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生物
结晶学
第63卷
|
第4部分
国际标准编号:1399-0047
2007年4月发行
封面插图:
2
F类
o个
-
F类
c(c)
中国大陆地图
-
约束形式
枝状关节霉
1.3º分辨率下的过氧化物酶(轮廓水平:绿色2
,红色6
)(
第472页
).
研究论文
《水晶学报》。
(2007).
D类
63
,
431-436
doi:10.1107/S0907444907000546
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转录调节剂CcpA的结构
乳酸乳球菌
B.洛尔
,
M.科瓦尔奇克
,
C.Alings公司
,
A.Chieduch公司
,
J.巴多夫斯基
,
W.萨恩格
和
J.比塞亚德卡
晶体结构
乳杆菌
报告了CcpA。
PDB参考
:
CcpA,2o20,r2o20sf
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《水晶学报》。
(2007).
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63
,
437-446
doi:10.1107/S0907444907001631
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山羊分泌糖蛋白(SPG-40)的糖结合特性及其功能意义:天然糖蛋白及其与甲壳素样低聚糖的四种复合物的结构
J.库马尔
,
A.S.埃萨亚图拉
,
D.B.斯里瓦斯塔瓦
,
N.辛格
,
沙尔马
,
P.Kaur先生
,
A.斯里尼瓦桑
和
T.P.辛格
测定了山羊信号糖蛋白(SPG-40)与不同长度寡糖的四种复合物的晶体结构。
GlcNAc配合物的结构
三
,GlcNAc公司
4
,GlcNAc公司
5
和GlcNAc
6
揭示了这些低聚糖在碳水化合物结合槽中的位置,并对低聚糖与SPG-40的结合机制提供了见解。
PDB参考
:
SPG-40、2dsz、r2dszsf
;
SPG-40–GlcNAc公司
三
,2dt0,r2dt0sf
;
SPG-40–GlcNAc公司
4
、2dt1、r2dt1sf
;
SPG-40–GlcNAc公司
5
、2dt2、r2dt2sf
;
SPG-40–GlcNAc公司
6
、2dt3、r2dt3sf
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《水晶学报》。
(2007).
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63
,
447-457
doi:10.1107/S0907444907002661
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通过分子替换实现结构解的自动搜索模型发现和制备
R.M.基根
和
M.D.Winn博士
描述了一种通过分子替换实现大分子结构求解的自动化管道,特别强调了大量搜索模型的发现和制备。
结论是,在许多情况下,自动探索一系列搜索模型是有价值的。
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,
458-464
doi:10.1107/S0907444907003228
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FabZ非同晶晶体中的堆积和环结构变化
恶性疟原虫
P.L.斯瓦尔纳穆奇
,
S.K.Sharma公司
,
P.巴达拉
,
N.苏罗利亚
,
A.苏罗莉亚
和
K.Suguna公司
FabZ的晶体结构
恶性疟原虫
报道了两种晶型,并对该酶的三种晶型进行了详细的结构比较,以探讨非同构存在的可能原因。
PDB参考
:
PfFabZ,表格2,2oki,r2okisf
;
形式3、2小时、2小时
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465-471
doi:10.1107/S0907444907003320
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的二聚结构域
大肠杆菌
双硫键异构酶DsbC和DsbG
S.-M.Yeh先生
,
N.Koon公司
,
C.乡绅
和
P.梅特卡夫
周质二硫键异构酶DsbC和DsbG的单独二聚结构域的晶体结构已分别在2.0和1.9º的分辨率下测定。
PDB参考
:
NDsbC、2iyj、r2iyjsf
;
NDsbG、2iy2、r2y2sf
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472-477
doi:10.1107/S0907444907003812
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氰化物、一氧化氮和羟胺配合物的结构
枝状关节霉
100K下的过氧化物酶精确到1.3°分辨率:血红素铁配体的配位几何
K.Fukuyama(福山)
和
T.冈田
CN的晶体结构
−
-、NO和羟胺结合形式的
枝状假丝酵母
1.3°分辨率的过氧化物酶显示了配体与血红素铁的配位构型。
PDB参考
:
CN绑定形式
枝状关节霉
过氧化物酶,2e39,r2e39sf
;
无约束形式,2e3a,r2e3asf
;
HA-结合形式,2e3b,r2e3bsf
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(2007).
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,
478-485
doi:10.1107/S0907444907005045
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结晶分析
枯草芽孢杆菌
CsaA公司
Y.A.Shapova先生
和
M.帕策尔
蛋白质靶向伴侣CsaA的结构
枯草杆菌
已经从三角晶体形式解到2.0Å的分辨率(
P(P)
三
2
21)和从四方晶型到1.9°分辨率(
P(P)
42
1
2).
