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2,5-鲁替丁(2,5-二甲基吡啶,C7H(H)9N) 已在150(2)K下确定就地从液体中生长出晶体。在空间组中P(P),不对称单元包含两个独立的分子。分子相互关联通过C-H公司N个相互作用形成极性链,以平行方式排列,形成极性片。相邻板材以反平行排列方式包装。 支持信息
CCDC参考:182637
关键指标
- 单晶X射线研究
- T型=150 K
- 平均值(C-C)=0.002º
- R(右)系数=0.054
- 水风险系数=0.145
- 数据与参数之比=18.2
检查CIF结果
未发现语法错误ADDSYM报告没有额外的对称性
样本(99%)是从兰开斯特公司获得的,使用时没有进一步净化。晶体生长在0.3毫米的玻璃毛细管中在加利福尼亚州236 K(温度仅略低于毛细管中的固体)使用前面描述的技术(戴维斯&邦德,2001年)。晶体生长后,冷却至150(2)K以获取数据收藏。圆柱形晶体的长度没有估计出来,但它超过准直器的直径(0.35 mm)。
氢原子以几何方式放置,并用各向同性位移进行细化参数,具有指定给化学等效H原子的通用参数(所有甲基H原子一个参数,共四个参数)。两种甲基组是无序的,被建模为两组位置,每个位置位置围绕本地三重轴与另一个旋转60°。
数据收集:收集(诺尼乌斯,1998);单元格细化:香港(HKL) 电子秤组件(Otwinowski&Minor,1997);数据缩减:香港(HKL) DENZO公司和电子秤组件(Otwinowski&Minor,1997);用于求解结构的程序:92新加坡元(阿尔托马雷等。, 1994); 用于优化结构的程序:SHELXL97型(谢尔德里克,1997);分子图形:XP(极限编程)(谢尔德里克,1993)和卡梅隆(沃特金等。, 1996); 用于准备出版材料的软件:SHELXL97型.
水晶数据 顶部
C7H(H)9N个 | F类(000) = 232 |
M(M)第页= 107.15 | D类x=1.113毫克−三 |
三联诊所,P(P)1 | 熔点:258 K |
一= 7.0991 (4) Å | 钼K(K)α辐射,λ= 0.7107 Å |
b条= 7.7279 (5) Å | 2259次反射的单元参数 |
c(c)= 12.3900 (9) Å | θ= 1.0–22.5° |
α= 108.139 (4)° | µ=0.07毫米−1 |
β= 92.399 (4)° | T型=150 K |
γ= 96.743 (5)° | 圆柱体,无色 |
V(V)= 639.26 (7) Å三 | 0.15 mm(半径) |
Z轴= 4 | |
数据收集 顶部
Nonius KappaCCD公司 衍射仪 | R(右)整数= 0.030 |
辐射源:细焦点密封管 | θ最大值= 27.5°,θ最小值= 3.7° |
薄片ω和ϕ扫描 | 小时= 0→9 |
4192次测量反射 | k个=−9→9 |
2827次独立反射 | 我=−15→15 |
1643次反射我> 2σ(我) | |
精炼 顶部
优化于F类2 | 主原子位置定位:结构-变量直接方法 |
最小二乘矩阵:完整 | 二次原子位置:差分傅里叶映射 |
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.054 | 氢站点位置:从邻近站点推断 |
水风险(F类2) = 0.145 | 受约束的氢原子参数 |
S公司= 1.03 | w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0487P(P))2+ 0.1043P(P)] 哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3 |
2827次反射 | (Δ/σ)最大值< 0.001 |
155个参数 | Δρ最大值=0.14埃−三 |
0个约束 | Δρ最小值=−0.13埃−三 |
水晶数据 顶部
C7H(H)9N个 | γ= 96.743 (5)° |
M(M)第页= 107.15 | V(V)= 639.26 (7) Å三 |
三联诊所,P(P)1 | Z轴= 4 |
一= 7.0991 (4) Å | 钼K(K)α辐射 |
b条= 7.7279 (5) Å | µ=0.07毫米−1 |
c(c)= 12.3900 (9) Å | T型=150 K |
α= 108.139 (4)° | 0.15毫米(半径) |
β= 92.399 (4)° | |
数据收集 顶部
