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结构基因组学的结晶
获得第一个晶体
复杂生物大分子的制备
提高晶体和数据质量
新方法
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结构基因组学的结晶
获得第一个晶体
复杂生物大分子的制备
提高晶体和数据质量
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晶体生长物理学
下一期
发行内容
生物
结晶学
第61卷
|
第6部分
国际标准编号:1399-0047
2005年6月发行
第十届生物大分子结晶国际会议论文集
2004年6月5日至8日,中华人民共和国北京
封面插图:
ICCBM10系列
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结构基因组学的结晶
《水晶学报》。
(2005).
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61
,
651-657
doi:10.1107/S0907444905007808
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建立高通量纳升结晶实验的程序。
初始筛选、自动存储、成像和优化的结晶工作流程
T.S.沃尔特
,
J.M.迪普罗斯
,
C.J.梅奥
,
C.西博尔德
,
皮克福德先生
,
L.卡特
,
G.C.萨顿
,
N.S.贝罗
,
J.布朗
,
I.M.贝里
,
G.B.E.斯图尔特-琼斯
,
J.M.格里姆斯
,
D.K.冲压件
,
R.M.埃斯努夫
,
E.Y.琼斯
,
R.J.欧文斯
,
D.I.斯图亚特
和
K.Harlos公司
描述了牛津蛋白质生产设施(OPPF)结晶的当前工作流程。
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
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61
,
658-663
网址:10.1107/S090744490500939X
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全自动高分子结晶/观察机器人系统HTS-80的开发
H.宫崎骏
,
S.-H.金
,
I.莫特基
,
H.松崎
,
H.北原
,
A.Higuchi
和
K.米奇
开发了一种用于大分子结晶和观察的全自动机器人系统HTS-80。
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
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61
,
664-670
doi:10.1107/S0907444905000028
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巴黎南部酵母结构基因组项目中的高通量晶体优化策略:一刀切?
N.鲁利奥特
,
L.Trésaugues公司
,
M.布雷曼
,
一、索雷尔
,
N.Ulryck公司
,
M.格雷尔
,
一、Aboulfath
,
A.Poupon公司
,
D.利格尔
,
S.Quevillon-Cheruel公司
,
J.贾宁
和
H.范蒂尔堡
讨论酵母结构基因组学项目中使用的高通量优化策略,并列举一些成功的例子。
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
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61
,
671-678
doi:10.1107/S0907444905001290
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哈尔克斯
:面向小型到大型实验室的开放源代码LIMS(实验室信息管理系统)
J.普里卢斯基
,
E.乌埃利特
,
北乌里克
,
A.巴戎
,
J.伯纳
,
I.克里姆
,
S.Quevillon-Cheruel公司
,
N.鲁利奥特
,
M.格雷尔
,
D.利格尔
,
L.Trésaugues公司
,
J.L.苏斯曼
,
J.贾宁
,
H.范蒂尔堡
和
A.Poupon公司
哈尔克斯
,设计为“电子实验书”的软件,旨在(i)存储和(ii)方便访问和使用所有实验数据。
它的使用将大大改进结构基因组学实验数据的管理和跟踪。
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
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61
,
679-684
doi:10.1107/S090744490501132
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SECSG的高通量蛋白质到结构管道
Z.-J.刘
,
W.Tempel公司
,
J.D.Ng
,
D.林
,
A.K.Shah先生
,
L.Chen先生
,
P.S.霍兰伊
,
J.E.哈贝尔
,
I.A.卡塔耶娃
,
H.Xu先生
,
H.杨
,
J.C.Chang先生
,
L·黄
,
S.-H.Chang
,
W·周
,
D.李
,
J.L.普拉斯曼
,
H.张
,
M.G.牛顿
,
J.P.罗斯
,
J.S.理查森
,
D.C.理查森
和
B.-C.王
介绍了美国国立卫生研究院蛋白质结构倡议试点中心东南结构基因组学合作中心的高通量晶体结构测定管道。
阅读文章
获得第一个晶体
《水晶学报》。
(2005).
