（IUCr）结晶学报第D节第59卷第11部分，2003年11月

前言

相位问题

G.泰勒

结构生物学新手的大分子阶段化方法概述。

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看待实验阶段的新方法

R.J.里德

可能性的应用对实验阶段产生了很大的影响。基于多元统计的新方法为当前方法提供了新的见解，并提出了未来改进的领域。

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重原子衍生化

E.加曼和J.W.穆雷

讨论了用重原子化合物衍生蛋白质晶体的实际步骤。

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一类新的镧系配合物，用于获得用于大分子晶体学的高相功率重原子衍生物

É. 吉拉德,M.斯特尔特,J.维卡特和R.卡恩

作为共结晶或浸泡实验的高浓度溶液使用的七种钆配合物被证明是获得重原子衍生物用于测定大分子结构的非常有力的工具。SAD阶段化实验已成功地用几种已知结构的蛋白质以及以前未知结构的450kDa蛋白质组装体进行。

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蛋白质晶体学中的三碘衍生物

G.埃文斯和G.布里科内

描述了制备三碘衍生物的程序，并给出了使用常规和同步辐射源对六种测试蛋白进行SAD和SIRAS定相的示例。

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在爱迪生之后的世界里卖蜡烛：在工程场地内使用惰性气体

M.L.奎林和B.W.马修斯

通过使用蛋白质工程引入新的位点，解决了天然蛋白质中缺乏贵族结合位点的问题。除了促进相位测定外，这些位点在模型构建和分子替换过程中也可能被证明是非常宝贵的。

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优化数据收集以确定结构

A.冈萨雷斯

描述了获得实验阶段的方法和优化这些实验的方法。

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远离边缘：使用铬辐射在室内测量的硫异常信号的SAD相位

C.杨,J.W.Pflugrath公司,D.A.库尔维尔,C.N.斯坦斯和J.D.费拉拉

铬的使用K（K）α辐射与硬件和软件的其他进步相结合，使得在家庭实验室中可以实现蛋白质衍射数据的硫SAD定相。

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这是快乐的悲伤吗？

E.多德森

许多例子表明，通过精确的衍射数据，SAD定相可以快速解决大分子晶体结构。实验要求很高，有几个因素会导致失败。

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大分子结构的子结构搜索程序

R.W.格罗斯·昆斯特里夫和P.D.亚当斯

概述了Patterson方法和直接方法。接下来是一个新的混合子结构搜索的概要。

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关于子结构的对称性

R.W.格罗斯·昆斯特里夫和P.D.亚当斯

概述了子结构对称性及其对实验定相程序的影响。

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LDL受体胞外结构域的“MAD”相位：中等大小的蛋白质、大钨簇和多个非同晶晶体

G.鲁登科,L.亨利,C.冯海因,G.布里科涅和J.德伊森霍夫

LDL受体是一种中等大小的蛋白质，含有700个残基。在MAD实验中，通过利用不对称单元中存在的两个半12-磷酸钨簇的异常信号，以低分辨率从多个非同晶晶体中测定了LDL受体的胞外结构域。给出了一个案例研究。

PDB参考以下为：人低密度脂蛋白受体胞外区，1n7d

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硒亚结构的优化SHELXD公司

F.达尔安东尼亚,P.J.贝克和T.R.施耐德

使用不同路径获得的Se子结构的准确性SHELXD公司通过比较子结构解和改进模型中的硒位置来评估。

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结对介绍

S.帕森斯

孪晶是一种聚集体，其中不同的畴根据特定的对称操作结合在一起：孪晶定律。来自不同区域的反射可能重叠，而孪晶大致可分为两类，其中所有反射或仅某些反射区受重叠影响。前者发生在晶格属于比晶体结构本身更高的点群时；当孪生定律是属于高对称超胞的对称操作时，后者经常发生。

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孪晶和反常相位

Z.道特

通过在单波长反常衍射（SAD）模式中的应用，讨论和说明了大分子晶体中的单体或假单体孪晶对结构溶解过程的影响。

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使用四面体孪晶的MIR相位

A.C.Terwisscha van Scheltinga公司,K.Valegárd公司,J.哈伊杜和I.安德森

迄今为止，只有六种结构通过同晶置换法从四面体孪晶中得到解决。主要障碍似乎是数据集之间孪生分数的巨大差异。

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结构测定中相位信息的产生、表示和流动：国内外最新发展锋利的2

G.布里科内,C.冯海因,C.弗伦斯堡,M.Schiltz先生和W.帕西奥雷克

从历史和概念的角度回顾了实验阶段化方法的连续公式，包括夏普提出了一种改进的编码和利用复平面相位信息的方法。指出了进一步研究的方向。

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蛋白质晶体学中的测量误差及其后果

D.博莱克,W.小调和Z.奥特温诺夫斯基

本文讨论了测量误差的类型、它们的估计及其在晶体学过程的进一步阶段中的后果。

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用Xe、Hg和Se对AP2核心复合物进行定相

P.埃文斯

对不同导数相对相位有效性的回顾性分析表明，Xe在这种情况下提供了最佳相位。包含错误数据会降低相位。

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30S核糖体亚基结构的定相

D.E.布罗德森,小W.M.克莱蒙斯,A.P.卡特,B.T.温伯里和V.罗摩克里希南

细菌核糖体两个亚单位的高分辨率结构最近已通过X射线结晶学以高分辨率测定。将对30S核糖体亚基的定相方法进行回顾和分析。

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发行内容

2003年11月发行

实验阶段划分

会议记录CCP4型学习周末

CCP4学习周末

相位问题

看待实验阶段的新方法

重原子衍生化

一类新的镧系配合物，用于获得用于大分子晶体学的高相功率重原子衍生物

蛋白质晶体学中的三碘衍生物

在爱迪生之后的世界里卖蜡烛：在工程场地内使用惰性气体

优化数据收集以确定结构

远离边缘：使用铬辐射在室内测量的硫异常信号的SAD相位

这是快乐的悲伤吗？

大分子结构的子结构搜索程序

关于子结构的对称性

LDL受体胞外结构域的“MAD”相位：中等大小的蛋白质、大钨簇和多个非同晶晶体

硒亚结构的优化SHELXD公司

结对介绍

孪晶和反常相位

使用四面体孪晶的MIR相位

结构测定中相位信息的产生、表示和流动：国内外最新发展锋利的2

蛋白质晶体学中的测量误差及其后果

用Xe、Hg和Se对AP2核心复合物进行定相

30S核糖体亚基结构的定相

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