（IUCr）《结晶学报》第D卷第69卷第12部分，2013年12月

阿克塔·克里斯特。(2013).D类69,2293-2295年
https://doi.org/10.107/S090744913024621

及时沉积大分子结构是同行评审的必要条件

R.P.Joosten先生,H.苏伊丹,L.F.A.Wessels公司和A.佩拉基斯

晶体结构的沉积应在提交手稿供同行审查的同时或之前进行，以便验证PDB并提高其可靠性。

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对的评论及时沉积大分子结构是同行评审的必要条件作者：Joosten等。(2013)

H.伯曼,G.J.克莱威格特,H.中村和J.L.马克利

对文章的回应尤斯登等。[（2013），阿克塔·克里斯特。D类69, 2293–2295].

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对的评论关于误差的传播Jaskolski（2013）

H.伯曼,G.J.克莱威格特,H.Nakamura中村和J.L.马克利

对文章的回应Jaskolski[（2013），阿克塔·克里斯特。D类69, 1865–1866].

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一种兼职dUTPase的结构和酶机制

I.水准仪,V.Németh公司,J.E.Szabó,V.哈玛特,K.Nyíri公司,Á. Á. 本德施,V.Papp-Kádár,I.扎格瓦,G.罗纳,O.Ozohanics公司,K.Vékey公司,托斯（J.Tóth）和B.G.Vértessy公司

一些葡萄球菌噬菌体中的水平基因转移受噬菌体dUTPases调节，这也负责维持基因组完整性。通过三维结构和酶动力学研究，可以深入了解这种调控的分子机制以及Φ11噬菌体dUTPase的酶作用。

PDB参考:φ11噬菌体dUTPase，4gv8

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快速动力学钙传感器CatchER中手状位点的结构基础

Y.Zhang先生,F.红色,S.唐,Y.卓,Y.-F.王,杨俊杰和I.T.韦伯

设计的钙传感器CatchER的高分辨率晶体结构显示了设计位置内钙和钆离子结合的快照，这与其快速动力学一致。

PDB参考:捕集器-Gd³⁺，第4页12;捕捉器（apo），4l13;捕集器-Ca²⁺，4l1i

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金黄色葡萄球菌硫胺酶II：寡聚保证蛋白水解酶对丝氨酸蛋白酶的保护

A.开始,J.德雷布斯,A.基克尼,I.B.米勒,M.Perbandt先生,D.斯维尔贡,C.扳手和C.贝策尔

抗甲氧西林药物TenA的晶体结构金黄色葡萄球菌据报道，它是病原体硫胺素代谢中的一种II型硫胺酶，可能作为控制细胞外蛋白酶分泌的转录激活剂。突变研究揭示了四聚体组合对蛋白水解消化的稳定作用。

PDB参考:硫胺酶II，4fn6

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结构洞察L（左）-核酮糖3-差向异构酶洛蒂中根瘤菌

K.Uechi公司,H.樱叶,A.吉原,森本康夫和G.高田

的结构L（左）-测定了核酮糖3-差向异构酶，并将其独特的结构特征与其他酮糖3-差向异构酶进行了比较。

PDB参考:L（左）-核糖3-差向异构酶，3vyl

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参与氰毒素类毒素a生物合成的脯氨酰-酰基载体蛋白氧化酶的结构

K.蒙科,雷加（L.Regad）,S.Mann（圣曼）,A.梅让和O.Ploux公司

报道了参与类毒素a生物合成的脯氨酰-酰基载体蛋白氧化酶AnaB的晶体结构。描述了这种具有酰基辅酶A脱氢酶折叠的黄素蛋白的氧化酶活性的结构基础。

PDB参考:安娜B，4irn

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家蚕血淋巴中一种意外蛋白复合物的结晶鉴定

A.J.Pietrzyk先生,A.布雅茨,J.米勒-迪克曼,奥钦斯卡先生,M.Jaskolski先生和G.布雅茨

测定了桑蚕贮藏蛋白SP2和SP3复合体的晶体结构。根据电子密度图，结晶学检测到天然复合物中存在两种不同的蛋白质。

PDB参考:SP2–SP3复合物，4l37

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植物结瘤素与细胞分裂素结合的景观

M.Ruszkowski先生,K.Szpotkowski先生,M.西科尔斯基和M.Jaskolski先生

配合物的晶体结构截形分枝杆菌具有四种细胞分裂素的结节蛋白13，反式-玉米素，N个⁶-异戊烯腺嘌呤、激动素和N个⁶-苄基腺嘌呤显示出这种PR-10倍植物蛋白的一种不寻常的二聚模式。蛋白内腔中的细胞分裂素结合模式在每个复合物中都是相同的，并且类似于细胞分裂素受体蛋白中的模式。

