（IUCr）结晶学报第D节第70卷第10部分，2014年10月

《水晶学报》。(2014).D类70,2500-2501
https://doi.org/10.107/S139900471402118X

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存档原始晶体学数据

T.C.特威利格

介绍IUCr衍射数据沉积工作组的一系列文章。

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提供衍射图像数据的经验：我们需要归档哪些元数据？

L.M.J.科隆-巴滕堡和J.R.海利维尔

提供了本地原始“衍射数据图像”档案，检索并重新处理了一些数据集，从而分析了顺铂中两个部分占据的氯原子的异常差异密度，并重新评估了这些衍射数据中的分辨率截止值。讨论了存储原始数据的一般问题。它还表明，人们通常需要明确的先验知识来读取（二进制）检测器格式和角度计几何设置。

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澳大利亚商店的运营。大分子晶体学用同步加速器

G.R.梅耶,D.阿拉戈,N.J.穆迪,T.T.卡拉多克病毒,S.McGowan公司,P.J.伯特林,D.格罗尼韦根,S.M.昆特,C.S.债券,A.M.扣和S.Androulakis公司

商店。本文介绍了澳大利亚同步加速器（Australian Synchrotron）的同步加速器（Synchroton）服务，该服务是一种全功能、基于云计算的解决方案，用于原始X射线数据的存档和传播。

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如何使图像沉积成为现实

J.M.格斯和B.麦克马洪

如果主要实验数据的沉积成为常规，则对需要克服的技术和财务挑战进行分析。

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PDB和X射线晶体学软件中大分子结构模型的持续相互改进：沉积实验数据的双重作用

T.C.特威利格和G.布里科内

沉积在PDB中的大分子结构可以而且应该在其附带的实验X射线数据的基础上不断地重新解释和改进，利用方法和软件的稳步进步，大规模沉积此类数据到PDB中已经成为可能。

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6keV下的多晶体自然SAD分析

Q.刘,Y.Guo先生,Y.Chang先生,Z.蔡,Z.阿苏,F.曼西亚,M.I.格林和W.A.亨德里克森

通过合并6keV的多晶体数据集，可以常规增强异常衍射信号以进行本机SAD分析。

PDB参考:YetJ，4tkq公司;厚度，4tkr;EGFR激酶结构域，4tks

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别藻蓝蛋白B的结构协同孢子虫PCC 6803揭示了藻胆体中末端发射极极端红移的结构基础

P.-P.彭,L.-L.董,Y.-F.孙,X.-L.曾,W.-L.丁,H.舍尔,X.杨和K.-H.赵

在晶格中，别藻蓝蛋白B的八个三聚体形成一个多孔的球形48亚基组装体，其中藻蓝蛋白发色团是共面的。

PDB参考:别藻蓝蛋白B，4po5

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解决RNA聚合酶I结构难题

莫雷诺-莫西略,N.M.I.泰勒,T.格鲁尼,P.罗格朗,U.J.拉希德,F.M.鲁伊斯,尤·斯特瓦尔德,C.W.米勒和C.费尔南德斯·托内罗

RNA聚合酶I晶体结构测定的详细信息为解决其他多亚单位复合物的结构提供了框架。描述了简单的晶体学实验，以提取相关的生物信息，如酶活性位点的位置。

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一个与多糖裂解酶相似的β-螺旋蛋白新家族

D.W.关闭,圣天使和A.R.M.布拉德伯里

Cthe_2159是未知函数族域（DUF4353）的成员，从C.热电偶基因组结合纤维素的能力。使用钆SAD定相法确定结构，并显示出与一些多糖裂解酶家族高度相似的结构特征。

PDB参考:Cthe_2159，钆衍生物，4phb;天然形态，钙结合，4peu

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晶体图谱比较的量度

A.乌尔珠姆塞夫,P.V.Afonine公司,V.Y.Lunin先生,T.C.特威利格和P.D.亚当斯

傅里叶合成的秩标度为晶体轮廓图的比较提供了新的工具。与传统的地图相关系数相比，新的度量与可视化地图分析更为一致。

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四聚α-碳酸酐酶的结构嗜氨热弧菌揭示了围绕分子间二硫化物形成的核心，有助于其热稳定性

