（IUCr）结晶学报D卷第62卷第11部分，2006年11月

《水晶学报》。(2006).D类62,1287-1293
doi:10.1107/S0907444906026746

来自单核细胞增生李斯特菌

A.Ooi公司,S.侯赛因,A.塞耶达拉比和R.W.皮克斯吉尔

内部蛋白C的晶体结构单核细胞增生李斯特菌已报告。假定受体结合表面平坦且主要亲水，类Ig结构域暴露出可能具有功能重要性的芳香化合物。

PDB参考:内部蛋白C，1xeu，r1zeusf

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人10-甲酰四氢叶酸脱氢酶及其与底物类似物复合物水解酶结构域的结构

P.库苏拉,H.舒勒,S.弗洛丁,P.尼尔森-埃勒,D.J.奥格,P.萨维茨基,P.诺德隆德和P.斯坦马克

人10-甲酰四氢叶酸脱氢酶是一种重要的单碳单位代谢酶，测定了其水解酶结构域的晶体结构。通过求解含有底物片段的复合物的结构，进一步揭示了活性位点。

PDB参考:10-甲酰四氢叶酸脱氢酶，apo型，2bw0，r2bw0sf;复数，2cfi，r2cfisf

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两种肽-HLA-B*1501复合物的晶体结构；HLA-B62超型的结构特征

G.罗德,T.布利赫,S.Justesen公司,B.约翰内森,O.克里斯滕森,J.卡斯特鲁普,S.Buus公司和M.加伊赫德

人类MHC-I分子目前被细分为十二种不同的超型，每种超型都代表了用于免疫识别的肽序列空间的不同部分。在这里，介绍了涉及B62 HLA超型成员的肽-MHC复合物的第一个结构。

PDB参考:LEKARGSTY，1xr8，r1xr8sf;ILGPPGSVY，1xr9，r1xr9sf

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MPCD：用于筛选策略的新型交互式在线结晶数据库

M.查尔斯,S.Veesler公司和F.博内特

创建了一个新的结晶数据库，可以对其进行分析以制定结晶策略。

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碱性蚕豆凝集素碳水化合物特异性的结构基础及其对Gal和GalNAc的差异亲和力

K.A.Kulkarni,S.Katiyar公司,A.苏罗莉亚,M.维贾扬和K.Suguna公司

碱性翼豆凝集素与半乳糖、2-甲氧基半乳糖，N个-乙酰氨基半乳糖和甲基-α-N个-乙酰半乳糖胺为凝集素的碳水化合物特异性提供了结构基础，并对一些植物凝集素对半乳糖和N个-乙酰半乳糖胺。

PDB参考:WBAI，Gal复合物，2du0，r2du0sf;2Me-O-Gal复合体，2dtw，r2dtwsf;GalNAc复合体，2dty，r2dtysf;Me-α-GalNAc复合物，2du1，r2du1sf

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氨基酸、肽和蛋白质分子的invariom数据库的引入和验证

B.Dittrich公司,C.B.Hübschle,P.卢格和M.A.斯派克曼

介绍了一个用于氨基酸、寡肽和蛋白质分子结构精细化的入侵数据库。

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布鲁克海文国家实验室国家同步辐射光源的Mail-in结晶学项目

H.罗宾逊,A.S.苏亚雷斯,M.贝克尔,R.甜蜜和A.赫鲁

几年来，NSLS的邮寄晶体学项目一直非常成功。随着我们新数据库（PXDB）的出现，现在从用户的角度重新审视PXRR组的操作和优势。

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大分子晶体学同步加速器束线集成软件II：修订、机器人和数据库

J.M.斯金纳,M.Cowan先生,R.布奥诺,W.诺兰,H.博沙德,H.H.罗宾逊,A.赫鲁,A.S.苏亚雷斯,D.K.施耐德和R.M.甜

这份手稿记录了最初用于控制高分子晶体学光束线衍射仪的软件的演变。

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C类三D类：低温晶体自动定心程序

B.拉沃,R.B.G.拉维利和F.西普里亚尼

C类三D类是一个用于自动晶体定心的程序，在使用可见光的晶体中心检测中具有改进的性能。

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冷冻蛋白质晶体的自动检测和定心

S.B.Pothineni公司,T.斯特鲁茨和V.S.兰津

描述了用于高分子晶体学光束线自动晶体定心的软件。

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具有伪体中心非结晶对称性的驯鹿β-乳球蛋白晶体结构

E.Oksanen公司,V.-P.贾科拉,托洛宁,K.瓦尔科宁,B.奥克斯特伦,N.Kalkkinen公司,V.维尔塔宁和A.高盛

报道了驯鹿β-乳球蛋白的晶体结构。由于几乎完美的伪体中心化，结构求解和精细化非常复杂。

PDB参考:驯鹿β-乳球蛋白，1yup，r1yupsf

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结构分析百日咳杆菌结合构象中的BugE溶质受体

一、Huvent,H.贝尔拉利,R.安托万,C.邦帕德,C.地点,F.雅各布·杜布森和V.维勒雷特

晶体结构百日咳鲍特菌据报道，BugE溶质受体的分辨率为2.3º。BugE有一个结合的偶然配体，被鉴定为谷氨酸。讨论了Bug蛋白家族中的配体结合。

PDB参考:错误E、2dvz、r2dvzsf

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丙酮酸脱氢酶多酶复合物E1脱辅基酶组分活性的变化大肠杆菌分辨率为2.32º