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61
,
685-689
doi:10.1107/S0907444904028707
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结晶和晶体操作
安哥拉紫檀
种子凝集素
R.洛里斯
,
A.加西亚-皮诺
,
L.Buts公司
,
J.布卡特
,
S.Beeckmans公司
,
H.德格雷夫
和
L.Wyns公司
人/Glc-特异性凝集素
安哥拉P
与Man(α1-3)ManMe复合物结晶。
竞争浸泡允许用一系列不同的单囊和寡囊取代结合的二糖,以及提取结合糖和金属离子。
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
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61
,
690-693
doi:10.1107/S0907444904029348
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狭窄苷合成酶及其与底物色胺复合物的结晶和初步X射线分析
J.科普克
,
X.马
,
G.弗里奇
,
H.米歇尔
和
J.Stöckigt
Strictosidine合成酶是一种参与植物单萜吲哚生物碱生物合成的中心酶。
将天然酶及其与底物色胺的复合物结晶并通过X射线进行分析。
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
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61
,
694-696
doi:10.1010/S0907444904028756
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天然和硒代亚砜基乙烯醚合酶的结晶和初步X射线分析
蛇形萝芙木
X.马
,
J.科普克
,
A.拜耳
,
G.弗里奇
,
H.米歇尔
和
J.Stöckigt
用悬滴法获得了乙烯醚合成酶和硒代亚砜标记的乙烯醚合酶的晶体,并用X射线晶体学进行了分析。
Vinorine合酶是BAHD超家族中第一个结晶酶。
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
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61
,
697-700
doi:10.1107/S090744490501174
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可溶性尿激酶受体(suPAR)与尿激酶氨基末端片段(1-143)复合物的结晶
M.黄
,
A.P.马扎尔
,
G.帕里
,
A.A.-R.希加西
,
A.郭台铭
和
D.B.电影院
suPAR–ATF复合物的结晶。
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
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61
,
701-703
doi:10.1107/S090744490404432
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抗IX因子抗体及其复合物的结晶
十、石
,
Y.Li(李彦宏)
,
C.卞
,
G.赵
和
M.黄
抗因子IX抗体的结晶。
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
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61
,
704-709
doi:10.1107/S0907444905006761
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刀豆蛋白的结晶与pH值的关系
E.L.福赛特
,
S.Gorti公司
和
M.L.普西
发现刀豆蛋白在pH 6.4到9.6之间结晶。
荧光各向异性和光散射测量表明溶液由三聚体组成。
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
710-712
doi:10.1107/S0907444905006864
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4存在下嗜热菌蛋白酶的初步X射线晶体学分析
M(M)
氯化钠
M.卡莫
,
K.Inouye公司
,
K.Nagata公司
和
M.Tanokura先生
本报告详细介绍了一种将高浓度氯化钠引入嗜热菌素晶体的新方法。
通过该方法获得的晶体经X射线衍射至2.43º,并在4
M(M)
NaCl首次溶解。
阅读文章
复杂生物大分子的制备
《水晶学报》。
(2005).
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61
,
713-719
doi:10.1010/S0907444905006311
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衍射良好的核糖体晶体的可重复生长
T.奥尔巴赫-内沃
,
R.扎里瓦赫
,
M.佩雷斯
和
A.约纳思
使用活性态核糖体提高了大核糖体亚基的晶体质量。
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
720-723
doi:10.1107/S0907444904030756
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将大杂质并入病毒晶体
于。
G.库兹涅佐夫
,
D.L.马基诺
,
A.J.马尔金
和
A.麦克弗森
病毒晶体可以包含多种不寻常的杂质,这是传统晶体甚至大多数蛋白质晶体所不可能的,因为它们的组成颗粒尺寸很大。
这里介绍了几种不寻常杂质的例子,以及晶格的一些后果。
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《水晶学报》。
(2005).
