（IUCr）结晶学报第D节第71卷第5部分，2015年5月

《水晶学报》。(2015).D类71,1023-1038
https://doi.org/10.107/S1399004715006045

大分子晶体的溶剂成分

C.X.威琴伯格,P.V.Afonine公司,K.Kantardjieff和B.卢比

平均而言，母液或溶剂及其成分约占大分子晶体的50%。有序和无序的溶剂组分需要在建模和精炼中准确解释，通常具有相当大的复杂性。

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人参主要类乳胶蛋白151的结构及其溶血磷脂酸结合机制

S.-H.Choi先生,M.-K.Hong先生,H.-J.金,N.Ryoo公司,H.瑞姆,S.-Y.Nah公司和L.-W.康

本文报道了人参主要类乳胶蛋白151的晶体结构、对溶血磷脂酸（LPA）的识别以及与LPA的复合物对G蛋白偶联LPA受体的激活。

PDB参考:人参主要乳样蛋白151，4reh;4雷伊;4rej号

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单分散体系小角度散射曲线的模糊性评估

M.V.Petoukhov先生和D.I.斯文根

提出了一种从给定的小角度散射图案定量评估三维形状重建固有模糊性的方法。

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REdiii公司：自动化结构解决方案的管道

M.-F.波恩和C.A.希弗

这个REdiii公司通过将现有工具嵌入到自我管理的工作流中，软件管道允许完全自动化的晶体结构解决方案。

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的结构脆弱拟杆菌尿苷5′-二磷酸-N个-乙酰氨基葡萄糖（UDP-GlcNAc）酰基转移酶（BfLpxA）

A.Ngo（阿诺）,K.T.方,D.L.考克斯,X.陈和A.J.费希尔

无配体和UDP-N个-乙酰氨基葡萄糖结合晶体结构脆弱拟杆菌UDP协议-N个-报道了乙酰氨基葡萄糖酰基转移酶（BfLpxA）。

PDB参考:BfLpxA，无配体，4r36;绑定UDP-GlcNAc，4r37

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蛋白质二级结构局部变异的鉴定

P.库马尔和M.班萨尔

ASSP公司是蛋白质结构中二级结构赋值的免费算法。该算法是HELANAL-Plus公司可以在以下位置访问https://nucleix.mbu.iisc.ernet.in/assp/index.html.

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X射线诱导八血红素细胞色素酶反应的结构研究c（c）亚硝酸盐还原酶

A.A.特罗菲莫夫,K.M.波利亚科夫,V.A.拉扎连科,A.N.波波夫,T.V.蒂霍诺娃,A.V.蒂霍诺夫和V.O.波波夫

研究了X射线诱导的细胞色素底物（亚硝酸盐和亚硫酸盐）转化c（c）亚硝酸盐还原酶硝化还原木霉.

PDB参考:TvNiR，自由形式，低剂量数据集，4q0t;中剂量数据集，4q17;高剂量数据集，4q1o;亚硝酸盐复合物，低剂量数据集，4l38;第一个中等剂量数据集，4l3x;第二个中剂量数据集，4l3z;高剂量数据集（NO复合物），4l3y;亚硫酸盐复合物，低剂量数据集，4q4u;中等剂量数据集，4q5c;高剂量数据集，4q5b

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克服困难？从头开始硫SAD法测定含两个半胱氨酸残基的菌毛结构

M.Gorgel先生,A.鲍吉尔,J.J.乌斯特鲁普,M.S.Weiss先生,尤·米勒,P.尼森和T.博森

从头开始尽管硫SAD（S-SAD）具有低异常信号、低辐射损伤和低冗余度，但仍实现了结构测定。在此基础上，讨论了S-SAD结构在PDB阈值中的统计数据，以成功确定S-SAD的结构。