P.詹姆斯,M.N.Isupov先生,C.塞耶,V.萨内伊,S.Berg公司,M.Lioliou先生,香港科特拉和J.A.小男孩

嗜热细菌α-碳酸酐酶的热稳定性氨化T这取决于亚单位内二硫键的形成以及四聚体分子中心独特的亚单位间二硫/赖氨酸核心。与大多数α-碳酸酐酶不同，这种酶对第页-醋酸硝基苯酯，这是因为它增加了结构刚度。

PDB参考:α-碳酸酐酶，4c3t;SAN复合体，4个;AZM复合物，4uov

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LprF的晶体结构和功能意义结核分枝杆菌和牛分枝杆菌

J.-S.金,焦立中,J.-I.哦,N.-C.哈和Y.-H Kim

脂蛋白LprF的晶体结构结核分枝杆菌和牛分枝杆菌分辨率为1.1º。

PDB参考:LprF，4qa8

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底物诱导的催化三联体生成构象的可视化脑膜炎奈瑟菌肽聚糖O（运行）-乙酰胆碱酯酶揭示SGNH酯酶家族成员的机制保守性

A.H.威廉姆斯,F.J.韦里尔,M.博尼斯,Y.米肖,B.雷纳,M.-K.塔哈,S.W.怀特,A.豪兹和I.G.博内卡

肽聚糖O（运行）-乙酰酯酶（Ape1），在内塞里亚sp.属于多种SGNH水解酶超家族，包括重要的病毒和细菌毒力因子。本文报道了具有SGNH催化结构域和新鉴定的肽聚糖检测模块的Ape1多结构域晶体结构。

PDB参考:肽聚糖O（运行）-乙酰酯酶，4k3u;4k9秒;4千7焦耳;4千40

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阿拉伯糖-5-磷酸异构酶的结构分析脆弱拟杆菌和功能含义

H.-J.Chiu先生,J.C.格兰特,C.L.Farr公司,L.雅罗斯基,M.W.Knuth先生,M.D.米勒,M.-A.埃尔斯利格,A.M.执事,A.戈德齐克,S.A.莱斯利和I.A.威尔逊

阿拉伯糖-5-磷酸异构酶的晶体结构脆弱拟杆菌描述了NCTC 9343与内源性配体CMP-Kdo的络合物。结构和序列比较表明活性位点中高度保守的功能残基可以作为抗菌药物设计的靶点。

PDB参考:阿拉伯糖-5-磷酸异构酶

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多点阵衍射数据索引的新方法

R.J.吉尔迪,D.G.沃特曼,J.M.帕克赫斯特,D.阿克斯福德,G.萨顿,D.I.斯图亚特,N.K.绍特,G.埃文斯和G.冬季

提出了一种新的索引方法，它能够从窄楔形数据索引多个晶格。半合成多晶格数据和从大小为～1µm的微晶记录的真实多晶格数据证明了该方法的有效性。

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人组成性一氧化氮合酶的结构

H.李,J.贾马尔,C.广场,S.H.Pineda公司,G.克雷菲,Q.Jing先生,Cinelli文学硕士,R.B.西尔弗曼和T.L.普洛斯

描述了人nNOS血红素结构域的一种新的晶体结构和人eNOS血红素结构域更好的衍射晶体形式。

PDB参考:人类nNOS–Arg，4d1n;人类eNOS–Arg，4d1o;人类eNOS抑制剂，4d1p

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低剂量X射线辐射诱导蛋白质结构改变

V.博尔什切夫斯基,E.圆形,一、埃罗菲耶夫,M.威克,A.伊什琴科,I.古什钦,A.米申,D.威尔博尔德,G.Büldt公司和V.戈德利

研究表明，即使蛋白质晶体吸收低剂量（0.06 MGy）的同步辐射也会引起结构改变。这一发现提出了一个重大问题，因为它可能会质疑以前解决的结构，并强调和定义蛋白质X射线晶体学的新局限性。

