（IUCr）结晶学报第D节第59卷第2部分，2003年2月

《水晶学报》。(2003).D类59,203-213
doi:10.1107/S0907444902021479

溶酶体半胱氨酸蛋白酶（组织蛋白酶）：有希望的药物靶点

D.土耳其语和G.枪炮

溶酶体半胱氨酸蛋白酶的生理作用正日益成为药物靶点。本文综述了现有晶体结构及其特异性决定因素，并描述了抑制剂设计的一些方向。

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真实空间中的乒乓交叉验证：一种在不存在模型偏差风险的情况下提高部分模型相位功率的方法

J.F.亨特和J.德伊森霍夫

描述了用于求解SecA转位ATP酶晶体结构的程序。使用迭代密度修改和部分模型构建程序，将MIR相位扩展至晶体的极限分辨率4.4º，该程序采用实际空间交叉验证，以最小化模型偏差。

PDB参考:无核苷酸SecA，1m6n，r1m6nsf;Mg-ADP结合SecA，1m74，r1m74sf

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MJ1267 ATP键合盒式晶体的结构表征

Y.-R.元,O.马尔辛基维奇和J.F.亨特

对一种具有复杂孪晶图案的三角晶型进行了法医学分析，包括主晶格的四面体孪晶。分析表明，孪生是由螺旋蛋白质纤维混杂的平行和反平行堆积引起的，这是由于蛋白质的构象灵活性和纤维之间分子间相互作用的固有可塑性所允许的。

PDB参考:MJ1267 ATP装订盒的孪晶三角晶型，1g9x，r1g9xsf

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膜蛋白结晶在古巴：单油酸-洗涤剂混合物的温度依赖相行为

C.森诺加,A.苍鹭,J.M.塞顿,R.H.坦普尔和B.汉卡姆

利用脂质立方相可以制备高质量的膜蛋白三维晶体。本文介绍了多种单油酸-洗涤剂混合物的详细温度依赖性相行为，以帮助开发流线型膜蛋白结晶在立方体中.

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混合南瓜抑制剂与猪胰腺弹性蛋白酶复合物的结构

J·A·,K.希尔伯特,N.克劳斯,J.Schneider-Mergener公司和W·Höhne

描述了一种与猪胰腺弹性蛋白酶复合的混合南瓜型抑制剂的晶体结构。来自土耳其卵黏液抑制剂第三结构域的结合环在弹性蛋白酶结合时采用“典型”构象。

PDB参考:南瓜抑制剂-猪胰腺弹性蛋白酶复合物，1mcv，r1mcvsf

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D49磷脂酶A的结构₂来自皮拉杰肉毒杆菌揭示了钙结合环前所未有的结构位移：可能与协同底物结合有关

D.J.里格登,L.W.Hwa先生,S.Marangoni公司,M.H.富山和一、波利卡波夫

吡喃毒素III的晶体结构可能代表磷脂酶A的T状态₂它异常地表现出协同底物结合。

PDB参考:吡喃毒素III，1gmz，r1gmzsf

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Actin–DBP：完美的结构配合？

C.动词,I.转向架,E.Waelkens公司,A.拉比恩斯,H.Van Baelen先生,R.布伊隆和C.德兰特

肌动蛋白-DBP复合物的晶体结构以2.4º的分辨率测定。讨论了DBP寻求肌动蛋白作用的含义和肌动蛋白纤维结构的模型。

PDB参考:肌动蛋白-DBP，1ma9，r1ma9sf

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异种化合物力场参数的自动生成方法

K.尼尔森,D.勒塞罗夫,E.Sigfridsson公司和U.莱德

已经开发出一种方法，可以根据理论频率计算自动构建任何分子的晶体学精细化力场（拓扑和参数文件）。该方法已在五种含有金属位点或非标准抑制剂或辅酶的蛋白质上进行了测试，结果表明结构在各个方面都得到了改进。

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利用多重反常色散对白细胞介素-1β的高度汞面孪晶进行相位调整

