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生物
结晶学
第61卷
|
第8部分
国际标准编号:1399-0047
2005年8月发行
封面插图:
牛乳铁蛋白锌饱和C端叶的结构揭示了锌离子在酸性pH下的隔离(
第1107页
).
研究论文
《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
1013-1021
doi:10.1107/S0907444905012734
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利用铬辐射结合新的晶体安装方法通过硫SAD测定一种新蛋白质的结构
Y.Kitago先生
,
N.Watanabe公司
和
I.田中
S-SAD利用内部铬辐射解决了一种新的蛋白质结构。
为了降低低温缓冲器和低温回路的X射线吸收,开发了一种新的自由晶体安装技术。
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
1022-1030
doi:10.1010/S0907444905012989
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充分利用家庭X射线源
R.A.P.纳根
,
A.L.B.安布罗西奥
,
A.L.罗哈斯
,
M.V.A.S.纳瓦罗
,
A.M.Golubev先生
,
R.C.加拉特
和
一、波利卡波夫
利用铜旋转阳极X射线源采集的衍射数据,结晶了14kDa磷脂酶、18kDa蛋白酶抑制剂和新型60kDa糖苷水解酶,并测定了它们的三维结构。
磷脂酶中S原子提供的异常信号和后两种情况中使用快速冷冻浸泡方法将I原子快速并入天然结构中的异常信号获得了实验相位。
阅读文章
《水晶学报》。
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61
,
1031-1040
doi:10.1107/S090744490501090
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SARS核衣壳肽与HLA-A*1101复合物的高分辨率结构
T.布利彻
,
J.S.卡斯特鲁普
,
S.Buus公司
和
M.加伊赫德
本文描述了人MHC-I分子HLA-A*1101与SARS冠状病毒N蛋白多肽复合物中1.45位的结构。
讨论了疫苗设计的意义。
PDB参考
:
HLA-A*1101–单核苷酸多态性
362-370
复数,1x7q,r1x7qsf
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,
1041-1048
doi:10.1107/S0907444905013806
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使用普通脱水剂的改良蒸汽扩散结晶协议
K.V.邓洛普
和
B.雾气
描述了共享储层溶液法,即一种蒸汽扩散结晶法,其中许多不同的实验共享同一储层溶液。
阅读文章
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,
1049-1056
doi:10.1107/S090744490501382X
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尿嘧啶-DNA的结构
N个
-糖化酶(UNG)来自
耐辐射球菌
I.雷罗斯
,
E.Moe公司
,
A.O.斯马洛斯
和
S.McSweeney公司
尿嘧啶-DNA的三维结构
N个
-糖化酶(UNG)来自
D.耐辐射药物
已确定分辨率为1.8°。
DNA结合区中带正电残基数量的增加说明了底物结合的改善。
PDB参考
:
drUNG、2boo、r2boosf
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61
,
1057-1066
doi:10.1107/S0907444905013831
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从头开始
利用内部数据确定人甲酰甘氨酸生成酶的钙/硫SAD阶段
D.罗瑟
,
A.迪克曼
,
K.Gasow公司
和
M.G.鲁道夫
基于钙的异常信号,利用SAD生长并定相了人甲酰甘氨酸生成酶的正交晶体
2+
使用在Cu的旋转阳极发生器上收集的数据
K(K)
α波长为1.54º。
PDB参考
:
FGE,1z70,r1z70sf
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,
1067-1071
doi:10.1107/S090744490501162
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马脊髓髓鞘P2蛋白的结构
D.J.B.亨特
,
R.麦克马斯特
,
A.W.罗斯扎克
,
A.Riboldi-Tunnicliffe公司
,
I.R.格里菲斯
和
A.弗利尔
作为来自马组织的髓鞘蛋白的初步表征,我们在洗涤剂条件下从CNS髓鞘中纯化并结晶了马P2。
结构解析为2.1º,在结合腔中显示HEPES分子和洗涤剂LDAO。
PDB参考
:
马P2髓鞘,1yiv,r1yivsf
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,
1072-1079
doi:10.1107/S0907444905014356
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野生型TEM-1β-内酰胺酶1.55℃和突变酶Ser70Ala 2.1℃的结构表明突变酶的非共价催化模式
B.Stec公司
,
K·M·霍尔茨
,
C.L.沃伊切霍夫斯基
和
E.R.坎特罗维茨
介绍了野生型TEM-1在1.55℃的结构和突变酶Ser70Ala在2.1℃的分辨率。
这些结构表明了突变酶的非共价催化模式。
PDB参考
:
TEM-1β-内酰胺酶,1zg4
;
Ser70Ala突变体,1zg6
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,
1080-1087
doi:10.1107/S0907444905015519
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从头算
分辨率高于实验分辨率时的相位
R.卡利安德罗
,
B.卡罗齐尼
,
G.L.卡斯卡拉诺
,
L.De Caro公司
,
C.贾科瓦佐
和
D.斯利奇
外推非测量反射的模量和相位,以便于
从头算
大分子的阶段化。
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,
1088-1098
doi:10.1107/S0907444905015581
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中子衍射技术测定Z-DNA六聚体的水合结构
T.查塔克
,
I.田中
,
H.乌米诺
,
S.Arai公司
和
Niimura猪笼草
对Z-DNA六聚体d(CGCGCG)进行了1.8°分辨率的单晶中子衍射研究。
PDB参考
:
d(CGCGCG),中子结构,1v9g,r1v9gsf
;
X射线结构,1woe,r1woesf
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(2005).