Nonius KappaCCD公司 衍射仪 | 1643次反射我> 2σ(我) |
4192次测量反射 | R(右)整数= 0.030 |
2827次独立反射 | |
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.054 | 0个约束 |
水风险(F类2) = 0.145 | 受约束的氢原子参数 |
S公司= 1.03 | Δρ最大值=0.14埃−三 |
2827次反射 | Δρ最小值=−0.13埃−三 |
155个参数 | |
特殊细节 顶部
实验.晶体生长就地在236 K的0.3 mm Lindemann管中。 |
几何图形.所有e.s.d.(两个l.s.平面之间二面角的e.s.d.除外)使用全协方差矩阵进行估计在估计e.s.d.的距离、角度时单独考虑和扭转角;e.s.d.细胞内参数之间的相关性仅为当它们由晶体对称性定义时使用。近似(各向同性)细胞e.s.d.的处理用于估计涉及l.s.的e.s.d。飞机。 最小二乘平面(x,年,z(z)晶体坐标)和与它们的偏差(*表示用于定义平面的原子) 2.5016 (0.0055)x+ 6.8487 (0.0029)年- 3.1884 (0.0079)z(z)= 5.0267 (0.0020) *0.0014(0.0008)N1A*-0.0015(0.0011)C2A*0.0002(0.0011”C3A*0.0011(0.0011)C4A*-0.0012(0.0008)C5A 拟合原子的Rms偏差=0.0012 - 2.8000 (0.0048)x+ 6.0639 (0.0036)年+ 3.6076 (0.0076)z(z)= 6.5009 (0.0039) 与前一平面的夹角(近似e.s.d.)=54.07(0.05) *-0.0029(0.0008)N1B*0.0034(0.0011)C2B*-0.0010(0.0010)C3B*-0.001(0.0011)C4B*0.0023(0.0008)C5B 拟合原子的Rms偏差=0.0024 |
精炼.改进F类2对抗所有反射。加权R(右)-因子水风险和贴合度S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,使用F类设置为零消极的F类2。的阈值表达式F类2>σ(F类2)仅用于计算R(右)-因子(gt)等.并且与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2从统计上看大约是两倍大作为那些基于F类,以及R(右)-基于所有数据的系数将为甚至更大。 |
分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部 | x | 年 | z(z) | U型国际标准化组织*/U型等式 | 开路特性。(<1) |
N1A型 | 0.25742 (19) | 0.81270 (19) | 0.37067 (12) | 0.0456 (4) | |
C2A公司 | 0.4063 (2) | 0.7350 (2) | 0.32155 (15) | 0.0405 (4) | |
C3A公司 | 0.4134 (2) | 0.6780 (2) | 0.20418 (15) | 0.0423 (4) | |
H3A型 | 0.5197 | 0.6240 | 0.1713 | 0.053 (2)* | |
C4A公司 | 0.2674 (2) | 0.6995 (2) | 0.13545 (14) | 0.0399 (4) | |
H4A型 | 0.2726 | 0.6605 | 0.0551 | 0.053 (2)* | |
C5A公司 | 0.1135 (2) | 0.7775 (2) | 0.18304 (14) | 0.0393 (4) | |
C6A型 | 0.1162 (2) | 0.8312 (2) | 0.30039 (15) | 0.0429 (4) | |
H6A型 | 0.0106 | 0.8851 | 0.3342 | 0.053 (2)* | |
C7A型 | 0.5634 (2) | 0.7155 (3) | 0.40036 (16) | 0.0541 (5) | |
H7AA型 | 0.5118 | 0.6406 | 0.4460 | 0.060 (2)* | 0.768 (18) |
H7AB型 | 0.6188 | 0.8374 | 0.4510 | 0.060 (2)* | 0.768 (18) |
H7AC型 | 0.6620 | 0.6558 | 0.3555 | 0.060 (2)* | 0.768 (18) |
