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在标题化合物中,C13H(H)14N个22·H(H)2O、 苯环和吡啶环的二面角为74.86(7)°。在晶体结构中,分子由一对O-H连接...O氢键[O...O=2.662(2)Au],形成中心对称二聚体。此外,分子是相互关联的通过O小时...O、 O-H公司...N和N-H...O涉及水分子的分子间氢键和C-H...O相互作用。

支持信息

到岸价

结晶信息文件(CIF)https://doi.org/10.107/S1600536807018284/ci2360sup1.cif
包含全局数据块,I

香港特别行政区

结构系数文件(CIF格式)https://doi.org/10.107/S1600536807018284/ci2360Isup2.hkl
包含数据块I

CCDC参考:647617

关键指标

  • 单晶X射线研究
  • T型=298千
  • 平均值[西格玛](C-C)=0.003º
  • R(右)系数=0.043
  • 水风险系数=0.125
  • 数据与参数之比=12.6

检查CIF/PLATON结果

未发现语法错误
警报级别C PLAT066_警报_1_C预测和报告的传输相同?铭牌420_铭牌_2_CD-H无接受体N2-H2A?
0A级警报=一般情况:严重问题0B级警报=潜在的严重问题2C级警报=检查并解释0G级警报=一般警报;检查1警报类型1 CIF结构/语法错误,数据不一致或缺失1警报类型2结构模型可能错误或有缺陷的指示器0警报类型3结构质量可能较低的指示器0警报类型4改进、方法、查询或建议0警报类型5信息性消息,检查

注释顶部

正在评估一些羟基吡喃酮和羟基吡啶酮,或被认为是治疗铁或铝的口服有效螯合剂过载(伯吉斯,1993;克利夫特等。, 1990). 在我们继续羟基吡啶酮(Lu)的研究等。,2003年),我们在此演示标题化合物(I)的晶体结构。

化合物(I)中的键距(表1)与观察到的键距一致N个-苄基类似物(Burgess、Fawcett、Russell和Zaisheng,1998;

Burgess、Fawcett、Russell和Waltham,1998年)。The dihedral angle between the苯环和吡啶酮环的温度为74.86(7)°。

化合物(I)的分子由一对O2-H2··O1(1)连接-x,-, -z(z))氢键形成中心对称二聚体(图1)。这种二聚体结构通常存在于无水或含水环境中3-羟基吡啶-4-酮(肖等。, 1992; 伯吉斯等。, 1993;Burgess、Fawcett、Russell和Zaisheng,1998年;伯吉斯、福塞特、罗素&Waltham,1998和3-羟基吡喃-4-酮化合物(Brown等。, 1995).在晶体结构中,每个晶体都有一个水分子吡啶酮分子,通过N2-H2B···O3氢键连接(图1)。水分子连接相邻吡啶酮的O1和N2原子通过O-H··O和O-H··O氢键,与O3··O1(x, 1 +, 1 +z(z))和O3··N2(-x, 2 -, 1 -z(z))距离分别为2.857(2)和2.987(3)欧。此外分子通过弱C-H··O接触连接加利福尼亚州C··O 3.3º,如之前观察到的这类化合物(伯吉斯等。, 1996;Burgess、Fawcett、Russell和Zaisheng,1998年;伯吉斯、福塞特、罗素&沃尔瑟姆,1998年)。

相关文献顶部

在3-羟基吡啶-4-酮中观察到O-H··O氢键二聚体的形成和3-羟基吡喃-4-酮化合物(肖等。, 1992; 伯吉斯et(等)阿尔。, 1993; Burgess、Fawcett、Russell和Zaisheng,1998年;福塞特·伯吉斯,罗素和沃尔瑟姆,1998年;棕色等。, 1995). 有关文献,参见:伯吉斯(1993);伯吉斯等。(1996); 等。(1992);Clevette&Orvig(1990);等。(2003).

