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标题化合物C中氰基甲基和4-溴苯基取代基的位置17H(H)13英国北卡罗来纳州42经单晶X射线结构测定证实。晶体填充显示出弱的氢键和芳香族π–π相互作用。

支持信息

到岸价

结晶信息文件(CIF)https://doi.org/10.1107/S1600536801004986/bt6027sup1.cif
包含全局数据块,I

香港特别行政区

结构系数文件(CIF格式)https://doi.org/10.1107.S1600536801004986/bt6027Isup2.hkl
包含数据块I

CCDC参考:165649

关键指标

  • 单晶X射线研究
  • T型=296千
  • 平均值[西格玛](C-C)=0.007º
  • R(右)系数=0.043
  • 水风险系数=0.120
  • 数据与参数之比=16.5

检查CIF结果

未发现语法错误ADDSYM报告没有额外的对称性
黄色警报警报级别C:
防抱死制动系统TM_02警报C预期与报告的Tmax/Tmin(RR)之比>1.10报告的Tmin和Tmax:0.509 0.769预期Tmin和Tmax:0.398 0.769RR=1.277请检查您的吸收校正是否适当。
0警报级别A=潜在的严重问题
0警报级别B=潜在问题
1警报级别C=请检查

注释顶部

治疗的重要性(Furuya和Ohataki,1994,b;海伯尔et(等)阿尔。, 1993; 派珀等。,1989)的适当功能化吡啶[2,3-d日]嘧啶环系统激发了我们开发创新的合成,其中不同的取代基可以排列在药效模式显示出多种药理活性订单。制备了标题化合物(I)(Srivastava等。, 2000)通过环变换反应6-芳基-3-氰基-4-甲硫基-2H(H)-吡喃-2-酮和6-氨基-1,3-二甲基尿嘧啶。目前的X射线晶体学研究承诺确认(I)的结构。

(I)的构造以及原子编号方案如图所示。1.该分子包含一个熔合环系统(A/B),其中溴苯基环(C)安装在7位置。所有环均为平面[偏差原子的最小平方平面在范围内-0.015 (3)–0.011 (3) Å]. 溴苯环与A/B环共面系统[扭转角N8-C7-C71-C72-179.0(4)°]。氰基是拧出A/B平面。晶体结构分析揭示了弱氢键相互作用的存在,如C-H··N、C-H··Br和C-H··O(图2和表1)。此外,晶体填料(图3)也显示了由于ππ相互作用环B和环C(Hunter&Sanders,1990)。重叠环(B和C)位于“平行方向”;之间的平均间隔距离它们的平均平面为3.480(6)°,它们之间的夹角为1.0(3)°。这个(I)晶体结构中的不同分子间相互作用很可能是分子中可能的相互作用的反映从不同的药理学特性看识别过程与适当功能化的吡啶[2,3-d日]嘧啶。

实验顶部

(I)的合成是通过6-氨基-1,3-二甲基尿嘧啶的反应进行的含6-(4-溴苯基)-3-氰基-4-甲硫基-2H(H)-吡喃-2-酮(Srivastava等。, 2000). 衍射质量的晶体是通过慢速生长从二氯甲烷-乙酸乙酯混合物中的溶液中蒸发室温。

精炼顶部

所有氢原子都被放置在几何理想位置,并允许骑在它们的母原子上,每一个原子都与之结合精细化。

计算详细信息顶部

数据收集:Rigaku/AFC衍射仪控制软件(Rigaku,1995);细胞细化:Rigaku/AFC衍射仪控制软件;数据缩减:德克萨斯州(分子结构公司/Rigaku公司,1998年);用于求解结构的程序:SHELXS86型(谢尔德里克,1990年);用于优化结构的程序:SHELXL93钢(谢尔德里克,1993年);分子图形:NRCVAX公司(盖布等。,, 1989); 用于准备出版材料的软件:SHELXL93钢.

