（IUCr）结晶学报第D节第60卷第10部分，2004年10月

《水晶学报》。(2004).D类60,1695-1697
doi:10.1107/S090744490418384

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大卫·默文·布鲁：学者与绅士（1931-2004）

B.W.马修斯

大卫·布鲁的讣告。

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p21存在下CK2调节亚单位的结构^{WAF1（加权平均1）}肽展示了酸性环的灵活性

L.贝特朗,M.F.R.赛义德,X.-Y.裴,E.帕里西尼,V.达纳拉吉,V.M.Bolanos-Garcia公司,J.E.阿连德和T.L.布伦德尔

蛋白激酶CK2调节亚单位的结构在p21存在下结晶^{WAF1（加权平均1）}建议在锌指图案的溶剂可及部分结合。这种新的晶体形态显示了未报道的基质结合酸性环的构象。

PDB参考:CK2β–p21^WAF公司，1rqf，r1rqfsf

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高分子结晶数据的机器学习技术

V.戈帕拉克里什南,G.利文斯顿,D.轩尼诗,B.布坎南和J.M.罗森博格

提出了系统化和表示结晶实验中所用添加剂的化学和物理特性的知识的方法。介绍了一种新的机器学习和发现程序，该程序使用这些知识自动分析增强的大分子结晶数据，以分类并找到可能有助于新晶体生长的有趣关系。

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从猪心到1.7°分辨率的辅酶A转移酶的结构

A.M.科罗斯,L.斯文森,W.T.Wolodko公司和M.E.弗雷泽

琥珀酰辅酶a:3-酮酸辅酶a转移酶的高分辨率结构显示，活性位点谷氨酸残基采用一种构象，当与辅酶a共价连接时，该酶容易发生自溶断裂。琥珀酰辅酶A:3-酮酸转移酶通过将缓冲液改为磷酸盐以这种新的晶体形式结晶。

PDB参考:斯科特，100，100;ΔSCOT，空间组P（P）2₁2₁2、1ooz、r1oozsf;ΔSCOT，空间组C类2、1型、1型操作

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使用离子结合位点绕过直接法测定结构的1000个原子极限

B.H.M.穆尔斯和B.W.马修斯

结合单个Rb的1309个非H原子的溶菌酶变体的结构⁺离子(Z=37）可通过直接方法使用本地数据确定，分辨率为1.06º。结果表明，含有1000个以上原子的蛋白质，包括卤化物结合位点或其他此类位点，可能适合从头算结构确定。

PDB参考:T4溶菌酶，1sx7，r1sx7sf;1swz，r1swzsf;1sx2，r1sx2sf;第1周，r1swysf

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抑制性芳香氨基酸与灰色链霉菌氨肽酶

V.雷兰德,R.吉尔博亚,A.斯彭金·比亚利克,D.朔姆堡,Y.肖姆,S.布隆伯格和G.肖姆

配合物的三维结构灰色链霉菌具有抑制作用的氨肽酶（SGAP）L（左）-色氨酸和第页-碘-L（左）-苯丙氨酸的测定和精制分辨率为1.3º。这些结构证实了先前提出的SGAP的作用模式以及参与结合和催化的关键酶残基。

PDB参考:新加坡会计准则-L（左）-Trp、1tf8、r1tf8sf;SGAP–第页-我-L（左）-苯丙氨酸，1tf9，r1tf9sf

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还原型二硫键异构酶DsbC的结构大肠杆菌

K.Banaszak公司,I.机械师,G.霜冻和W.里普涅夫斯基

根据决定酶活性的因素分析还原DsbC的结构。

PDB参考:DsbC、1tjd、r1tjdsf

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嗜酸性适应的结构醋酸杆菌N⁵-羧氨基咪唑核糖核苷酸变位酶（PurE）

E.C.Settembre公司,J.R.奇图鲁鲁,C.P.轧机,T.J.卡波克和S.E.伊里克

PurE的晶体结构(N个⁵-羧氨基咪唑核糖核苷酸变位酶）A.aceti公司与已知中温和嗜热菌的PurE结构相比，可以识别可能赋予酸稳定性的重要结构特征。

PDB参考:PurE、1u11、r1u11sf

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两种晶体形式的人源化抗干扰素-γFab（HuZAF）的三维结构