H7AD型 | 0.6833 | 0.7820 | 0.3890 | 0.060 (2)* | 0.232 (18) |
H7AE型 | 0.5762 | 0.5851 | 0.3839 | 0.060 (2)* | 0.232 (18) |
H7AF型 | 0.5331 | 0.7667 | 0.4795 | 0.060 (2)* | 0.232 (18) |
C8A公司 | −0.0512 (2) | 0.8010 (3) | 0.11044 (16) | 0.0562 (5) | |
H8AA型 | −0.0027 | 0.8536 | 0.0529 | 0.060 (2)* | 0.638 (17) |
H8AB型 | −0.1309 | 0.8836 | 0.1587 | 0.060 (2)* | 0.638 (17) |
H8AC型 | −0.1271 | 0.6811 | 0.0725 | 0.060 (2)* | 0.638 (17) |
H8AD公司 | −0.1712 | 0.7585 | 0.1365 | 0.060 (2)* | 0.362 (17) |
H8AE公司 | −0.0429 | 0.7286 | 0.0307 | 0.060 (2)* | 0.362 (17) |
H8AF型 | −0.0467 | 0.9311 | 0.1169 | 0.060 (2)* | 0.362 (17) |
N1B型 | 0.26955 (18) | 0.69075 (19) | 0.84937 (12) | 0.0430 (4) | |
C2B型 | 0.4229 (2) | 0.7806 (2) | 0.81909 (13) | 0.0358 (4) | |
C3B型 | 0.4128 (2) | 0.8328 (2) | 0.72224 (14) | 0.0401 (4) | |
H3B型 | 0.5225 | 0.8950 | 0.7022 | 0.053 (2)* | |
C4B型 | 0.2446 (2) | 0.7952 (2) | 0.65465 (14) | 0.0380 (4) | |
H4B型 | 0.2381 | 0.8313 | 0.5881 | 0.053 (2)* | |
C5B型 | 0.0858 (2) | 0.7052 (2) | 0.68387 (13) | 0.0368 (4) | |
C6B型 | 0.1067 (2) | 0.6566 (2) | 0.78164 (14) | 0.0409 (4) | |
H6B型 | −0.0019 | 0.5943 | 0.8027 | 0.053 (2)* | |
C7B型 | 0.6037 (2) | 0.8188 (2) | 0.89500 (15) | 0.0510 (5) | |
H7BA型 | 0.5774 | 0.7867 | 0.9640 | 0.060 (2)* | 0.593 (18) |
H7BB型 | 0.6540 | 0.9495 | 0.9161 | 0.060 (2)* | 0.593 (18) |
H7BC公司 | 0.6975 | 0.7449 | 0.8544 | 0.060 (2)* | 0.593 (18) |
H7BD型 | 0.7086 | 0.8674 | 0.8591 | 0.060 (2)* | 0.407 (18) |
H7BE公司 | 0.6319 | 0.7046 | 0.9069 | 0.060 (2)* | 0.407 (18) |
H7高炉 | 0.5885 | 0.9092 | 0.9686 | 0.060 (2)* | 0.407 (18) |
C8B类 | −0.1029 (2) | 0.6634 (2) | 0.61414 (15) | 0.0520 (5) | |
H8BA型 | −0.0871 | 0.6974 | 0.5449 | 0.060 (2)* | 0.627 (18) |
h8b型 | −0.1952 | 0.7338 | 0.6590 | 0.060 (2)* | 0.627 (18) |
H8BC型 | −0.1490 | 0.5317 | 0.5933 | 0.060 (2)* | 0.627 (18) |
H8BD型 | −0.2005 | 0.6112 | 0.6532 | 0.060 (2)* | 0.373 (18) |
H8BE型 | −0.0924 | 0.5748 | 0.5391 | 0.060 (2)* | 0.373 (18) |