数字顶部
[图1] 图1。ORTEP公司(Johnson,1965)显示(一) 非H原子和位移椭球体标记为50%概率。
[图2] 图2。PLUTO公司(Motherwell&Clegg,1978)晶体填充图虚线形式的C-H··O氢键和C-H·•Br氢键如虚线所示。
[图3] 图3。晶体堆积(垂直于穿过C6原子的平面,环B的C7和N8)显示部分重叠(如黑色所示由于分子间堆积,环B和环C的脱落)。
7-(4-溴苯基)-5-氰甲基-1,3-二甲基-2,4-二氧吡啶[2,3-d日]嘧啶顶部
水晶数据 顶部
C类17H(H)13英国北卡罗来纳州42F类(000) = 388
M(M)第页= 385.22D类x=1.628毫克米
三联诊所,P(P)1熔点=220–230 K
= 8.728 (3) ÅK(K)α辐射,λ= 0.71073 Å
b条= 12.087 (4) Å24次反射的细胞参数
c(c)= 8.672 (3) Åθ= 14.7–15.0°
α= 108.22 (3)°µ=2.63毫米1
β= 113.43 (2)°T型=296千
γ= 91.24 (3)°块,无色
V(V)= 786.1 (5) Å0.4×0.3×0.1毫米
Z= 2
数据收集 顶部
里加库AFC-5R
衍射仪
2254次反射> 2σ()
辐射源:旋转阳极R(右)整数= 0.000
石墨单色仪θ最大值= 27.5°,θ最小值= 2.6°
ω–2θ扫描小时=1111
吸收校正:经验(使用强度测量)
(德克萨斯州; 分子结构公司/Rigaku公司,1998年)
k个=150
T型最小值= 0.509,T型最大值= 0.769=1011
3619次测量反射每150次反射中有3次标准反射
3619个独立反射强度衰减:<0.2%
精炼 顶部
优化于F类2主原子位置定位:结构-变量直接方法
最小二乘矩阵:完整二次原子位置:差分傅里叶映射
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.043氢站点位置:从邻近站点推断
水风险(F类2) = 0.120受约束的氢原子参数
S公司= 1.03 w个= 1/[σ2(F类o个2) + (0.0669P(P))2+ 0.8316P(P)]
哪里P(P)= (F类o个2+ 2F类c(c)2)/3
3616次反射(Δ/σ)最大值< 0.001
219个参数Δρ最大值=0.48埃
0个约束Δρ最小值=0.43埃
水晶数据 顶部
C类17H(H)13英国北卡罗来纳州42γ= 91.24 (3)°
M(M)第页= 385.22V(V)= 786.1 (5) Å
三联诊所,P(P)1Z= 2
= 8.728 (3) ÅK(K)α辐射
b条= 12.087 (4) ŵ=2.63毫米1
c(c)= 8.672 (3) ÅT型=296千
α= 108.22 (3)°0.4×0.3×0.1毫米
β= 113.43 (2)°
数据收集 顶部
里加库AFC-5R
衍射仪
2254次反射> 2σ()
吸收校正:经验(使用强度测量)
(德克萨斯州; 分子结构公司/Rigaku公司,1998年)
R(右)整数= 0.000
T型最小值= 0.509,T型最大值= 0.769每150次反射中有3次标准反射
3619次测量反射强度衰减:<0.2%
3619个独立反射
精炼 顶部
R(右)[F类2> 2σ(F类2)] = 0.0430个约束
水风险(F类2) = 0.120受约束的氢原子参数
S公司= 1.03Δρ最大值=0.48埃
3616次反射Δρ最小值=0.43埃
219个参数
特殊细节 顶部

几何形状.所有e.s.d.(两个l.s.平面之间二面角的e.s.d.除外)使用全协方差矩阵进行估计在估计e.s.d.的距离、角度时单独考虑和扭转角;e.s.d.细胞内参数之间的相关性仅为当它们由晶体对称性定义时使用。近似(各向同性)细胞e.s.d.的处理用于估计涉及l.s.的e.s.d。飞机。

精炼.优化F类2对于所有反射,除了3个非常负的反射F类2或者由用户标记潜在的系统错误。加权R(右)-因素水风险以及所有适合的优点S公司基于F类2,常规R(右)-因素R(右)基于F类,具有F类负值设置为零F类2。阈值表达式属于F类2>σ(F类2)仅用于计算R_factors(gt).与选择反射进行细化无关。R(右)-因素基于F类2从统计上看大约是两倍大作为基于F类、和R(右)-基于所有数据的因素甚至更大。

