（IUCr）结晶学报第D节第61卷第5部分，2005年5月

葡萄糖-6-磷酸和NADP的结构研究⁺与人葡萄糖-6-磷酸脱氢酶的结合

M.Kotaka先生，S.Gover公司，L.Vandeputte-Rutten先生，S.W.N.金，V.M.S.Lam先生和M.J.亚当斯

人葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺失突变体与G6P和NADP的二元复合物结构⁺显示底物和辅酶结合并确认需要顺式脯氨酸（172）位于活性位点附近。第二种结构（非辅酶）NADP之间的可能相互作用⁺提出了G6P的界，并考虑了它的含义。

PDB参考:ΔG6PD–G6P，2bhl，r2bhlsf;ΔG6PD–NADP⁺、2bh9、r2bh9sf

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内蛋白酶furin含有两种必需的钙²⁺离子稳定其N末端和独特的S1特异性囊

M.E.比，S.亨利克，G.P.布伦科夫，H.D.巴图尼克，R.Huber公司和W.博德

哺乳动物前激素/前蛋白转化酶furin中必需钙位点的确切数量和三维定位已通过收集Ca两侧的X射线衍射数据确定K（K）通过从这些反常散射数据计算一种新型的双差分图。

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晶体工程产生亲环素D晶体，衍射分辨率为1.7º

D.施拉特，R.托马，E.昆，M.斯蒂尔，F.米勒，E.博罗尼，A.塞苏拉和M.Hennig先生

结果表明，亲环素D表面的一个单点突变改变了蛋白质的结晶特性，从而可以获得衍射质量优异且极为稳定的晶体。

PDB参考:亲环素D，2bit，r2bitsf;二甲基亚砜复合物，2biu，r2biusf

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参数空间筛选：高通量晶体结构测定的有力工具

Z.-J.刘，D.林，W.Tempel公司，J.L.普拉斯曼，J.P.罗斯和B.-C.王

使用高通量管道筛选参数空间可提高蛋白质结构测定的成功率。

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亲和素相关蛋白的高分辨率晶体结构：高亲和力生物素结合和蛋白质稳定性的研究

Y.Eisenberg-Domovich公司，V.P.Hytönen先生，M.Wilchek先生，E.A.拜耳，M.S.库洛马和O.利夫纳

AVR4已结晶为apo和生物素络合物形式，其结构已在高分辨率下确定。

PDB参考:杆状病毒表达AVR4-生物素复合物，1y52，r1y52sf;细菌表达的AVR4、1y53、r1y3sf;细菌表达的AVR4–生物素复合物，1y55，r1y55sf

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全氘化细胞色素P450cam的制备及X射线晶体学分析

F.梅勒尔，M.-T.多弗涅，一、施利钦和D.A.A.迈尔斯

为了帮助确定其中子晶体学结构，已经生产并结晶了全氘化细胞色素P450cam。

PDB参考:氢化细胞色素P450cam，1yrc，r1yrcsf;氘化细胞色素P450cam，1yrd，r1yrdsf

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的高分辨率结构肌-肌醇单磷酸酶&锂治疗的潜在靶点

R.吉尔，F.穆罕默德，R.巴迪尔，L.科茨，P.厄斯金，D.汤普森，J.库珀，M.戈尔和S.Wood公司

的结构肌-肌醇单磷酸酶（inositol monophosphatase）是锂治疗双相情感障碍的潜在靶点，已与生理镁离子配体复合测定。提出了一种详细的三金属机构；底物6-OH基团的作用被证明是直接稳定过渡态，并提出了锂的可能模式的机制⁺和镁²⁺抑制。

PDB参考:肌-肌醇单磷酸酶，2bji，r2bjisf

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以高于实验分辨率的分辨率进行相位转换

R.卡利安德罗，B.卡罗齐尼，G.L.卡斯卡拉诺，L.德·卡罗，C.贾科瓦佐和D.斯利奇

估计了非测量反射的模量和相位，以提高电子密度图的质量。

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在PEG 4000存在下，COHbC和COHbS在中性pH下以R2四元状态结晶

