（IUCr）结晶学报第D节第70卷第1部分，2014年1月

《水晶学报》。(2014).天70,1
doi:10.1107/S1399004713024905

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做正确的事

雅斯科尔斯基

对流行媒体中生物螺旋结构误传的最新实例进行了识别和讨论。

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TRAF4 TRAF结构域与线圈结构域的结构及其对TRAF4信号通路的影响

J.H.尹,Y.Cho先生和H.H.公园

TRAF4是TRAF的一个独特家族，参与许多个体发生过程。TRAF4的TRAF畴的晶体结构以2.3º的分辨率求解。

PDB参考以下为：人类TRAF4 TRAF域，4k8u

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11族木聚糖酶Michaelis及其产物复合物的X射线晶体学研究：对催化机制的启示

Q.Wan先生,Q.张,S.Hamilton-Brem公司,K.维斯,穆斯塔基莫夫,L.科茨,P.兰根,D.格雷厄姆和A.科瓦列夫斯基

带有结合木己糖底物或产物的家族11木聚糖酶的X射线结构显示，酶活性部位有六个糖结合亚基。取代催化谷氨酸177附近的氨基酸降低了木聚糖酶的活性，但增加了碱性pH下的相对活性。

PDB参考以下为：E177Q–X6，4hk8;N44H–X3，4hk9;无配体N44H，4hkl;XynII–TrisX2–X3，4hkw;无配体E177Q，4hko

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钙调蛋白中心螺旋坍缩初始步骤的晶体快照

P.库苏拉

提出了钙调素中心螺旋的新型弯曲构象。这些结构可能与靶肽结合后钙调素结构崩溃的初始阶段有关。

PDB参考以下为：钙调蛋白，4bw7;4磅8

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可逆光开关红色荧光蛋白rsTagRFP的旋转有序-无序结构

S.普列特涅夫,F.V.斯巴赫,V.V.Verkhusha公司和Z.道特

对可逆光开关红色荧光蛋白rsTagRFP的旋转有序-无序结构进行了分析。

PDB参考以下为：rsTagRFP，4kpi

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Ⅲ型分泌蛋白酶NleC的结构与机制

W.李,刘彦（Y.Liu）,X.盛,P.尹,F.胡,刘彦（Y.Liu）,C.陈,Q.李,C.严和J.Wang（王）

报告了NleC的晶体结构，分辨率为1.55º。结合生化分析，结构显示NleC是锌蛋白锌蛋白酶家族的成员，NleC活性位点的结构类似于金属肽酶的metzincin家族。

PDB参考以下为：NleC，4磅;4磅/加仑

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赖氨酸羧基化：揭示一种自发的翻译后修饰

D.吉梅内兹-莫拉莱斯,L.阿达曼,D.施和J.梁

描述了一种预测蛋白质结构中赖氨酸羧基化（KCX）的计算方法。该方法准确识别了误报的KCX，并预测了之前未知的KCX位点。

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通过晶体结构和生化分析揭示caspase 6原结构域的调控机制

Q.曹,X.-J.王,L.-F.李和X.-D.苏

揭示了半胱天冬酶6原结构域的调控机制。

PDB参考以下为：预测CASP6H121A，4年

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新型脱氧胞苷激酶抑制剂的结构表征使分子的亲和力决定部分合理化

J.诺姆,J.M.墨菲,Y.Su先生,N.D.桑松,A.L.Armijo（阿米约）,S.T.奥尔森,C.半径和A.拉维

本文描述了一类新型高亲和力和选择性人脱氧胞苷激酶抑制剂的结构和生化特性。

PDB参考以下为：脱氧胞苷激酶，与F1，4jlj复合物;含F2，4jlk的络合物;含F3，4jlm的复合体;带有F4、4jln的复合体

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氨基酸消旋酶新家族广泛特异性的结构基础

A.Espaillat公司,C.卡拉斯科·洛佩斯,N.Bernardo-García,N.彼得罗斯莫利,L.H.奥特罗,拉阿尔瓦雷斯,佩德罗硕士,F.帕佐斯,B.M.戴维斯,M.K.Waldor先生,J.A.赫莫索和F.卡瓦

