发行内容

结构
生物学

第72卷| 第3部分

国际标准编号：2059-7983

2016年3月发行

实验阶段化的进展

会议记录CCP4型Charles Ballard、Airlie McCoy和Thomas Schneider编辑的《研究周末》

封面插图：一石二鸟：CdC23的阶段化^N术语用4.6keV X射线束(Cianci公司等。，第403页).

介绍

实验阶段化的进展

A.J.McCoy公司和T.施耐德

2015年CCP4实验阶段进展研究周末简介。

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研究论文

大分子晶体学实验阶段的历史

N.Isaacs公司

介绍了蛋白质晶体学中相位方法的发展。

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多个样本数据的有效合并以确定异常子结构

D.L.Akey（D.L.阿基）,T.C.特威利格和J.L.史密斯

使用局部缩放和异常信号优化的好处（如菲尼克斯)为了合并来自多个晶体的数据集，以确定弱异常散射体的子结构，本文进行了研究。

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蛋白质晶体重原子衍生化研究综述

A.C.W.派克,E.F.加曼,T.克罗杰,冯·代尔夫特和E.P.卡彭特

本文综述了蛋白质晶体的重原子衍生化之所以有用的原因，如何选择重原子，如何制备仍然衍射的重原子修饰晶体，以及如何确定蛋白质是否被修饰。

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bestrophin-1的阶段和结构：带有多亚单位跨膜蛋白的重原子簇合物的应用案例研究

V.凯恩·迪克森

在膜蛋白共同面临的基本挑战的背景下，讨论了使用溴化钽SAD定相法求解的真核生物离子通道的结构。

PDB参考:bestrophin-1，4rdq

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COP9信号体的晶体结构测定

R.D.煤仓

详细介绍了从受旋转假对称性和孪晶影响的晶体中测定COP9信号体（一种大型多蛋白复合物）的低分辨率结构。

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使用硒代亚砜衍生物分配AP2-氯氰菊酯适配器低分辨率结构中的序列

B.T.凯利,S.C.格雷厄姆和D.J.欧文

硒代蛋氨酸标记策略允许在低分辨率下识别断开的电子密度区域，尽管硒代蛋清掺入较差，因此构建了一个结构框架，以了解氯菊酯适配器AP2如何调节哺乳动物细胞中的氯菊酯结合。

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我可以通过SAD分阶段解决我的结构吗？SAD定相中的异常信号

T.C.特威利格,G.邦科奇,L.-W.洪,P.H.兹瓦特,J.L.史密斯,D.L.Akey（D.L.阿基）和P.D.亚当斯

SAD实验中有用的异常相关性和异常信号是描述SAD数据集中数据准确性和总信息含量的指标，并表明与解决异常子结构的概率和初始相位的质量有关。

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我可以通过SAD分阶段解决我的结构吗？规划实验、缩放数据并评估有用的异常相关性和异常信号

T.C.特威利格,G.邦科奇,L.-W.洪,P.H.Zwart先生,J.L.史密斯,D.L.Akey（D.L.阿基）和P.D.亚当斯

描述了SAD数据集中有用异常相关性和异常信号的评估和优化算法。

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解释实验误差的晶体相位对数型增益强度目标

R.J.里德和A.J.McCoy公司

强度测量误差影响的新Rice函数近似改进了弱强度数据在晶体应用（包括实验定相、分子替换和精细化）中计算对数似然增益分数时的处理。

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大分子晶体学中的辐射损伤和衍生化：一个结构因素的观点

R.L.欧文和D.A.谢雷尔

特定位置的辐射损伤和重原子衍生化都会导致反射强度的微小变化。计算并比较每个反射引起的变化大小。

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辐射损伤诱导相位调整：使用发光二极管紫外线照射的案例研究

D.de Sanctis公司,C.祖别塔,费利萨兹,H.卡塞罗托和M.H.Nanao先生

讨论了使用紫外线发光二极管诱导特定辐射损伤的辐射损伤诱导相位调整的案例研究。

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使用2.69º波长（4.6 keV）的定制X射线束尺寸进行数据采集：Cdc23的硫SAD定相^N术语

M.Cianci先生,M.R.Groves先生,D.巴福德和T.R.施耐德

在PETRA III新建立的EMBL光束线P13上，以4.6 keV（λ=2.69μm）的定制50µm直径X射线束进行数据采集，从而确定Cdc23的晶体结构^N术语同二聚体（65.4 kDa；12 Cys和10 Met残留物），通过硫SAD定相，分辨率为3.1º，同时克服晶体孪晶。

PDB参考:Cdc23 APC亚基的硫SAD定相，5ftp

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促进收集异常散射数据的最佳实践从头开始ESRF结构生物学光束线的结构解决方案

D.de Sanctis公司,M.奥斯卡森,A.波波夫,O.斯文森和G.伦纳德

描述了ESRF结构生物学光束线实验相位数据采集的最佳实践。

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挑战本地SAD阶段化的数据收集策略

V.奥利埃里克,T.韦内特,A.D.芬克,C.安德斯,D.李,N.奥列里奇,C.N.博尔卡,M.O.斯坦梅茨,M.Caffrey先生,M.Jinek先生和王先生

证明了通过自然SAD阶段化成功地解决了完整膜二酰甘油激酶和CRISPR相关核酸内切酶RNA-DNA复合物的结构。这些结构通过组合低剂量多方向多晶体数据收集策略进行了求解。

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真空中长波长大分子晶体学

瓦格纳,R.杜曼,K·亨德森和V.Mykhaylyk公司

介绍了金刚石光源新型真空中长波长MX光束线I23的动机和首次结果。

PDB参考:索姆丁，4zg3

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通过多维分子替换启动重原子相化

B.P.佩德森,P.古尔登,十、刘,J.L.卡尔森和P.尼森

提出了一种策略来建立n个-使用来自相关数据集的反常差分傅里叶变换图进行维度分子重定位参数矩阵（MRPM）搜索，以发现弱但正确的分子重定位解决方案，用于重原子亚结构测定和随后的实验定相。

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低分辨率方面的进展从头算分阶段使用群组相位

J.Jorda（约尔达）,M.R.Sawaya先生和T.O.酵母菌

新发展群组相位介绍了一款用于解决低分辨率阶段问题的协作在线游戏。新功能解决了几个晶体学问题，并扩展了群组相位更广泛的实验数据集。

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