PDB参考:皮尔巴赫1，4us7

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的结构中东呼吸综合征冠状病毒3C样蛋白酶揭示底物特异性

D.打捆针,G.T.Lountos公司和D.S.Waugh先生

MERS-CoV 3CL公司^{赞成的意见}已结晶，X射线晶体结构已被解析为三种不同的晶体形式，分别代表游离酶结构和酶-产物复合物。

PDB参考:MERS-CoV 3CL蛋白酶，4wmd;4瓦;4瓦

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使用Na测定膜蛋白稳定性的热荧光法的开发⁺/H（H）⁺反转运蛋白NhaA与细胞色素c（c）氧化酶

M.Kohlstaedt先生,I.冯·德·霍赫特,F.希尔贝尔斯,Y.蒂尔曼和H.米歇尔

通过使用普通荧光探针测试五种不同的洗涤剂，探索了热荧光法测定膜蛋白的应用。染料1-苯胺基萘-8-磺酸在与洗涤剂和膜蛋白NhaA一起使用时被认为是一种有价值的工具。

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鲤鱼选择素（FEL）的三维结构和配体结合位点

S.Capaldi公司,B.法金,M.E.Carrizo先生,L.Destefanis公司,M.C.冈萨雷斯,M.珀杜卡,M.Bovi先生,M.加利亚诺和H.L.摩纳哥

鱼类选择素（FEL）是一个蛋白质家族，最初在鲤鱼卵中发现，现在被认为存在于鱼类和两栖动物中。这里，鲤鱼FEL的X射线结构以载脂蛋白形式被报道，并与α-和β-单体结合N个-乙酰氨基葡萄糖。这是该蛋白家族成员的第一个实验确定的结构。

PDB参考:鲤鱼鱼精蛋白，载脂蛋白，4ruq;全息图，4rus

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对耐热NADP的结构分析⁺-从属的中尺度的-二氨基戊二酸脱氢酶热嗜性尿酸杆菌

H.秋田,T.Seto（塞托）,T.Ohsima公司和H.樱叶

耐热性的独特结构中尺度的-二氨基苯丙酸脱氢酶热相乳杆菌测定并与其他来源的相应酶进行比较。

PDB参考:中尺度的-二氨基苯甲酸脱氢酶，3wyb;含NADP的复合体，3wyc

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利用支持向量机改进大分子晶体结构中元素离子的识别

N.Morshed公司,N.回声和P.D.亚当斯

一种自动识别X射线晶体结构中可能的元素离子的方法已被扩展为使用在PDB中选定结构上训练的支持向量机（SVM）分类器，与手动编码的启发式方法相比，灵敏度显著提高。

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甜菜碱醛脱氢酶的结构和功能分析金黄色葡萄球菌

A.S.哈拉瓦蒂,R.L.里奇,C.陈,J·C·乔,G.米纳索夫,I.杜布罗夫斯卡,J.R.温莎,D.G.迈斯卡,M.Duban先生,L.舒瓦洛娃,A.F.亚库宁和W.F.安德森

提纯的早期耐甲氧西林甜菜碱醛脱氢酶SACOL2628金黄色葡萄球菌COL具有甜菜碱醛脱氢酶活性，并且在结构上与醛脱氢酶类似。

PDB参考:甜菜碱醛脱氢酶;与NAD复合⁺，4英里/小时;与NAD复合⁺不含BME-free Cys289，4nea;带BME-free Cys289，4nu9;BME修饰的Cys289和PEG分子位于活性位点，4qto;G234S突变，与NAD复合⁺不含BME的Cys289，4qn2;G234S突变，带有BME修饰的Cys289，4q92;G234S突变体，具有Cys289、4qje的无BME亚磺酸形式

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S100B–RAGE衍生肽复合物揭示了S100B与人类晚期糖基化终产物受体（RAGE）结合的结构见解

J.L.延森,V.S.K.Indurthi公司,D.B.Neau先生,S.W.维特和C.L.科尔伯特

2.55 报道了S100B与晚期糖基化终产物受体衍生的15-氨基酸肽配合物的光学分辨晶体结构。

PDB参考:钙²⁺-S100B，与人RAGE衍生肽的复合物，4xyn

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使用微聚焦和纳米聚焦同步辐射束的光栅扫描串行蛋白质晶体学

