发行内容

期刊徽标生物
结晶学
国际标准编号:1399-0047

2000年10月发行

低分辨率相位

会议记录CCP4型学习周末

突出显示的插图

封面插图:猪胰腺弹性蛋白酶,模型包膜的[100]部分(x个) (第1316页).



研究论文


《水晶学报》。(2000).561205-1214
doi:10.1010/S0907444900009355
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本文讨论了蛋白质晶体学中的相位问题如何需要原子分辨率数据从头算无模型分阶段工作。

《水晶学报》。(2000).561215-1222年
doi:10.1107/S090744900010787
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本文综述了低温电子显微术和三维重建在测定大分子结构方面的贡献和未来潜力。

《水晶学报》。(2000).561223-1232
doi:10.1107/S090744900010088
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提出了一种低分辨率相位统计方法,并讨论了可成功用于相位调整的优值。

《水晶学报》。(2000).561233-1244
doi:10.1107/S0907444900009331
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讨论了不同密度约束在低分辨率相位调整中的应用。

《水晶学报》。(2000).561245-1252
doi:10.1107/S0907444900009343
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在低分辨率下使用统计似然作为优值的可能性从头算测试相位。

《水晶学报》。(2000).561253-1258
doi:10.1010/S090744490001115X
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本文描述了用低温电子显微镜对非结晶生物大分子进行结构分析的主要步骤。

《水晶学报》。(2000).561259-1269
doi:10.1107/S090744900011252
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2D晶体的电子晶体学数据正在加速生成和发布。然而,与X射线晶体学不同的是,电子晶体学中没有标准化的标准,可以帮助研究人员和审核员判断电子晶体数据的可靠性。本文讨论了一些相关问题,并打算作为进一步讨论的平台。

《水晶学报》。(2000).561270-1277
doi:10.1107/S09074449900009549
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推导了分析表达式,并使用计算机模拟来评估从复合物的单分子图像中导出的蛋白质结构的常见分辨率测量的准确性。得出的结论是,图像的对齐伴随着噪声的相关性,这种相关性会导致错误的分辨率测量。

《水晶学报》。(2000).561278-1287
doi:10.1107/S090744900010817
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X射线和低温电子显微镜结果的互补性在9º分辨率下被包裹病毒结构的测定和解释中得到了说明。

《水晶学报》。(2000).561288-1303
doi:10.1107/S0907444900009574
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从基本理论和实验考虑,到低分辨率下大分子包络的定相,对MASC方法进行了完整的阐述。

《水晶学报》。(2000).561304-1311
doi:10.1107/S0907444900008982
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对标准内部X射线衍射相机(Elliot-GX13/300 mm MAR IP)进行了改进,允许测量极低分辨率的衍射强度(>200º)。

《水晶学报》。(2000).561312-1315
doi:10.1107/S0907444900008970
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比奈奎斯特频率更精细地对有限样品的衍射图案进行采样,对应于样品周围无密度区域的电子密度。此无密度区域可用于直接从衍射图案中检索相位信息。

《水晶学报》。(2000).561316-1323
doi:10.1107/S0907444900008490
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单形指数模型给出了大分子晶体结构缺失部分和本体溶剂的概率分布的紧凑表示。这些分布用于局部结构的最大似然精化和最大熵补全。

《水晶学报》。(2000).561324-1331
doi:10.1107/S090744900010283
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小波系数的预测值用于将相位从10Å扩展到6-7Å左右。

《水晶学报》。(2000).561332-1340
doi:10.1010/S0907444900010908
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通过将组分的原子结构对接到低温电子显微镜图中,可以建立大分子复合物的原子模型。提出了一种基于局部真实空间关联的方法,并通过将GroEL晶体结构中的畴对接到低聚物的低温电子显微镜图中进行了验证。

《水晶学报》。(2000).561341-1349
doi:10.1107/S0907444900009562
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本文描述了利用组件结构的高、近原子分辨率晶体学结果解释低分辨率低温电子显微镜结果的技术和示例。

《水晶学报》。(2000).561350-1357
doi:10.1107/S0907444900009410
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提出了两种在存在空间位阻的情况下将X射线与EM数据拟合的技术,并将其应用于轮状病毒-Fab复合物。由于已知Fab和与病毒蛋白结合的Fab的X射线结构,这是一个很好的测试案例。
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