L.N.Patskovska公司，Y.V.帕特斯科夫斯基，S.C.阿尔莫和R.E.赫希

在中性pH和低离子强度下，COHbC（β6K）和COHbS（β6V）以R2四元形式结晶。这是第一个详细的高分辨率R2四级结构的人类血红蛋白结晶条件下接近生理。

PDB参考:二氧化碳，1m9p，r1m9psf;COHbS，1nej，r1nejsf

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中子衍射初步研究大肠杆菌与抗癌药物甲氨蝶呤结合的二氢叶酸还原酶

B.C.贝内特，F.梅勒尔，D.A.A.迈尔斯，E.E.豪厄尔和C.G.Dealwis公司

当与甲氨蝶呤抑制剂结合时，中子衍射用于帮助确定DHFR活性部位内H原子的位置。

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枯草杆菌素-嘉士伯–OMTKY3复合物的结构揭示了两种不同的卵粘蛋白构象

J.T.梅恩斯，M.M.Cherney先生，M.A.卡西姆，M.小拉斯科夫斯基和M.N.G.詹姆斯

与广谱蛋白蛋白酶抑制剂OMTKY3结合的枯草杆菌素嘉士伯的X射线晶体结构揭示了抑制剂的两种不同构象，并根据可加性合理化了先前的热力学数据。

PDB参考:枯草杆菌素-嘉士伯–OMTKY3复合物，1yu6，r1yu6sf

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来自火球菌属支持硫胺代谢中的酶功能

J.贝纳赫，W.C.埃德斯特罗姆，I.李，K.Das公司，B.库珀，R.肖，J.刘，B.名册，T.B.阿克顿，G.T.蒙蒂利奥内和J.F.亨特

TenA酶的结构暴躁P.furiosus据报道，4-氨基-5-羟基甲基-2-甲基嘧啶磷酸结合在其活性部位。

PDB参考:TenA、1rtw、r1rtwsf

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的结构大肠杆菌四方晶型5′-磷酸吡哆醇氧化酶：对该酶机制的探讨

M.K.萨福，F.N.穆萨耶夫和V.Schirch公司

吡哆醇5′-磷酸氧化酶的晶体结构揭示了该酶的机制途径。

PDB参考:吡哆醇5′-磷酸氧化酶，1wv4，r1wv4sf

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光合作用反应中心的低温结构绿芽囊藻在光明和黑暗中

R.H.G.巴克斯特，B.-L.西格尔，N.波诺马连科和J.R.诺里斯

的结构绿色双歧杆菌反应中心是通过低温数据采集报告的。

PDB参考:光合反应中心

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大肠杆菌四分体孪晶蛋白质晶体结构的MAD定相和精细化

T.R.M.巴伦兹，R.M.德容，K.E.van Straaten公司，A.-M.W.H.Thunnissen先生和B.W.迪克斯特拉

在用MAD定相数据集之后，发现晶体是四面体孪晶的。描述了一种特殊的细化协议，该协议用于处理这些数据。由此产生的结构解释了MAD在分阶段数据方面的成功，以及四分体孪晶的原因。

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低盐条件下人胸苷酸合成酶的结构

L.L.洛夫莱斯，W.小调和莱比奥达

低盐和2.0条件下人类胸苷酸合成酶的结构M（M）硫酸铵非常相似。获得的较高分辨率使疏水配体的位置能够稳定环181-197的非活性构象。

PDB参考:胸苷酸合成酶，1ypv，r1ypvsf

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1.7°分辨率下Fab HyHEL-5溶菌酶复合物结构的抗体-抗原界面中的水分子：与等温滴定量热法结果的比较