实验顶部

标题化合物是根据Lu的文献方法制备的et(等)阿尔。(2003). 适用于X射线分析的晶体是通过慢室温下甲醇-水溶液的蒸发周。

精炼顶部

氨基的H原子被定位在差异图中,并且被自由细化。这个剩余的H原子被放置在计算位置,C-H=0.93–0.97 Au,O-H=0.82–0.85 Au,并包含在最后的精炼循环中使用骑行模型U型国际标准化组织(H) =1.2U型等式(C) 和1.5U型等式(O) ●●●●。

结构描述顶部

正在评估一些羟基吡喃酮和羟基吡啶酮,或被认为是治疗铁或铝的口服有效螯合剂过载(伯吉斯,1993;克利夫特等。, 1990). 在我们继续羟基吡啶酮(Lu)的研究等。,2003年),我们在此演示标题化合物的晶体结构,(I)。

化合物(I)中的键距(表1)与观察到的键距一致N个-苄基类似物(Burgess、Fawcett、Russell和Zaisheng,1998;

伯吉斯、福塞特、罗素和沃尔瑟姆,1998年)。The dihedral angle between the苯和吡啶酮环为74.86(7)°。

化合物(I)的分子由一对O2-H2··O1(1)连接-x,-, -z(z))氢键形成中心对称二聚体(图1)。这种二聚体结构通常存在于无水或含水环境中3-羟基吡啶-4-酮(肖等。, 1992; 伯吉斯等。, 1993;Burgess、Fawcett、Russell和Zaisheng,1998年;伯吉斯、福塞特、罗素&Waltham,1998和3-羟基吡喃-4-酮化合物(Brown等。, 1995).在晶体结构中,每个晶体都有一个水分子吡啶酮分子,通过N2-H2B···O3氢键连接(图1)。水分子连接相邻吡啶酮的O1和N2原子通过O-H··O和O-H··O氢键,与O3··O1(x, 1 +, 1 +z(z))和O3··N2(-x, 2 -, 1 -z(z))距离分别为2.857(2)和2.987(3)欧。此外分子通过弱C-H··O接触连接加利福尼亚州C··O 3.3º,如之前观察到的这类化合物(伯吉斯等。, 1996;Burgess、Fawcett、Russell和Zaisheng,1998年;伯吉斯、福塞特、拉塞尔&沃尔瑟姆,1998年)。

在3-羟基吡啶-4-酮中观察到O-H··O氢键二聚体的形成和3-羟基吡喃-4-酮化合物(肖等。, 1992; 伯吉斯et(等)阿尔。, 1993; Burgess、Fawcett、Russell和Zaisheng,1998年;福塞特·伯吉斯,罗素和沃尔瑟姆,1998年;棕色等。, 1995). 有关文献,参见:伯吉斯(1993);伯吉斯等。(1996); 等。(1992);Clevette&Orvig(1990);等。(2003).

计算详细信息顶部

数据收集:智能(布鲁克,1998);单元格细化:圣保罗(布鲁克,1999);数据缩减:圣保罗; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(Sheldrick,1997);用于优化结构的程序:SHELXL97型(Sheldrick,1997);分子图形:SHELXTL公司(布鲁克,1999);用于准备出版材料的软件:SHELXTL公司.

数字顶部
[图1] 图1。(I)的氢键二聚体(虚线)视图。取代椭球以30%的概率水平绘制。
[图2] 图2。(I)的包装图。氢键显示为虚线。
1-(4-氨基苯基)-2-乙基-3-羟基-1,4-二氢吡啶-4-酮一水合物顶部
水晶数据 顶部
C类13H(H)14N个22·H(H)2Z= 2
M(M)第页= 248.28F类(000) = 264
三联诊所,P(P)1D类x=1.331毫克
大厅符号:-P 1K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
= 7.8992 (14) Å1277次反射的单元参数
b条= 8.0162 (15) Åθ= 2.9–27.8°
c(c)= 11.4759 (19) ŵ=0.10毫米1
α= 96.835 (2)°T型=298千
β= 106.273 (2)°板,黄色
γ= 113.143 (3)°0.58×0.47×0.22毫米
V(V)= 619.43 (19) Å
数据收集 顶部
Bruker SMART CCD区域探测器
衍射仪
2155次独立反射
辐射源:细焦点密封管1494次反射> 2σ()
石墨单色仪R(右)整数= 0.019
φω扫描θ最大值= 25.0°,θ最小值= 1.9°
吸收校正:多扫描
(SADABS公司:Sheldrick,1996)
小时=99
T型最小值= 0.947,T型最大值= 0.979k个=96
3228次测量反射=1213
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.043氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.125用独立和约束精化的混合物处理H原子
S公司= 1.03 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.058P(P))2+ 0.141P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
2155次反射(Δ/σ)最大值= 0.001
171个参数Δρ最大值=0.15埃
0个约束Δρ最小值=0.19埃
水晶数据 顶部
C类13H(H)14N个22·H(H)2γ= 113.143 (3)°
M(M)第页= 248.28V(V)= 619.43 (19) Å
三联诊所,P(P)1Z= 2
= 7.8992 (14) ÅK(K)α辐射
b条= 8.0162 (15) ŵ=0.10毫米1
c(c)= 11.4759 (19) ÅT型=298千
α= 96.835 (2)°0.58×0.47×0.22毫米
β= 106.273 (2)°
数据收集 顶部
Bruker SMART CCD区域探测器
衍射仪
2155次独立反射
吸收校正:多扫描
(SADABS公司:谢尔德里克,1996年)
1494次反射> 2σ()
T型最小值= 0.947,T型最大值= 0.979R(右)整数= 0.019
3228次测量反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0430个约束
水风险(F类2) = 0.125用独立和约束精化的混合物处理H原子
S公司= 1.03Δρ最大值=0.15埃
2155次反射Δρ最小值=0.19埃
171个参数
特殊细节 顶部

