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发行内容
生物
结晶学
第58卷
|
第7部分
国际标准编号:1399-0047
2002年7月发行
封面插图:
通过逆流扩散在受限几何形状中生长的胰岛素晶体可以巩固晶体生长优化、低温X射线数据采集和
从头算
相位测定成为一种无需晶体操作即可快速测定结构的方法,
第1147页
.
研究论文
阿克塔·克里斯特。
(2002).
D类
58
,
1085年至1991年
doi:10.1107/S0907444902006261
股份
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高电位铁硫蛋白的超高分辨率结构
热染色质
L·刘
,
T.诺吉
,
小林先生
,
T.野泽
和
K.三木
高电位铁硫蛋白的晶体结构
特皮杜霉
使用低温衍射数据将其细化至0.80Ω分辨率,使用同步辐射收集。
基于疏水相互作用和分子堆积讨论了电子转移。
PDB参考
:
HiPIP、1iua、r1iuasf
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2002).
D类
58
,
1092-1098
doi:10.1107/S0907444902006510
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通过快速橡木方法生成同晶重原子衍生物。
第一部分:测试用例
P.D.孙
,
S.Radaev公司
和
M.卡塔赫
以溶菌酶和Fc受体晶体为测试案例,证明了传统的重原子衍生物可以通过在10分钟到2小时的时间范围内快速浸泡而不是几天来生成。
以这种方式生成的衍生物显示出更强的重原子信号,并且似乎比隔夜浸泡生成的衍生物与天然产物同构。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2002).
D类
58
,
1099-1103
doi:10.1107/S0907444902006522
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通过快速橡木方法生成同晶重原子衍生物。
第二部分:新结构的阶段划分
P.D.孙
和
S.Radaev公司
使用快速橡木方法生成重原子衍生物
从头开始
两个结构物的相位。
以这种方式生成的衍生物不仅足以进行相位调整,而且与浸泡一夜的衍生物相比,衍射效果更好,与天然产物同构。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2002).
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58
,
1104-1110
doi:10.1107/S0907444902006534
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细胞色素的结构
c(c)
6
从
最大节旋藻
:在一个几乎对称的壳中由24个亚基组成
C.A.科尔菲尔德
,
M.R.Sawaya先生
,
D.W.克罗格曼
和
T.O.酵母菌
细胞色素的一种亚型
c(c)
6
来自蓝藻
A.最大值
空间群结晶
我
4
1
32,不对称单元中有8个分子。
晶体结构显示蛋白质分子被封装成24个分子的空心簇。
PDB参考
:
细胞色素
c(c)
6
,1kib,r1kibsf
阅读文章
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(2002).
D类
58
,
1111-1117
doi:10.1107/S0907444902006509
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用于相位蛋白质X射线衍射数据的硫醇稀土螯合物
M.D.Purdy博士
,
P.Ge公司
,
J.陈
,
P.R.塞尔文
和
M.C.维纳
使用硫醇反应性镧系螯合物将有序镝离子并入34kDa测试蛋白的晶体中。
从这些晶体内部和同步加速器束线收集的数据具有较大的异常信号,这使得在这两种情况下都可以计算出高质量的SAD相位。
阅读文章
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(2002).
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58
,
1118-1128
doi:10.1107/S090744490200656X
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来自台湾的蛇毒金属蛋白酶镉取代TM-3的1.35Å结构:具有扭曲的镉八面体几何结构的TNFα转化酶样活性位点结构的阐明
K.-F.黄
,
S.-H.Chiou
,
T.-P.Ko公司
,
J.-M.袁
和
A.H.-J.王
解决了蛇毒金属蛋白酶(SVMP)TM-3的高分辨率晶体结构,该结构与TNF-转化酶(TACE)催化结构域的晶体结构有较强的相似性。
PDB参考
:
TM-3,1kuf,r1kufsf
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(2002).