P.C.伯恩,S.S.Terzyan公司,G.云,N.F.兰多菲,M.Vásquez先生和A.B.埃德蒙森

通过对来自人源化抗γ-干扰素抗体（HuZAF；USAN名称为fontolizumab）的两种晶型Fab的X射线分析，确定了三种稍有不同的结构，该抗体目前正在进行克罗恩病II期临床试验。通过最佳序列fit方法设计的HuZAF重链（VH）的可变域在结构上与小鼠前体更相似，而不是基于人类VH模型的版本（HuAF2），该版本与小鼠序列同源性更低。

PDB参考:人源化抗IFN-γFab，斜方体P（P）2₁2₁2₁形式，1t3f，r1t3fsf;单斜的C类2表，1t04，r1t04sf

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的结构大肠杆菌氨肽酶P和抑制剂apstatin的复合物

S.C.格雷厄姆,M.J.马赫,W·H·西蒙斯,H.C.弗里曼和J.M.格斯

的结构大肠杆菌氨基肽酶P与抑制剂apstatin的复合物已在2.3°分辨率下精制。复合物的结构说明了阿司他丁是如何抑制氨肽酶P的，但并不能解释该酶的脯氨酸专一性。

PDB参考:氨肽酶P–阿司他丁复合物，1n51，r1n51sf

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抑制大型利什曼原虫2,4,6-三氨基喹唑啉催化的蝶啶还原酶：NADPH三元配合物的结构

K.麦克卢斯基,F.Gibellini（吉贝里尼）,P.卡瓦略,M.A.Avery先生和W.N.亨特

一种新的晶体形式L.主要已对蝶啶还原酶和抑制剂2,4,6-三氨基喹唑啉的络合物进行了表征。该抑制剂模仿原型反叶酸甲氨蝶呤的蝶呤头部组，尽管其体积小得多，但显示出类似的抑制常数。结构细节可能有助于改进锥虫感染的治疗方法。

PDB参考:蝶啶还原酶三元复合物，1w0c，r1w0csf

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泊松-玻尔兹曼静电抑制对中等分辨率蛋白质结构的影响

A.科罗斯特列夫,M.O.芬利和M.S.查普曼

库仑模型所体现的静电约束通常被证明对晶体细化有害。这里，基于泊松-玻尔兹曼的约束被证明对中分辨率优化有一定的益处。

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脂质中间相膜和可溶性蛋白质结晶机器人系统

V.切列佐夫,A.佩迪,L.穆图苏布拉曼尼亚,Y.F.Zheng先生和M.Caffrey先生

已经开发了一种相对便宜的实验室规模的机器人系统，用于在脂质中间相中结晶膜和可溶性蛋白质。它包括一个用于设置结晶试验的机器人、基于玻璃的结晶板和一个成像机器人。在标准条件下，机器人可以在13分钟内建立一个96磅的平板，每个孔只需20毫升蛋白质溶液。

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天冬氨酸-β-半醛脱氢酶机理中的关键催化官能团

J.布兰科,R.A.摩尔,C.R.费恩勒和R.E.维奥拉

为了确定活性位点半胱氨酸-组氨酸二联体的扰动对天冬氨酸-β-半醛脱氢酶催化效率的影响，对突变体结构进行了检测。

PDB参考:C136S ASADH，1pqp，r1pqpsf;H277N ASADH，1pqu，r1pqusf

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醛缩酶的结构嗜热菌HB8显示低聚物状态对热稳定性的贡献

N.K.Lokanath公司,一、Shiromizu,北大岛,Y.野鸭,M.Sugahara先生,横山由纪夫,S.Kuramitsu公司,M.Miyano先生和N.Kunishima公司

2-脱氧核糖-5-磷酸醛缩酶的晶体结构嗜热杆菌用MAD方法以1.5°的分辨率求解了HB8。该结构揭示了一种独特的四聚低聚状态，与来自不同生物体的其他两种醛缩酶的结构进行了比较。