H8BF型 | −0.1385 | 0.7769 | 0.6048 | 0.060 (2)* | 0.373 (18) |
原子位移参数(2) 顶部 | U型11 | U型22 | U型33 | U型12 | U型13 | U型23 |
N1A型 | 0.0508 (8) | 0.0478 (8) | 0.0395 (9) | 0.0071 (6) | 0.0022 (7) | 0.0160 (7) |
C2A公司 | 0.0431 (8) | 0.0389 (9) | 0.0415 (10) | 0.0036 (7) | 0.0002 (7) | 0.0166 (8) |
C3A型 | 0.0448 (8) | 0.0414 (9) | 0.0434 (11) | 0.0072 (7) | 0.0097 (8) | 0.0161 (8) |
C4A公司 | 0.0507 (9) | 0.0398 (9) | 0.0285 (9) | 0.0001 (7) | 0.0036 (7) | 0.0120 (7) |
C5A公司 | 0.0430 (8) | 0.0371 (9) | 0.0389 (10) | −0.0004 (7) | −0.0016 (7) | 0.0163 (7) |
C6A型 | 0.0452 (9) | 0.0446 (10) | 0.0423 (11) | 0.0093 (7) | 0.0057 (8) | 0.0172 (8) |
C7A型 | 0.0528 (10) | 0.0615 (12) | 0.0510 (12) | 0.0093 (9) | −0.0058 (9) | 0.0229 (10) |
C8A公司 | 0.0534 (10) | 0.0613 (12) | 0.0542 (13) | 0.0063 (9) | −0.0096 (9) | 0.0213 (10) |
N1B型 | 0.0452 (7) | 0.0484 (8) | 0.0388 (9) | 0.0069 (6) | 0.0030 (6) | 0.0187 (7) |
C2B型 | 0.0387 (8) | 0.0335 (8) | 0.0341 (9) | 0.0080 (6) | 0.0023 (7) | 0.0083 (7) |
C3B型 | 0.0395 (8) | 0.0399 (9) | 0.0437 (11) | 0.0047 (7) | 0.0082 (7) | 0.0171 (8) |
C4B型 | 0.0470 (8) | 0.0417 (9) | 0.0312 (9) | 0.0122 (7) | 0.0068 (7) | 0.0174 (7) |
C5B型 | 0.0385 (8) | 0.0353 (9) | 0.0354 (10) | 0.0088 (7) | 0.0014 (7) | 0.0085 (7) |
C6B型 | 0.0383 (8) | 0.0423 (9) | 0.0432 (11) | 0.0026 (7) | 0.0057 (7) | 0.0161 (8) |
C7B公司 | 0.0445 (9) | 0.0537 (11) | 0.0502 (12) | 0.0084 (8) | −0.0061 (8) | 0.0106 (9) |
C8B类 | 0.0452 (9) | 0.0546 (11) | 0.0509 (12) | 0.0111 (8) | −0.0069 (8) | 0.0089 (9) |
几何参数(λ,º) 顶部
N1A-C6A型 | 1.350 (2) | N1B-C6B型 | 1.3489 (19) |
N1A-C2A型 | 1.350 (2) | N1B至C2B | 1.352 (2) |
C2A-C3A型 | 1.387 (2) | C2B-C3B型 | 1.382 (2) |
C2A-C7A型 | 1.503 (2) | C2B-C7B型 | 1.5018 (19) |
C3A-C4A型 | 1.372 (2) | C3B-C4B型 | 1.377 (2) |
C3A-H3A型 | 0.950 | C3B-H3B型 | 0.950 |
C4A-C5A型 | 1.376 (2) | C4B-C5B型 | 1.376 (2) |
C4A-H4A型 | 0.950 | C4B-H4B型 | 0.950 |
C5A-C6A | 1.381 (2) | C5B-C6B型 | 1.383 (2) |
C5A-C8A型 | 1.508 (2) | C5B-C8B型 | 1.5074 (19) |