PDB参考:MtN13，复杂反式-玉米素，4jhg;复杂的N个⁶-异戊烯腺嘌呤，4gy9;激动素复合物，4jhh;复杂的N个⁶-苄基腺嘌呤，4jhi

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基于电子顺磁共振、光学吸收和X射线衍射研究对溶菌酶晶体中X射线诱导二硫键断裂机制的理解

K.A.萨顿,P.J.布莱克,K.R.Mercer公司,E.F.加曼,R.L.欧文,E.H.斯奈尔和W.A.伯恩哈德

电子顺磁共振（EPR）和在线紫外-可见吸收显微分光光度法与X射线晶体学以互补的方式用于跟踪X射线诱导的二硫键断裂，以确认多轨道辐射损伤过程并建立该过程的模型。

PDB参考:溶菌酶，4h8x;4小时8分;4赫兹8赫兹;4时90分;4时91分;4时92分;4时93分;4时94分;4小时9分;4时9分;4小时9分;4时9分;4时9分;4小时9小时;4小时9分

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Lig搜索：基于知识的web服务器，用于识别蛋白质目标的可能配体

T.A.P.de Beer公司,R.A.拉斯科夫斯基,M.-E.Duban先生,A.W.E.Chan先生,W.F.安德森和J.M.桑顿

Lig搜索是一个web服务器，用于识别可能与给定蛋白质结合的配体。可以在以下位置访问https://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/LigSearch网站.

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特殊结构组织中的双-四链基序协同参与DNA适配体的凝血酶结合

一、俄罗斯克劳斯,A.皮卡,A.梅利诺,L.马扎雷拉和F.西卡

凝血酶–HD22-27mer复合物的结构，在2.4溶解奥决议，揭示了一个耐人寻味的双-四倍折叠适配体，它广泛地与蛋白质的外位点II相互作用。

PDB参考:凝血酶–HD22-27mer，4i7y

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对Chl4–Iml3复合体在动粒组装中作用的结构见解

Q.郭,陶毅（Y.Tao）,H.刘,M.滕和十、李

Iml3蛋白采用了一种新的结构，在动粒组装中与Chl4二聚。

PDB参考:Iml3、4kr1

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TLR信号适配器TRIF/TICAM-1具有与IFIT蛋白结构相似的N末端螺旋结构域

M.O.乌拉,T.Ve公司,曼根先生,M.Alaidaous（阿拉达鲁）,M.J.斯威特,A.曼塞尔和B.神户

介绍了Toll样受体信号适配器TRIF/TICAM-1的N末端结构域的结构和功能特征。2.22版使用含有两个额外引入的蛋氨酸的蛋白质，通过基于硒代蛋氨酸的SAD定相确定了Δ分辨率晶体结构。

PDB参考:TRIF-NTD公司^{A66M/L113M型}，4磅/平方英寸;野生型TRIF-NTD，4c0m

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人类H2A L1环区的结构多态性。Z.1和H2A。Z.2号

N.Horikoshi先生,佐藤（K.Sato）,K.Shimada公司,Y.Arimura先生,A.奥萨卡贝,H.塔奇瓦纳,Y.Hayashi-Takanaka先生,W.岩崎,W.卡加瓦,哈拉塔先生,H.木村和H.Kurumizaka先生

含有H2A的人类核小体的晶体结构。Z.1和H2A。Z.2已确定。H2A的L1环区存在结构多态性。Z.1和H2A。Z.2存在于核小体中，这可能是由于核小体的柔性引起的。

PDB参考:H2A。Z.1核小体，3wa9;H2A。Z.2核小体，3waa

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类核糖核酸酶H型ASKHA超家族激酶MK0840的结构表征坎德利草属

