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结构
生物学

第71卷| 第6部分

国际标准编号：2059-7983

2015年6月发布

突出显示的插图

封面插图：巨大的血红蛋白来自Glossocolex paulistus公司(鲁杰罗·巴切加等。第1257页). 该图显示了六方单分子层中原聚体-原聚体的相互作用是如何发生的。

科学评论

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膜蛋白结晶学进展：就地和在中数据收集

S.Weyand公司和C.G.泰特

膜蛋白结构生物学在过去十年中取得了巨大进展，但在结晶、数据收集和结构测定方面仍存在许多挑战。两个独立的团体Axford等。[(2015),阿克塔·克里斯特。D类71，1228–1237]和黄等。[(2015),阿克塔·克里斯特。D类71，1238–1256]，发表了对解决这些挑战做出重大贡献的方法。

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研究论文

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室温下晶体中完整膜蛋白的结构测定就地

D.阿克斯福德,J.Foadi公司,N.-J Hu先生,H.G.乔杜里,岩手南部,K.Beis公司,G.埃文斯和Y.阿尔盖尔

利用同步辐射衍射数据测定整体膜蛋白的X射线结构就地在室温下进行了演示。

PDB参考:HiTehA，4年

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中尺度原位可溶性蛋白和膜蛋白的系列X射线晶体学

C.-Y.黄,V.奥利埃里克,P.马,E.帕内普奇,K.迪德里克斯,王先生和M.Caffrey先生

一种实现高吞吐量的方法就地描述了脂立方相中可溶性蛋白和膜蛋白的系列X射线晶体学。它与微克数量的蛋白质和脂质（以及存在的配体）一起工作，并与最苛刻的硫SAD阶段相兼容。

PDB参考:Lyso-Native，293年 K、 4xjb型;溶菌酶，100 K、 4个jd;Lyso-Br，293年 K、 4xjf型;Lyso-Br，100 K、 4xjg;Lyso-S，293年 K、 4小时;Lyso-S，100号 K、 4xji型;佩普_标准, 293 K、 4xni型;佩普_标准, 100 K、 4xnj型;阿尔格，293 K、 4xnk型;藻类，100 K、 4个nl

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巨大血红蛋白的结构保氏舌苔

J.F.鲁杰罗·巴切加,F.瓦康塞洛斯·马卢夫,B.安迪,H.D’Muniz Pereira先生,M.Falsarella火山灰,A.M.奥维尔,M.塔巴克,J.Brandáo-Neto公司,R.C.加拉特和E.Horjales Reboredo公司

巨大血红蛋白的结构保氏G.paulistus已确定。

PDB参考:巨大血红蛋白来自保氏G.paulistus，4u8u;隔离的，孤立的d日链条，4wch

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多肽骨架中的键距离取决于局部构象

R.Improta公司,L.维塔利亚诺和L.埃斯波西托

蛋白质结构的统计调查结合量子力学计算揭示了键距离对构象的系统依赖性。有趣的是，主链C-O和C-N距离的变化与肽键平面度没有直接关系。

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一种外显体依赖性核酸外切酶Dis3l2的结构分析葡萄裂殖酵母

H.Lv公司,Y.Zhu先生,Y.Qiu（音译）,L.Niu（牛）,M.滕和十、李

裂变酵母Dis3l2的晶体结构显示出与小鼠Dis3l2-RNA复合物不同的开放构象。

PDB参考:Dis3l2、4ro1

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与血红蛋白受体IsdH结合的血红蛋白的结构金黄色葡萄球菌显示天然α-珠蛋白血红素囊破裂

C.F.迪克森,D.A.雅克,R.T.俱乐部,J.M.格斯和D.A.盖尔

金黄色葡萄球菌从人类血红蛋白（Hb）中以血红素形式窃取铁。晶体结构金黄色葡萄球菌Hb受体IsdH与Hb的复合物表明，该受体在珠蛋白血红素囊中诱导构象变化，可能促进血红素转移。

PDB参考:IsdH，与Hb络合物，4xs0

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的结构超嗜热菌ADP结合态的FtsH显示C₂-对称六聚体

M.Vostrukhina先生,A.波波夫,E.布伦斯坦,M.A.Lanz先生,R.鲍姆加特纳,C.比尼奥塞克,M.Schacherl先生和尤·鲍曼

截断的六元结构超嗜热菌FtsH显示出形成两个环的分子结构，其中ATP酶环具有双重对称性，蛋白酶环具有六重对称性。活性位点的动态β链和连接区的保守甘氨酸的重要性通过定点突变在全长蛋白中得到了证明。

PDB参考:超嗜热菌FtsH，第四周;4z8倍

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FK506结合域的两种晶体结构恶性疟原虫FKBP35与雷帕霉素高分辨率复合物