C6A-H6A型 | 0.950 | C6B-H6B型 | 0.950 |
C7A-H7AA型 | 0.980 | C7B-H7BA | 0.980 |
C7A-H7AB型 | 0.980 | C7B-H7BB型 | 0.980 |
C7A-H7AC型 | 0.980 | C7B-H7BC型 | 0.980 |
C7A-H7AD型 | 0.980 | C7B-H7BD型 | 0.980 |
C7A-H7AE型 | 0.980 | C7B-H7BE型 | 0.980 |
C7A-H7AF型 | 0.980 | C7B-H7BF | 0.980 |
C8A-H8AA | 0.980 | C8B-H8BA型 | 0.980 |
C8A-H8AB型 | 0.980 | C8B-H8BB型 | 0.980 |
C8A-H8AC型 | 0.980 | C8B-H8BC型 | 0.980 |
C8A-H8AD | 0.980 | C8B-H8BD型 | 0.980 |
C8A-H8AE | 0.980 | C8B-H8BE型 | 0.980 |
C8A-H8AF型 | 0.980 | C8B-H8BF型 | 0.980 |
| | | |
C6A-N1A-C2A型 | 116.96 (15) | C6B-N1B-C2B | 117.02 (15) |
N1A-C2A-C3A | 121.25 (15) | N1B-C2B-C3B | 121.16 (13) |
N1A-C2A-C7A | 116.68 (16) | N1B-C2B-C7B | 116.79 (15) |
C3A-C2A-C7A | 122.06 (15) | C3B-C2B-C7B | 122.05 (15) |
C4A-C3A-C2A型 | 120.14 (15) | C4B-C3B-C2B | 120.38 (15) |
C4A-C3A-H3A型 | 119.9 | C4B-C3B-H3B型 | 119.8 |
C2A-C3A-H3A型 | 119.9 | C2B-C3B-H3B型 | 119.8 |
C3A-C4A-C5A | 119.91 (16) | C5B-C4B-C3B | 119.72 (16) |
C3A-C4A-H4A | 120 | C5B-C4B-H4B | 120.1 |
C5A-C4A-H4A | 120 | C3B-C4B-H4B | 120.1 |
C4A-C5A-C6A型 | 116.77 (15) | C4B-C5B-C6B型 | 116.69 (14) |
C4A-C5A-C8A | 121.58 (16) | C4B-C5B-C8B | 121.98 (16) |
C6A-C5A-C8A | 121.65 (15) | C6B-C5B-C8B | 121.33 (15) |
N1A-C6A-C5A | 124.96 (15) | N1B-C6B-C5B | 125.02 (15) |
N1A-C6A-H6A | 117.5 | N1B-C6B-H6B | 117.5 |
C5A-C6A-H6A | 117.5 | C5B-C6B-H6B | 117.5 |
C2A-C7A-H7AA型 | 109.5 | C2B-C7B-H7BA型 | 109.5 |
C2A-C7A-H7AB | 109.5 | C2B-C7B-H7BB型 | 109.5 |
H7AA-C7A-H7AB型 | 109.5 | H7BA-C7B-H7BB型 | 109.5 |
C2A-C7A-H7AC型 | 109.5 | C2B-C7B-H7BC型 | 109.5 |
H7AA-C7A-H7AC | 109.5 | H7BA-C7B-H7BC型 | 109.5 |
H7AB-C7A-H7AC型 | 109.5 | H7BB-C7B-H7BC型 | 109.5 |
C2A-C7A-H7AD型 | 109.5 | C2B-C7B-H7BD | 109.5 |
C2A-C7A-H7AE型 | 109.5 | C2B-C7B-H7BE型 | 109.5 |
H7AD-C7A-H7AE型 | 109.5 | H7BD-C7B-H7BE型 | 109.5 |
C2A-C7A-H7AF型 | 109.5 | C2B-C7B-H7BF型 | 109.5 |
H7AD-C7A-H7AF型 | 109.5 | H7BD-C7B-H7BF型 | 109.5 |
H7AEC7A-H7AF型 | 109.5 | H7BE-C7B-H7BF型 | 109.5 |
C5A-C8A-H8AA | 109.5 | C5B-C8B-H8BA型 | 109.5 |
