（IUCr）结晶学报第D节第75卷第11部分，2019年11月

《水晶学报》。（2019）。D类75,947-958
https://doi.org/10.107/S2059798319011379

蛋白质晶体的高能相控X射线成像可视化

M.波利卡波夫,G.布伦科夫,I.斯尼吉列娃,A.斯尼吉列夫,S.齐默尔曼,K.Csanko公司,S.布罗克豪斯和T.R.施耐德

在PETRA III的大分子晶体学光束线P14上，用微米分辨率证明了高能相控X射线显微镜和不透明基质中蛋白质晶体的层析成像。

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XFEL数据的SAD阶段划分严重依赖于错误模型

A.S.布鲁斯特,A.博米克,R.博洛托夫斯基,D.门德斯,P.H.Zwart先生和N.K.绍特

XFEL数据的SAD定相被显示为需要来自合并反射强度的精确误差估计。本文介绍了各种处理误差的方法，包括使用非线性最小二乘法细化误差校正项的最佳实践方法。

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锌（II）和镁（II）复合物中Sonic Hedgehog蛋白的结构揭示了与肽药物设计相关的离子协调可塑性

R.Bonn-违约,Y.Gu先生,J.詹金斯,R·法桑和J.韦德金

Sonic Hedgehog（Shh）蛋白对胚胎模式至关重要，但当潜在的信号通路被异常激活时，它可能会导致各种癌症。在这里，人类Shh信号结构域的结构以与八面体配位的Zn的复合物的形式呈现²⁺和镁²⁺分辨率为1.43º的离子会引起局部变化。将离子配位模式与以前在分离或与结合伙伴复合物中确定的结构进行比较，这揭示了金属配位模式的显著可塑性，这对设计抑制信号通路的肽类药物具有意义。

PDB参考:人类Sonic Hedgehog N端信号域，6pjv

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冷蛋白质晶体中的溶剂流动、构象变化和晶格重排

D.W.莫罗,H.阿塔基西和R.E.索恩

通过将内部溶剂保持在完全液态、温度依赖性和时间依赖性的晶体无序和重排状态，可以在220至260之间的温度下观察到脱铁蛋白晶体中的蛋白质构象松弛和冷却后溶剂流动的明确证据这些结果阐明了冷却诱导晶体无序的原因和补救措施，并建议在温度低至200K的更接近天然溶剂条件下研究冷变性方面的可行性。

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周质结合蛋白AtzT的进化史

M.L.丹尼斯,L.Esquirol公司,T.内布尔,J.纽曼,C.斯科特和T.S.泥炭

AtzT的结构被认为与细菌对阿特拉津的吸收有关，通过使用乙基汞磷酸盐衍生物进行SAD定相来解决。随后发现结合部位的密度是蛋白质在整个纯化过程中保留的鸟嘌呤。用2-羟基阿特拉津取代鸟嘌呤，可以确定该底物的结合方式，并将其与该蛋白质的原始配体进行比较。

PDB参考:AtzT，磷酸乙基汞衍生物，6pi5;本地（鸟嘌呤结合），6pi6;2-羟基阿特拉津配合物，6pii

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抗体片段在结构上支持针对癌症靶点Mcl-1的药物发现活动

J.卢普塔克,M.比斯塔,D.费希尔,L.Flavell公司,N.高,K.威克森,S.L.卡兹米尔斯基,T.霍华德,P.B.罗林斯和D.哈格里夫斯

Mcl-1是药物治疗的重要肿瘤靶点，通过抑制其保护功能可以恢复正常的细胞凋亡。已使用单链抗体和Fab生成apo-Mcl-1晶体系统，该系统适用于迭代结构导向药物设计。

PDB参考:Mcl-1与scFv，apo，6qb3复合物;配体，6qb4;Mcl-1与Fab复合，6qb6;结合酒石酸盐的scFv，6qb9;工厂，6qbc;大肠杆菌-表达的scFv，6qf6;单链抗体，6qf9;Mcl-1–显示C-终端标签绑定的scFv复合体，6qfc

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提高分辨率的蛋白质晶体计算设计

杰利亚兹科夫,A.C.罗宾逊,B.加西亚-莫雷诺E。,J.M.伯杰和J.J.格雷

生物大分子的结晶学性质可能是不可预测的，蛋白质晶体不能始终产生高分辨率衍射数据。在这里描述的研究中，试图开发一种计算设计方法，以识别结晶蛋白质-蛋白质界面上的分辨率增强点突变。

PDB参考:葡萄球菌核酸酶变体Δ+PHS，K127L突变，6ok8;K133M突变体，6u0w;Q123D突变，6u0x

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晶体结构枯草芽孢杆菌前噬菌体裂解盒蛋白XepA和YomS

S.Freitag-Pohl公司,A.茉莉花属,M.Hákansson先生,L.A.斯文森,R.科瓦奇奇,M.韦林,H.瓦兹拉威克,L·王,J.阿尔滕布什纳,M.Płotka先生,A.K.卡佐罗夫斯卡,T.卡佐罗夫斯基,E.Nordberg Karlsson公司,S.Al-Karadaghi公司,B.沃尔斯,A.艾瓦尔森和E.波尔

裂解盒蛋白XepA和YomS枯草芽孢杆菌原噬菌体的特征已经确定，并且发现只有XepA在斑块分析中建立了细胞毒性活性。这两种蛋白质的晶体结构都显示出独特的五聚体组装，其中YomS采用了与XepA哑铃状五聚体的C末端结构域非常相似的折叠方式。XepA的整体结构，其N末端结构域亚单位类似于细胞质膜结合的C2结构域折叠，表明任何裂解功能都可能基于细胞质膜质子动力的破坏，而质子动力是诱导细胞裂解的基础。

PDB参考:年环比，6i50;XepA，6i56型;6ia5号机组

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研究论文

蛋白质晶体的高能相控X射线成像可视化

XFEL数据的SAD阶段划分严重依赖于错误模型

锌（II）和镁（II）复合物中Sonic Hedgehog蛋白的结构揭示了与肽药物设计相关的离子协调可塑性

冷蛋白质晶体中的溶剂流动、构象变化和晶格重排

周质结合蛋白AtzT的进化史

抗体片段在结构上支持针对癌症靶点Mcl-1的药物发现活动

提高分辨率的蛋白质晶体计算设计

晶体结构枯草芽孢杆菌前噬菌体裂解盒蛋白XepA和YomS

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