分数原子坐标和各向同性或等效各向同性位移参数2) 顶部
xz(z)U型国际标准化组织*/U型等式
英国0.08388 (7)0.28864 (4)0.14885 (8)0.0565 (2)
C1A公司0.5035 (5)0.3069 (3)0.0501 (6)0.0348 (8)
N1型0.4360 (4)0.3982 (3)0.2164 (5)0.0402 (8)
C11号机组0.2806 (6)0.3883 (4)0.3600 (6)0.0558 (13)
H11A型0.29390.31300.37260.084*
H11B型0.18680.39520.33030.084*
H11C型0.25950.45020.47090.084*
指挥与控制0.5054 (6)0.4975 (4)0.2526 (6)0.0418 (9)
O21号机组0.4402 (5)0.5786 (3)0.3964 (5)0.0631 (10)
N3号机组0.6523 (5)0.5053 (3)0.1141 (5)0.0422 (8)
C31号机组0.7350 (7)0.6072 (4)0.1563 (7)0.0540 (12)
H31A型0.66680.65990.27640.081*
H31B型0.74830.64780.07370.081*
H31C型0.84430.58090.14630.081*
补体第四成份0.7317 (5)0.4211 (4)0.0569 (6)0.0411 (9)
O41号机组0.8613 (4)0.4372 (3)0.1683 (5)0.0575 (9)
C4A公司0.6496 (5)0.3176 (3)0.0898 (6)0.0357 (8)
C5级0.7086 (5)0.2240 (4)0.2554 (6)0.0387 (9)
第51页0.8651 (6)0.2219 (5)0.4198 (6)0.0502 (11)
H51A型0.85990.16900.52730.060*
H51B型0.86680.30040.42680.060*
第52页1.0196 (7)0.1826 (5)0.4111 (7)0.0556 (12)
53号1.1398 (6)0.1492 (5)0.4054 (8)0.084 (2)
C6型0.6231 (5)0.1299 (4)0.2705 (6)0.0397 (9)
H6型0.65960.06830.38010.048*
抄送70.4812 (5)0.1261 (3)0.1220 (6)0.0352 (8)
C71号机组0.3874 (5)0.0253 (3)0.1297 (6)0.0353 (8)
C72号机组0.4376 (6)0.0728 (4)0.2855 (6)0.0444 (10)
H72型0.53180.07540.38790.053*
C73号机组0.3483 (6)0.1675 (4)0.2903 (6)0.0467 (10)
H73型0.38380.23330.39470.056*
抄送740.2074 (6)0.1626 (4)0.1392 (6)0.0412 (9)
C75码0.1566 (6)0.0668 (4)0.0179 (6)0.0449 (10)
H75型0.06230.06440.11990.054*
C76号0.2483 (6)0.0266 (4)0.0221 (6)0.0444 (10)
H76型0.21550.09060.12840.053*
N8号0.4227 (4)0.2154 (3)0.0368 (5)0.0354 (7)
原子位移参数(2) 顶部
U型11U型22U型33U型12U型13U型23
英国0.0632 (3)0.0492 (3)0.0733 (4)0.0251 (2)0.0380 (3)0.0292 (2)
C1A公司0.038 (2)0.031 (2)0.037 (2)0.004 (2)0.017 (2)0.012 (2)
1个0.041 (2)0.035 (2)0.037 (2)0.0084 (15)0.013 (2)0.0072 (15)
C11号机组0.058 (3)0.052 (3)0.036 (2)0.015 (2)0.008 (2)0.003 (2)
指挥与控制0.047 (2)0.036 (2)0.046 (3)0.011 (2)0.024 (2)0.014 (2)
O21号机组0.072 (2)0.042 (2)0.056 (2)0.013 (2)0.021 (2)0.001 (2)
N3号机组0.043 (2)0.035 (2)0.054 (2)0.011 (2)0.026 (2)0.016 (2)
C31号机组0.060 (3)0.042 (2)0.070 (3)0.023 (2)0.035 (3)0.022 (2)
补体第四成份0.038 (2)0.044 (2)0.050 (3)0.009 (2)0.022 (2)0.022 (2)
O41号机组0.051 (2)0.060 (2)0.063 (2)0.024 (2)0.019 (2)0.029 (2)
C4A公司0.034 (2)0.037 (2)0.040 (2)0.009 (2)0.018 (2)0.017 (2)
C5级0.038 (2)0.044 (2)0.037 (2)0.008 (2)0.016 (2)0.018 (2)
第51页0.049 (3)0.057 (3)0.038 (2)0.010 (2)0.012 (2)0.017 (2)
第52页0.044 (3)0.061 (3)0.041 (3)0.009 (2)0.003 (2)0.011 (2)
53号0.041 (3)0.102 (4)0.085 (4)0.001 (3)0.012 (3)0.025 (3)
C6型0.040 (2)0.038 (2)0.035 (2)0.005 (2)0.015 (2)0.006 (2)
抄送70.034 (2)0.034 (2)0.039 (2)0.005 (2)0.018 (2)0.011 (2)
C71号机组0.034 (2)0.034 (2)0.038 (2)0.006 (2)0.016 (2)0.011 (2)
C72号机组0.041 (2)0.041 (2)0.039 (2)0.006 (2)0.013 (2)0.004 (2)
C73号机组0.052 (3)0.037 (2)0.045 (3)0.007 (2)0.021 (2)0.005 (2)
抄送740.045 (2)0.039 (2)0.050 (3)0.009 (2)0.027 (2)0.020 (2)
C75码0.042 (2)0.048 (2)0.040 (2)0.007 (2)0.012 (2)0.016 (2)