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58
,
1129-1137
doi:10.1107/S0907444902006601
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活性位点结构的深三叶结酶
O.努雷基
,
M.Shirouzu先生
,
K.桥本
,
R.Ishitani先生
,
T.Terada公司
,
M.Tamakoshi先生
,
T.大岛
,
M.Chijimatsu先生
,
K.Takio公司
,
D.G.Vassylyev(D.G.瓦西里耶夫)
,
T.柴田
,
井上Y
,
S.Kuramitsu公司
和
横山由纪夫
假想RNA 2′的晶体结构-
O(运行)
-核糖甲基转移酶
嗜热杆菌
(RrmA)的分辨率为2.4Å,首次发现了一个深三叶结。
PDB参考
:
嗜热杆菌
RrmA、1ipa、r1ipasf
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58
,
1138-1146
doi:10.1010/S0907444902006698
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全日空航空公司
三
-依赖NAD
+
合成酶
枯草芽孢杆菌
分辨率为1º
J.赛默斯基
,
Y.德维德吉耶夫
,
K.摩尔
,
C.布鲁莱特
和
L.德卢卡斯
NAD的原子分辨率结构
+
合成酶被提出,并对催化机理进行了暗示。
PDB参考
:
北美
+
合成酶,1kqp,r1kqpsf
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阿克塔·克里斯特。
(2002).
D类
58
,
1147-1154
doi:10.1107/S0907444902006959
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从头算
不经晶体处理从蛋白质到电子密度的胰岛素晶体结构测定
J.A.加维拉
,
D.托赫
,
J.洛佩兹·贾拉米洛
,
J.M.García-Ruíz
和
J.D.Ng
胰岛素的结晶、低温保护和重原子衍生化已在受限几何形状下使用反扩散技术进行了优化。
获得的蛋白晶体立即用于
就地
X射线衍射、SAS的相位测定和无需晶体操作的电子密度图计算。
阅读文章
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(2002).
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,
1155-1161
doi:10.1107/S0907444902007138
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不同湿度水平下人体氧合血红蛋白和脱氧血红蛋白的结构:T状态的变化
B.K.比斯瓦尔
和
M.维贾扬
在不同环境湿度和溶剂含量水平下,高盐氧合血红蛋白和脱氧血红蛋白晶体的结构分析似乎表明,脱氧形式可以获得相关T态的集合。
PDB参考
:
含氧血红蛋白,93%r.h.,1lfq,r1lfqsf
;
氧合血红蛋白,90%r.h.,1lft,r1lftsf
;
氧合血红蛋白,88%r.h.,1lfv,r1lfvsf
;
含氧血红蛋白,84%r.h.,1lfy,r1lfysf
;
含氧血红蛋白,25%甲醇,1lfz,r1lfzsf
;
脱氧血红蛋白,90%r.h.,1lfl,r1lflsf
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阿克塔·克里斯特。
(2002).
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58
,
1162-1167
doi:10.1010/S0907444902007126
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稳定剂对蛋白质结构和水合作用的影响:单斜溶菌酶的研究
N.T.萨拉斯瓦蒂
,
R.桑卡拉纳拉亚南
和
M.维贾扬
一项在蔗糖、海藻糖、山梨醇和甘油存在下生长的单斜溶菌酶晶体的比较研究表明,稳定剂对酶的结构及其周围有序水分子的组织没有显著影响。
PDB参考
:
溶菌酶,天然单斜(I),1lj3,r1lj3sf
;
原生单斜晶系(II),1lj4,r1lj4sf
;
含10%蔗糖(I)、1lje、r1ljesf
;
含10%蔗糖(II),1ljf,r1ljfsf
;
含5%甘油(I),1ljg,r1ljgsf
;
含5%甘油(II),1ljh,r1ljhsf
;
含10%山梨醇,1lji,r1ljisf
;
含10%海藻糖、1ljj、r1ljjsf
;
含15%海藻糖、1ljk、r1ljksf
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阿克塔·克里斯特。
(2002).
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58
,
1168-1174
doi:10.1107/S090744490200714X
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在催化丝氨酸中观察到的交替构象
枯草芽孢杆菌
以1.3°分辨率测定脂肪酶
K.川崎
,
近藤H
,
铃木先生
,
S.Ohgiya公司
和
南津田
晶体结构
枯草杆菌
脂肪酶以1.3º的分辨率测定。
基于催化丝氨酸残基侧链上的交替构象和活性中心中的甘油分子,提出了一种底物结合模型。
PDB参考
:
脂肪酶,1isp,r1ispsf
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阿克塔·克里斯特。
(2002).
