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真细菌RibG和酵母Rib2分别在核黄素生物合成的第二和第三步中具有嘧啶脱氨的脱氨酶结构域。这些酶分别对核糖和核糖醇具有特异性。这里是枯草芽孢杆菌RibG与脱氨酶产物复合物的分辨率为2.56º。两个环向底物结合产物移动,导致与核糖基和磷酸基团的相互作用和显著的构象变化。产物羰基部分从嘧啶环中弯曲出来,与催化锌离子配位。结合底物和产物的这种畸变可能在酶催化中起着重要作用。对酵母Rib2结构进行建模,并进行突变分析,以了解这两种酶中底物识别的机制。详细的结构比较表明,PC之前发生的两个连续的羰基主干XX年C签名构成底物目标氨基的结合孔。这个氨基结合孔在枯草杆菌RibG在RNA/DNA编辑脱氨酶中也保守。

支持信息

PDB参考:肋骨,4g3m


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