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61
,
724-730
doi:10.1107/S0907444904029063
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蛋白质和表面活性剂相互作用在膜蛋白结晶中的作用
B.W.Berger(伯杰)
,
C.M.Gendron公司
,
C.R.罗宾逊
,
E.W.卡勒
和
A.M.伦霍夫
研究了导致整合膜蛋白细菌视紫红质结晶的相互作用。
用自作用色谱法测定渗透二级病毒系数。
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
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61
,
731-736
doi:10.1107/S0907444905009595
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多肽复合物中GGA-GAE和γ1-ear的结构测定:低亲和力复合物在膜交通中的结晶
Y.山田
,
井上先生
,
T.石坝
,
川崎先生
,
加藤(R.Kato)
,
K.Nakayama公司
和
S.Wakatsuki公司
测定了同源肽配合物中GGA1-GAE和γ1-耳结构域的晶体结构。
使用肽标记蛋白结晶γ1-耳/肽复合物显著改善了衍射质量。
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
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61
,
737-743
doi:10.1107/S09074449053
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高分子晶体中高压诱导有序化的机理
T.林
,
西尔德坎普
,
K.布里斯特
,
P.C.Doerschuk公司
,
M.索马里祖鲁
,
H.毛
和
J.E.约翰逊
提出了一个与实验数据一致的大分子晶体压力诱导有序化的机理模型。
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
744-749
doi:10.1010/S0907444905006724
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Fab–蛋白L半无序肽复合物的不同晶体堆积
R.梅内兹
,
N.G.霍斯登
,
S.哈里森
,
C.乔利夫·雷纳德
,
M.G.戈尔
和
E.A.斯图拉
构象不明确的肽可以与蛋白质形成复合物结晶,在晶格中它们将采用多种构象。
肽与抗HCV单克隆抗体的复合物在其具有最大空间以实现自身能量最小的位置排列最有序。
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
750-754
doi:10.1107/S0907444905007110
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两种Fab单位点突变蛋白L复合物结晶和晶体堆积的比较
V.格拉纳塔
,
N.G.霍斯登
,
S.哈里森
,
C.乔利夫·雷纳德
,
M.G.戈尔
和
E.A.斯图拉
当两个不同的PpL突变体Y64W和A66W结晶结合到Fab′时,引入蛋白L(PpL)中用于停流荧光研究的色氨酸会发生晶体接触。
晶格参数在两个晶体学方向上几乎相同,但在第三个方向上显著不同,表明接触残余物的小位移在晶格中被放大。
阅读文章
提高晶体和数据质量
《水晶学报》。
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61
,
755-758
doi:10.1010/S0907444905000405
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分析超速离心法研究蛋白质预结晶溶液
一、吉崎骏
,
M.酒井
和
Y.Matsuura先生
采用分析超速离心法研究鸡蛋白溶菌酶预结晶溶液中的晶体生长单元。
阅读文章
《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
759-762年
doi:10.1107/S0907444905013466
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溶液搅拌可启动成核并提高腺苷脱氨酶晶体的质量
H.阿达奇
,
K.Takano公司
,
A.尼诺
,
H.松村
,
T.基诺西塔
,
M.瓦里萨亚
,
井上T
,
Y.Mori先生
和
佐佐木(T.Sasaki)
采用溶液冲洗技术获得了高质量的ADA络合物和ADA天然晶体。
阅读文章
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(2005).
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61
,
763-771
doi:10.1107/S0907444904028902
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从20年微重力大分子结晶历史中提取趋势
R.A.法官
,
E.H.斯奈尔
和
范德沃尔德
分析了20年微重力结晶历史的趋势。
研究发现,与作为任务寄生部分发生结晶的任务相比,专门的微重力任务增加了成功的机会。
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《水晶学报》。
(2005年)。
D类
61
,
772-775
doi:10.1107/S0907444904028768
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通过动态播种优化蛋白质晶体生长
D.Y.Zhu博士
,
朱永清(Y.-Q.Zhu)
,
Y.香
和
D.-C.王
描述了一种不同于传统方法的非平衡连续微/宏观喂料动态播种方法及其在CutCm蛋白晶体生长优化中的成功应用。
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《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
776-779
doi:10.1107/S0907444905014708
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提高蛋白质晶体筛选效率的尝试:简化筛选和实验
W.高
,
S.李
和
R.Bi公司
根据不同筛网结晶条件的效率,设计了一种简化的筛网,相关研究和试验结果表明,它可以提高结晶成功率,降低消耗。
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《水晶学报》。
(2005).
