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标题化合物C10H(H)9不2从海洋的EtOAc提取物中分离并表征链霉菌属. 060524. 除甲基氢原子外,所有原子几乎都是共面的。存在分子间N-H晶体结构中的O氢键。该化合物对K562人类慢性白血病具有细胞毒性。 支持信息
CCDC参考:274336
关键指标
- 单晶X射线研究
- T型=298千
- 平均值(C-C)=0.003Å
- R(右)系数=0.056
- 水风险系数=0.152
- 数据与参数之比=14.4
检查CIF/PLATON结果
未发现语法错误
警报级别C
牢房02_警报_1_C提供的电池体积s.u.与之不同根据电池参数s.u.'s计算,大于2计算单元体积su=8.88单元体积su=6.00RINTA01_ALERT_3_CRint值大于0.10给出的铃声0.146PLAT020_警报_3_CRint值大于0.10。。。。。。。。。0.15PLAT029_警报_3_C_衍射_测量_分数_高度_全低。。。。。。。0.98PLAT066_警报_1_C预测和报告的传输相同?铭牌125_警报_4_C没有给定_symmetriy_space_group_name_Hall?PLAT152_警报_1_C供应和计算的体积s.u.不一致?铭牌230_铭牌_2_CC7-C8的Hirshfeld测试差异。。6.16苏
0A级警报=一般情况:严重问题0B级警报=潜在的严重问题8C级警报=检查并解释0G级警报=一般警报;检查3警报类型1 CIF结构/语法错误,数据不一致或缺失1警报类型2结构模型可能错误或有缺陷的指示器3警报类型3结构质量可能较低的指示器1警报类型4改进、方法、查询或建议
数据收集:智能(西门子,1996年);单元格细化:圣保罗(西门子,1996年);数据缩减:圣保罗; 用于求解结构的程序:SHELXS97标准(谢尔德里克,1997年a);用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,1997年a);分子图形:谢尔克斯特尔(谢尔德里克,1997年b);用于准备出版材料的软件:谢尔克斯特尔.
水晶数据 顶部
C类10H(H)9不2 | F类(000) = 736 |
M(M)第页= 175.18 | D类x个=1.347毫克−三 |
单诊所,C类2/c(c) | 钼K(K)α辐射,λ= 0.71073 Å |
一= 21.382 (4) Å | 1009次反射的细胞参数 |
b条= 7.4070 (15) Å | θ= 2.9–26.5° |
c(c)= 13.372 (3) Å | µ=0.10毫米−1 |
β= 125.34 (3)° | T型=298千 |
V(V)= 1727.6 (6) Å三 | 无色棱镜 |
Z轴= 8 | 0.45×0.41×0.38毫米 |
数据收集 顶部
西门子SMART CCD区域探测器 衍射仪 | 1752独立反射 |
辐射源:细焦点密封管 | 1315次反射我> 2σ(我) |
石墨单色仪 | R(右)整数= 0.146 |
φ和ω扫描 | θ最大值= 26.5°,θ最小值= 2.3° |
吸收校正:多扫描 (SADABS;谢尔德里克,1996年) | 小时=−26→26 |
T型最小值= 0.959,T型最大值= 0.965 | k个=−9→5 |
5009次测量反射 | 我=−16→16 |
精炼 顶部
优化于F类2 | 主原子位置定位:结构-变量直接方法 |
最小二乘矩阵:完整 | 二次原子位置:差分傅里叶映射 |
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.056 | 氢站点位置:从邻近站点推断 |
水风险(F类2) = 0.152 | 受约束的氢原子参数 |
S公司= 1.06 | w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0677P(P))2+ 0.0691P(P)] 哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3 |
1752次反射 | (Δ/σ)最大值< 0.001 |
122个参数 | Δρ最大值=0.34埃−三 |
1个约束 | Δρ最小值=−0.33埃−三 |
特殊细节 顶部
几何图形所有的e.s.d.(除了两个l.s.平面之间的二面角中的e.s.d.)使用全协方差矩阵进行估计在估计距离、角度的e.s.d.时单独考虑和扭转角;e.s.d.细胞内参数之间的相关性仅为当它们由晶体对称性定义时使用。近似(各向同性)细胞e.s.d.的处理用于估计涉及l.s.的e.s.d。飞机。 |
精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险以及贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类设置为零消极的F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt)等.并且与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2从统计上看大约是两倍大作为那些基于F类,以及R(右)-基于所有数据的系数将为甚至更大。 |
分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部 | x个 | 年 | z(z) | U型国际标准化组织*/U型等式 | |