D类
58
,
1175-1181
doi:10.1107/S0907444902007254
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主要草花粉过敏原Phlp 5b的功能域结构
K.拉贾尚卡
,
A.布菲
,
韦伯
,
圣埃森堡
,
B.林德纳
和
Ch.Betzel餐厅
作为理解花粉蛋白与人类免疫系统成分之间相互作用的重要步骤,timothy草花粉中主要过敏原Phlp 5b的C末端关键结构域的结构已在2.0º下测定。
它是第一个完全由α螺旋体组成的已知过敏原。
PDB参考
:
[Phlp 5b]′,1l3p
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阿克塔·克里斯特。
(2002).
D类
58
,
1182-1192
doi:10.1107/S0907444902007849
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明胶结合基质金属蛋白酶C-末端截短的人ProMMP9的结构
P.A.埃尔金斯
,
Y.S.Ho先生
,
W.W.史密斯
,
C.A.詹森
,
K.J.D’Alessio(德莱西奥)
,
M.S.McQueney先生
,
M.D.Cummings博士
和
A.M.浪漫主义
人基质金属蛋白酶MMP9的X射线晶体结构已被解析为2.5º分辨率。
MMP9抑制剂的设计可能能够利用S1′结合囊的形状来实现特异性。
PDB参考
:
人型MMP9,1l6j,r1l6jsf
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结晶纸
阿克塔·克里斯特。
(2002).
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58
,
1193-1194
doi:10.1107/S0907444902005498
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重组人肉碱乙酰转移酶的结晶及初步X射线晶体学研究
W.连
,
L.戈文达萨米
,
顾耀东
,
T.库卡尔
,
M.Agbandje-McKenna先生
,
R.麦肯纳
和
D.吴
据报道,肉碱乙酰转移酶晶体的X射线衍射分辨率为1.6º。
这种酶催化短链酰基转移到辅酶A。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2002).
D类
58
,
1195-1197
doi:10.1107/S0907444902007928
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HLA-A*1101与HIV-1十肽复合物的结晶及初步X射线晶体学研究
李立群(L.Li)
,
N.Promadej公司
,
J.M.麦克尼科尔
和
M.Bouvier先生
第一个可溶性重组I类HLA-A*1101分子已被表达并重新折叠
在体外
β2-微球蛋白和Nef十肽。
对该配合物进行结晶,并收集到2.2º分辨率的X射线衍射数据。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2002).
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58
,
1198-1200人
doi:10.1107/S0907444902008417
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严格响应因子的结晶
超嗜热菌
O.克里斯滕森
,
M.劳伯格
和
M.加伊赫德
蛋白质的突变和蓄意氧化被用于提高实验阶段化的可能性。
变异蛋白在不同条件下结晶为野生型蛋白,并产生物理稳定性增强的晶体形式。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2002).
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58
,
1201-1203
doi:10.1107/S0907444902006583
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一种DnaB内含子的纯化和初步结晶研究
协同孢子虫
特殊PCC 6803
X.陈
,
徐先生(M.-Q.Xu)
,
丁毅(Y.Ding)
,
S.费兰登
和
Z.饶
来自
dna
的B基因
协同孢子虫
属。
PCC 6803公司(
Ssp公司
DnaB intein)已使用PEG 4000作为沉淀剂进行纯化和结晶。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
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58
,
1204-1206
doi:10.1107/S0907444902006571
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天然产物的结晶研究
反式
-拼接内含子
协同孢子虫
特殊PCC 6803
X.陈
,
徐先生(M.-Q.Xu)
,
丁毅(Y.Ding)
,
S.费兰登
和
Z.饶
从
dna
的E基因
协同孢子虫
特别是。
PCC6803型(
Ssp公司
DnaE intein)已使用PEG 8K作为沉淀剂进行纯化和结晶。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2002).
D类
58
,
1207-1210
doi:10.1107/S0907444902006960
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结晶和初步X射线分析
大肠杆菌
衔接蛋白ClpS,游离并与ClpA的N末端结构域复合
K.泽思
,
D.A.Dougan博士
,
S.库萨克
,
B.布考
和
R.B.拉维利
底物传感器蛋白ClpS的结晶及初步分析
大肠杆菌
报道了ClpA的N末端底物结合域的单独和复合物。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2002).