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61
,
1099-1106
doi:10.1107/S0907444905015866
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从头算
单位细胞中心对称球形病毒的晶体结构测定
J.塔卡
,
H.奈托
,
吉村先生
,
N.宫崎骏
,
A.中川
和
T.筑原
安
从头算
该方法被有效地应用于确定单位细胞中唯一位于中心对称位置的球形病毒的晶体结构。
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,
1107-1115
doi:10.1107/S090744490501069
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2.0°分辨率下牛乳铁蛋白锌饱和C末端叶的结构
T.贾贝
,
沙尔马
,
N.辛格
,
A.布珊
和
T.P.辛格
牛乳铁蛋白的C端叶是用蛋白酶K进行蛋白质水解制备的。与金属离子的结合研究表明,在pH高达3.8时,锌离子仍然与C端叶结合。
锌饱和的C端叶的结构表明,锌
2+
以八面体配位结合在金属结合间隙中。
PDB参考
:
牛乳铁蛋白的锌饱和C端叶,1sdx
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61
,
1116-1124
doi:10.1107/S0907444905016318
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天然和天然的晶体结构(
S公司
)-赖氨酸结合二氢二吡啶酸合成酶
大肠杆菌
随着分辨率的提高,显示出具有生物学意义的新特征
R.C.J.多布森
,
M.D.W.格里芬
,
詹姆逊
和
杰拉德
晶体结构的分辨率优于2.0Å的天然和(
S公司
)-赖氨酸结合二氢吡啶酸合成酶
大肠杆菌
并进行了分析。
PDB参考
:
二氢二吡啶酸合酶,天然,1yxc,r1yxcsf
;
二氢二吡啶酸合成酶(
S公司
)-赖氨酸结合,1yxd,r1yxdsf
阅读文章
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(2005).
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61
,
1125-1131
doi:10.1107/S0907444905016781
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两种晶型d(TGCGCG)·d(CGCGCA)的结构:Z-DNA中序列和晶体堆积的影响
S.Thiyagarajan公司
,
S.S.拉詹
和
N.高萨姆
序列d(TGCGCG)·d(CGCGCA)结晶为两种晶型。
结构已在空间群中求解
P(P)
2
1
2
1
2
1
和
P(P)
6
5
报道了序列和晶体堆积对结构的影响。
NDB参考
:
ZD0013号
;
ZD0014号
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(2005).
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61
,
1132-1139
doi:10.1107/S0907444905016732
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胰蛋白酶晶体结构中功能运动的提取
A.施密特
和
V.S.兰津
描述了从一系列胰蛋白酶结构的各向异性原子位移参数中提取和可视化功能相关的方向运动。
PDB参考
:
尖孢F.oxysporum
胰蛋白酶,室温,1xvm,r1xvmsf
;
pH 6,1xvo,r1xvosf
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61
,
1140-1148
doi:10.1107/S0907444905016896
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的结构
耻垢分枝杆菌
单链DNA-结合蛋白和同源SSB的比较研究:结构可塑性和第四纪组合可变性的生物学意义
K.赛克里希南
,
G.P.Manjunath公司
,
P.辛格
,
杰亚坎坦
,
Z.道特
,
K.塞卡尔
,
K.穆尼亚帕
和
M.维贾扬
单链DNA结合蛋白(SSB)的结构分析
M.污点
相关研究证实,稳定二聚体和四聚体椭球形状的钳位排列是分枝杆菌SSB的特征。
不同来源的蛋白质在四级组合中表现出相当大的变异性。
PDB参考
:
使用同步辐射的低温MsSSB,1x3e
;
使用家用电源的低温MsSSB,1x3f
;
使用家用电源的室温MsSSB,1x3g
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61
,
1149-1159
doi:10.1107/S0907444905017038
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细菌F17G粘附素的自然变异对结晶行为的影响
L.Buts公司
,
A.惠伦斯
,
一、范·莫尔
,
L.Wyns公司
,
R.洛里斯
,
M.拉赫曼
,
S.奥斯卡森
,
H.德格雷夫
和
J.布卡特
利用天然种内变异体可以很容易地提高原核蛋白的成功结晶速率。
F17G伞粘连蛋白凝集素结构域的六个已知变体的结晶以及它们序列与获得的晶体形式的相容性分析证明了这一点。
PDB参考
:
F17a-G–GlcNAc、2bsc、r2bscsf
;
F17a-G–GlcNAc(β1-)OMe,1zpl,r1zplsf
;
F17b-G–壳二糖,2bs7,r2bs7sf
;
F17b-G–GlcNAc、2bs8、r2bs8sf
;
F17e-G–GlcNAc,2bsb,r2bsbsf
;
F17f-G–GlcNAc,1zk5,r1zk5sf
阅读文章
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(2005).
D类
61
,
1160-1164
doi:10.1107/S0907444905017270
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脂肽类抗生素松霉素的结构
G.邦科奇
,
L.Vértesy公司
和
G.M.谢尔德里克
达托霉素相对的tsushimicin是由
从头算
直接方法,并为这类抗生素提供了第一个X射线结构。
PDB参考
:
海啸霉素,1w3m,r1w3msf
阅读文章
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61
,
1165-1171
doi:10.1010/S0907444905017336
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一种纳米体积结晶机器人,可以动态创建结晶屏幕
B.雾气
和
L.价格
描述了使用纳米体积异步结晶机器人创建组合结晶屏幕和设置结晶实验。
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61
,
1172
doi:10.1107/S0907444905013533
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MltA:四分体孪晶蛋白质晶体结构的MAD定相和精细化。
补遗和勘误表
T.R.M.巴伦兹
,
R.M.德容
,
K.E.van Straaten公司
,
A.-M.W.H.Thunnissen先生
和
B.W.迪克斯特拉
论文的补遗和勘误表
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61
, 613–621.
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