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用X射线结晶学对P3进行成像，发现一个三聚体分子，其特征与腺病毒的主要外壳蛋白己糖极为相似。原生P3的结构现已扩展到1.65º分辨率(R（右）工作=19.0%和R（右）自由的= 20.8%). 新的高分辨率模型表明，P3通过2-甲基-2,4-戊二醇分子溶剂化的疏水斑块形成晶体。它揭示了分子的高稳定性是如何通过有序溶剂以及亚单位内和亚单位间的相互作用实现的。特别重要的是，分子顶部的“水坑”含有四层深层水化壳，该水化壳与“三聚环”形成的复杂结构特征交联。这些环也通过延伸到相邻的亚基上，连接到三聚体中的第三个亚基。由于每个亚单位都有两个八种牌子的病毒果冻卷，三聚体具有伪六角形状，可以在240个六价衣壳位置紧密堆积。P3中的柔性区域有助于衣壳内以及与下层膜的这些相互作用。一种硒代蛋氨酸P3衍生物，用于解决结构问题，已被细化到2.2º分辨率(R（右）工作=20.1%和R（右）自由的 = 22.8%). 衍生化的分子基本上没有改变，尽管同步辐射有一种奇怪的效果，使其绕三重轴旋转。P3是三聚体“双桶”蛋白的第二个例子，它形成了一个稳定的构建块，具有构建大型二十面体病毒衣壳的最佳形状。一个主要区别是，hexon有长的可变环，可以区分不同的腺病毒种类。P3中的短环及其各种相互作用的严格限制解释了为什么PRD1家族具有高度保守的外壳蛋白。
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