D类
58
,
1211-1213
doi:10.1107/S090744490200700X
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物品统计
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大鼠外ADP-核糖基转移酶2(ART2.2)的表达、纯化、结晶和初步X射线分析
C.米勒-迪克曼
,
T.谢尔曼
,
K.Wurthorn公司
,
J·施罗德
,
F.哈格
,
G.E.舒尔茨
和
F.科赫-诺尔特
大鼠外ADP-核糖基转移酶(ART2.2)已表达于
大肠杆菌
以三种衍射到高分辨率的形式进行纯化和结晶。
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(2002).
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58
,
1214-1216
doi:10.1010/S0907444902007357
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人TGF-βⅡ型受体配体结合域的结晶及初步晶体学研究
C.C.博森
,
S.A.Motyka公司
,
A.帕塔马韦努
和
P.D.孙
人类TGF-β受体胞外结构域的各种截短物已被表达用于结晶。
其中,TBRII(27-136)产生了衍射分辨率为1.05 Au的晶体。
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(2002).
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58
,
1217-1219
doi:10.1107/S0907444902007369
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物品统计
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结晶和初步X射线晶体学分析
yedU是的
基因产物来自
大肠杆菌
O.-G.金
,
I.-K.金
,
金先生
,
J.Ko公司
,
C.公园
,
P.-G.Suh先生
,
S.-O.Kang先生
,
H.-S.李
和
S.-S.Cha公司
A类
yedU是的
分子量为31kDa的基因产物是一种假设的蛋白质,没有已知功能。
蛋白质被纯化并在296 K下结晶。
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阿克塔·克里斯特。
(2002).
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58
,
1220-1223
doi:10.1107/S0907444902007345
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物品统计
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一种含镍超氧化物歧化酶的结晶及镍上MAD的初步相测定
K(K)
边缘
J.Wuerges公司
,
J.-W.李
,
S.-O康
和
K.Djinovic葡萄牙语
含镍超氧化物歧化酶属于一类新的超氧化物歧化酶。
它以各种晶体形式结晶,通过MAD在Ni
K(K)
边缘。
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(2002).
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58
,
1224-1225
doi:10.1010/S0907444902007370
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物品统计
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半胱氨酸脱硫酶IscS的初步晶体学分析
大肠杆菌
H.D.乌尔维纳
,
J.R.库普·维克里
和
L.E.维克里
晶体
大肠杆菌
制备了IscS,获得了分辨率为2.1º的自然X射线衍射数据集。
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(2002).
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58
,
1226-1228
doi:10.1107/S0907444902007382
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dTDP-4-keto-6-deoxy-glucose-5-epimerase(EvaD)的纯化、结晶和初步结构研究
东方Amycolatosis orientalis
,dTDP中的第四种酶-
L(左)
-表vancosamine生物合成途径
A.B.默克尔
,
G.K.寺庙
,
M.D.Burkart博士
,
H.C.洛西
,
K.Beis公司
,
C.T.沃尔什
和
J.H.奈史密斯
万古霉素是治疗革兰阳性感染的最后一道防线。
它是由碳水化合物和环化肽组成的复杂分子。
报道了合成该化合物碳水化合物部分的酶dTDP-3-氨基-4-酮基-2,3,6-三脱氧-3-C-甲基葡萄糖-5-己内酰胺酶的结晶。
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(2002).
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58
,
1229-1231
doi:10.1107/S090744490200762X
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物品统计
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海葵成孔毒素sticholysin II水溶状态的结晶和初步X射线衍射研究
向日葵针茅
J.M.曼切诺
,
马丁内斯·里波尔
,
J.G.加维兰斯
和
J.A.赫莫索
真核细胞造孔毒素Stiholysin II已通过悬滴蒸汽扩散法结晶。
本机数据的采集分辨率为1.71º。
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(2002).