O1公司 | 0.23931 (6) | 0.28869 (16) | 0.36724 (11) | 0.0529 (4) | |
氧气 | 0.35102 (5) | 0.43096 (16) | 0.49706 (10) | 0.0534 (4) | |
N1型 | 0.23271 (7) | 0.90625 (17) | 0.35139 (12) | 0.0478 (4) | |
C1类 | 0.16367 (8) | 0.6504 (2) | 0.28083 (12) | 0.0403 (4) | |
指挥与控制 | 0.15931 (8) | 0.8388 (2) | 0.27359 (13) | 0.0433 (4) | |
C3类 | 0.09050 (9) | 0.9314 (3) | 0.19884 (15) | 0.0564 (5) | |
H3级 | 0.0888 | 1.0569 | 0.1952 | 0.068* | |
补体第四成份 | 0.02488 (10) | 0.8286 (3) | 0.13045 (17) | 0.0658 (5) | |
H4型 | −0.0223 | 0.8859 | 0.0795 | 0.079* | |
C5级 | 0.02772 (9) | 0.6419 (3) | 0.13603 (16) | 0.0626 (5) | |
H5型 | −0.0178 | 0.5770 | 0.0889 | 0.075* | |
C6级 | 0.09592 (8) | 0.5490 (3) | 0.20931 (14) | 0.0517 (4) | |
人6 | 0.0970 | 0.4234 | 0.2113 | 0.062* | |
抄送7 | 0.24359 (7) | 0.6066 (2) | 0.36797 (12) | 0.0400 (4) | |
抄送8 | 0.28203 (9) | 0.7678 (2) | 0.40701 (15) | 0.0461 (4) | |
H8型 | 0.3347 | 0.7798 | 0.4639 | 0.055* | |
C9级 | 0.27562 (8) | 0.4288 (2) | 0.40758 (13) | 0.0401 (4) | |
C10号机组 | 0.38748 (10) | 0.2590 (2) | 0.54184 (19) | 0.0615 (5) | |
H10A型 | 0.3610 | 0.1897 | 0.5671 | 0.092* | |
H10B型 | 0.4398 | 0.2762 | 0.6104 | 0.092* | |
H10C型 | 0.3862 | 0.1958 | 0.4780 | 0.092* | |
上半年 | 0.2455 (10) | 1.0248 (15) | 0.3644 (18) | 0.080* | |
原子位移参数(2) 顶部 | U型11 | U型22 | U型33 | U型12 | U型13 | U型23 |
O1公司 | 0.0529 (6) | 0.0330 (7) | 0.0656 (7) | −0.0009 (5) | 0.0302 (6) | 0.0007 (5) |
氧气 | 0.0436 (6) | 0.0418 (7) | 0.0631 (7) | 0.0047 (4) | 0.0242 (5) | 0.0034 (5) |
N1型 | 0.0514 (7) | 0.0300 (8) | 0.0571 (8) | −0.0024 (5) | 0.0286 (6) | −0.0030 (6) |
C1类 | 0.0463 (8) | 0.0319 (9) | 0.0442 (7) | 0.0009 (6) | 0.0271 (6) | 0.0008 (6) |
指挥与控制 | 0.0487 (8) | 0.0366 (10) | 0.0463 (7) | 0.0021 (6) | 0.0284 (7) | 0.0010 (6) |
C3类 | 0.0577 (9) | 0.0429 (10) | 0.0642 (10) | 0.0129 (7) | 0.0327 (8) | 0.0066 (8) |
补体第四成份 | 0.0484 (9) | 0.0645 (15) | 0.0713 (11) | 0.0126 (9) | 0.0270 (8) | 0.0084 (10) |
C5级 | 0.0435 (8) | 0.0579 (13) | 0.0695 (10) | −0.0033 (8) | 0.0228 (8) | 0.0020 (10) |
C6级 | 0.0490 (8) | 0.0390 (10) | 0.0597 (9) | −0.0052 (7) | 0.0272 (7) | 0.0010 (7) |
抄送7 | 0.0434 (7) | 0.0313 (8) | 0.0449 (8) | −0.0018 (6) | 0.0252 (6) | −0.0022 (6) |
抄送8 | 0.0434 (7) | 0.0392 (10) | 0.0520 (8) | −0.0009 (6) | 0.0254 (7) | −0.0018 (6) |
C9级 | 0.0421 (7) | 0.0354 (8) | 0.0451 (7) | −0.0004 (6) | 0.0266 (6) | −0.0009 (6) |
