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结构
生物学
第63卷
|
第3部分
国际标准编号:2059-7983
2007年3月发行
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磺胺酸分子在猪胰蛋白酶晶体中形成晶格界面(
第310页
).
社论
《水晶学报》。
(2007).
D类
63
,
275
https://doi.org/10.107/S090744907005185
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分子生物学
Z.道特
和
E.N.贝克
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63
,
276-281
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缺失DNA时人类p53核心结构域的结构
Y.Wang(王)
,
A.罗森加思
和
H.勒克
用一个新的单斜空间群测定了人类p53核心结构域在没有DNA的情况下的晶体结构(
P(P)
2
1
).
对非晶体学对称性和晶体堆积的详细分析表明,p53分子的排列与其他p53晶体中的分子不同,这表明可能存在不同的p53核心结构域四聚体。
PDB参考
:
人类p53核心结构域,2ocj,r2ocjsf
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,
282-287
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CO-敏感转录因子CooA激活的基于结构的假设
M.Borjigin先生
,
H.李
,
N.D.兰兹
,
R.L.科尔比
,
G.P.罗伯茨
和
T.L.普洛斯
嗜热细菌CooA变异体的结构
羧热氢化物
(ChCooA)是指其中一个单体完全处于开启状态。
PDB参考
:
COA,2hkx,r2hkxsf
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,
288-294
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酵母谷胱甘肽Grx1p C30S突变体的结构
K·O·Hákansson
和
J.R.温特
的结构
蜡样链球菌
谷胱甘肽1(glutaredoxin1)和由黄色荧光蛋白和谷胱甘蛋白组成的融合蛋白经分子置换溶解,分别精制为2.0和2.7º。
PDB参考
:
Grx1p C30S突变体,2jac,r2jacsf
;
rxYFP-Grx1p C30S融合蛋白,2jad,r2jadsf
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295-301
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His-tag对结构的影响
M.卡森
,
D.H.约翰逊
,
H.麦当劳
,
C.布鲁莱特
和
L.J.德卢卡斯
已经调查了含有和不含His-tags的晶体结构,作者表明His-tag对您的结构没有危害。
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302-309
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通过在15K下收集数据减少X射线诱导的大分子晶体辐射损伤:一项系统研究
A.会面
,
瓦格纳
,
R.施耐德
,
C.普拉德万德
,
E.波尔
和
C.舒尔泽·布列塞
在对总共54个胰岛素和全铁蛋白晶体的系统研究中发现,与90K相比,15K时X射线诱导的辐射损伤小而显著地减少。
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310-318
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蛋白质结晶的新策略:X射线衍射验证
S.B.拉尔森
,
J.S.日
,
R.库德尼
和
A.麦克弗森
对九种晶体进行了差分傅里叶X射线衍射分析,有力地证明了蛋白质结晶可以由富含氢键、疏水键和静电键的小分子所包含的假说的有效性。
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,
319-327
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禾本科菌素D与KI的非化学计量络合物,分辨率为0.80º
A.奥尔扎克
,
M.L.Główka先生
,
M.Szczesio先生
,
J.博贾斯卡
,
W·L·杜克斯
,
B.M.Burkhart先生
和
Z.Wawrzak公司
测定了具有KI络合物的禾本科菌素D晶体中双链右手双螺旋禾本科菌素通道(二聚体)的结构。
高分辨率数据能够定量测定革兰菌素组分以及通道外I阴离子和通道内K阳离子的分布,其反常散射证实了这一点。
PDB参考
:
含KI、2izq、r2izqsf的革兰菌素D
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,
328-338
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弓形虫
和
恶性疟原虫
烯醇酰基载体蛋白还原酶及其在抗寄生虫药物开发中的意义
S.P.Muench公司
,
S.T.普里格
,
R.麦克劳德
,
J.B.拉弗蒂
,
M.J.基里西斯
,
C·W·罗伯茨
,
梅艳杰
和
D.W.赖斯
晶体结构
弓形虫
和
恶性疟原虫
ENR与NAD复合体
+
三氯生和
弓形虫
以apo形式计算的ENR分别为2.6、2.2和2.8Ω。
PDB参考
:
PfENR–北美地区
+
–三氯生复合物,2o2y,r2o2ysf
;
TgENR–北美
+
–三氯生复合物,2o2s,r2o2ssf
;
apo TgENR,2o50,r2o50sf
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,
339-347
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晶体生长温度控制优化的方法和仪器
M.Budayova-Spano先生
,
F.多弗涅
,
M.奥迪弗伦
,
T.香根兰
和
S.库萨克
描述了晶体生长温度控制优化的方法和仪器。
该技术在中子晶体学用高质量大晶体的生长中得到了应用。
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348-354
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一个极端SAD病例:一种推测的氧化还原酶成熟蛋白的结构
富氏古球虫
分辨率为3.4º
O.基里洛娃
,
M.Chruszcz先生
,
I.A.舒米林
,
T.斯卡利纳
,
E.Gorodichtchenskaia公司
,
M.辛布罗夫斯基
,
A.萨维奇科
,
A.爱德华兹
和
W.小调
SAD技术用于测定氧化还原酶成熟蛋白的晶体结构
A.富列杜斯
分辨率为3.4º。
PDB参考
:
AF0173,2o9x,r2o9xsf
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63
,
357-365
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古代乙醛酸还原酶的结构
霍里克希热球菌
OT3与烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸络合
S.吉川
,
R.Arai公司
,
Y.Kinoshita先生
,
T.Uchikubo-Kamo公司
,
瓦卡马祖
,
赤坂(R.Akasaka)
,
R.Masui先生
,
T.Terada公司
,
S.Kuramitsu公司
,
M.Shirouzu先生
和
横山由纪夫
高温古菌乙醛酸还原酶的晶体结构
P.horikoshii先生
OT3与NADP(H)的络合物以1.7º的分辨率溶解。
本研究揭示了其协同因子再认知和热稳定性机制。
PDB参考
:
P.horikoshii先生
乙醛酸还原酶,
我
4
1
、2dbq、r2dbqsf
;
P(P)
6
1
、2dbz、r2dbzsf
;
P(P)
1、2dbr、r2dbrsf
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(2007).