M.G.鲁道夫,M.S.Kelker先生,T.R.施耐德,T.O.酵母菌,V.Oseroff公司,D.K.海德利,P.A.詹宁斯和I.A.威尔逊

白细胞介素-1β的双突变体（F42W/W120F）的晶体结构由MAD使用来自四面体孪晶的数据确定。本文介绍了白细胞介素-1β晶体中孪晶的检测和克服，并分析了孪晶对MAD相位的影响。

PDB参考:F42W/W120F白细胞介素-1β，1l2h，r1l2hsf

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牛腺苷脱氨酶与6-羟基-1,6-二氢尿苷核苷复合物的结构

T.基诺西塔,N.西洋,I.Nakanishi公司,A.佐藤和藤井裕久

牛小肠腺苷脱氨酶（ADA）与过渡态类似物6-羟基-1,6-二氢尿苷核苷（HDPR）的晶体结构以2.5°的分辨率进行了解析。HDPR通过六个氢键与ADA紧密相互作用，并完全封闭在活性位点内。

PDB参考:ADA–HDPR复合物，1krm，r1krmsf

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SOMoRe公司：一种用于分子替换的多维搜索和优化方法

D.C.贾姆罗格,Y.Zhang先生和小G.N.菲利普斯

引入了一种新的分子置换码，通过对低分辨率目标函数进行全局六维搜索，然后进行多部分局部优化，从而平衡局部优化和全局优化。

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使用反常色散确定结构的更快数据收集策略

A.冈萨雷斯

本文讨论了几个数据集的分析结果，以确定SAD和MAD相位所需的最小数据量，以及对寻求最小化晶体吸收的总曝光时间和剂量的数据收集策略设计的影响。

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牛羧肽酶A在1.25°分辨率下的精细结构

A.Kilshtain-Vardi,M.格利克,H.M.格林布拉特,A.戈德布鲁姆和G.肖姆

牛羧肽酶A的晶体结构以1.25º的分辨率进行了精细化，结合理论模拟，改进了对静息酶中构象紊乱、溶剂网络和质子化状态的描述。

PDB参考:1.25℃、1m4l、r1m4lsf条件下的牛羧肽酶A

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NADP（H）依赖性醇脱氢酶的结晶和初步X射线分析酿酒酵母和拉娜·佩雷斯

E.巴伦西亚,A.罗塞尔,C.拉罗伊,J.Farrés,J.A.Biosca公司,一、菲塔,十、Parés和W.F.奥乔亚

已经获得了两种NADP（H）依赖性醇脱氢酶的不同晶体形式衍射到高分辨率：来自酿酒酵母和ADH8来自R.佩雷斯.

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结晶和初步X射线衍射分析O（运行）-乙酰丝氨酸巯基酶pernix气核菌第1页

K.米诺,Y.Oda（奥达）,M.阿塔卡和石川克郎（K.Ishikawa）

一种参与高温古菌半胱氨酸生物合成的酶已结晶。待测定的晶体结构有望阐明祖先型酶的多功能底物特异性。

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一种耐热果胶裂解酶PL47的结晶和初步X射线分析芽孢杆菌特殊TS 47

T.Nakaniwa公司,T.塔达,石井（K.Ishii）,M.高雄,T.酒井和西村K.Nishimura

耐热果胶裂解酶PL47来自芽孢杆菌TS 47结晶。使用同步辐射收集了一组完整的衍射数据，分辨率为1.8º。

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治疗Gaucher病的重组人酸β-葡萄糖脑苷酶的结晶和初步X射线分析

D.罗伯,A.阿查里,P.马纳瓦兰,T.埃德蒙兹和D.L.斯科特

酶替代疗法在临床上可有效降低与高雪氏病（溶酶体储存障碍）相关的发病率。从相关酶（β-葡萄糖脑苷酶）的晶体中收集了2.7μl数据集。

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二氢细胞色素的结晶和初步X射线衍射分析c（c）过氧化物酶来自斯氏假单胞菌

C.博尼法西奥,C.A.库尼亚,A.米勒,C.G.蒂莫托,J.M.迪亚斯,一、莫拉和M.J.Romão先生

细胞色素c（c）过氧化物酶来自P.斯图泽里已使用柠檬酸钠和PEG 8000作为沉淀剂结晶。晶体属于太空群P（P）2₁，带有单位-细胞参数一= 69.29,b条= 143.31,c（c）= 76.83 Å, β = 100.78°.