PDB参考:嗜热杆菌醛缩酶，1j2w，r1j2wsf;DRP复合物，1ub3，r1ub3sf

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过氧化氢酶-过氧化物酶KatG的C末端结构大肠杆菌

十、卡佩纳,W.梅利克·阿达米扬,P.C.洛文和一、菲塔

KatG C末端结构域的晶体在三个不同的空间群中产生，P（P）2₁2₁2₁,我4₁和P（P）1，取决于结晶条件和N末端序列。中的晶体包装P（P）2₁2₁2₁spacegroup展现了一种晶体学上的新颖性，三个伪origin峰反映了相称的调制排列。

PDB参考:KatG，太空小组我4₁，1u2k，r1u2ksf;空间组P（P）1、1u2l、r1u2lsf;空间组P（P）2₁2₁2₁，1u2j，r1u2jsf

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通过X射线衍射将结构自动准确沉积到蛋白质数据库

H.杨,V.古拉诺维奇,S.Dutta（圣杜塔）,Z.Feng先生,H.M.伯曼和J.D.韦斯特布鲁克

RCSB蛋白质数据库（PDB）有许多用于沉积结构数据的选项，并开发了软件工具来促进该过程。这里描述了用于准确和自动化PDB数据沉积的选项、程序和工具。

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精子特异性蛋白SSP-19的结构秀丽隐杆线虫

N.舍曼,J.赛默斯基和M.罗

的结构秀丽线虫据报道，SSP-19是一个类似MSP的域。将序列、结构和包装与MSP家族成员进行比较。

PDB参考:SSP-19，第1行，第1列

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的结构嗜热菌推测周质谷氨酸/谷氨酰胺结合蛋白

H.高桥,E.稻垣祯一,C.黑石和T.H.塔希罗夫

蛋白质的晶体结构嗜热杆菌HB8基因TT1099用多波长反常色散法和硒代蛋氨酸结合蛋白求解为1.75℃，天然蛋白结构用分子替换法求解为1.5℃。两种结构都显示了结合配体，L（左）-谷氨酸或L（左）-谷氨酰胺和与周质底物结合蛋白相关的折叠，表明嗜热杆菌HB8分子很可能是L（左）-谷氨酸或/和L（左）-与周质受体相关的谷氨酰胺结合蛋白。

PDB参考:本地的Tt公司GluBP，1us4，r1us4sf;硒代亚砜Tt公司GluBP，1us5，r1us5sf

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的结构大肠杆菌YhdH，一种假定的醌氧化还原酶

G.苏尔森巴赫,V.罗伊格·扎姆博尼,F.帕戈特,S.格栅,A.所罗门群岛,C.巴伦西亚,V.坎帕纳奇,R.文森特利,M.特戈尼,H.埃克隆德和C.坎比劳

作为未知功能细菌基因产物结构基因组学项目的一部分，YhdH（一种假定的醌氧化还原酶）及其与NADP的复合物的晶体结构已分别以2.25和2.6º的分辨率测定。

PDB参考:原生YhdH，1o89，r1o89sf;YhdH–NADP复合物，1o8c，r1o8csf

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法尼基二磷酸合成酶的结晶和初步X射线衍射研究布氏锥虫

J.毛,Y.-G.高,S.奥德,H.罗宾逊,A.蒙塔尔维蒂,R.多坎波和E.奥尔德菲尔德

法尼基二磷酸合成酶布氏锥虫，非洲昏睡病的病原体，在大肠杆菌纯化后，在没有或存在二膦酸盐抑制剂氨基膦酸盐的情况下结晶。初始电子密度图质量良好，主要显示螺旋结构，但添加了两个环区。

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人甲状腺激素受体配体结合域α1亚型的结晶和初步X射线衍射研究

F.M.修女,R.阿帕里西奥,M.A.M.桑托斯,R.V.葡萄牙,S.M.G.直径,F.A.R.内维斯,L.A.西梅尼,J.D.巴克斯特,P.韦伯和一、波利卡波夫