A.比安琴,F.过敏原,A.贝尔,A.J.Chubb和J.-F.Guichou先生

本文报道了雷帕霉素与FK506结合域复合物的两种晶体结构恶性疟原虫高分辨率PfFKBP35，氧化和还原形式。

PDB参考:FKBP35的FK506结合域，与雷帕霉素复合，4qt2;4夸脱3

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牛COPIδ亚基μ同源结构域2.15的结构 Å分辨率

A.拉哈夫,H.罗森伯格,A.帕尼斯,D.卡塞尔和N.阿迪尔

牛COPI复合物δ亚基的μ同源结构域的晶体结构被确定为2.15 奥分辨率。该结构揭示了与COPI功能相关的域间灵活性的重要方面。

PDB参考:COPIδ亚单位的MHD，4o8q

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甘露糖苷磷酸化酶加工N-聚糖的结构基础

S.Ladevèze公司,G.Cioci公司,P.罗布林,L.穆里,S.特兰尼尔和G.Potocki-Véronèse

GH130酶Uhgb_MP的apo形式及其与甘露糖和甘露糖的复合物的晶体结构N个-描述了乙酰氨基葡萄糖，并确定了与人体肠道细菌分解N-聚糖有关的酶的功能特异性的结构决定因素。

PDB参考:Uhgb_MP、apo、4udi;甘露糖复合物，4udj;复杂的N个-乙酰氨基葡萄糖，4udg;与甘露糖和N个-乙酰氨基葡萄糖，4udk

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数据仓库，用于HPLC–SAXS数据分析的工具

A.V.Shkumatov公司和S.V.斯特雷尔科夫

数据仓库描述了一种用于快速处理HPLC-SAXS数据的新工具。

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人类病原体富含亮氨酸重复蛋白新亚家族的结构特征问号钩端螺旋体

I.米拉斯,F.索尔,M.诺瓦科夫斯基,P.韦伯,A.豪兹,W.谢泼德和M.皮卡多

病原菌四种典型LRR蛋白的晶体结构问号钩端螺旋体已经解决，为细菌LRR的一个新亚家族提供了见解，该家族以23个氨基酸重复基序的连续延伸为特征。

PDB参考:LIC12234，4tz;LIC10831，2006年4月;LIC11098，2008年4月;LIC12759，2009年4月

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3-磺基丙酰基辅酶A（3SP-CoA）脱硫酶米米加德海鞘DPN7型^T型：具有酰基辅酶a脱氢酶折叠的脱硫酶的晶体结构和功能

M.Schürmann先生,R.Meijers公司,T.R.施耐德,A.斯坦布切尔和M.Cianci先生

3-硫丙酰辅酶A脱硫酶（Acd_DPN7型)是一种新型的脱硫酶，在3,3′-二硫二丙酸的分解代谢途径中催化硫的提取。天然Acd的晶体结构_DPN7型1.89 本地Acd的分辨率和_DPN7型用底物类似物琥珀酰辅酶A浸泡在2.30 Δ拆分显示酰基辅酶a脱氢酶折叠，Arg84是脱硫反应中的关键残基。

PDB参考:3-硫丙酰辅酶A脱硫酶，天然，5af7;琥珀酰辅酶A络合物，5ahs

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主要自溶素LytA的全长结构

Q.李,W.Cheng先生,C.莫洛特,X.-H.白,Y.-L.江,王伟（W.Wang）,D.I.绳索,T.Vernet公司,Y.-H Dong先生,Y.Chen先生和C.-Z.周

主要自溶素LytA的全长结构肺炎链球菌结合酶活性测定表明，所有胆碱结合位点的二聚化和完全占据对于LytA的充分活性是必不可少的体内.

PDB参考:LytA，4x36

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α-葡萄糖苷酶HaG的结构分析为底物特异性和催化机制提供了新的见解

十、沈,西萨布里,Z.盖,加藤（K.Kato）,T.小岛加藤,J.余,K.Komoda公司,Y.基多,H.松井,H.森喜朗和姚明（M.Yao）

HaG及其突变体复合物的结构揭示了HaG的底物特异性和催化机制。

PDB参考:HaG，3wy1型;葡萄糖基酶中间体，3wy2;D202N突变体，与D类-葡萄糖和甘油，3wy3;E271Q突变体，与麦芽糖复合，3wy4

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参与大鼠一般应激反应的RsbX磷酸酶的结构枯草芽孢杆菌

A.-H.Teh公司,M.马基诺,T.细野,S.Baba公司,N.清水,山本先生和库马萨卡

PPM II磷酸酶RsbX具有结合两个锰的催化中心²⁺使用五个残基的离子，而不是PPM I磷酸酶中通常的四个残基，其构象重组使柔性环向第二个Mn倾斜²⁺第五个残基的配位离子。

PDB参考:RsbX，钴络合物，空间群P（P）1、3周45;含镁化合物，空间群P（P）1，3周40;空间组P（P）2₁，第3页第41页;锰络合物，空间群P（P）1、3周42;空间组P（P）2₁，第3页第43页;硒蛋氨酸衍生物，3w44

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X射线自由电子激光数据的修正偏好模型及后细化算法

H.M.金恩,A.S.布鲁斯特,J.哈特尼,G.埃文斯,瓦格纳,J.M.格里姆斯,N.K.绍特,G.萨顿和D.I.斯图亚特

提出了一种更新的偏度模型和XFEL快照衍射数据的后细化算法，并通过观测X射线波长1.3处S原子的反常密度进行了验证 Å.

PDB参考:1.46 CPV17的分辨率XFEL结构，4zqx

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