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61
,
780-783
网址:10.1107/S09074449044034407
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厌氧净化和结晶以提高晶体质量:铁氧还蛋白II
巨大脱硫弧菌
谢永昌
,
M.-Y.刘
,
J.勒加尔
和
C.-J.陈
铁氧还蛋白II的厌氧结晶
巨眶灯鱼
。
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,
784-788
doi:10.1107/S0907444905007109
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高静水压下凝胶中三种蛋白质的结晶质量和差异结晶生长行为
A.卡德里
,
B.洛伯
,
C.查伦
,
M.-C.罗伯特
,
B.卡佩尔
,
M.达马克
,
G.詹纳
和
R.Giegé
在压力下和在琼脂糖凝胶中结晶的索马丁和两种溶菌酶显示出与蛋白质水合壳的改变相关的特殊作用。
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《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
789-792
doi:10.1107/S0907444905007122
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大分子杂质和结晶方法对真细菌天冬氨酰tRNA合成酶晶体质量的影响
A.莫雷诺
,
A.托巴尔德·迪特里希
,
B.洛伯
,
C.绍特
和
R.Giegé
微量的蛋白质杂质会改变天冬氨酸-tRNA合成酶晶体的生长。
使用最纯净的酶,最好的晶体生长在对流减少的环境中。
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《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
793-798
doi:10.1107/S0907444905001368
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蛋白质晶体的完善及其应用
J.R.海利维尔
综述了X射线对蛋白质晶体完整性的评价。
给出了利用完美蛋白质晶体的几个X射线衍射物理应用。
然后介绍了中子蛋白质晶体学的应用。
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新方法
《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
799-802
doi:10.1107/S09074449050085
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新型等电聚焦两性缓冲液的研制:自由流等电聚焦X射线晶体学蛋白质样品的电荷分离
S.-H.金
,
H.宫崎骏
,
上野烟草
,
T.长尾
和
K.米奇
开发了一种适用于使用ProTeam FFE设备结晶的新型两性缓冲液。
由于使用了低分子量电解质,该缓冲液能够产生pH梯度。
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《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
803-808
doi:10.1107/S0907444905006578
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薄膜晶体和经典晶体溶菌酶结构的比较
E.佩奇科娃
,
V.西沃哲列佐夫
,
G.三角钢琴
,
圣菲奥多罗
和
C.尼科里尼
一份系统比较纳米生物膜模板法和经典悬挂滴气相扩散法产生的晶体结构的报告。
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《水晶学报》。
(2005).
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61
,
第809页至第812页
doi:10.1107/S09074449050066
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研究有无LB模板的晶体生长机制:LB到晶体的蛋白质转移
E.佩奇科娃
,
圣菲奥多罗
,
D.丰塔尼
和
C.尼科里尼
在溶菌酶薄膜模板诱导的溶菌酶晶体生长中,蛋白质从LB膜直接转移到正在形成的晶体中,为晶体成核和生长的机制提供了可能的解释。
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晶体生长物理学
《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
813-818
doi:10.1107/S0907444905006943
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化学交联法研究过饱和溶菌酶溶液结构
C.L.霍尔
,
J.R.克莱门斯
,
A.M.布朗
和
L.J.威尔逊
戊二醛交联后分离已用于检测过饱和溶液中鸡蛋白溶菌酶(CEWL)的聚集体
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《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
819-825
doi:10.1107/S090744490402949X
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共聚焦扫描荧光显微镜对蛋白质结晶的抑制成像
通过
液-液相分离
D.维瓦雷斯
,
E.W.卡勒
和
A.M.伦霍夫
液-液相分离、聚集和凝胶化等亚稳态会影响蛋白质结晶。
研究了聚乙二醇和一种大模型蛋白质葡萄糖异构酶的混合物,以表征亚稳态液-液相分离对蛋白质结晶的影响。
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《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
826-831
网址:10.1107/S0907444905013703
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原子力显微镜研究EAFP蛋白质晶体快速生长的表面形貌和动力学特性
S.Wang(王)
,
G.李
,
Y.香
,
R.-H.黄
,
Y.Zhang(张)
和
D.-C.王
用原子力显微镜观察了EAFP蛋白晶体快速生长的表面形貌和动力学特性。
讨论了与快速生长有关的特征模式。
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《水晶学报》。
(2005).
D类
61
,
832-836
doi:10.1107/S0907444905013569
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蛋白质溶液中的范德瓦尔斯相变
P.R.Wills公司
和
D.J.Winzor博士
不完全气体的范德瓦尔斯状态方程被应用于大分子溶液,特别是用于解释蛋白质溶液中的流体-流体相变。
由于分子间吸引力、硬球和静电斥力,以及惰性共溶质引起的排除体积效应,因此适当考虑了二聚作用。
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《水晶学报》。
(2005).
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61
,
837-843
doi:10.1107/S0907444905006487
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溶菌酶晶体生长的可测量特性
S.Gorti公司
,
E.L.福赛特
和
M.L.普西
讨论了影响蛋白质晶体生长速度的物理过程。
特别是,评估了可用于确定动态粗化发生的方法。
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