报道了人甲状腺激素受体LBD亚型α1与甲状腺激素T3和Triac两种晶型复合物的纯化、结晶、数据收集和初步结构解。

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二肽基肽酶IV的表达、纯化及初步晶体学分析牙龈卟啉单胞菌

D.雷亚尔,A.-M.兰贝尔,Y.Kumagai先生,I.德梅斯特,S.Scharpé和V.Fülöp

重组二肽基肽酶IV来自牙龈假单胞菌已经结晶。已从硒代蛋氨酸衍生晶体中收集到2.7º的数据，SAD或MAD的结构解决方案正在进行中。

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转录调控蛋白（Rv3291c）的克隆、表达、纯化和结晶结核分枝杆菌H37Rv型

T.Shrivastava公司,S.Kumar公司和R.Ramachandran（拉马钱德兰）

Rv3291c，来自结核分枝杆菌，已被净化。该蛋白质在正交空间群中结晶P（P）222₁晶体衍射到2.7º的分辨率。

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纤维二糖磷酸化酶的结晶和初步X射线分析吉尔维斯细胞弧菌

M.Hidaka先生,北冈先生,K.Hayashi先生,瓦卡吉（T.Wakagi）,H.Shoun先生和S.Fushinobu公司

纤维二糖磷酸化酶C.吉尔维斯已经结晶，并且已经在PF BL-5A收集到2.1Å分辨率的X射线衍射数据。

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真菌水解酶的结晶和初步X射线衍射研究新乌尔米蛇造口

M.N.Isupov先生,A.A.布林德利,E.J.Hollingsworth公司,G.N.穆尔舒多夫,A.A.瓦金和J.A.小男孩

通过坐滴气相扩散技术，从表达于青霉素结合蛋白的重组蛋白中生长出与青霉素结合蛋白质同源的真菌水解酶晶体大肠杆菌.两种晶体形式在不同条件下生长。衍射数据已收集到2.6°和2.3°分辨率。

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人大黄GTPase结构域的表达、纯化、结晶和初步结构表征

Y.Yu先生,Y.Chang先生,S.李,H.胡,Q.黄和J.丁

本报告描述了人类Rheb的表达、纯化和结晶，Rheb是一种连接结节性硬化复合体和mTOR信号通路的小GTPase。Rheb与GDP、GTP和GTP类似物GppNHp以多种晶体形式结晶，为Rheb的进一步结构和功能研究奠定了基础。

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YciE蛋白的表达、结晶及初步晶体学分析大肠杆菌

D.刘,Y.Zhao先生,十、风机,Y.孙和R.O.福克斯

YciE蛋白来自大肠杆菌被过度表达和纯化。YciE晶体属于空间群R（右）32并衍射到3.0º的分辨率。

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一种推测的胍丁胺酶的结晶和初步X射线晶体学分析耐辐射球菌

J.A.李,H.J.Ahn先生,J.Y.Ha先生,S.M.垫片,K·H·金,香港金和S.W.Suh先生

推测的胍丁胺酶来自D.耐辐射药物显示出与人胍丁酶相当相似的序列被结晶。X射线数据已收集到1.80º。

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人磷酸甘油酸变位酶的克隆、纯化、结晶及初步晶体学分析

Y.Wang（王）,Z.Cheng先生,L.刘,Z.魏,万先生和W·龚

人类磷酸甘油酸变位酶已在大肠杆菌并通过吊滴蒸汽扩散法结晶。晶体属于太空群P（P）2₁衍射到2.8°的分辨率。

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蚯蚓半乳糖结合凝集素EW29 C末端结构域的结晶和初步X射线晶体学研究陆生蚯蚓

R.铃木,Z.藤本,A.库诺,J.Hirabayashi先生,K.-卡赛和长谷川（T.Hasegawa）

环节动物门蚯蚓EW29的截短突变体雷氏杆菌包含C末端结构域的晶体化。这颗水晶属于太空小组P（P）4_三2₁2，带单位-细胞参数一=b条= 61.2,c（c）=175.6º，衍射分辨率超过1.9º。

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3′-氨基糖苷激酶IIIa与真核蛋白激酶抑制剂CKI-7复合物的结晶及初步晶体学分析