C76号0.048 (2)0.042 (2)0.038 (2)0.005 (2)0.016 (2)0.010 (2)
N8号0.034 (2)0.034 (2)0.035 (2)0.0064 (14)0.0137 (15)0.0104 (14)
几何参数(λ,º) 顶部
溴-C741.885 (4)C5至C61.374 (6)
C1A-N8号机组1.323 (5)C5-C51型1.525 (6)
C1A-N1型1.395 (5)C51-C521.458 (7)
C1A-C4A型1.411 (6)C52-N53型1.140 (7)
N1-C2型1.361 (5)C6至C71.402 (6)
N1-C11号机组1.470 (6)C7-N8号机组1.345 (5)
C2-O21型1.220 (5)C7-C71号1.481 (5)
C2-N3型1.395 (6)C71至C761.387 (6)
N3-C41.387 (6)C71至C721.388 (6)
编号3-C311.463 (5)C72至C731.398 (6)
C4-O41型1.228 (5)C73至C741.379 (7)
C4-C4A型1.462 (6)C74至C751.380 (6)
C4A-C5型1.406 (6)C75-C76号1.397 (6)
N8-C1A-N1型116.1 (4)C6-C5-C51型118.3 (4)
N8-C1A-C4A124.9 (4)C4A-C5-C51型122.7 (4)
N1-C1A-C4A型119.0 (4)C52-C51-C5111.0 (4)
C2-N1-C1A型123.3 (4)N53-C52-C51型178.4 (6)
C2-N1-C11型117.9 (3)C5-C6-C7120.5 (4)
C1A-N1-C11号机组118.8 (3)N8-C7-C6121.0 (4)
O21-C2-N1型122.3 (4)N8-C7-C71号116.3 (4)
O21-C2-N3型120.7 (4)C6-C7-C71122.7 (4)
N1-C2-N3型116.9 (4)C76-C71-C72号118.6 (4)
C4-N3-C2型125.4 (4)C76-C71-C7号119.9 (4)
C4-N3-C31型117.3 (4)C72-C71-C7号121.5 (4)
C2-N3-C31型117.2 (4)C71-C72-C73号120.7 (4)
O41-C4-N3型119.8 (4)C74-C73-C72号119.6 (4)
O41-C4-C4A型124.8 (4)C73-C74-C75号120.7 (4)
N3-C4-C4A号115.4 (4)C73-C74-Br号119.3 (3)
C5-C4A-C1A116.1 (4)C75-C74-Br120.1 (3)
C5至C4至C4123.9 (4)C74-C75-C76号119.3 (4)
C1A-C4A-C4119.9 (4)C71-C76-C75号121.0 (4)
C6-C5-C4A型119.1 (4)C1A-N8-C7型118.3 (3)
N8-C1A-N1-C2179.0 (4)C4-C4A-C5-C510.8 (6)
C4A-C1A-N1-C21.0 (6)C6-C5-C51-C5298.7 (5)
N8-C1A-N1-C11号1.9 (6)C4A-C5-C51-C52型81.0 (5)
C4A-C1A-N1-C11178.0 (4)C4A-C5-C6-C7型1.4 (6)
C1A-N1-C2-O21176.7 (4)C51-C5-C6-C7178.3 (4)
C11-N1-C2-O212.4 (7)C5-C6-C7-N81.9 (6)
C1A-N1-C2-N3型0.6 (6)C5-C6-C7-C71178.3 (4)
C11-N1-C2-N3型179.7 (4)N8-C7-C71-C76号0.4 (6)
O21-C2-N3-C4176.6 (4)C6-C7-C71-C76179.8 (4)
N1-C2-N3-C40.7 (6)N8-C7-C71-C72179.0 (4)
O21-C2-N3-C31型7.4 (6)C6-C7-C71-C721.2 (6)
N1-C2-N3-C31175.3 (4)C76-C71-C72-C73号1.0 (7)
C2-N3-C4-O41179.7 (4)C7-C71-C72-C73179.6 (4)
C31-N3-C4-O413.7 (6)C71-C72-C73-C74号0.9 (7)
C2-N3-C44a0.7 (6)C72-C73-C74-C75号1.8 (7)
C31-N3-C4-C4A176.7 (4)C72-C73-C74-Br178.1 (3)
N8-C1A-C4A-C51.5 (6)C73-C74-C75-C76号0.8 (7)
N1-C1A-C4A-C5178.4 (4)溴-C74-C75-C76179.2 (3)
N8-C1A-C4A-C4177.6 (4)C72-C71-C76-C75号2.0 (7)
N1-C1A-C4A-C42.5 (6)C7-C71-C76-C75179.4 (4)
O41-C4-C4A-C5型0.8 (7)C74-C75-C76-C71号1.1 (7)
N3-C4-C4A-C5178.7 (4)N1-C1A-N8-C7178.8 (3)
O41-C4-C4A-C1A型178.1 (4)C4A-C1A-N8-C71.1 (6)
N3-C4-C4A-C1A2.3 (6)C6-C7-N8-C1A0.6 (6)
C1A-C4A-C5-C60.2 (6)C71-C7-N8-C1A179.5 (3)
C4至C4至C5至C6178.8 (4)C52-N53-H75型-C75码36
C1A-C4A-C5-C51179.8 (4)
对称代码:(i)x+1,,z(z).
氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
C31-H31B类···英国ii(ii)0.963.073.701 (5)125
C31-H31B类···N8号0.962.813.639 (6)145
C31-H31C类···O41号机组0.962.663.600 (6)166
C6-H6··N53v(v)0.932.763.565 (7)146
C72-H72··N53v(v)0.932.653.476 (7)148
C73-H73··O21不及物动词0.932.323.223 (6)165
对称代码:(ii)x+1,1,z(z); (iii)x+1,1,z(z); (iv)x+2,1,z(z); (v)x+2,,z(z)+1; (vi)x,+1,z(z)+1.