M.Schacherl先生,S.沃尔特斯佩格和尤·鲍曼

推测的糖激酶MK0840的晶体结构坎德利M已在高分辨率下以载脂蛋白和核苷酸结合形式进行了求解。根据晶体形式和核苷酸状态，观察到大的结构域运动。

PDB参考:MK0840型^{载脂蛋白-m}，4磅8;MK0840型^{载脂蛋白-o}，4背景9;MK0840–ADP^打开，4bga;MK0840–ADP^关闭，4bgb

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融合蛋白质设计：蛋白质结构预测和进化的意义

K.斯科鲁普卡,S.K.Han先生,H.-J.Nam公司,S.Kim（S.金）和S.Faham公司

描述了通过异源二聚体融合设计新的蛋白质折叠。

PDB参考:FliS-FliC融合，4iwb

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天然、底物结合和抑制形式的结构结核分枝杆菌咪唑甘油磷酸脱水酶

M.S.Ahangar先生,R.维亚斯,N.纳西尔和B.K.Biswal（比斯瓦尔）

晶体结构结核分枝杆菌测定了HisB及其底物结合和抑制剂结合形式。

PDB参考:IGPD，本地，4gqu;与IGP复合，4 lom;3-氨基-1,2,4-三唑4lpf配合物

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VI型分泌肽聚糖的结构基础DL公司-内肽酶的功能、特异性和中和作用粘质沙雷菌

V.斯里坎纳塔桑,G.英语,N.K.布伊,K.行李箱,P.E.F.奥洛克,V.A.Rao（拉奥）,W.Vollmer（沃尔默）,S.J.库尔瑟斯和W.N.亨特

报道了VI型分泌系统相关免疫蛋白、肽聚糖内肽酶和内肽酶及其同源免疫蛋白复合体的晶体结构，以及内肽酶活性测定和功能评估。

PDB参考:Ssp1、4bi3;Ssp1-C50A，4bi4;Ssp1–Rap1a，4bi8;Rap1a、3zfi;Rap2a、3zib

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铜胺氧化酶的高分辨率晶体结构球状节杆菌：结合双原子分子赋值为O₂

T.村川,H.Hayashi先生,T.Sunami公司,K.Kurihara公司,T.塔马达,R.Kuroki先生,铃木先生,K.Tanizawa公司和T.冈岛

铜胺氧化酶的晶体结构球形A.globiformis确定为1.08 奥分辨率。从二聚体界面的中央空腔到活性位点的一条路线上检测到了最可能是分子氧的双原子分子。

PDB参考:铜胺氧化酶;3瓦3

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人类dUTPase核定位信号附近的磷酸化消除核输入：结构和机制的见解

G.罗纳,马福里先生,M.博尔索斯,I.舍尔,E.塔卡奇,托斯（J.Tóth）,F.巴布斯,A.马扎尔,A.埃尔迪,Z.波佐基,L.Buday公司,B.神户和B.G.Vértessy公司

dUTPase是DNA完整性所必需的酶，其核质转运受磷酸化调节。三维结构和细胞研究揭示了这种控制的机制。

PDB参考:importin-α-dUTPase NLS复合物，4mz5;importin-α-dUTPase S11E突变NLS复合物，4mz6

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孤立Pin1-WW结构域中小分子介导的环路稳定的证据

D.E.莫滕森,D.F.Kreitler先生,H.G.Yun先生,S.H.盖尔曼和K.T.森林

一种小蛋白的两个结构已经确定，它具有一个确定的三级折叠，即分离的Pin1 WW结构域通过小分子添加剂的外消旋结晶。这些添加剂是外消旋的或非手性的，似乎可以稳定结构的动态环区域。

PDB参考:带有苹果酸的Pin1 WW域，4gwt;柠檬酸盐，4gwv

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分裂绿色荧光蛋白作为蛋白质结晶的模块化结合伴侣

H.B.Nguyen先生,L.-W.洪,T.O.叶芝,T.C.特威利格和G.S.沃尔多

提出了一种利用新型分裂绿色荧光蛋白（GFP）作为模块化结合伙伴与目标蛋白形成稳定蛋白复合物的策略。模块化分离GFP可能为快速创建结晶变体开辟了道路。

PDB参考:sf樱桃，4kf4;sfCherry-GFP（10–11）–GFP（1–9）复合体，4kf5

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通过控制脱水改善glypican-1晶体的有序性、各向同性和电子密度