G.H.科恩，E.W.西尔弗顿，E.A.帕德兰，F.迪达，J.A.Wibbenmeyer公司，R.C.威尔森和D.R.戴维斯

蛋清溶菌酶和Fab HyHEL-5之间的复合物的结构已在1.7°分辨率下重新评估。将结构结果与等温滴定量热法的结果进行了比较。

PDB参考:HyHEL-5–溶菌酶复合物，1yqv，r1yqvsf

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SSEP-2.0：蛋白质的二级结构元素

B.巴拉穆鲁根，K.Samaya Mohan先生，J.拉梅什，M.N.A.Md.罗山，K.Sumathi公司和K.塞卡尔

蛋白质二级结构元素（SSEP）数据库是一个综合全面的知识库，用于访问非冗余（25%和90%）蛋白质链中所有二级结构成分的相关信息。此处介绍了新版本2.0。

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CADB-2.0：构象角度数据库

K.Samaya Mohan先生，S.S.Sheik公司，J.拉梅什，B.巴拉穆鲁根，Jeyasimhan先生，C.马伊拉拉西和K.塞卡尔

构象角数据库（CADB）是一个全面、权威和及时的知识库，它开发了一个强大的查询引擎，以便于检索与非冗余（25%和90%）数据集中氨基酸残基的构象角（主链和侧链）相关的信息。此处描述了更新版本。。

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飞时中子衍射法初步研究脱氮副球菌

N.苏库马尔，P.Langan先生，F.S.马修斯，L.H.琼斯，P.蒂亚加拉扬，B.P.勋伯恩和V.L.戴维森

尺寸为～2×1.3×1 mm的蓝色铜蛋白氨基氰菊酯晶体，使用D制备的溶液反复结晶和宏观喂料₂O在整个晶体生长过程中，中子的衍射分辨率为1.9º。

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晶体衍生蛋白质样品的样品制备和质谱表征

J.E.无网船舶，T.S.沃尔特，R.阿普林，D.K.冲压件和R.J.欧文斯

描述了一种用于质谱分析的晶体制备方法。给出了一个使用实例。

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口蹄疫病毒3C蛋白酶的结晶：表面诱变和一种新的结晶优化策略

J.R.伯特利和S.咖喱

通过替换两种表面暴露的半胱氨酸，获得口蹄疫病毒3C蛋白酶的可溶性重组形式。使用标准筛选溶液，通过简单的优化策略获得衍射到高分辨率（1.9º）的晶体。

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2005年5月发行

研究论文

葡萄糖-6-磷酸和NADP的结构研究⁺与人葡萄糖-6-磷酸脱氢酶的结合

内蛋白酶furin含有两种必需的钙²⁺离子稳定其N末端和独特的S1特异性囊

晶体工程产生亲环素D晶体，衍射分辨率为1.7º

参数空间筛选：高通量晶体结构测定的有力工具

亲和素相关蛋白的高分辨率晶体结构：高亲和力生物素结合和蛋白质稳定性的研究

全氘化细胞色素P450cam的制备及X射线晶体学分析

的高分辨率结构肌-肌醇单磷酸酶&锂治疗的潜在靶点

以高于实验分辨率的分辨率进行相位转换

在PEG 4000存在下，COHbC和COHbS在中性pH下以R2四元状态结晶

中子衍射初步研究大肠杆菌与抗癌药物甲氨蝶呤结合的二氢叶酸还原酶

枯草杆菌素-嘉士伯–OMTKY3复合物的结构揭示了两种不同的卵粘蛋白构象

来自火球菌属支持硫胺代谢中的酶功能

的结构大肠杆菌四方晶型5′-磷酸吡哆醇氧化酶：对该酶机制的探讨

光合作用反应中心的低温结构绿芽囊藻在光明和黑暗中

大肠杆菌四分体孪晶蛋白质晶体结构的MAD定相和精细化

低盐条件下人胸苷酸合成酶的结构

1.7°分辨率下Fab HyHEL-5溶菌酶复合物结构的抗体-抗原界面中的水分子：与等温滴定量热法结果的比较

短通信

SSEP-2.0：蛋白质的二级结构元素

CADB-2.0：构象角度数据库

飞时中子衍射法初步研究脱氮副球菌

晶体衍生蛋白质样品的样品制备和质谱表征

口蹄疫病毒3C蛋白酶的结晶：表面诱变和一种新的结晶优化策略

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