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生物学
国际标准编号:2059-7983

2014年4月发布

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封面插图:电子冷冻显微镜重建质体定位谷氨酰胺合成酶GSII-2a截形苜蓿和细胞质GSII-1a晶体结构的拟合截形分枝杆菌每个单体的颜色不同(第981页).

研究论文


《水晶学报》。(2014).D类70,912-921
https://doi.org/10.107/S1399004713033749
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假定基因西姆0.1420来自变形链球菌被证明编码具有NADPH特异性醌氧化还原酶活性的MdaB蛋白。Smu.1420与NADP的晶体结构+甲萘醌揭示了底物选择和催化机制,并为未来针对变形链球菌.

《水晶学报》。(2014).D类70,922-931
https://doi.org/10.107/S1399004713033762
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IPM异构酶和高乌头酶属于乌头酶家族,由大小亚基组成。这两种酶的大亚基在铁硫簇结合前采用不同的活性位点状态。


《水晶学报》。(2014).D类70,943-957
https://doi.org/10.107/S139900471303397X
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CcbJ甲基转移酶的2.7位分辨率晶体结构盲肠链球菌作为林可酰胺类抗生素天青素生物合成途径的一部分,其与S公司-腺苷-L(左)-同型半胱氨酸2.9Å。基于这些结构的突变和对接研究被用来提出其活性的合理机制。

《水晶学报》。(2014).D类70,958-967
https://doi.org/10.107/S1399004713034160
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顺磁核磁共振数据(伪接触位移和自定向剩余偶极耦合)和反磁性剩余偶极耦合器现在可以在程序中使用REFMAC公司CCP4中的5作为结构约束以及X射线晶体学数据。这些核磁共振约束可以揭示分子的固态和溶液构象之间的差异,如果没有它们,则可以与X射线晶体学数据一起用于结构精细化。

《水晶学报》。(2014).D类70,968-980
https://doi.org/10.107/S1399004713034391
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Δ的结构1-吡咯烷-5-羧酸脱氢酶(PruA),参与结核分枝杆菌,已在apo和NAD中确定+-绑定表单。抑制剂开发的机会已经确定,脯氨酸利用途径已经通过核磁共振的新用途进行了表征。

《水晶学报》。(2014).D类70,981-993年
https://doi.org/10.107/S1399004713034718
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双子叶植物细胞质和质体定位谷氨酰胺合成酶的实验模型揭示了一个保守的真核型十聚体结构,在截形分枝杆菌解释其独特抗除草剂性的同工酶。

《水晶学报》。(2014).D类70,994-1004
https://doi.org/10.107/S1399004713034925
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3-脱氢-3-脱氧的晶体结构-D类-葡萄糖酸5-脱氢酶嗜热杆菌HB8以载脂蛋白的形式,以及与辅因子和柠檬酸盐的配合物,通过X射线衍射法进行了测定。柠檬酸分子和辅因子已在两个相邻亚单位界面之间形成的缝隙的深处被鉴定。这些结构为3-脱氢-3-脱氧的底物识别和催化机制提供了见解-D类-葡萄糖酸5-脱氢酶。

《水晶学报》。(2014).D类70,1005-1014
https://doi.org/10.1107/S139004714000078
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野生型人类脑红蛋白的晶体结构揭示了含有内部二硫键的CD环的两种不同构象。二硫键形成后氧亲和力增加,可能是由于CD环的灵活性和内腔的重塑。

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晶格紊乱是一种可能阻碍大分子晶体结构测定的现象。以stefin B的晶体结构为例,描述了旋转有序-无序的识别和结构测定。

《水晶学报》。(2014).D类70,1026-1036
https://doi.org/10.107/S1399004714000121

《水晶学报》。(2014).D类70,1037-1049
https://doi.org/10.107/S139900471400087X
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异亮氨酸在X射线蛋白质结构中的侧链扭转角是分辨率、二级结构和精细化软件的函数。细化细化软件中使用的标准扭转角可以改进蛋白质结构的细化。

《水晶学报》。(2014).D类70,1050-1060
https://doi.org/10.107/S1399004714000972

《水晶学报》。(2014).D类70,1061-1073
https://doi.org/10.107/S1399004714000996
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测定了FfIBP的高分辨率晶体结构,该结构在封盖头环区域显示出分子内二硫键和T-a/G-X(X)-T/N结冰主题。刚性封头环区域和结冰部位较大的表面积对FfIBP的防冻活性很重要。

《水晶学报》。(2014).D类70,1074-1085
https://doi.org/10.107/S1399004714000911

《水晶学报》。(2014).D类70,1086-1093
https://doi.org/10.107/S1399004714001084
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X射线晶体结构(R(右))-选择性胺转氨酶烟曲霉分辨率为1.27º通过S-SAD阶段化分辨率为1.84º。

《水晶学报》。(2014).D类70,1094-1103
https://doi.org/10.107/S1399004714001242
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确定了VgrG3CCD-TsiV3配合物的第一晶体结构。详细的生物化学、生物物理和功能研究勾画了自我保护的结构基础霍乱弧菌.

《水晶学报》。(2014).D类70,1104-1114
https://doi.org/10.107/S1399004714001308
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中的溶剂拾取过程菲尼克斯定义已扩展并与相位器反常子结构完成和配位几何分析,以识别和放置元素离子。

《水晶学报》。(2014).D类70,1115-1123
https://doi.org/10.107/S1399004714001497
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粉末衍射和大分子晶体学的结合证明了至少存在三种不同的晶体形式迟缓芽孢杆菌枯草杆菌素在大规模工业生产中的悬浮液。粉末衍射的应用是酶生产质量控制的有力工具。

《水晶学报》。(2014).D类70,1124-1135
https://doi.org/10.107/S1399004714001606

《水晶学报》。(2014).D类70,1136-1146
https://doi.org/10.107/S1399004714001928
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利用数据库中可传递的多极参数,基于多极模型分析了溶菌酶活性部位的化学键。大型B类低温下的因子反映了冻结无序,但因此阻碍了多极参数的有意义的自由细化。

《水晶学报》。(2014).D类70,1147-1154
https://doi.org/10.107/S1399004714001916

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X射线晶体学表明,3′-叠氮胸苷是一种可逆的大肠杆菌胸苷磷酸化酶以不同于已知嘧啶核苷磷酸化酶复合物中胸苷底物和核苷类似物的方向结合在酶的活性位点。讨论了3′-叠氮基团作为配体重取向触发器的可能作用。

《水晶学报》。(2014).D类70,1166-1172
https://doi.org/10.107/S1399004713034275

补遗和勘误表


《水晶学报》。(2014).D类70,1173
https://doi.org/10.107/S1399004714006130

《水晶学报》。(2014).D类70,1174
https://doi.org/10.107/S1399004714006154

书评


《水晶学报》。(2014).D类70,1175-1176
https://doi.org/10.107/S1399004714005719
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