（IUCr）结晶学报第D节第70卷第12部分，2014年12月

《水晶学报》。(2014).D类70,3088-3089
doi:10.1107/S1399004714025413

解放还是不解放？

A.乌尔珠姆塞夫

用于原子模型优化的最大似然目标需要统计参数的知识。提出了一种新的方法，在不参考测试数据集的情况下对其进行估计，从而使求精更加稳健。

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eIF5B和eIF5B-eIF1A复合物的X射线结构：eIF5B的构象灵活性通过与eIF1A的相互作用限制在核糖体上

A.郑,J.余,R.山本,T.Ose公司,一、田中和姚明（M.Yao）

eIF5B的两种晶型和eIF5B-eIF1A复合体的一种晶型展示了eIF5B的四种不同构象，表明eIF5C的构象具有高度的灵活性。eIF5B结构域IV和eIF1A C末端尾部之间的相互作用可能会限制eIF5B在核糖体上的灵活性，并稳定核糖体亚基连接的界面。

PDB参考:eIF5B、3wbi;3个工作日;eIF5B–eIF1A，3wbk

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回溯状态的结构显示出与人类诺如病毒聚合酶中核苷酸掺入后的状态类似的构象变化

D.扎米亚特金,C.拉奥,E.霍法思,G.尤尔卡,H.罗,F.帕拉,P.格罗丘尔斯基和K.K.-S.Ng公司

一种新型人类诺如病毒聚合酶复制复合物的晶体结构揭示了构象的变化，类似于核苷酸掺入后的状态。

PDB参考:人诺如病毒聚合酶复制复合物

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剪接体肽基丙基的结构和进化顺式–反式异构酶Cwc27

A.乌尔里奇和M.C.Wahl先生

进化比较表明，Cwc27从脯氨酸异构酶进化为纯脯氨酸粘合剂。Cwc27的PPIase结构域的热稳定性从C.嗜热菌与人类相比，它是基于几种氨基酸变化的加性效应，导致应变构象中长侧链的去除和额外的分子内相互作用。

PDB参考:人类Cwc27^6–178，4r3e;嗜热毛壳菌Cwc27号机组^1–201，4r3f

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大分子晶体结构最大似然精细化中的任意球代替交叉验证

J.普拉日·尼卡和D.土耳其语

与最大似然交叉验证目标相比，最大似然自由踢球目标从工作集和随机位移模型计算模型误差估计值，证明在晶体结构精细化的准确性和一致性方面具有优越性，计算测试集和未扰动模型的误差估计。

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Eph受体酪氨酸激酶的结构及其潜在激活机制

Q.魏,J.刘,N.王,十、张,J.Jin（金）,一、金山,J.郑和Z.贾

代表三种激活状态的EphA2结构表明，EphA2可能具有不同于其他Eph受体酪氨酸激酶的交替激活机制。

PDB参考:EphA2激酶，4pdo;4平方公里;4升

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海藻糖合成酶的结构耐辐射球菌揭示了分子内异构化的催化作用涉及到一个闭合构象

Y.-L.王,S.-Y.Chow（周星云）,Y.-T.林,Y.-C.谢,G.-C.李和S.-H.刘

海藻糖合成酶野生型和N253A突变体的晶体结构D.耐辐射药物在和抑制剂的配合物中，Tris分别以2.7和2.21μl的分辨率被测定，它们显示出催化分子内异构化的闭合构象。

PDB参考:DrTS，野生型，4tvu;N253A突变体，4wf7

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还原态胆固醇氧化酶的高分辨率结构为氧化还原稳定化提供了见解