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α-环糊精葡聚糖转移酶的结晶和初步X射线衍射研究macerans芽孢杆菌

H.-W.Choe先生,K.S.公园,J.拉巴恩,J.格兰津,C.-J.金和G.Büldt公司

α-环糊精葡聚糖转移酶软化芽孢杆菌均相纯化并结晶。晶体适合X射线分析，衍射至少为2º。

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核糖核酸酶P（C5蛋白）的初步X射线表征大肠杆菌：表达、结晶和冷冻条件

H.-W.Choe先生,D.-G.Jeong先生,J.H.公园,R.施莱辛格,J.拉巴恩,K.P.霍夫曼和G.比尔特

基因大肠杆菌核糖核酸酶P蛋白（也称为C5蛋白）及其突变体C5-C113A已在大肠杆菌在高水平上。融合蛋白经裂解后得到高纯度的功能性C5蛋白，可以结晶并通过X射线衍射进行表征。

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α-甲基酰基辅酶A外消旋酶的结晶和初步X射线衍射研究结核分枝杆菌

P.巴密克,P.库苏拉,五、Ratas,E.康泽尔曼,J.K.希尔顿,W.施密茨和R.K.维伦加

α-甲酰辅酶A消旋酶来自结核分枝杆菌已表示为大肠杆菌纯化并结晶。属于空间群的原生晶体P（P）6₁22或P（P）6₅22衍射至2.8°。

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表达、纯化和初步X射线表征N个-乙酰-γ-谷氨酰磷酸还原酶嗜热菌HB8型

M.后藤,Y.阿加里,R.奥米,一、宫城县和K.Hirotsu公司

N个-乙酰-γ-谷氨酰磷酸还原酶嗜热杆菌HB8表达于大肠杆菌纯化并结晶。晶体属于太空群P（P）6₂22或P（P）6₄衍射数据已收集到2.2º的分辨率。

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F1抗原Caf1M–Caf1伴侣-亚基预组装复合物的过度表达、纯化、结晶和初步X射线衍射分析鼠疫耶尔森菌

A.扎维亚洛夫,J.伯格伦德和S.D.奈特

晶体鼠疫耶氏菌获得了囊膜抗原预组装复合物Caf1M–Caf1。利用天然晶体、SeMet晶体和Pt标记晶体的衍射数据获得2 Au电子密度图。

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结晶和初步的X射线晶体学分析rolfsii菌核凝集素

D.D.列奥尼达斯,B.M.斯瓦米,A.G.巴特,S.R.Inamdar公司,M.N.Kosmopoulou先生,E.D.克莱西纳和N.G.Oikonamakos公司

这个齐整小核菌凝集素结晶，X射线衍射数据采集到1.1º分辨率。

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SMN Tudor域的晶界定义和结晶

R.Sprangers公司,P.塞连科,M.Sattler先生,一、正弦和M.R.Groves先生

脊髓肌肉神经元蛋白SMN的Tudor结构域的边界已用核磁共振确定，并报道了衍射到1.8º分辨率的晶体。

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类μ钙蛋白酶的纯化、结晶和初步X射线分析

G.P.帕尔,T.德维拉,J.S.埃尔斯和Z.贾

一种含有85%μ-钙蛋白酶序列的杂交钙蛋白酶已经结晶，其性质与μ-钙酶非常接近。这种结构可能有助于理解钙的差异²⁺μ-和m-钙蛋白酶之间的要求。

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高温古细菌TBP相互作用蛋白的结晶及初步X射线分析柯达卡拉热球菌应变KOD1