C10号机组 | 0.0506 (9) | 0.0546 (13) | 0.0710 (11) | 0.0151 (7) | 0.0304 (9) | 0.0138 (8) |
几何参数(λ,º) 顶部
O1-C9型 | 1.2189 (18) | C4-C5型 | 1.384 (3) |
氧气-C9 | 1.3415 (18) | C4-H4型 | 0.9300 |
氧气-C10 | 1.4312 (19) | C5至C6 | 1.381 (3) |
N1-C8型 | 1.345 (2) | C5-H5型 | 0.9300 |
N1-C2型 | 1.3808 (19) | C6-H6型 | 0.9300 |
N1-H1型 | 0.906 (10) | C7-C8号机组 | 1.370 (2) |
C1-C2类 | 1.398 (2) | C7-C9 | 1.437 (2) |
C1-C6号机组 | 1.406 (2) | C8-H8型 | 0.9300 |
C1-C7 | 1.4421 (19) | C10-H10A型 | 0.9600 |
C2-C3型 | 1.390 (2) | C10-H10B型 | 0.9600 |
C3至C4 | 1.379 (3) | C10-H10摄氏度 | 0.9600 |
C3至H3 | 0.9300 | | |
| | | |
C9-O2-C10 | 116.44 (13) | C5-C6-C1型 | 117.76 (18) |
C8-N1-C2型 | 109.06 (13) | C5-C6-H6 | 121.1 |
C8-N1-H1型 | 125.4 (12) | C1-C6-H6型 | 121.1 |
C2-N1-H1型 | 125.5 (12) | C8-C7-C9 | 127.25 (14) |
C2-C1-C6型 | 119.04 (13) | C8-C7-C1 | 106.32 (13) |
C2-C1-C7 | 106.33 (12) | C9-C7-C1 | 126.41 (13) |
C6-C1-C7型 | 134.64 (15) | N1-C8-C7型 | 110.36 (15) |
N1-C2-C3型 | 129.18 (16) | N1-C8-H8型 | 124.8 |
N1-C2-C1型 | 107.93 (12) | C7-C8-H8型 | 124.8 |
C3-C2-C1 | 122.89 (14) | O1-C9-O2型 | 122.29 (14) |
C4-C3-C2型 | 116.87 (18) | O1-C9-C7 | 124.85 (14) |
C4-C3-H3型 | 121.6 | 氧气-C9-C7 | 112.85 (13) |
C2-C3-H3型 | 121.6 | 氧气-C10-H10A | 109.5 |
C3-C4-C5型 | 121.32 (15) | 氧气-C10-H10B | 109.5 |
C3-C4-H4型 | 119.3 | H10A-C10-H10B型 | 109.5 |
C5-C4-H4 | 119.3 | 氧气-C10-H10C | 109.5 |
C6-C5-C4 | 122.12 (16) | H10A-C10-H10C型 | 109.5 |
C6-C5-H5型 | 118.9 | H10B-C10-H10C型 | 109.5 |
C4-C5-H5型 | 118.9 | | |
| | | |
C8-N1-C2-C3 | 179.28 (14) | C2-C1-C7-C8型 | −0.25 (14) |
C8-N1-C2-C1 | −0.50 (15) | C6-C1-C7-C8 | −179.87 (15) |
C6-C1-C2-N1 | −179.86 (12) | C2-C1-C7-C9 | 178.33 (13) |
C7-C1-C2-N1型 | 0.46 (12) | C6-C1-C7-C9 | −1.3 (2) |
C6-C1-C2-C3 | 0.35 (18) | C2-N1-C8-C7 | 0.34 (18) |
C7-C1-C2-C3 | −179.34 (13) | C9-C7-C8-N1 | −178.62 (12) |
N1-C2-C3-C4 | −179.58 (14) | C1-C7-C8-N1 | −0.05 (17) |
C1-C2-C3-C4型 | 0.2 (2) | C10-O2-C9-O1 | 1.1 (2) |
C2-C3-C4-C5型 | −0.2 (2) | C10-O2-C9-C7 | −179.98 (12) |
C3-C4-C5-C6型 | −0.3 (3) | C8-C7-C9-O1号机组 | −177.58 (14) |
C4-C5-C6-C1型 | 0.8 (2) | C1-C7-C9-O1 | 4.1 (2) |
C2-C1-C6-C5型 | −0.84 (19) | C8-C7-C9-O2 | 3.5 (2) |
C7-C1-C6-C5 | 178.74 (14) | C1-C7-C9-O2 | −174.74 (11) |
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类 | D类-H(H) | H(H)···A类 | D类···A类 | D类-H(H)···A类 |
N1-H1··O1我 | 0.91 (1) | 1.96 (1) | 2.8381 (18) | 162 (2) |
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