K.Chandrasekhar公司,P.阿朱南,M.萨克斯,N.内梅里亚,F.约旦和W.愤怒

同二聚体E1脱辅基酶结构的首次报道表明，与异源四聚体支链特异性酶相比，没有证据表明与全酶相关的无序-有序环转换。在活性位点区域，组氨酸残基His142清楚地显示出在脱辅酶中部分占据了两个不同的旋转体位点，有序溶剂分子的数量从脱辅酶增加到全酶再到抑制剂复合物。

PDB参考:丙酮酸脱氢酶E1组分，2g67，r2g67sf

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的结构霍乱弧菌胞外核酸内切酶I揭示了埋藏的氯离子的存在

B.变更标记,A.O.斯马洛斯,N.P.威拉森和R.希腊

内切酶I的两种晶体结构霍乱弧菌确定埋在酶核心的氯化物。镁对催化作用至关重要，它在中性pH值下与酶结合，但在低pH值下不与酶结合。

PDB参考:Vc公司EndA，低pH形式，2g7e，r2g7esf;中性-pH型，2g7f，r2g7fsf

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四环素与延伸因子Tu的GTPase活性位点的分子互补性

S.E.Heffron公司,梅圣美,A.奥罗拉,K·阿贝尔,E.伯格曼和F.朱尔纳克

报道了四环素与胰蛋白酶修饰的EF-Tu的络合结构。

PDB参考:四环素–EF-Tu复合物，P（P）2₁表格，2hdn，r2hdnsf;P（P）4_三2₁2表格，2hcj，r2hcjsf

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改进氨基酸鉴定、拟合和C^α单纯形法在自动建模中的预测

T·D·罗摩,J.C.萨切蒂尼和T.R.Ioerger公司

将Nelder–Mead Simplex搜索纳入副链识别和建模例程文本.

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单链DNA结合蛋白SSB的结构水热Thermus aquaticus

R.Jędrzejczak博士,M.道特,Z.道特,M.Olszewski先生,A.Dłgoęcka和J.库尔

单链DNA结合蛋白的晶体结构水曲霉以1.85º的分辨率进行溶解和精制。

PDB参考:不锈钢，2fxq，r2fxqsf

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花生凝集素与二糖复合物的结构研究：对凝集素结构和相互作用的进一步认识

S.K.Natchiar公司,O.斯里尼瓦斯,N.密特拉,A.苏罗莉亚,N.贾亚拉曼和M.维贾扬

测定了花生凝集素与Galβ1-3Gal、甲基T抗原、Galβ1-6GalNAc、Galα1-3Gal和Galα1-6Glc配合物的晶体结构，以及在Galα1-3 Galβ1~4Gal存在下获得的晶体结构。

PDB参考:花生凝集素，Galβ1-3Gal复合物，2dv9，r2dv9sf;甲基T抗原复合物，2dva，r2dvasf;Galβ1-6GalNAc复合物，2dvb，r2dvbsf;Galα1-3Gal络合物，2dvd，r2dvdsf;Galα1-6Glc复合物，2dvg，r2dvgsf;在Galα1-3Galβ1-4Gal，2dvf，r2dvfsf存在下生长的晶体

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海带酶Lam16A天然硫SAD结构的X射线晶体学测定黄孢原毛平革菌

J.瓦苏尔,R.卡瓦伊,A.M.拉尔森,K.Igarashi公司,M.桑德格伦,M.Samejima先生和J.圣赫伯格

木降解真菌产昆布多糖Lam16A的结构白腐真菌分辨率为1.34Ω。它是非特异性1,3（4）-β中的第一个结构-D类-糖苷水解酶家族GH16的葡聚糖酶亚家族。

PDB参考:昆布多糖Lam16A，2cl2，r2cl2sf

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硫SAD法测定VEGF-E的结构

瓦格纳,M.Pieren先生,C.舒尔泽·布列塞,K.鲍尔默·霍弗和A.E.普罗塔

VEGF-E的晶体结构已经利用高度冗余的数据通过S-SAD求解。为了获得最高的数据精度，在设置数据采集的光束参数时要特别小心。

PDB参考:VEGF-E，2纳米，2纳米

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研究论文

来自单核细胞增生李斯特菌

人10-甲酰四氢叶酸脱氢酶及其与底物类似物复合物水解酶结构域的结构

两种肽-HLA-B*1501复合物的晶体结构；HLA-B62超型的结构特征

MPCD：用于筛选策略的新型交互式在线结晶数据库

碱性蚕豆凝集素碳水化合物特异性的结构基础及其对Gal和GalNAc的差异亲和力

氨基酸、肽和蛋白质分子的invariom数据库的引入和验证

布鲁克海文国家实验室国家同步辐射光源的Mail-in结晶学项目

大分子晶体学同步加速器束线集成软件II：修订、机器人和数据库

C类三D类：低温晶体自动定心程序

冷冻蛋白质晶体的自动检测和定心

具有伪体中心非结晶对称性的驯鹿β-乳球蛋白晶体结构

结构分析百日咳杆菌结合构象中的BugE溶质受体

丙酮酸脱氢酶多酶复合物E1脱辅基酶组分活性的变化大肠杆菌分辨率为2.32º

的结构霍乱弧菌胞外核酸内切酶I揭示了埋藏的氯离子的存在

四环素与延伸因子Tu的GTPase活性位点的分子互补性

改进氨基酸鉴定、拟合和C^α单纯形法在自动建模中的预测

单链DNA结合蛋白SSB的结构水热Thermus aquaticus

花生凝集素与二糖复合物的结构研究：对凝集素结构和相互作用的进一步认识

海带酶Lam16A天然硫SAD结构的X射线晶体学测定黄孢原毛平革菌

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