D.H.Fong先生和A.M.Berghuis公司

真核蛋白激酶抑制剂CKI-7与3′-氨基糖苷磷酸转移酶IIIa型共结晶。通过显微进料获得晶体。

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的编辑域的结晶和初步X射线晶体学研究嗜热菌异亮氨酸-tRNA合成酶与转移前后编辑底物类似物复合

R.Fukunaga公司和横山由纪夫

的CP1域嗜热菌IleRS已被分离、纯化并与Val-AMS（Val-AMP类似物）和Val-2AA（Val-tRNA）共结晶表达^伊利模拟）。

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提纯、结晶和初步X射线衍射分析里氏木霉疏水蛋白HFBI

S.阿斯科林,J.P.图尔肯堡,M.Tenkanen先生,S.Uotila公司,K·S·威尔逊,M.Penttilä和K.维萨里

II类疏水蛋白HFBI已被纯化和结晶，X射线衍射数据已收集到2.5º。这是关于疏水蛋白结晶的首次报道。

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液泡H的表达、结晶和定相⁺-的ATP酶亚基C（Vma5p）酿酒酵母

O.德里,A.莫尔,F.弗罗洛和N.纳尔逊

Vma5p（亚单位C）来自酿酒酵母表达、纯化和结晶。衍射数据从原生晶体收集到1.80º，从Lu衍生晶体收集到2.0º。此外，获得了衍射至3.0℃的天然蛋白质的菱形晶体。使用SIRAS求解结构。

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GcnA结晶N个-乙酰-β-D类-葡糖苷酶，来自格氏链球菌

D.B.兰利,D.W.S.Harty,S.C.格雷厄姆,J.M.格斯,N.亨特和C.科勒

这个全球通用航空公司基因来自S.戈多尼，它授予N个-乙酰-β-D类-氨基葡糖苷酶活性已经过表达。GcnA晶体衍射到1.55埃分辨率，属于空间群P（P）2₁2₁2

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富含半胱氨酸分泌蛋白（CRISP）的纯化、结晶和初步X射线晶体学分析舟山眼镜蛇毒液

Y.-L.王,K.-X.高,吴先生和C.-J.Chen先生

富含半胱氨酸的分泌蛋白晶体阿特拉邦北部已报告。

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古细菌亮氨酸-tRNA合成酶的结晶和初步X射线晶体学研究霍里克希热球菌

R.Fukunaga公司和横山由纪夫

古细菌的亮氨酸-tRNA合成酶（LeuRS）P.horikoshii先生以C末端截断形式过度表达大肠杆菌以硫酸铵为沉淀剂，采用悬挂滴气相扩散法进行提纯和结晶。

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外膜pyochelin受体FptA的结晶和X射线衍射分析铜绿假单胞菌

D.科贝西,H.塞利亚和F.帕图斯

来自铜绿假单胞菌在高盐浓度和低盐浓度下均能获得含pyochelin的样品。他们属于太空小组P（P）1和P（P）2₁2₁2₁分别是。正交晶体衍射超过2º分辨率。

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细菌素LlpA的过表达、纯化和结晶假单胞菌属比例尺BW11M1

A.H.A.帕雷特,L.Wyns公司,R.De Mot公司和R.洛里斯

大豆凝集素样细菌素LlpA的结晶和初步X射线分析假单胞菌属描述了sp.BW11M1。表达的重组蛋白晶体大肠杆菌属于空间组P（P）2₁2₁2，带单位-细胞参数一= 150.5,b条= 154.5,c（c）= 34.2 Å.

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表达、结晶和初步X射线分析深海热球菌蛋白质同源物酿酒酵母无7p

P.P.科尔特里,B.G.吉马朗斯,C.C.奥利维拉和N.I.T.赞钦

这个P.阿比西对Nip7p（PaNip7）的同源物进行结晶，并从天然晶体和碘衍生晶体中收集X射线数据。原生晶体衍射为1.8°，属于空间群C类2，带单位-细胞参数一= 88.49,b条=90.28，c（c）= 63.35 Å, β = 134.29°. 使用SIRAS方法求解PaNip7结构。

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