E.金色,A.卡尔顿和A.Vrielink公司

本文报道了氧化还原黄素酶胆固醇氧化酶还原态的原子分辨X射线衍射结构。结构表明存在与黄素N5原子结合的H原子，表明发生了氢化物转移。

PDB参考:胆固醇氧化酶，与2-丙醇复合物，还原态，4u2;氧化态异丙醇4u2t络合物;含有FAD–亚硫酸盐加合物，4u2l

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酵母膜全氘化脂类提取物的多基因结构

Y.Gerelli（耶雷利）,A.de Ghellinck先生,J.朱赫特,V.Laux公司,M.Haertlein先生和G.弗拉格内托

全氘化天然脂类提取物的首次结构表征表明，膜堆是复杂的，主要受相邻膜之间的静电斥力调节。研究了氢类似物的结构差异与温度和湿度的关系。

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的结构间日疟原虫丝氨酸羟甲基转移酶：配体结合特异性和功能控制的意义

P.Chitnumsub公司,A.贾鲁瓦特,P.Riangrungroj公司,W.伊塔拉特,K.Noytanom公司,W.Oonanant公司,J.Vanichthanankul,川卡岩P,S.Maenpuen公司,C.-J.Chen先生,P.Chaiyen先生,Yuthavong先生和U.Leartsakulpanich公司

晶体结构间日疟原虫丝氨酸羟甲基转移酶(个人价值SHMT）与L（左）-丝氨酸和D类-丝氨酸和5-甲酰四氢叶酸能够更好地理解配体结合和催化机制。对控制个人价值讨论了立体选择性和氧化还原状态等SHMT。

PDB参考:SHMT与L（左）-丝氨酸席夫碱，4pfn;带PLP希夫碱，4pff;复杂的D类-丝氨酸和亚叶酸，4oyt

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对古生物的结构和功能见解L（左）-通过组成域的无连接体组装获得的天冬酰胺酶

R.托马尔,P.夏尔马,A.斯利瓦斯塔瓦,S.Bansal公司,阿施施和B.昆都

连体弓L（左）-在没有共价连接子的情况下，通过组装单个结构域获得的天冬酰胺酶与亲本蛋白相比，具有结构相似性和功能优越性。从底物结合酶的晶体结构提出了一种新的作用机制。

PDB参考:暴躁P.furiosus L（左）-天冬酰胺酶，野生型，4q0m;连体，apo，4ra6;复杂的L（左）-天冬氨酸，4nje;柠檬酸盐络合物，4ra9

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重新审视髓磷脂的中子散射：双层不对称性和水交换动力学

A.R.丹尼格,B.德美,V.克里斯蒂利奥,G.勒杜克,W.B.Feller公司和D.A.Kirschner博士

用中子衍射法测定了啮齿动物中枢和外周神经系统的节间髓鞘结构。还描述了这些组织中的水交换动力学。

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人线粒体3-酮酰基-CoA硫酶（T1）的晶体结构：硫酶和硫酯酶活性的反应机制

T.-R.基马,R.K.哈里扬,M.斯特罗兹克,T.福考,S.E.H.Alexson先生和R.K.维伦加

人类降解介质链特异性3-酮酰基-CoA硫解酶（hT1）的结构和酶学表征表明，它的结构与短链特异性四聚生物合成硫解酶高度相似，只是活性位点的两个环的结构差异很小，这为中链脂肪酰基尾部的结合提供了额外的空间。还讨论了hT1的固有硫酯酶活性。

PDB参考:人线粒体3-酮酰基-CoA硫酶，4c2k;CoA络合物，4c2j

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与视黄醇和视网膜结合的全野生型人细胞视黄醇结合蛋白II（hCRBPII）的结构

Z.诺索尼,Z.阿萨尔,一、亚皮奇,M.诺沙拉蒂,W.王,T.贝尔巴索娃,C.瓦西里欧,B.博尔汗和J.盖革

报道了视网膜结合型和视黄醇结合型hCRBPII的结构。证明了hCRBPII结合囊中视黄醇的X射线通量依赖性和波长依赖性重排。对比了CRBPI和CRBPII中视黄醇和视网膜的结合方式。

PDB参考:hCRBPII，与视黄醇结合，4qyn;4股;4qzu公司;与视网膜结合，4qyp

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Tle4–Tli4复合物的结构基础揭示了H2-T6SS的自我保护机制铜绿假单胞菌

