（IUCr）结晶学报第D节第78卷第1部分，2022年1月

《水晶学报》。（2022）。D类78,1-13
https://doi.org/10.107/S2059798321012122

的含义AlphaFold公司2用于通过分子替换进行晶体定相

A.J.McCoy公司,桑米托医学博士和R.J.里德

The implications of theAlphaFold公司讨论了用于晶体相位策略的蛋白质结构建模软件。

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时间分辨串行同步辐射晶体学的最佳实践

E.C.舒尔茨,B.A.约克,A.R.皮尔逊和P.梅赫拉比

讨论了时间分辨结晶学实验的规划和执行过程中应考虑的关键因素，重点讨论了时间分辨率串行同步辐射结晶学。

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X射线衍射和体内研究揭示了克氏锥虫核苷二磷酸激酶1：一种新型螺旋低聚物结构

J.A.戈麦斯·巴罗佐,米兰达先生,C.A.佩雷拉,R.C.加拉特和C.F.阿吉拉尔

五元多六边形螺旋结构T.cruzi公司NDPK1由晶体学和体内研究。

PDB参考:克氏锥虫核苷二磷酸激酶1，7mk0

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激进的激进方法

刘彦（Y.Liu）,M.Biczysko先生和N.W.莫里亚蒂

基于量子化学计算定义的对氮氧自由基配体MTN的新限制允许精确地重新定义蛋白质结构。

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使用薄膜样品架在室温下捕获光敏膜蛋白的两种状态

D.阿克斯福德,P.J.法官,J.F.巴达·华雷斯,关锦涛,J.白桦,J.葡萄酒,A.瓦茨和I.莫莱斯

使用透明和不透明的聚合物薄膜样品支架，在室温下收集古神经毒素-3感光体的光适应和暗适应状态的高分辨率X射线衍射数据。

PDB参考:光适应Archaehodopsin-3，6guz;暗适应Archaehodopsin-3，6s63

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抗CRISPR相关2转录抑制抗CRISRP的分子基础

S.Y.Lee先生,G.E.金和H.H.公园

本研究解决了抗CRISPR-associated 2（Aca2）的晶体结构，并表明Aca2在溶液中形成二聚体，这对启动子结合至关重要；揭示了对DNA结合及其保存至关重要的特定残基。由于作用机制在不同的Aca蛋白家族中基本上是保守的，因此对它们的结构和功能提供了见解。

PDB参考:Aca2、7ezy

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B类-蛋白质晶体结构的因子精度

O.葡萄牙语

的准确性B类通过比较大量蛋白质晶体结构中的相同原子来估计的因子相当温和：接近9 Å²在环境温度结构和至6 Å²在低温结构中。这些数值与20年前的估计值相似，表明此后几乎没有变化。

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两个与同一隐秘结合囊结合的类药物片段的鉴定和表征类鼻疽伯克霍尔德菌DsbA公司

G.A.Petit公司,B.莫汉蒂,R.M.麦克马洪,S.Nebl公司,D.H.希尔科,K·L·王尔德,M.J.斯坎伦,J.L.马丁和M.A.哈利利

二硫键形成蛋白a中两个类药物片段与构象动力学位点的结合特性假鼻疽杆菌描述了。

PDB参考:BpsDsbA+片段1，70卢克;BpsDsbA+片段2，70万

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催化活性全息智人腺苷脱氨酶I采用闭合构象

M.T.马,M.R.詹宁斯,J.布拉泽克和R.L.利伯曼

与小鼠和牛的同源结构的预期相反，全人类腺苷脱氨酶1的结构表明，它在进入其活性位点时采用了闭合构象。这一发现为依赖同源物进行与蛋白质工程或药物开发等应用相关的结构推断提供了一个警示。

PDB参考:人腺苷脱氨酶1，7rtg

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根杆菌中植物生长促进因子YxaL的结构绒毛芽孢杆菌及其在蛋白质工程中的应用

J.金,H.范,Y.Baek先生,I.乔,Y.-H.金和N.-C.哈

测定了YxaL的晶体结构，揭示了具有结构变化的八叶片β-螺旋桨折叠。随后，根据该结构对该蛋白进行了改造，从而提高了植物的生长-繁殖活性。

PDB参考:YxaL，野生型（SeMet），7dxn;T175W/W215G突变体，7eq5;T175W/S213G/W215A突变体，7evf

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sub-2小型植物生物催化剂的CryoEM分析 Å分辨率

N.迪莫斯,C.P.O.赫尔默,A.M.Chánique先生,M.C.Wahl先生,R.库里斯特,T.希拉尔和B.Loll公司

尽管低温电子显微术已经彻底改变了结构生物学，但迄今为止，它在相对较小的酶的高分辨率结构分析中的适用性仍有待探索。这里，植物冰片脱氢酶的两个冷冻电镜结构为～120 kDa等于或小于2 报告了分辨率。

EMDB参考:药用鼠尾草冰片脱氢酶2，EMD-12739;迷迭香鼠尾草冰片脱氢酶1，EMD-12740

PDB参考:药用鼠尾草冰片脱氢酶2，7o6p;迷迭香鼠尾草冰片脱氢酶1，7o6q

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甘油作为单粒子冷冻电镜样品可接受添加剂的案例

B.巴桑塔,M.M.Hirschi先生,D.A.格罗特扬和G.C.着陆器

如～2.3所示，在单粒子低温EM缓冲液中加入甘油并不妨碍高分辨率结构测定小鼠去铁蛋白（～500）的分辨率重建 kDa）和an～3.3 Å分辨率重建兔肌肉醛缩酶（~160 kDa）在20%的情况下(v（v）/v（v）)甘油。

EMDB参考:200℃时获得的1.7%甘油中的脱铁蛋白肯尼亚，EMD-24795;200℃时获得的20%甘油中的脱铁蛋白肯尼亚，EMD-24796;300℃时获得的20%甘油中的脱铁蛋白 keV，EMD-24797;在200时获得的20%甘油中的醛缩酶肯尼亚，EMD-24798;300℃时获得的20%甘油醛缩酶肯尼亚，EMD-24799

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发行内容

2022年1月发布

CCP4型

的含义AlphaFold公司2用于通过分子替换进行晶体定相

时间分辨串行同步辐射晶体学的最佳实践

研究论文

X射线衍射和体内研究揭示了克氏锥虫核苷二磷酸激酶1：一种新型螺旋低聚物结构

激进的激进方法

使用薄膜样品架在室温下捕获光敏膜蛋白的两种状态

抗CRISPR相关2转录抑制抗CRISRP的分子基础

B类-蛋白质晶体结构的因子精度

两个与同一隐秘结合囊结合的类药物片段的鉴定和表征类鼻疽伯克霍尔德菌DsbA公司

催化活性全息智人腺苷脱氨酶I采用闭合构象

根杆菌中植物生长促进因子YxaL的结构绒毛芽孢杆菌及其在蛋白质工程中的应用

sub-2小型植物生物催化剂的CryoEM分析 Å分辨率

甘油作为单粒子冷冻电镜样品可接受添加剂的案例

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