谷歌学者

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