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研究论文
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发行内容
生物
结晶学
第67卷
|
第4部分
国际标准编号:1399-0047
2011年4月发布
从晶体到CCP4结构
会议记录
CCP4型
学习周末
封面插图:
人Thr160-磷酸CDK2-cyclin A与双苯胺嘧啶抑制剂PDB结合
2英寸6
.使用绘制
CCP4毫克
(
第386页
).
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研究论文
阿克塔·克里斯特。
(2011).
D类
67
,
235-242
doi:10.1107/S0907444910045749
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概述
中央对手方清算所
4套房和当前开发
M.D.Winn博士
,
C.C.巴拉德
,
K.D.Cowtan公司
,
E.J.多德森
,
P.埃姆斯利
,
P.R.埃文斯
,
R.M.基根
,
E.B.克里斯内尔
,
A.G.W.莱斯利
,
A.麦考伊
,
S.J.麦克尼古拉斯
,
G.N.穆尔舒多夫
,
N.S.潘努
,
E.A.波特顿
,
H.R.鲍威尔
,
R.J.里德
,
A.瓦金
和
K.S.威尔逊
概述
中央对手方清算所
给出了4套高分子晶体学软件。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2011).
D类
67
,
243-248年
doi:10.1107/S0907444911007797
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都在水晶里…
Z.S.德雷温达
蛋白质表面工程越来越多地被用作提高蛋白质结晶倾向的常规工具。
未来的可能性包括使用多位点蛋白变体、合理调节溶解度以及开发处理膜蛋白的策略。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2011).
D类
67
,
249-260
doi:10.1107/S0907444911007943
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蛋白质信息管理系统(PiMS):任何结构生物学研究实验室的通用工具
C.莫里斯
,
A.巴戎
,
S.L.格里菲斯
,
E.丹尼尔
,
M.萨维茨基
,
B.林
,
J.M.迪普罗斯
,
A.威尔特·达席尔瓦
,
K.Pilicheva公司
,
P.Troshin公司
,
J.van Niekerk先生
,
N.Isaacs公司
,
奈史密斯
,
C.中堂
,
R.布莱克
,
K.S.威尔逊
,
D.I.斯图亚特
,
K·亨里克
和
R.M.埃斯努夫
本文描述了蛋白质信息管理系统(PiMS),并讨论了其特点如何使其适合各种规模的实验室。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2011).
D类
67
,
261-270
网址:10.1107/S090744911007608
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高分子晶体学衍射实验的设计
G.埃文斯
,
D.阿克斯福德
和
R.L.欧文
提出了在同步加速器束线上设计大分子X射线晶体学实验时所作决定的想法。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2011).
D类
67
,
271-281
网址:10.1107/S0907444910048675
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iMOSFLM公司
:衍射图像处理的新图形界面
MOSFLM公司
T·G·G·巴蒂
,
L.Kontogiannis公司
,
O.约翰逊
,
H.R.鲍威尔
和
A.G.W.莱斯利
新的图形用户界面
MOSFLM公司
开发了程序来简化大分子衍射数据的处理。
界面,
iMOSFLM公司
,允许数据处理
通过
一系列明确定义的任务,并对每个阶段的进度提供视觉反馈。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2011).
D类
67
,
282-292年
doi:10.1107/S090744491003982X
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数据简化简介:空间组确定、缩放和强度统计
P.R.埃文斯
如何在中运行数据还原程序的摘要
中央对手方清算所
4套房。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2011).
D类
67
,
293-302年
doi:10.1107/S0907444911007773
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数据处理和分析
自动PROC
工具箱
C.冯海因
,
C.弗伦斯堡
,
P.凯勒
,
A.沙夫
,
O.智能
,
W.Paciorek公司
,
T.沃马克
和
G.布里科内
讨论了衍射实验数据处理过程中遇到的典型主题和问题,并在
自动PROC
软件描述。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2011).
D类
67
,
303-312
doi:10.1107/S0907444910051218
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分子置换模型的改进
雕塑家
G.邦科奇
和
R.J.里德
分子置换模型改进计划
雕塑家
对所使用的算法进行了分析。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2011).
D类
67
,
313-323
doi:10.1107/S0907444911007530
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评估解决方案
BUMP先生
和
棒球
R.M.基根
,
F.长
,
V.J.法齐奥
,
M.D.Winn博士
,
G.N.穆尔舒多夫
和
A.A.瓦金
分子替换的自动化管道
BUMP先生
和
棒球
审查,重点是了解他们的产出。
结论来自于它们在广泛试验中的表现。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2011).
D类
67
,
324-330
doi:10.1107/S090744491004117X
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欧洲蛋白质数据库(PDBe):将结构引入生物学
S.维兰卡
和
G.J.克莱威格特
讨论了PDB及其监护人未来面临的一些挑战,并描述了欧洲蛋白质数据库(PDBe)结构生物信息学的当前和未来活动。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2011).
D类
67
,
331-337
doi:10.1107/S0907444910052224
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最新进展
曲柄
用于实验阶段划分的软件套件
N.S.潘努
,
W.-J.Waterreus公司
,
P.Skubaák先生
,
一、Sikharulidze
,
J.P.亚伯拉罕斯
和
R.A.G.de Graaff先生
最近的发展
曲柄
用于实验阶段化的软件套件导致了更多的结构被自动构建。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2011).
D类
67
,
338-344
doi:10.1107/S0907444910051371
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在中使用SAD数据
相位器
R.J.里德
和
A.J.McCoy公司
SAD数据可用于
相位器
以解决新的结构、补充分子置换相位信息或从最终的精细模型中识别异常散射体。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2011).
D类
67
,
345-354
doi:10.1107/S0907444911002083
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通过β校正降低密度修正偏差
P.Skubaák先生
和
N.S.潘努
在实验X射线晶体学图的“经典”迭代密度修改中,一种基于交叉验证的偏差减少方法提供了更准确的相位质量估计,并改进了自动模型构建。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2011).
D类
67
,
355-367
doi:10.1107/S0907444911001314
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REFMAC公司
5用于细化大分子晶体结构
G.N.穆尔舒多夫
,
P.斯库贝克
,
A.A.列别捷夫
,
N.S.潘努
,
R.A.斯坦纳
,
R.A.尼科尔斯
,
M.D.Winn博士
,
F.长
和
A.A.瓦金
高分子晶体结构精细化程序的一般原理
REFMAC公司
描述了5个。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2011).
D类
67
,
368-375
doi:10.1107/S0907444910039934
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JCSG的分布式结构确定
H.van den Bedem先生
,
G.沃尔夫
,
Q.徐
和
A.M.执事
软件套件
X解决方案
半详尽地探索了X射线结构确定过程的关键参数,以便从一组衍射图像中独立并并行地计算多个三维蛋白质结构。
根据这些结构计算出用于后续手动细化的最佳共识模型。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2011).
D类
67
,
376-385
doi:10.1107/S0907444911007232
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晶体和溶液中的高分子配合物
E.克里斯内尔
描述并讨论了分析大分子络合物与相互作用之间关系的方法及其在晶体堆积中的表现。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2011).
D类
67
,
386-394
doi:10.1107/S0907444911007281
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4
毫克
分子图形软件
S.麦克尼古拉斯
,
E.波特顿
,
K.S.威尔逊
和
M.E.M.诺贝尔
这个
中央对手方清算所
4分子粒度程序现在使用Qt框架来提供现代外观。
有许多新功能,包括用于公共质量图像的渲染和序列对齐。
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