PDB参考:细菌视紫红质，4md1;4米2

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蛋白质SIRAS数据处理的案例研究

D.姚明,T·张,Y.他,P.韩,M.切尼,Y.Gu先生,M.Cygler先生和H.风扇

描述了使用最初未知的蛋白质LegC3N处理SIRAS数据的案例研究。提出了一种基于迭代直接方法的处理方法，从而在这个特定的测试用例中改善了结果。

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1.8°分辨率下Archaehodopsin-2的结构

T.Kouyama,R.富士,南卡纳达,T.Nakanishi公司,S.K.Chan先生和村上春树先生

在用膜融合方法制备的三维晶体中，重建了与在天然膜中观察到的相同的六角阵列的archaerhodpsin-2三聚体。在这个晶体中，质子释放途径中的一对保守的谷氨酸残基由低势垒氢键维持。

PDB参考:Archaehodopsin-2，3wqj

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使用纹理根据可能存在的晶体对结晶液滴进行排序

J.T.Ng公司,C.德克尔,M.克罗默,M.奥斯本和冯·代尔夫特

提出了一种健壮且可转移的算法，用于根据结晶行为的可能性对结晶液滴的自动捕获图像进行客观描述和排序，以高效准确地识别成功结晶。

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使用大量多重合并数据对黄病毒NS1进行低分辨率S-SAD定相和精炼

D.L.Akey（D.L.阿基）,W.C.布朗,J.R.康沃尔斯基,C.M.绪方和J.L.史密斯

高倍性数据用于解决西尼罗河病毒S-SAD的NS1结构，用于扩展可用分辨率以进行细化。

PDB参考:西尼罗河病毒NS1，4吨/升

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多粘菌素抵抗和运动所需的磷酸乙醇胺转移酶EptC的结晶研究空肠弯曲菌

C.D.法格,D.B.布朗,J.M.波尔,A.T.基廷粘土和特伦特先生

这个C.空肠磷酸乙醇胺转移酶EptC在抗菌性、运动性和宿主肠道定植中发挥作用。在本研究中，报道了共价磷酸酶中间态下EptC催化结构域的三维结构。EptC活性位点突变株C.空肠证明EptC酶抑制剂的潜力。

PDB参考:第4页

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PARP抑制剂与人tankyrase-2催化域结合的见解

邱伟,R.Lam（兰姆）,O.Voytyuk公司,V.罗曼诺夫,R.戈登,S.Gebremeskel公司,J.伏特加莱克,C.汤普森,一、Beletskaya,K.P.巴蒂尔,E.F.Pai公司,R.Rottapel公司和纽约Chirgadze

报道了人类tankyrase 2 poly（ADP-核糖）聚合酶（PARP）结构域与16种不同的PARP抑制剂（包括化合物BSI-201、AZD-2281和ABT-888）复合物的高分辨率晶体结构，这些化合物目前正在进行2期或3期临床试验。

PDB参考:TNKS2–EB-47，4tk5;TNKS2–DR-2313，4pnl型;TNKS2–3,4-CPQ-5-C，4tju;TNKS2–BSI-201，4tki公司;TNKS2–TIQ-A，4pnr;TNKS2–5-AIQ，4pnq;TNKS2–4-HQN，4pnn;TNKS2–3-AB，下午4点;TNKS2–AZD-2281，4tkg;TNKS2–NU-1025，4pnm;TNKS2–PJ-34，4tjw;TNKS2–INH2BP，4pns;TNKS2–DPQ，4tk0;TNKS2–ABT-888，4tjy公司;TNKS2–IWR-1，4tkf;TNKS2–1,5-IQD，4件套

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结晶和小角X射线散射分析显示双功能氨基糖苷抗性酶AAC（6′）-Ie-APH（2′′）-Ia的结构

C.A.史密斯,M.托斯,T·M·维斯,H.弗雷斯和S.B.瓦库连科

双功能抗生素抗性酶AAC（6′）-Ie-APH（2′′）-Ia的N-末端乙酰转移酶结构域[AAC（6'）-Ie]的X射线结构被确定为三元卡那霉素/辅酶a复合物。分离的AAC（6′）-Ie和APH（2′′）-Ia结构域的X射线结构，结合小角度X射线散射（SAXS）数据，可以确定溶液中全长双功能酶的结构。

PDB参考:AAC（6′）-Ie，4qc6

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