几何形状.所有e.s.d.(两个l.s.平面之间二面角的e.s.d.除外)使用全协方差矩阵进行估计在估计e.s.d.的距离、角度时单独考虑和扭转角;e.s.d.细胞内参数之间的相关性仅为当它们由晶体对称性定义时使用。近似(各向同性)细胞e.s.d.的处理用于估计涉及l.s.的e.s.d。飞机。

精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类设置为零消极的F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt).并且与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2从统计上看大约是两倍大作为基于F类、和R(右)-基于所有数据的因素甚至更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
xz(z)U型国际标准化组织*/U型等式
N1型0.2932 (2)0.4626 (2)0.13373 (15)0.0410 (4)
氮气0.2456 (4)1.0252 (4)0.4479 (2)0.0598 (6)
O1公司0.3004 (2)0.02104 (19)0.07892 (12)0.0487 (4)
氧气0.6375 (2)0.2808 (2)0.11625 (14)0.0555 (4)
氢气0.62200.18840.06710.083*
臭氧0.0972 (2)0.8939 (2)0.65506 (14)0.0663 (5)
H14型0.15910.92520.73390.100*
H15型0.00160.91690.64370.100*
C1类0.4659 (3)0.4445 (3)0.15894 (17)0.0376 (5)
指挥与控制0.4666 (3)0.2958 (3)0.08741 (17)0.0392 (5)
C3类0.2953 (3)0.1587 (3)0.01476 (17)0.0386 (5)
补体第四成份0.1269 (3)0.1900 (3)0.03696 (19)0.0465 (5)
H4型0.01200.10850.10400.056*
C5级0.1280 (3)0.3360 (3)0.0369 (2)0.0476 (5)
H5型0.01280.34980.02090.057*
C6型0.2799 (3)0.6082 (3)0.21302 (18)0.0390 (5)
抄送70.1834 (3)0.5618 (3)0.2967 (2)0.0485 (5)
H7型0.12500.43770.30040.058*
抄送80.1741 (3)0.6998 (3)0.3745 (2)0.0502 (5)
H8型0.10930.66790.43070.060*
C9级0.2597 (3)0.8856 (3)0.37046 (18)0.0444 (5)
C10号机组0.3514 (3)0.9284 (3)0.28396 (19)0.0465 (5)
H10型0.40681.05180.27840.056*
C11号机组0.3620 (3)0.7914 (3)0.20597 (18)0.0430 (5)
H11型0.42460.82260.14860.052*
第12项0.6474 (3)0.5818 (3)0.26744 (18)0.0449 (5)
H12A型0.64340.70170.28290.054*
H12B型0.76290.60100.24610.054*
第13页0.6645 (4)0.5139 (4)0.3857 (2)0.0671 (7)
H13A型0.78240.60470.45280.101*
H13B型0.67020.39610.37110.101*
H13C型0.55190.49780.40830.101*
过氧化氢0.346 (5)1.136 (5)0.464 (3)0.091 (11)*
过氧化氢0.214 (4)0.983 (4)0.513 (2)0.071 (8)*
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
N1型0.0404 (10)0.0359 (9)0.0441 (9)0.0184 (8)0.0109 (8)0.0073 (7)
氮气0.0670 (15)0.0683 (15)0.0520 (12)0.0413 (13)0.0205 (11)0.0054 (11)
O1公司0.0524 (9)0.0468 (9)0.0433 (8)0.0258 (7)0.0108 (7)0.0023 (7)
氧气0.0439 (9)0.0527 (9)0.0588 (9)0.0254 (7)0.0058 (7)0.0070 (7)
臭氧0.0696 (11)0.0737 (11)0.0486 (9)0.0372 (9)0.0089 (8)0.0027 (8)
C1类0.0385 (11)0.0363 (11)0.0388 (10)0.0174 (9)0.0128 (8)0.0121 (8)
指挥与控制0.0397 (11)0.0417 (11)0.0391 (10)0.0208 (9)0.0130 (9)0.0138 (9)
C3类0.0457 (11)0.0361 (11)0.0327 (10)0.0177 (9)0.0126 (9)0.0095 (8)
补体第四成份0.0424 (12)0.0417 (12)0.0438 (11)0.0173 (9)0.0031 (9)0.0060 (9)
C5级0.0397 (11)0.0442 (12)0.0537 (12)0.0218 (10)0.0067 (10)0.0081 (10)
C6型0.0404 (11)0.0385 (11)0.0413 (10)0.0210 (9)0.0144 (9)0.0100 (9)
抄送70.0477 (12)0.0453 (12)0.0602 (13)0.0230 (10)0.0234 (11)0.0223 (11)
抄送80.0527 (13)0.0649 (15)0.0512 (12)0.0349 (12)0.0281 (10)0.0239 (11)
C9级0.0427 (11)0.0537 (13)0.0405 (11)0.0309 (10)0.0080 (9)0.0086 (9)