山本T.Yamamoto,T.松田,北坂本,H.松村,井上T,森川先生,S.卡纳亚和Y.Kai先生

高温古细菌的26kDa-TBP相互作用蛋白柯达卡拉锥虫KOD1公司(塔克-TIP26）结晶，晶体衍射至2.2º。硒代蛋氨酸塔克-TIP26也结晶并收集MAD数据。Bijvoet差分Patterson图显示出足以确定硒原子位置的强峰。

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两个家族11醛酮还原酶的表达、结晶和活性枯草芽孢杆菌

A.埃伦斯伯格和D.K.威尔逊

两种醛酮还原酶枯草杆菌它们的NADPH依赖性氧化还原酶活性已被动力学表征。

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一种岩藻糖特异凝集素的X射线晶体学表征和定相奥兰蒂亚Aleuria aurantia

藤桥先生,D.H.皮珀斯,E.中岛,T.山田,J.斋藤,A.基塔,Y.Higuchi先生,苏加瓦拉Y,A.安藤,北神宫,Y.Nagata（永田）和K.三木

一种岩藻糖特异性凝集素A.奥兰提亚结晶了。2.2Å分辨率的数据集通过使用汞衍生物的MAD方法进行收集和分阶段。

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仓鼠双氢orotase的结晶：二硫键联四聚体形式的参与

M.J.马赫,D.T.C.黄,J.M.格斯,C.A.科勒和R.I.克里斯托弗森

仓鼠的二氢orotrase结构域通过蒸汽扩散结晶。晶体被发现完全由酶的二硫键四聚体形式组成。

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国际空间站上锰超氧化物歧化酶晶体的改进三维生长

A.瓦赫迪·法里迪,J.波尔塔和G.E.O.Borgstahl公司

报道了在国际空间站微重力环境中改进锰超氧化物歧化酶结晶的初步结果。晶体体积是最佳地球晶体的80倍，衍射分辨率达到1.26º。

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的结构小肠结肠炎耶尔森菌分子杯蛋白SycE

C.B.Trame公司和D.B.麦凯

的晶体结构小肠结肠炎耶尔森菌分子-衣壳蛋白SycE显示其羧基末端肽与相邻分子上的疏水补丁结合。

PDB参考:SycE、1n5b、r1n5bsf

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利马豆胰蛋白酶抑制剂的室内相测定：一例低分辨率硫-SAD病例

《期刊》。德布赖采尼,G.邦科奇,B.吉尔曼和G.M.谢尔德里克

利用3？内部铜从天然硫的异常信号中解决了利马豆胰蛋白酶抑制剂的未知结构K（K）α数据，并根据2°同步加速器数据进行改进。

PDB参考:利马豆胰蛋白酶抑制剂，1h34，r1h34sf

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使用改进的微区组法快速筛选蛋白质结晶条件的优点

A.达西,A.麦克·斯威尼,M.斯蒂尔和A.哈伯

本文介绍了一种改进的微填充技术，可用于快速筛选结晶条件。描述了使用硅油或石蜡油的结晶特性。

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从头开始提纯方案和结晶条件产生了几丁质酶A及其与抑制剂异柳胺复合物的高分辨率结构

Y.帕帕尼科劳,G.塔夫拉,C.E.Vorgias公司和K.Petratos公司

粘质沙雷氏菌几丁质酶A的均质样品产生晶体，其结构分辨率为1.55º。酶与其有效抑制剂异氨基脲的共结晶提供了1.9°分辨率的复合物结构

PDB参考:几丁质酶A，1edq，r1edqsf;几丁质酶A-异氨基化合物复合物，1ffq，r1ffqsf

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以最大的可能性推动分子替换的边界。勘误表

R.J.里德

论文的勘误表阅读（2001）《水晶学报》。D类57, 1373–1382.

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