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生物学
第72卷| 第5部分
编号：2059-7983

2016年5月号

突出显示的插图

封面插图：RNA聚合酶II（Pol II）晶体片段的负染透射电镜图像，显示高质量晶格和布拉格斑点（插图）(史蒂文森等。，第603页). 可以看到Pol II（背景）的高对比度单个粒子从较大晶体碎片的上平面分离。

科学评论

《水晶学报》。(2016).D类72,601-602
doi:10.1010/S2059798316006550
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核蛋白复合物辐射损伤的客观评估

Z.道特
对蛋白质-RNA复合物的系统分析表明，核蛋白复合物可以防止辐射损伤。
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研究论文

《水晶学报》。(2016).D类72,603-615
doi:10.1107/S2059798316001546
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用于评估和优化晶体生长的透射电子显微镜

H.P.史蒂文森,G.林,C.O.巴恩斯,一、Sutkeviciute,T.Krzysiak公司,S.C.魏斯,S.雷诺兹,吴彦祖（Y.Wu）,V.纳加拉扬,A.M.Makhov（马霍夫）,R.劳伦斯,E.拉姆,L.克拉克,T.J.加德拉,B.G.霍格,C.M.绪方,J.Ahn（安杰）,A.M.Gronenborn先生,J.F.康威,J.-P.维拉达加,A.E.科恩和G.卡莱罗
在本文中，我们展示了透射电子显微术在常规晶体学以及自由电子激光和微电子衍射应用中帮助生成衍射良好晶体的过程中的潜力。
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《水晶学报》。(2016).D类72,616-628
doi:10.1010/S2059798316003016
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使用迭代片段组装和渐进序列截断来帮助确定远相关蛋白质的相位和晶体结构

Y.Wang（王）,J.维塔宁,Z.薛,J.J.G.泰斯默和Y.张
一种自动化管道，I-TASSER-MR公司，已开发用于促进使用分子替换（MR）对蛋白质数据库中只有远距离相关结构的样品进行结构测定。通过结合迭代碎片结构组装模拟和对建模不良区域的渐进修剪，管道提高了MR的成功率。
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《水晶学报》。(2016).D类72,629-640
doi:10.1107/S2059798316003065
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使用HC1b湿度控制器的蛋白质晶体脱水通用协议

C.M.C.罗布利,J.桑迪,J.桑切斯·韦瑟比,M.马佐拉纳,T.克罗杰,R.P.诺瓦克和T.L.索伦森
提出了一种研究晶体脱水的通用协议，并使用一组使用HC1b高精度晶体加湿器/除湿器的蛋白质晶体系统进行了测试。
PDB参考:葡萄糖异构酶，天然，室温，4zb2;脱水，室温，4zb0;本地，100 K，4zb5;脱水，100 K，4zbc
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《水晶学报》。(2016).D类72,641-647
doi:10.1107/S2059798316003272
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晶体结构大肠杆菌环糊精复合物中的分支酶

L·冯,R.法瓦兹,科布多南部,F.Sheng先生,M.诺沙拉蒂和J.H.盖革
的结构大肠杆菌与α-、β-和γ-环糊精结合的分支酶揭示了一个新的底物结合位点，并阐明了葡聚糖结合特异性的决定因素。
PDB参考:大肠杆菌分支酶，与α-环糊精复合物，5e6y;β-环糊精配合物，5e6z;γ-环糊精5e70配合物
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《水晶学报》。(2016).D类72,648-657
doi:10.1107/S2059798316003351
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RNA保护核蛋白复合物免受辐射损伤

C.S.伯里,J.E.麦基汉,A.A.安特森,I.卡迈克尔,M.Gerstel先生,M.B.谢夫佐夫和E.F.加曼
对大剂量范围（1.3-25 MGy）蛋白质-RNA复合物内辐射损伤的系统分析表明，RNA和蛋白质的敏感性存在显著差异。提出了一种新的差分电子密度定量方法。
PDB参考:TRAP–RNA，剂量1.3 MGy，5eeu;剂量3.9 MGy，5eev;剂量6.5 MGy，5周;剂量9.0 MGy，5eex;剂量11.6 MGy，5年;剂量14.1 MGy，5eez;剂量16.7 MGy，5ef0;剂量19.3 MGy，5ef1;剂量25.0 MGy，5ef3;剂量21.9 MGy，5ef2
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《水晶学报》。(2016).D类72,658-674
doi:10.1107/S2059798316003624
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载脂蛋白和抑制剂结合的TGFβR2激酶结构域的晶体结构：对TGFβR亚型选择性的见解

A.J.特本,M.鲁扎诺夫,高先生,D.谢,S.E.基弗,C.严,J.A.纽伊特,L.张,K·金,H.卢,L.M.Kopcho先生和S.治安官
为了找到结晶相容的TGFβR2激酶结构域，我们鉴定了几个潜在高熵残基的表面补丁。表达并纯化具有这些突变为丙氨酸的残基的构建体。其中一种晶体的衍射分辨率通常高于2º。TGFβR1和TGFβR2与抑制剂的结构比较解释了异构体的选择性。
PDB参考:载脂蛋白转化生长因子βR1-WT，5e8s;载脂蛋白转化生长因子βR1-T204D，5e8t;载脂蛋白转化生长因子βR1-8M，5e8u;apo-转化生长因子βR2-6M，5e8v;TGFβR1-T204D，与staurosporine复合物，5e8w;转化生长因子βR1-8M，与staurosporine复合物，5e8x;转化生长因子βR2-6M，与staurosporine复合物，5e8y;TGFβR1-T204D，与化合物1，5e8z的络合物;TGFβR1-8M，与化合物1，5e90的络合物;TGFβR2-6M，与化合物1，5e91的络合物;TGFβR2-6M，与AMPPNP的复合物，5e92
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《水晶学报》。(2016).D类72,675-681
doi:10.1007/S2059798316004198
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病原菌脯氨酰4-羟化酶辅因子结合的结构分析炭疽杆菌

N.J.Schnicker公司和M.戴伊
脯氨酰4-羟化酶的活性部位重组炭疽杆菌在金属与α-酮戊二酸结合时观察到。
PDB参考:脯氨酰4-羟化酶与α-酮戊二酸配合物，5hv0;5伏4
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《水晶学报》。(2016).D类72,682-693
doi:10.1107/S2059798316004502
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ERK5中新变构抑制剂结合位点的发现：与经典激酶铰链ATP结合位点的比较

H.陈,J.塔克,X.王,P.R.加文,C.菲利普斯,奥古斯丁硕士,P.施莱纳,斯坦巴赫,M.普雷斯顿和D.奥格
MAP激酶ERK5与XMD8-92和四种新型抑制剂的复合物的晶体结构揭示了激酶P-loop和αC螺旋之间的变构结合位点。在该位点的结合将P-环移位到ATP结合位点，并且被证明是ATP竞争性的。
PDB参考:ERK5，复合物2，5年;复合物三，5倍;复合物4，4盎司;复合物5，4zsj;复合物6，4zsl
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《水晶学报》。(2016).D类72,694-702
doi:10.1107/S205979831600509X
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番茄酸性亮氨酸氨肽酶K354E突变增强伴侣活性的结构研究

K.T.杜普雷兹,M.A.斯克兰顿,L.L.沃林和L.风扇
番茄亮氨酸氨肽酶K354E突变将寡聚平衡转移到低阶寡聚体，暴露出可能参与伴侣活性的疏水表面。
PDB参考:番茄亮氨酸氨肽酶，K354E突变体，5d8n
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