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58
,
1232-1233
doi:10.1107/S0907444902006169
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物品统计
股份
中等嗜热性单酰基甘油脂肪酶的结晶和初步X射线晶体学研究
芽孢杆菌
编号H-257
K.Yoneda公司
,
T.西村
,
N.卡图努马
,
S.Imamura村
,
K.尼塔
和
H.Tsuge公司
一种中等嗜热性单酰基甘油脂肪酶
芽孢杆菌
特别是。
H-257已结晶。
衍射数据已收集到2.6 A的分辨率。
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(2002).
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58
,
1234-1236
doi:10.1107/S0907444902007965
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物品统计
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核糖核酸酶P蛋白的表达、纯化、结晶及初步衍射分析
海洋热藻
A.A.克里文科
,
A.V.卡赞采夫
,
C.阿达米迪
,
D.J.哈林顿
和
N.R.速度
RNase P蛋白来自
马里蒂玛锥虫
在中过度表达
大肠杆菌
纯化并结晶。
晶体衍射超过2.0°,属于单斜空间群
P(P)
2
1
并具有单元间参数
一
= 56.29,
b条
= 64.41,
c(c)
= 68.19 Å, β = 101.94°.
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(2002).
D类
58
,
1237-1239
doi:10.1107/S0907444902008132
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物品统计
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非FAD依赖型乙酰乳酸合成酶的结晶
肺炎克雷伯菌
S·S·庞
,
L.W.古达特
和
R.G.达格尔比
结晶和初步的X射线衍射分析
肺炎克雷伯菌
报道了乙酰乳酸合成酶。
这种酶参与2-乙酰内酰胺的形成,2-乙酰内酰胺是支链氨基酸缬氨酸和亮氨酸的前体。
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阿克塔·克里斯特。
(2002).
D类
58
,
1240-1242
doi:10.1107/S0907444902007679
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一种DNA结合蛋白的表达、纯化、结晶和初步X射线分析
詹氏甲烷球菌
G.王
,
R.Guo先生
,
M.Bartlam先生
,
H.薛
,
H.杨
,
刘彦(Y.Liu)
,
L·黄
和
Z.饶
高温古细菌87个氨基酸残基的小DNA结合蛋白
詹纳西伊先生
(Mja10b)已被克隆并在
大肠杆菌
.
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2002).
D类
58
,
1243-1245
doi:10.1107/S0907444902008326
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结晶和初步分析
大肠杆菌
YodA公司
G.大卫
,
K.布隆多
,
M.雷诺阿
和
A.莱维特·本特利
一种功能未知的蛋白质,YodA,来自
大肠杆菌
被提纯并结晶成几种不同的晶体形式。
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阿克塔·克里斯特。
(2002).
D类
58
,
1246-1248
doi:10.1107/S0907444902007667
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疟疾候选疫苗PfMSP1-19抗体复合物的结晶和初步结构分析
J.C.皮萨罗
,
V.奇塔拉
,
C.小鹿
,
D.维格
和
G.A.宾利
PfMSP1-19是一种很有前途的疟疾候选疫苗,它与一种特异性单克隆抗体的Fab之间形成的复合物已经结晶。
通过分子置换确定了该复合物的初步模型。
阅读文章
阿克塔·克里斯特。
(2002).
D类
58
,
1249-1251
doi:10.1107/S0907444902008338
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细胞分裂和分化的重要反应调节剂DivK的表征和结晶
新月尾蚴
S.Cabantous公司
,
V.吉列特
,
N.Ohta公司
,
A.牛顿
和
J.-P.萨马马
反应调节器DivK在空间组中结晶
P(P)
2
1
2
1
2
1
,带有单位-细胞参数
一
= 37.2,
b条
= 40.5,
c(c)
= 67.1 Å.
本机数据以1.6º的分辨率采集。
阅读文章
短通信
阿克塔·克里斯特。
(2002).
D类
58
,
1252-1254
doi:10.1107/S0907444902007333
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人类VI型胶原α3链C末端Kunitz型结构域在原子分辨率(0.9°)下的各向异性行为
B.阿诺
,
A.杜克鲁斯
和
T.Prangé
对人类胶原蛋白C项片段的各向异性分析表明,在100K温度下,二级结构发生高度振动。
PDB参考
:
胶原蛋白Kunitz型结构域,第1kth
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