D.卢,Y.Zheng先生,N.廖,L.Wei（李伟）,B.徐,十、刘和J.刘

报道了分辨率为1.75 Au的Tle4-Tli4络合物的结构。

PDB参考:Tle4–Tli4复合物，4r1d

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针对天冬氨酸生物合成途径中一种必需酶的结构导向抑制剂开发的警示故事

A.G.巴甫洛夫斯基,B.桑加韦鲁,P.班萨利和R.E.维奥拉

针对天冬氨酸生物合成途径中的一种必需酶开发结构导向抑制剂。

PDB参考:服务提供商ASADH–NADP+4-硝基-2-磷酸苯甲酸酯，4r41;风险资本ASADH–NADP+4-硝基-2-磷酸苯甲酸，4r5m;服务提供商ASADH–NADP+1,2,3-苯三甲酸，4r3n;服务提供商ASADH–NADP+3-（3-羧丙基）邻苯二甲酸盐，4r4j;服务提供商ASADH–NADP+3-（3-羧基丙烯基）邻苯二甲酸盐，4r5h;服务提供商ASADH–NADP+3-（2-羧乙基）邻苯二甲酸酯，4r54;服务提供商ASADH–NADP+邻苯二甲酸盐，4r51;服务提供商ASADH–2′，5′-ADP+1,2,3-苯三甲酸盐，4r3w

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木质素降解真菌锰过氧化物酶催化和稳定性特性中C末端尾部的结构意义

E.Fernández-Fueyo,S.Acebes公司,F.J.Ruiz-Duenñas公司,马丁内斯,A.罗梅罗,F.J.梅德拉诺,V.瓜利亚尔和A.T.马丁内斯

锰过氧化物酶是一类参与木质素降解的酶，其可变C末端尾部与它们的催化和稳定性有关，如新的晶体结构、分子模拟和直接诱变数据所示。基于这种结构-功能评估，短锰过氧化物酶和长/超长锰过氧化物酶亚家族已被接受；后者具有非凡的稳定性，而首次表明前者能够在锰（II）被氧化的同一位置氧化其他底物。

PDB参考:锰P6，4czn;MnP6–锰²⁺，4czo;4立方厘米;锰P6–镉²⁺，4立方厘米;4立方厘米

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过氘化：改进了中子大分子晶体学中溶剂结构的可视化

S.J.费希尔,M.P.布莱克利,E.I.霍华德,一、小赫特林,M.Haertlein先生,A.米施勒,A.库西多·西亚,A.G.萨尔维,A.波波夫,C.穆勒·迪克曼,T.彼得罗娃和A.波贾尼

通过两种中子蛋白质结构的比较，证明了全氘化在大分子溶剂可见度方面的优势。

PDB参考:亮氨酸和缬氨酸甲基丙三型防冻剂4ny6的中子结构

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β-HU手臂灵活性金黄色葡萄球菌规定了DNA绑定和识别机制

D.-H.金,H.进口,J.-G.Jee（杰伊）,S.-B.Jang（S.-B.Jang）,H.-J.Yoon先生,A.-R.Kwon公司,S.-M.Kang先生和B.-J.李

载脂蛋白和DNA结合的HU的结构分析金黄色葡萄球菌（SHU）揭示了DNA结合时蛋白质和DNA的构象变化。SHU对DNA的结合和识别涉及碱基重吸收和形状重吸收机制，其中β-臂的柔韧性是主要决定因素。

PDB参考:舒，阿波，4qjn;DNA结合，4qju

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ACHESYM公司大分子模型在单位细胞中标准化放置的算法和服务器