N.科克勒,A.S.布鲁斯特,U.卡普,A.希洛瓦,B.魏恩豪森,M.Burghammer先生和J.-P.科利蒂尔

提出了一种光栅扫描串行蛋白质晶体学方法，其消耗低至200–700 沉淀晶体的nl。新的串行数据预分析软件，纳米峰细胞引入了。

PDB参考:鸡蛋白溶菌酶，4wg1;4周7;第4轮第6轮;第4轮第7轮

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Tah1螺旋交换二聚化防止混合Hsp90共伴侣复合物

摩根大通银行,M.帕尔,S.M.罗,L.H.珀尔和C.普罗德罗莫

涉及两个相邻结合的Tah1分子之间的第五螺旋的螺旋交换恢复了Hsp90的保守MEEVD肽的正常结合环境。二聚化也解释了其他单体TPR域蛋白如何被排除在与Hsp90和Tah1形成不适当的混合共伴侣复合物之外。

PDB参考:Tah1，与Hsp90肽的复合物，4cgq

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双特异性酪氨酸磷酸化调节激酶1A–PKC412复合物的结构揭示了与异常催化环HRD（HCD）半胱氨酸形成二硫桥

M.阿列克谢娃,E.奥伯格,R.A.工程师和尤·罗斯韦勒

报道了DYRK1A与PKC412配合物的晶体结构以及PKC412与DYRJ1A/1B结合的数据。这种结构证实了DYRK激酶在催化环和活化段之间形成二硫键桥的独特能力。

PDB参考:DYRK1A与PKC412，4nct复合体

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高丝氨酸脱氢酶催化机理的结构基础

V.纳夫拉特纳,G.雷迪和B.戈帕尔

的结构金黄色葡萄球菌不同pH条件下的高丝氨酸脱氢酶为理解赖氨酸残基（Lys105）在反应机理的氢化物转移步骤中的作用提供了基础。

PDB参考:金黄色葡萄球菌高丝氨酸脱氢酶，4pg4;第4页第5页;第6页;第7页;第8页，共4页

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2015年5月发布

专题文章

大分子晶体的溶剂成分

研究论文

人参主要类乳胶蛋白151的结构及其溶血磷脂酸结合机制

单分散体系小角度散射曲线的模糊性评估

REdiii公司：自动化结构解决方案的管道

的结构脆弱拟杆菌尿苷5′-二磷酸-N个-乙酰氨基葡萄糖（UDP-GlcNAc）酰基转移酶（BfLpxA）

蛋白质二级结构局部变异的鉴定

X射线诱导八血红素细胞色素酶反应的结构研究c（c）亚硝酸盐还原酶

克服困难？从头开始硫SAD法测定含两个半胱氨酸残基的菌毛结构

的结构中东呼吸综合征冠状病毒3C样蛋白酶揭示底物特异性

使用Na测定膜蛋白稳定性的热荧光法的开发⁺/H（H）⁺反转运蛋白NhaA与细胞色素c（c）氧化酶

鲤鱼选择素（FEL）的三维结构和配体结合位点

对耐热NADP的结构分析⁺-从属的中尺度的-二氨基戊二酸脱氢酶热嗜性尿酸杆菌

利用支持向量机改进大分子晶体结构中元素离子的识别

甜菜碱醛脱氢酶的结构和功能分析金黄色葡萄球菌

S100B–RAGE衍生肽复合物揭示了S100B与人类晚期糖基化终产物受体（RAGE）结合的结构见解

使用微聚焦和纳米聚焦同步辐射束的光栅扫描串行蛋白质晶体学

Tah1螺旋交换二聚化防止混合Hsp90共伴侣复合物

双特异性酪氨酸磷酸化调节激酶1A–PKC412复合物的结构揭示了与异常催化环HRD（HCD）半胱氨酸形成二硫桥

高丝氨酸脱氢酶催化机理的结构基础

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