实验细节

水晶数据
化学配方C类17H(H)13英国北卡罗来纳州42
M(M)第页385.22
晶体系统,空间组三联诊所,P(P)1
温度(K)296
,b条,c(c)(Å)8.728 (3), 12.087 (4), 8.672 (3)
α,β,γ(°)108.22 (3), 113.43 (2), 91.24 (3)
V(V))786.1 (5)
Z2
辐射类型K(K)α
µ(毫米1)2.63
晶体尺寸(mm)0.4 × 0.3 × 0.1
数据收集
衍射仪里加库AFC-5R
衍射仪
吸收校正经验(使用强度测量)
(德克萨斯州; 分子结构公司/Rigaku公司,1998年)
T型最小值,T型最大值0.509, 0.769
测量、独立和
观察到的[> 2σ()]反射
3619, 3619, 2254
R(右)整数0
(罪θ/λ)最大值1)0.649
精炼
R(右)[F类2> 2σ(F类2)],水风险(F类2),S公司0.043, 0.120, 1.03
反射次数3616
参数数量219
氢原子处理受约束的氢原子参数
Δρ最大值, Δρ最小值(eó))0.48,0.43

计算机程序:Rigaku/AFC衍射仪控制软件(Rigaku,1995)、Rigaku-AFC衍射仪控制器软件、,德克萨斯州(分子结构公司/Rigaku公司,1998年),SHELXS86型(Sheldrick,1990),SHELXL93钢(谢尔德里克,1993),NRCVAX公司(盖布等。,, 1989),SHELXL93钢.

氢键几何形状(λ,º) 顶部
D类-H(H)···A类D类-H(H)H(H)···A类D类···A类D类-H(H)···A类
C31-H31B···Br0.963.073.701 (5)125
C31-H31B··N8ii(ii)0.962.813.639 (6)145
C31-H31C···O410.962.663.600 (6)166
C6-H6··N530.932.763.565 (7)146
C72-H72··N530.932.653.476 (7)148
C73-H73··O21v(v)0.932.323.223 (6)165
对称代码:(i)x+1,1,z(z); (ii)x+1,1,z(z); (iii)x+2,1,z(z); (iv)x+2,,z(z)+1; (v)x,+1,z(z)+1.
 

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