西阿瓦德,G.斯文森·比克达尔,M.M.G.M.Thunnissen先生,K.Mani公司和D.T.洛根

通过使用HC1装置进行控制脱水，glypican-1晶体的各向异性显著降低，允许构建之前无序的结构部分。

PDB参考:glypican-1，4bwe型

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五维晶体学测定蛋白质能量景观

M.施密特,V.斯拉杰,R.海宁,H.伊希,N.普瓦尔,J.天波和S.特里帕西

从在多个温度设置下收集的时间分辨晶体数据的综合时间过程中，提取了光活性蛋白光周期内的激活屏障。

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Rv3717的结构揭示了一种新的酰胺酶结核分枝杆菌

A.库马尔,S.库马尔,D.库马尔,A.米什拉,R.P.Dewangan先生,P.施里瓦斯塔瓦,S.拉马钱德兰和B.塔内加

Rv3717的结构确定为1.7 Pt-SAD相位分析显示出一种独特的自身溶血素，它缺乏细胞-球结合域。Rv3717利用其净正电荷与底物结合，并对广泛的底物细胞壁表现出活性。结构分析表明，Rv3717利用其N端的β发夹状转来自动调节其酶活性。

PDB参考:Rv3717，4lq6

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含必需镁的人脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶1的结构²⁺辅因子

B.A.曼维利亚,E.波扎尔斯基,E.A.托斯和A.C.德罗哈特

人AP内切酶1（APE1）属于类DNase I超家族，需要二价阳离子催化磷酰转移反应。新1.92 APE1的光学分辨率晶体结构揭示了单个Mg的理想八面体配位²⁺离子并告知此基本辅因子的作用。

PDB参考:APE1，4升

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人类刺猬信号调节中SUFU–GLI相互作用的结构基础

A.L.樱桃,C.芬塔,卡尔斯特罗姆,Q.Jin（金）,T.Schwend公司,J.阿斯托加·威尔斯,R.A.祖巴列夫,M.Del Campo先生,A.R.克里斯维尔,D.de Sanctis公司,L.乔文和R.托夫特格德

全长人SUFU的晶体和小角度X射线散射结构与GLI转录因子保守SYGHL基序的复合物显示出与结合相关的主要构象变化，并揭示了对通路激活至关重要的内在无序区域。

PDB参考:MBP-SUFU-FL，4bl8型;MBP-SUFU-Δ，晶型I，4bl9;晶型II，4bla;MBP公司_{A216H_K220H型}-腐乳-Δ_{W61D_L62S_G63F_P453A_Δ454–456_K457A}–GLI1_第页，4磅;MBP公司_{A216H_K220H型}-SUFU-Δ_{W61D_L62S_G63F_P453A_Δ454–456_K457A}–GLI3_第页，4桶

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随机改组5′和3′编码序列末端提高重组蛋白的可溶性表达

C.比格农,C.李,J.李奇埃,B.卡纳德和B.库塔

利用任何实验室可用的基本技术，设计了一种名为“边界洗牌”的方法来生成定向库，用于可溶性域选择。

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抗磁悬浮、硅油和琼脂糖凝胶产生的无容器条件下生长的蛋白质晶体的质量比较。勘误表

H.-L.曹,L.-H.孙,J.李,L.Tang（李·唐）,H.-M.Lu先生,Y.-Z.郭,J.何,Y.-M.刘,X.-Z.谢,沈海峰（H.F.Shen）,C.-Y.Zhang,W.-H.郭,L.-J.黄,P.尚,J.-H.何和D.-C.尹

通过以下方式对文章进行更正曹等。[(2013),阿克塔·克里斯特。D类69, 1901–1910].

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香叶基焦磷酸甲基转移酶的结构分析及SAM依赖的反应机理C-甲基化。勘误表

O.Ariyawutthiphan先生,T.Ose公司,A.南美人,S.Shinde公司,M.Tsuda先生,Y.-G.高,姚明（M.Yao）,H.Oikawa先生和I.田中

通过以下方式对文章进行更正阿里亚沃提芬等。[(2012),阿克塔·克里斯特。D类68, 1558–1569].

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