这项工作报告了BsrV的晶体结构，BsrV是霍乱弧菌（1.15°分辨率）；揭示与其多特异性相关的标志性氨基酸，并使用该标志性序列鉴定细菌中一个类似BsrV的多特异性消旋酶大家族。对另一个Bsr的结构分析证实了Bsr家族成员之间的区别特征是保守的。

PDB参考以下为：BsrV、4beu;ΔCl-BsrV，4beq;英国标准普尔_啊，4高炉5;阿尔尔_啊，4 bhy

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谷胱甘肽1的原子分辨晶体结构恶性疟原虫与其他谷胱甘肽的比较

M.约卡维,T.特里帕西,A.古普塔,M.M.Banday先生,S.拉尔夫,K·贝克尔,H.贝尔拉利和A.夏尔马

谷胱甘肽1的结构恶性疟原虫以原子分辨率测定，并分析了其独特的结构特征。

PDB参考以下为：谷胱甘肽1，4hjm;4千焦;4千焦耳

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打破连续晶体学中的索引歧义

W.布雷姆和K.Diederichs公司

在串行晶体学中，证明了可以使用与其他数据集的相关系数和聚类过程来建立部分数据集的索引模式。对于24个手性空间群，聚类可以在二维中进行，但在空间群中P（P）三，P（P）三₁和P（P）三₂需要在三个或四个维度上进行聚类。

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蛋白质晶体中金属中心的精确结构表征：Ni和Cu T的结构₆牛胰岛素衍生物

C.G.Frankaer公司,S.莫辛,K.Stáhl公司和P.哈里斯

镍金属部位周围的结构细节水平²⁺和铜²⁺T型₆结合使用单晶X射线晶体学和X射线吸收光谱，胰岛素衍生物得到了显著改进。铜的光还原和随后的辐射损伤²⁺通过XANES光谱跟踪Cu胰岛素中的位点。

PDB参考以下为：铜胰岛素，4m4f;4米4小时;4米4英寸;4米4焦耳;4毫升;镍胰岛素，4m4m

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Kif15的晶体结构和生化特性：一种参与双极纺锤体形成和神经元发育的双功能分子马达

M.克莱诺,A.法尔尼卡,V.乌拉加纳桑,R.A.十字架,P.W.Baas先生和F.科齐尔斯基

Kif15的结构和生物化学研究提供了对该潜在药物靶点的深入了解，并允许与Eg5进行比较，Eg5是一种部分共享Kif15功能的驱动蛋白。

PDB参考以下为：Kif15型_19–375，40亿2

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基于先验结构的配体放置：引导配体重新放置方法

H.E.Klei先生,N.W.莫里亚蒂,N.回声,T.C.特威利格,E.T.鲍德温,M.波克罗斯,S.Posy公司和P.D.亚当斯

一个新模块，引导配体更换（GLR），于年开发凤凰在已有蛋白-甘氨酸复合物的情况下，增加配体放置的容易性和成功率。

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蛋白质-配体复合物的自动晶体结构解决方案和精细化

N.回声,N.W.莫里亚蒂,H.E.Klei先生,P.V.Afonine公司,G.邦科奇,J.J.头,A.J.麦考伊,R.D.Oeffner先生,R.J.里德,T.C.特威利格和P.D.亚当斯

自动化蛋白质-配体晶体学软件系统已在凤凰一套。这大大减少了高通量晶体学研究所需的人工工作。

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Fbxo7的FP结构域揭示了一种新的蛋白质-蛋白质相互作用模式

J.尚,G.王,杨洋,X.黄和Z.Du先生

人类F-box蛋白Fbxo7的FP结构域采用与人类蛋白酶体抑制剂PI31的FP域类似的α/β折叠结构。然而，这两个FP结构域在介导蛋白质-蛋白质相互作用的方式上显示出巨大的差异。

PDB参考以下为：Fbxo7、4l9c的FP域;4l9小时

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人类髓磷脂外周膜蛋白P2结构-功能关系的原子分辨率观察

S.Ruskamo公司,R.P.雅达夫,沙尔马,M.Lehtimäki先生,S.劳卢马,S.Aggarwal公司,M.西蒙斯,J.Bürck,A.S.乌尔里奇,A.H.朱弗,I.库苏拉和P.库苏拉