C10号机组0.0498 (12)0.0389 (11)0.0525 (12)0.0213 (10)0.0185 (10)0.0119 (10)
C11号机组0.0472 (12)0.0416 (12)0.0436 (11)0.0201 (10)0.0199 (9)0.0139 (9)
第12项0.0424 (11)0.0401 (11)0.0478 (12)0.0197 (9)0.0109 (9)0.0049 (9)
第13条0.0633 (15)0.0707 (17)0.0441 (13)0.0200 (13)0.0051 (11)0.0052 (12)
几何参数(λ,º) 顶部
N1-C5型1.358 (2)C5-H5型0.93
N1-C1型1.382 (2)C6-C11型1.376 (3)
N1-C6型1.449 (2)C6至C71.384 (3)
N2-C9气体1.404 (3)C7-C8号机组1.375 (3)
N2小时2a0.88 (3)C7-H7型0.93
N2-H2B型0.92 (3)C8-C9型1.386 (3)
O1-C31.273 (2)C8-H8型0.93
氧气-C21.354 (2)C9-C10型1.384 (3)
氧气-氢气0.82C10-C11号机组1.376 (3)
臭氧-H140.85C10-H10型0.93
臭氧-H150.85C11-H110.93
C1-C2类1.367 (3)C12-C13型1.512 (3)
C1-C12号机组1.500 (3)C12-H12A型0.97
C2-C3型1.431 (3)C12-H12B型0.97
C3-C4型1.409 (3)C13-H13A型0.96
C4-C5型1.356 (3)C13-H13B型0.96
C4-H4型0.93C13-H13C型0.96
C5-N1-C1120.00 (17)C8-C7-H7120.1
C5-N1-C6118.45 (16)C6-C7-H7型120.1
C1-N1-C6121.45 (16)C7-C8-C9121.07 (19)
C9-N2-H2A111.3 (19)C7-C8-H8型119.5
C9-N2-H2B109.7 (16)C9-C8-H8119.5
H2A-N2-H2B型119 (3)C10-C9-C8号机组118.19 (19)
C2-O2-H2109.5C10-C9-N2型120.9 (2)
H14-O3-H15型107.1C8-C9-N2型120.8 (2)
C2-C1-N1型119.21 (17)C11-C10-C9121.2 (2)
C2-C1-C12型120.64 (17)C11-C10-H10119.4
N1-C1-C12120.09 (17)C9-C10-H10119.4
氧气-C2-C1117.57 (17)C6-C11-C10119.89 (18)
氧气-C2-C3119.97 (17)C6-C11-H11型120.1
C1-C2-C3122.46 (18)C10-C11-H11号机组120.1
O1-C3-C4型124.17 (18)C1-C12-C13型111.82 (17)
O1-C3-C2型120.92 (18)C1-C12-H12A型109.3
C4-C3-C2型114.92 (17)C13-C12-H12A型109.3
C5-C4-C3121.69 (19)C1-C12-H12B型109.3
C5-C4-H4119.2C13-C12-H12B型109.3
C3-C4-H4型119.2H12A-C12-H12B型107.9
C4-C5-N1型121.67 (19)C12-C13-H13A型109.5
C4-C5-H5型119.2C12-C13-H13B109.5
N1-C5-H5型119.2H13A-C13-H13B型109.5
C11-C6-C7型119.82 (19)C12-C13-H13C109.5
C11-C6-N1120.78 (17)H13A-C13-H13C型109.5
C7-C6-N1型119.41 (18)H13B-C13-H13C型109.5
C8-C7-C6119.8 (2)
C5-N1-C1-C21.6 (3)C5-N1-C6-C11107.4 (2)
C6-N1-C1-C2174.75 (17)C1-N1-C6-C1176.2 (2)
C5-N1-C1-C12178.74 (17)C5-N1-C6-C772.6 (2)
C6-N1-C1-C122.4 (3)C1-N1-C6-C7型103.8 (2)
N1-C1-C2-O2型178.87 (16)C11-C6-C7-C81.5 (3)
C12-C1-C2-O21.7 (3)N1-C6-C7-C8型178.45 (18)
N1-C1-C2-C31.1 (3)C6-C7-C8-C90.1 (3)
C12-C1-C2-C3178.27 (17)C7-C8-C9-C101.4 (3)
氧气-C2-C3-O10.6 (3)C7-C8-C9-N2型178.5 (2)
C1-C2-C3-O1179.44 (18)C8-C9-C10-C11号机组1.6 (3)
O2-C2-C3-C4179.23 (17)N2-C9-C10-C11型178.6 (2)
C1-C2-C3-C4型0.8 (3)C7-C6-C11-C101.3 (3)
O1-C3-C4-C5177.90 (19)N1-C6-C11-C10178.65 (18)
C2-C3-C4-C5型2.3 (3)C9-C10-C11-C60.2 (3)
C3-C4-C5-N12.0 (3)C2-C1-C12-C13型84.4 (2)
C1-N1-C5-C40.1 (3)N1-C12-C13型92.7 (2)
C6-N1-C5-C4176.39 (18)
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-小时H(H)···A类D类···A类D类-小时···A类
O3-H15···N20.852.172.987 (3)160
O3-H14···O1ii(ii)0.852.012.857 (2)174
O2-H2··O10.822.342.7630 (19)113
O2-H2··O10.822.012.662 (2)136
N2-H2气体B类···臭氧0.92 (3)2.15 (3)3.053 (3)170 (2)
C11-H11···O1iv(四)0.932.453.324 (3)157
对称代码:(i)x,+2,z(z)+1; (ii)x,+1,z(z)+1; (iii)x+1,,z(z); (iv)x+1,+1,z(z).