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63
,
366-380
https://doi.org/10.107/S090744906055624
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关于软X射线在大分子晶体学中的常规应用。
第四部分:使用更长的X射线波长有效测定生物大分子中的异常亚结构
C.米勒-迪克曼
,
S.Panjikar公司
,
A.施密特
,
S.米勒
,
J.库珀
,
A.吉尔洛夫
,
M.Wilmanns先生
,
R.K.辛格
,
P.A.塔克
和
M.S.Weiss先生
根据在2.0º波长下收集的衍射数据,测定了19种不同生物大分子23个晶体中的反常散射亚结构。
PDB参考
:
脱铁蛋白2g4h、r2g4hsf的异常亚结构
;
伴刀豆球蛋白A,2g4i,r2g4isf
;
葡萄糖异构酶,2g4j,r2g4jsf
;
人ADP-核糖水解酶3,2g4k,r2g4ksf
;
溶菌酶,pH 4.5,2g4p,r2g4psf
;
pH值8.0,2g4q,r2g4qsf
;
羟基腈裂解酶,2g4l,r2g4lsf
;
胰岛素,2g4m,r2g4msf
;
α-乳清蛋白,2g4n,r2g4nsf
;
3-异丙基苹果酸脱氢酶,2g4o,r2g4osf
;
MogA、2g4p、r2g4psf
;
NBR1 PB1、2g4s、r2g4ssf
;
猪胰腺弹性蛋白酶,钠型,2g4t,r2g4tsf
;
钙形态,2g4u,r2g4usf
;
蛋白酶K,2g4v,2g4-vsf
;
核糖核酸酶A,
C类
2、2g4w、r2g4wsf
;
P(P)
三
2
21、2g4x、r2g4xsf
;
索默丁,2g4y,r2g4ysf
;
嗜热菌蛋白酶,2g4z,r2g4zsf
;
钛-(A168-A169),2ill,r2illsf
;
胰蛋白酶,
P(P)
1、2克51、2克51平方英尺
;
P(P)
2
1
,2g52,r2g52sf
;
P(P)
三
1
21、2g54、r2g55sf
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(2007).
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63
,
381-389
https://doi.org/10.107/S090744906056204
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肌肉肌酸激酶的结构不对称性和亚单位间通讯
J.F.Ohren(J·F·奥伦)
,
M.L.Kundracik先生
,
小C.L.Borders
,
P.埃德米斯顿
和
R.E.维奥拉
肌肌酸激酶过渡态类似物的结构揭示了功能性同二聚体内的显著不对称性。
氨基末端区域与亚单位结合和亚单位间通讯密切相关。
PDB参考
:
肌肉肌酸激酶,1u6r,r1u6rsf
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(2007).
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63
,
390-400
https://doi.org/10.107/S09074490605640X
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AlaX-M的结构
反式
-编辑来自的酶
霍里克希热球菌
R.福永
和
横山由纪夫
AlaX-M的晶体结构
反式
-编辑酶显示,N末端结构域中的保守富含甘氨酸环位于C末端结构域的催化位点附近。
PDB参考
:
AlaX-M、2e1b、r2e1bsf
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63
,
401-407
https://doi.org/10.107/S090744906056435
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在三氟乙酸和盐酸存在下生长的革兰菌素S晶体中的双品牌螺旋扭曲β-片通道
A.L.Llamas-Saiz
,
G.M.格罗滕布雷格
,
M.悬臂式
和
M.J.van Raaij先生
从含有水、甲醇、三氟乙酸和盐酸的溶剂中结晶出一种膜活性抗生素革兰菌素S。
该结构以0.95º的分辨率进行了精细化,在晶体不对称单元中包含1.5个禾本科菌素S分子、两个三氟乙酸分子和10个水分子。
在晶体中,禾谷镰刀菌素S分子排列成螺旋通道,与之前观察到的不同。
阅读文章
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,
408-414
https://doi.org/10.107/S090744907000182
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两个突变体的结构,用于探测人转铁蛋白N叶中双赖氨酸对铁释放的作用
H.M.贝克
,
D.努里佐
,
A.B.梅森
和
E.N.贝克
人转铁蛋白N端半分子的两个突变体K206E和K206E/K296E的晶体结构确定了铁释放机制的重要特征。
PDB参考
:
转铁蛋白N-叶,K206E突变体,2o84,r2o84sf
;
K206E/K296E突变体,2o7u,r2o7usf
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63
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415-419
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X射线晶体学监测乳糖从半乳糖凝集素-3晶体中缓慢扩散:配体交换协议的可能含义
P.M.柯林斯
,
K.I.P.J.Hidari公司
和
H.布兰查德
在配体去除的不同阶段测定的人半乳糖凝集素-3碳水化合物再认识域的结构,为了解配体扩散率及其与配体交换协议的关系提供了线索。
PDB参考
:
人galectin-3碳水化合物再认识域,2nn8,r2nn8sf
;
2nmo,2nmosf
;
2nmn、2nmnsf
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63
,
420
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(2007).
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(2007).
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