人类髓磷脂外周膜蛋白P2的结构已在0.93º分辨率下得到优化。结合功能实验在体外,体内和生物信息学P2中结构-功能关系的精细细节正在显现。

PDB参考以下为：人髓磷脂外周膜蛋白P2，4bvm

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结构酶学幽门螺杆菌futalosine途径中的甲基硫腺苷核苷酶

R.Q.金,W.A.犯罪,G.J.戴维斯和K.A.Stubbs公司

晶体结构幽门螺杆菌甲基硫腺苷核苷酶（MTAN）HpyMqnB以天然和络合形式被溶解，从而揭示了底物结合和反应机理。

PDB参考以下为：HpyMqnB，4倍;E14Q突变体，4bn0;D199N突变体，4bmz;D199A突变体，4bmy

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的三维结构sviceus链霉菌与人GH84的C末端结构域相似的GNAT乙酰转移酶O（运行）-GlcNA酶

Y.何,C.罗斯,J.P.图尔肯堡和G.J.戴维斯

细菌乙酰转移酶的晶体结构与人类C末端结构域的序列同源性为27%O（运行）-GlcNAcase以1.5º的分辨率进行了求解。这个斯维塞乌斯链球菌将该蛋白与已知的GCN5相关乙酰转移酶进行比较，增加了在该超家族中观察到的多样性。

PDB参考以下为：SsAT，4英里/小时

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ABC型铁转运蛋白周质铁离子结合亚基FbpA的铁离子配位新模式嗜热菌HB8型

S.Wang（王）,M.绪方,S.Horita公司,J.大冢,K.Nagata公司和M.Tanokura先生

FbpA的晶体结构嗜热杆菌（TtFbpA）的载脂蛋白和铁离子结合形式已被解决。TtFbpA显示了由三个酪氨酸残基、两个单齿碳酸氢盐和一个水分子配位的六配位铁离子络合物的新形成。

PDB参考以下为：TtFbpA、apo、3wae;铁离子结合，3waf

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六角层状蛋白质结构的挑战性解释

M.C.汤普森和T.O.酵母菌

作者描述了一种六边形层状蛋白质结构的结构测定，该结构受到平移非晶体学对称性和半面体孪晶的复杂组合的影响。这个案例提醒我们，由于单位-细胞轴加倍而导致的晶体对称性破坏通常需要新的原点选择。

PDB参考以下为：CcmK1外壳蛋白突变体，4liw

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研究论文

TRAF4 TRAF结构域与线圈结构域的结构及其对TRAF4信号通路的影响

11族木聚糖酶Michaelis及其产物复合物的X射线晶体学研究：对催化机制的启示

钙调蛋白中心螺旋坍缩初始步骤的晶体快照

可逆光开关红色荧光蛋白rsTagRFP的旋转有序-无序结构

Ⅲ型分泌蛋白酶NleC的结构与机制

赖氨酸羧基化：揭示一种自发的翻译后修饰

通过晶体结构和生化分析揭示caspase 6原结构域的调控机制

新型脱氧胞苷激酶抑制剂的结构表征使分子的亲和力决定部分合理化

氨基酸消旋酶新家族广泛特异性的结构基础

谷胱甘肽1的原子分辨晶体结构恶性疟原虫与其他谷胱甘肽的比较

打破连续晶体学中的索引歧义

蛋白质晶体中金属中心的精确结构表征：Ni和Cu T的结构₆牛胰岛素衍生物

Kif15的晶体结构和生化特性：一种参与双极纺锤体形成和神经元发育的双功能分子马达

基于先验结构的配体放置：引导配体重新放置方法

蛋白质-配体复合物的自动晶体结构解决方案和精细化

Fbxo7的FP结构域揭示了一种新的蛋白质-蛋白质相互作用模式

人类髓磷脂外周膜蛋白P2结构-功能关系的原子分辨率观察

结构酶学幽门螺杆菌futalosine途径中的甲基硫腺苷核苷酶

的三维结构sviceus链霉菌与人GH84的C末端结构域相似的GNAT乙酰转移酶O（运行）-GlcNA酶

ABC型铁转运蛋白周质铁离子结合亚基FbpA的铁离子配位新模式嗜热菌HB8型

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六角层状蛋白质结构的挑战性解释

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