PDB参考
:
CsaA、,
P(P)
三
2
21、2nzo、r2nzosf
;
P(P)
42
1
2、2nzh、r2nzhsf
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《水晶学报》。
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63
,
486-492
doi:10.1107/S0907444907005264
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低温(<20 K)氦冷却可减轻蛋白质晶体的辐射损伤
U.Chinte公司
,
B.沙阿
,
Y.-S.Chen先生
,
A.A.平克顿
,
C.A.沙尔
和
B.L.汉森
对在设定温度为8K的氦气和100K的氮气中浸泡的匹配蛋白质晶体的衍射数据进行了比较,结果表明,使用低温氦可以提高晶体的衍射寿命,并可明显减轻辐射损伤。
阅读文章
《水晶学报》。
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63
,
493-499
doi:10.1107/S0907444907006592
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ADP-2Ho作为含核苷酸蛋白质的定相工具
S.-Y.Ku先生
,
G.D.史密斯
和
P.L.豪厄尔
描述了ADP-2Ho作为重原子衍生物在MTR激酶结构测定中的应用。
PDB参考
:
MTR激酶–ADP-2Ho复合物,2olc,r2olcsf
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《水晶学报》。
(2007).
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63
,
500-507
doi:10.1107/S090744490700697X
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0.97º分辨率下胰蛋白酶与高效合成抑制剂复合物的结构
M.Sherawat先生
,
P.Kaur先生
,
M.Perbandt先生
,
C.贝策尔
,
W.A.Slusarchyk公司
,
G.S.比萨奇
,
C.张
,
B.L.雅各布森
,
H.M.Einspahr先生
和
T.P.辛格
用原子分辨率测定了含有设计的高效合成抑制剂的胰蛋白酶的晶体结构。
该结构揭示了酶和抑制剂分子之间相互作用的精确性质。
PDB参考
:
胰蛋白酶-抑制剂复合物,2ayw,r2aywsf
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(2007).
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63
,
508-513
doi:10.1010/S090744490700902X
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人谷氨酸羧肽酶II抑制:GCPII与两种强效抑制剂奎斯夸酯和2-PMPA复合物的结构
J.R.梅斯特斯
,
K·亨宁
和
R.希尔根菲尔德
谷氨酸羧肽酶II(GCPII;氨基酸残基44-750)胞外部分与两种有效抑制剂奎斯夸酯和2-PMPA(迄今为止最有效的GCPII抑制剂)的复合物的晶体结构分别以3.0和2.2º的分辨率测定。
PDB参考
:
GCPII–奎斯夸酸络合物,2jbk,r2jbksf
;
GCPII–2-PMPA复合体,2jbj,r2jbjsf
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《水晶学报》。
(2007).
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63
,
514-525
doi:10.1107/S0907444907000844
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CAALIGN公司
:一个成对和多蛋白结构比对程序
T.J.奥尔德菲尔德
程序
CAALIGN公司
基于C的最大叠加对蛋白质结构进行成对结构比对和多重结构比对
α
协调。
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63
,
526-535
doi:10.1107/S0907444906056137
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非共价荧光染料结晶实验中蛋白质晶体的一般鉴定方法
M.R.Groves先生
,
I.B.米勒
,
X.克雷普林
和
J.Müller-Dieckmann
描述了一种方法,其中在结晶之前将非特异性荧光染料添加到各种不同的蛋白质溶液中,导致从蛋白质晶体获得的荧光信号显著增加。
结晶实验的后续荧光成像表明,含有晶体的成功实验很容易与结晶实验产生的其他物体区分开来。
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63
,
536-547
doi:10.1107/S090744490700964X
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触发因子域的结构和相互作用
海洋热托加
E.马丁内斯·哈克特
和
W.A.亨德里克森
N端和C端畴的晶体结构和交联实验
马里蒂玛锥虫
给出了触发因子(TF)。
结构和交联数据表明TF可以与底物蛋白相互作用
通过
亲水表面。
PDB参考
:
tmTF(tmTF)
C类
,2nsa,r2nsasf
;
tmTF(tmTF)
N个
、SeMet、2nsb、r2nsbsf
;
本地、2nsc、r2nscsf
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短通信
《水晶学报》。
(2007).
D类
63
,
548-549
doi:10.1107/S0907444907354
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磷脂酶A两种晶体结构的交替描述
2
从
印度环蛇
一、乐荣
和
R.E.斯坦坎普
磷脂酶A两种晶体结构的非晶体学对称操作
2
来自普通krait的异构体可以重新解释为晶体学操作。
空间群的变化影响了关于结晶状态下蛋白质低聚物形式的结论。
PDB参考
:
磷脂酶A
2
,2osn,r2osnsf
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《水晶学报》。
(2007).
D类
63
,
550-554
doi:10.1107/S0907444907652
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一种蛋白质结晶的自动微种子基质筛选方法
A.达西
,
F.维拉德
和
M.马什
结晶实验中细胞核的形成需要蛋白质分子的相互作用,直到形成临界尺寸的聚集物。
这种核的形成可以在蛋白质浓度很高或饱和度较低的情况下通过引入种子来形成核位置。
将此播种步骤纳入自动筛选过程可能会对产生晶体的条件数量产生相当大的影响。
本文给出了一些初步结果。
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