发行内容

生物
结晶学

第64卷| 第11部分

国际标准编号：1399-0047

2008年11月发行

封面插图：原生的叠加M.污点RecA分子（红色）和DNA结合大肠杆菌RecA分子（黄色）。特别引人注目的是螺旋N末端结构域的运动伴随着连接N结构域和分子其余部分的环中的构象变化(第1146页).

研究论文

PURY：杂合物几何约束数据库，用于提炼具有大分子结构的配合物

安德烈亚什奇先生,J.普拉日·尼卡和D.土耳其语

PURY是从剑桥结构数据库中存放的小分子晶体结构导出的几何约束数据库。导出的参数覆盖了化学空间的很大一部分，可以用于高分子晶体结构的测定。

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能量产生子A的核苷酸结合亚基B的结构₁A类₀ATP合成酶与二磷酸腺苷复合物

A.库马尔,M.S.马尼梅卡莱和G.Grüber公司

亚单位B的ADP复合物结构有助于理解A-ATP合成酶底物的进入模式以及抗生素efrapeptin C的抑制作用机制。

PDB参考:A类₁A类₀ATP合酶亚单位B–ADP复合物，3dsr，r3dsrsf

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基于插件的纳米体积微毛细管蛋白质结晶系统（MPCS）

C.J.Gerdts公司,M.埃利奥特,S.Lovell公司,M.B.混合物,A.J.那普利,B.L.利益相关者,P.诺列特和L.斯图尔特

微毛细管蛋白质结晶系统（MPCS）是一种新的蛋白质结晶技术，用于生成纳米级结晶实验，以进行晶体筛选和优化。使用MPCS，在塑料MPCS CrystalCard中生长衍射晶体，并用于求解蛋氨酸的结构-R（右）-亚砜还原酶。

PDB参考:蛋氨酸-R（右）-亚砜还原酶，3cxk，r3cxksf

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通过结晶试验的目视分析建立培训集。第一部分：~150000张图片

E.H.斯奈尔,J.R.勒夫特,S.A.波特,A.M.劳丽塞拉,S.M.古尔德,M.G.马尔科夫斯基,M.Koszelak-Rosenblum先生,M.I.说,J.L.史密斯,C.K.韦奇,R.J.柯林斯,G.弗兰克斯,M.Thayer先生,C.坎巴,一、法理学和G.T.德提塔

作为自动化图像分析训练集的一部分，来自96种不同大分子的约150000张结晶实验图像已被视觉分类为七类。分析结果和趋势。

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通过结晶试验的目视分析建立培训集。第二部分：晶体示例

E.H.斯奈尔,A.M.劳丽塞拉,S.A.波特,J.R.勒夫特,S.M.古尔德,R.J.柯林斯,G.弗兰克斯,马尔科夫斯基,C.坎巴,一、法理学和G.T.德蒂塔

作为自动图像分析训练集的一部分，对269种不同大分子的结晶筛选实验进行了可视化分析，并提取了一组晶体图像。分析结果和趋势。

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F-响应蛋白卷轴结构域的结构揭示了一种独特的β-三明治褶皱，带有可变形的二硫键合环

M.Nagae先生,西川K,N.Yasui公司,山崎实,T.诺吉和J.高木

已确定人类F-spondin卷轴结构域的两段的晶体结构，分辨率分别为1.45和2.70º。这些结果为该领域的结构塑性提供了深入的见解。

PDB参考:FSP198、2zot、r2zotsf;FSP145、2zou、r2zousf

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RecA分子和纤丝的重要功能运动：涉及突变和环境变化的研究

J.R.普拉布,G.P.Manjunath公司,N.R.Chandra公司,K.穆尼亚帕和M.维贾扬

19个突变体晶体和核苷酸复合物的结构M.污点本文报道的在不同条件下制备的RecA，以及之前报道的11种结构，为RecA功能中重要的变构转化轨迹提供了见解。

PDB参考:MsRecA突变体和复合物，2zr7;2个zrp;2锆;2zro公司;2锆;2千赫兹;2zri公司;2zrj公司;2zrk公司;2zrl型;2zrc型;2个zrd;2zre公司;2兹罗夫;2zrg型;2zrb型;2zr0型;2zra公司;2锆9

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测定四分体孪晶分数的方程式

T.O.酵母菌和F.余

在四分体孪晶的情况下，根据观察到的X射线衍射强度，建立了确定孪晶分数的方程(即其中有四个不同取向的孪晶畴，每个观察到的强度包含四个晶体学独立反射的贡献）。

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的结构迁徙蝗虫蛋白酶抑制剂3（LMPI-3）与尖孢镰刀菌胰蛋白酶

P.利昂,A.罗塞尔和C.凯伦伯格

LMPI-3和尖孢F.oxysporum胰蛋白酶的测定分辨率为1.8Å。本研究表明，该小抑制剂通过反应位点P3–P4′和P10–P6残基与蛋白酶相互作用。

PDB参考:LMPI-3–胰蛋白酶复合物，2vu8，r2vu8sf

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癌相关物质的结构测定猪支原体蛋白Mh-p37

K.H.西佩尔,A.H.罗宾斯,R.Reutzel公司,J.多姆西奇,S.K.Boehlein公司,L.戈文达萨米,M.Agbandje-McKenna先生,C.J.罗斯和R.麦肯纳

癌症相关的结构猪鼻支原体使用新型重原子试剂、5-氨基-2,4,6-三碘异酞酸和SIRAS方法测定了蛋白Mh-p37，分辨率为1.9°。

PDB参考:Mh-p37，天然，3e78，3e78sf;I3C复合物，3e79，3e79sf

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短通信

大分子实验相位的幻方

T.贝克,A.克拉索斯卡斯,T.格鲁尼和G.M.谢尔德里克

5-氨基-2,4,6-三碘异酞酸被用作蛋白质结构测定的相位工具。它是一类用于重原子衍生化的新型化合物的代表，该类化合物将重原子与功能基团结合以与蛋白质结合。

PDB参考:溶菌酶，3e3d，r3e3dsf;索默丁，3e3s，r3e3ssf;弹性蛋白酶，3e3t，r3e3tsf

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亲和标签可以减少膜蛋白晶体的四面体孪晶

A.回标,M.尼布洛姆,S.Törnroth-Horsfield公司,U.科辛斯卡·埃里克森,K.Nordén,M.Fellert先生,P.Kjellbom先生,尤·约翰逊,K.Hedfalk公司,K.Lindkvist-佩特森,R.纽茨和R.霍斯菲尔德

本研究比较了三种真核细胞膜蛋白的晶体包装：人水通道蛋白1、人水通道蛋白质5和菠菜质膜水通道蛋白。所有这些蛋白都是从带有和不带亲和标记的表达结构中纯化的。

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