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结构
生物学

第78卷| 第8部分

国际标准编号：2059-7983

2022年8月号

封面插图：α-SAS在溶液中生物大分子结构建模中的应用[安妮塔斯（2022），《水晶学报》。D类78, 1046–1063]此图显示了球形Janus粒子的α形状的构造。

CCP-EM公司

结构动力学：时间分辨低温电子显微镜综述

M.-E.Mäeots公司和R.I.Enchev公司

时间分辨低温电子显微镜是结构生物学中的一种新兴技术，它允许用户捕捉结构状态，否则对于标准方法来说，这些状态将过于短暂。过去五年来，该领域的技术进步有所回升，本次审查总结了技术亮点。

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CCP4型

采用以结果为导向和以技能为基础的指导策略培训本科生研究助理

D.德拉·科尔特,C.J.莫里斯,W.M.账单,J.斯特恩,A.J.贾勒特,B.赫德利乌斯和A.本尼恩

研究发现，对本科生进行研究指导可以为科学学科做出有意义的贡献。在此，针对CASP14社区挑战，提出并评估了一种以结果为导向、以技能为基础的指导策略。

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研究论文

评估X射线损伤对室温（277 K）和低温蛋白质晶体构象异质性的影响

F.亚布卡尔斯基,T.杜科夫,D.A.莫赫塔里,S.Du公司和D.赫施拉格

高分辨率数据分析表明，X射线损伤对室温（277K）下蛋白质晶体的构象集合信息影响不大。相反，X射线损伤可以改变在普通实验条件下从低温晶体获得的构象分布，在某些情况下使结构解释复杂化。所给出的结果为室温X射线晶体学的广泛应用提供了强有力的动力。

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用“温度-溶解”大分子晶体学研究内切硫代胃蛋白酶的配体结合

C.-Y Huang,S.奥莫尼尔,S.Engilberge公司,D.埃利斯,K.M.L.史密斯,F.莱昂纳斯基,J.A.沃伊迪拉,J.H.比尔,D.本茨楚,A.保卢恩,M.E.夏普,A.梅茨,V.奥利埃里克和王先生

开发了一种室温X射线晶体学方法，以温度为触发点，记录电影般的结构快照，并用于研究配体结合和蛋白质可塑性。

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室温串行同步辐射晶体学果蝇属隐花色素

C.M.施奈普斯,A.甘古里和B.R.起重机

全长的结构果蝇属本文介绍了康奈尔高能同步辐射源用固定靶串行同步辐射晶体学解决的隐花色素问题。采用缩放和过滤方法来提高最终模型的整体质量。

PDB参考:果蝇属隐花色素，室温，7ud0

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室温下的固有SAD相位

J.B.格雷斯曼,K.M.道尔顿,C.J.希恩,M.A.Klureza先生,I.库里诺夫和D.R.Hekstra先生

室温晶体学使研究人员能够解决结构的构象异质性。这里，四种结构在295 K下的自然SAD定相突出了室温衍射实验的优势，包括详细的反常差异图和由电子密度很好支持的交替构象。

PDB参考:鸡蛋白溶菌酶，7l84;大肠杆菌二氢叶酸还原酶，7lvc;人蛋白酪氨酸磷酸酶1B，载脂蛋白，7rin;配有TCS401的复合体，7mm1

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从微流控液滴中生长的晶体收集数据

G.巴比格,D.谢雷尔,Y.Kim先生,J.L.约翰逊,B.诺切克,K.Tan先生,D.阿克斯福德,H.李,L.毕格罗,L.韦尔克,M.恩德斯,R.L.欧文和A.约阿奇米亚克

微流控液滴中生长的蛋白质晶体被证明是使用硅固定靶串行设备进行存储、传输和串行晶体学数据采集的有效且可靠的平台，对衍射质量的影响最小。

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用多极伪原子数据库模拟蛋白质的理论三维电子衍射静电势图

M.库利克,M.L.Chodkiewicz先生和P.M.多米尼克

基于可转移非球面原子模型，利用伪原子数据库计算了蛋白质的精确静电势图和电子密度图，并与实验数据进行了比较。

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硫SAD在具有大不对称单元和异常亚结构的小晶体中的应用

T.-C.牟,B.曾,T.I.杜科夫和S.R.斯普朗

采用多种数据合并、定标和反常亚结构测定方法，从硫SAD弱衍射晶体中求解大型非对称单元的结构。

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以水合二核苷酸为构建块的基于知识的DNA水合预测

L.Biedermannová,乔恩,M.马尔,内卡多娃和B.施耐德

结构和顺序不同的DNA二核苷酸片段周围的数据库衍生水概率密度再现了已知的水合基序，因此可以用作预测DNA水合的构建块。

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α-SAS：溶液中生物大分子结构建模的综合方法

E.M.阿尼塔斯

提出了一种模拟对比度变化小角度散射实验的新方法。

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CbpD的晶体结构阐明了几丁质活性裂解多糖单加氧酶的底物特异性基序

C.M.戴德,B.豆子,C.坎比劳,G.球,R.Voulhoux公司和K.T.森林

3º分辨率的晶体结构铜绿假单胞菌毒力因子CbpD支持并挑战了裂解多糖单加氧酶如何结合甲壳素的现有模型，并提出了2型分泌系统底物如何与分泌机制相互作用的有趣可能性。这种结构还证明了新的AI驱动的蛋白质结构预测算法在使具有挑战性的结构目标易于处理方面的实用性。

PDB参考:CbpD，7平方米

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