M.科维尔,M.Jaskolski先生和Z.道特

提出了一种选择高分子晶体结构唯一描述的算法。建议作者在沉积和出版之前使用该程序，以便非晶体学家更容易解释和比较晶体结构。

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改进了单次XFEL蒸馏器的晶体取向和物理性能

N.K.绍特,J.哈特尼,A.S.布鲁斯特,N.回声,P.H.Zwart先生和P.D.亚当斯

X射线自由电子激光晶体学依赖于静止衍射图样的收集。开发了新的方法来优化晶体取向和镶嵌块特性的建模。

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高-同步器尿苷的构象和六聚体分子的不对称性在高分辨率结构中的揭示欧氏Shewanella oneidensis游离形式的MR-1尿苷磷酸化酶及其与尿苷的复合物

T.N.萨伏诺娃,S.N.米哈伊洛夫,V.P.维科,N.N.莫德科维奇,V.A.Manuvera公司,C.S.Alekseev先生,M.V.科瓦尔丘克,V.O.波波夫和K.M.波利亚科夫

尿苷磷酸化酶的三维结构沙雷氏菌游离形式和与尿苷络合物中的MR-1分别以原子分辨率（0.95℃）和高分辨率（1.6℃）进行测定。尿苷分子具有能量上不利的高-同步器具有近平面核糖环的构象。尿苷磷酸化酶的六聚体是不对称的。

PDB参考:尿苷磷酸化酶，4r2x;尿苷磷酸化酶与尿苷复合物，4r2w

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香草醛1的结构：一种连接代谢疾病和炎症的关键酶

Y.L.Boersma先生,J.纽曼,T.E.亚当斯,N.科维森,G.克里普纳,K.博佐格鲁和T.S.泥炭

香草醛1是一种与炎症和代谢疾病有关的人体外酶，其结构被一种不寻常的变构机制调节。

PDB参考:香草醛1，天然，4cyf;三角形状，4cyy;配体结合，4cyg

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科学评论

解放还是不解放？

研究论文

eIF5B和eIF5B-eIF1A复合物的X射线结构：eIF5B的构象灵活性通过与eIF1A的相互作用限制在核糖体上

回溯状态的结构显示出与人类诺如病毒聚合酶中核苷酸掺入后的状态类似的构象变化

剪接体肽基丙基的结构和进化顺式–反式异构酶Cwc27

大分子晶体结构最大似然精细化中的任意球代替交叉验证

Eph受体酪氨酸激酶的结构及其潜在激活机制

海藻糖合成酶的结构耐辐射球菌揭示了分子内异构化的催化作用涉及到一个闭合构象

还原态胆固醇氧化酶的高分辨率结构为氧化还原稳定化提供了见解

酵母膜全氘化脂类提取物的多基因结构

的结构间日疟原虫丝氨酸羟甲基转移酶：配体结合特异性和功能控制的意义

对古生物的结构和功能见解L（左）-通过组成域的无连接体组装获得的天冬酰胺酶

重新审视髓磷脂的中子散射：双层不对称性和水交换动力学

人线粒体3-酮酰基-CoA硫酶（T1）的晶体结构：硫酶和硫酯酶活性的反应机制

与视黄醇和视网膜结合的全野生型人细胞视黄醇结合蛋白II（hCRBPII）的结构

Tle4–Tli4复合物的结构基础揭示了H2-T6SS的自我保护机制铜绿假单胞菌

针对天冬氨酸生物合成途径中一种必需酶的结构导向抑制剂开发的警示故事

木质素降解真菌锰过氧化物酶催化和稳定性特性中C末端尾部的结构意义

过氘化：改进了中子大分子晶体学中溶剂结构的可视化

β-HU手臂灵活性金黄色葡萄球菌规定了DNA绑定和识别机制

ACHESYM公司大分子模型在单位细胞中标准化放置的算法和服务器

改进了单次XFEL蒸馏器的晶体取向和物理性能

高-同步器尿苷的构象和六聚体分子的不对称性在高分辨率结构中的揭示欧氏Shewanella oneidensis游离形式的MR-1尿苷磷酸化酶及其与尿苷的复合物

香草醛1的结构：一种连接代谢疾病和炎症的关键酶

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