实验细节

水晶数据
化学式C类13H(H)14N个22·H(H)2
M(M)第页248.28
晶体系统,空间组三联诊所,P(P)1
温度(K)298
,b条,c(c)(Å)7.8992 (14), 8.0162 (15), 11.4759 (19)
α,β,γ(°)96.835 (2), 106.273 (2), 113.143 (3)
V(V))619.43 (19)
Z2
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)0.10
晶体尺寸(mm)0.58 × 0.47 × 0.22
数据收集
衍射仪布吕克智能CCD区域探测器
吸收校正多扫描
(SADABS公司:谢尔德里克,1996年)
T型最小值,T型最大值0.947, 0.979
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
3228, 2155, 1494
R(右)整数0.019
(罪θ/λ)最大值1)0.595
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.043, 0.125, 1.03
反射次数2155
参数数量171
氢原子处理用独立和约束精化的混合物处理H原子
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.15,0.19

计算机程序:智能(布鲁克,1998),圣保罗(布鲁克,1999),圣保罗,SHELXS97标准(谢尔德里克,1997),SHELXL97型(谢尔德里克,1997),SHELXTL公司(布鲁克,1999),SHELXTL公司.

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-小时···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-小时···A类
O3-H15···N20.852.172.987 (3)160
O3-H14···O1ii(ii)0.852.012.857 (2)174
O2-H2··O10.822.342.7630 (19)113
O2-H2··O10.822.012.662 (2)136
N2-H2B···O30.92 (3)2.15 (3)3.053 (3)170 (2)
C11-H11···O1iv(四)0.932.453.324 (3)157
对称代码:(i)x,+2,z(z)+1; (ii)x,+1,z(z)+1; (iii)x+1,,z(z); (iv)x+1,+1,z(z).
 

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