C5A-C8A-H8AB | 109.5 | C5B-C8B-H8BB型 | 109.5 |
H8AA-C8A-H8AB型 | 109.5 | H8BA-C8B-H8BB型 | 109.5 |
C5A-C8A-H8AC | 109.5 | C5B-C8B-H8BC型 | 109.5 |
H8AA-C8A-H8AC | 109.5 | H8BA-C8B-H8BC | 109.5 |
H8AB-C8A-H8AC | 109.5 | H8BB-C8B-H8BC型 | 109.5 |
C5A-C8A-H8AD | 109.5 | C5B-C8B-H8BD型 | 109.5 |
C5A-C8A-H8AE | 109.5 | C5B-C8B-H8BE型 | 109.5 |
H8AD-C8A-H8AE | 109.5 | H8BD-C8B-H8BE型 | 109.5 |
C5A-C8A-H8AF型 | 109.5 | C5B-C8B-H8BF型 | 109.5 |
H8AD-C8A-H8AF型 | 109.5 | H8BD-C8B-H8BF型 | 109.5 |
H8AE-C8A-H8AF型 | 109.5 | H8BE-C8B-H8BF型 | 109.5 |
| | | |
C6A-N1A-C2A-C3A | 0.4 (2) | C6B-N1B-C2B-C3B | −0.7 (2) |
C6A-N1A-C2A-C7A | 179.80 (15) | C6B-N1B-C2B-C7B | 179.83 (14) |
N1A-C2A-C3A-C4A | −0.2 (3) | N1B-C2B-C3B-C4B | 0.5 (2) |
C7A-C2A-C3A-C4A | −179.60 (16) | C7B-C2B-C3B-C4B | 179.92 (14) |
C2A-C3A-C4A-C5A | −0.1 (2) | C2B-C3B-C4B-C5B | 0.0 (2) |
C3A-C4A-C5A-C6A | 0.1 (2) | C3B-C4B-C5B-C6B | −0.3 (2) |
C3A-C4A-C5A-C8A | −179.07 (15) | C3B-C4B-C5B-C8B | 178.94 (14) |
C2A-N1A-C6A-C5A | −0.3 (3) | C2B-N1B-C6B-C5B | 0.5 (2) |
C4A-C5A-C6A-N1A | 0.1 (3) | C4B-C5B-C6B-N1B | 0.0 (2) |
C8A-C5A-C6A-N1A | 179.26 (16) | C8B-C5B-C6B-N1B型 | −179.19 (14) |
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-小时···A类 | D类-H(H) | H(H)···A类 | D类···A类 | D类-小时···A类 |
补体第四成份B类-H4型B类···N1型A类 | 0.95 | 2.66 | 3.567 (2) | 159 |
补体第四成份A类-H4型A类···N1型B类我 | 0.95 | 2.63 | 3.525 (2) | 157 |
实验细节
水晶数据 |
化学配方 | C7H(H)9N个 |
M(M)第页 | 107.15 |
晶体系统,空间组 | 三联诊所,P(P)1 |
温度(K) | 150 |
一,b条,c(c)(Å) | 7.0991 (4), 7.7279 (5), 12.3900 (9) |
α,β,γ(°) | 108.139 (4), 92.399 (4), 96.743 (5) |
V(V)(Å三) | 639.26 (7) |
Z轴 | 4 |
辐射类型 | 钼K(K)α |
µ(毫米−1) | 0.07 |
晶体尺寸(mm) | 0.15(半径) |
|
数据收集 |
衍射仪 | Nonius KappaCCD公司 衍射仪 |
吸收校正 | – |
测量的、独立的和 观察到的[我> 2σ(我)]反射 | 4192, 2827, 1643 |
R(右)整数 | 0.030 |
(罪θ/λ)最大值(Å−1) | 0.649 |
|
精炼 |
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司 | 0.054, 0.145, 1.03 |
反射次数 | 2827 |
参数数量 | 155 |
氢原子处理 | 受约束的氢原子参数 |
Δρ最大值, Δρ最小值(eÅ)−三) | 0.14,−0.13 |
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