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生物
结晶学
第56卷
|
第10部分
国际标准编号:1399-0047
2000年10月发行
低分辨率相位
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CCP4型
学习周末
封面插图:
猪胰腺弹性蛋白酶,模型包膜的[100]部分
米
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x个
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第1316页
).
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《水晶学报》。
(2000).
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56
,
1205-1214
doi:10.1010/S0907444900009355
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低分辨率的直接方法和蛋白质晶体学
C.J.吉尔摩
本文讨论了蛋白质晶体学中的相位问题如何需要原子分辨率数据
从头算
无模型分阶段工作。
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《水晶学报》。
(2000).
天
56
,
1215-1222年
doi:10.1107/S090744900010787
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用低温电子显微镜测定大分子结构
H.R.赛比尔
本文综述了低温电子显微术和三维重建在测定大分子结构方面的贡献和未来潜力。
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《水晶学报》。
(2000).
天
56
,
1223-1232
doi:10.1107/S090744900010088
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低分辨率
从头算
阶段划分:问题与进展
V.Y.Lunin先生
,
N.L.Lunina公司
,
T.E.彼得罗娃
,
T.P.斯科沃罗达
,
A.G.Urzhumtsev公司
和
A.D.波贾尼
提出了一种低分辨率相位统计方法,并讨论了可成功用于相位调整的优值。
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《水晶学报》。
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56
,
1233-1244
doi:10.1107/S0907444900009331
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密度约束和低分辨率相位
A.G.Urzhumtsev公司
,
N.L.Lunina公司
,
T.P.斯科沃罗达
,
A.D.波贾尼
和
V.Y.Lunin先生
讨论了不同密度约束在低分辨率相位调整中的应用。
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56
,
1245-1252
doi:10.1107/S0907444900009343
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大分子晶体学中基于最大似然法的低分辨率相位
T.E.彼得罗娃
,
V.Y.鲁宁
和
A.D.波贾尼
在低分辨率下使用统计似然作为优值的可能性
从头算
测试相位。
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《水晶学报》。
(2000).
天
56
,
1253-1258
doi:10.1010/S090744490001115X
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非结晶大分子的结构分析:核糖体
E.V.奥尔洛娃
本文描述了用低温电子显微镜对非结晶生物大分子进行结构分析的主要步骤。
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56
,
1259-1269
doi:10.1107/S090744900011252
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生物样品二维晶体电子晶体学数据的评估
V.M.Unger先生
2D晶体的电子晶体学数据正在加速生成和发布。
然而,与X射线晶体学不同的是,电子晶体学中没有标准化的标准,可以帮助研究人员和审核员判断电子晶体数据的可靠性。
本文讨论了一些相关问题,并打算作为进一步讨论的平台。
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《水晶学报》。
(2000).
天
56
,
1270-1277
doi:10.1107/S09074449900009549
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单粒子结构的分辨率测量
N.格里戈里夫
推导了分析表达式,并使用计算机模拟来评估从复合物的单分子图像中导出的蛋白质结构的常见分辨率测量的准确性。
得出的结论是,图像的对齐伴随着噪声的相关性,这种相关性会导致错误的分辨率测量。
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(2000).
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56
,
1278-1287
doi:10.1107/S090744900010817
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补充晶体学还是补充显微镜?
一种研究包膜病毒的综合方法
E.J.曼奇尼
和
S.D.Fuller(S.D.富勒)
X射线和低温电子显微镜结果的互补性在9º分辨率下被包裹病毒结构的测定和解释中得到了说明。
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(2000).
天
56
,
1288-1303
doi:10.1107/S0907444900009574
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多波长反常溶剂对比度变化实验中的低分辨率相位信息
W.谢泼德
,
R.卡恩
,
M.拉明
和
R.福姆
从基本理论和实验考虑,到低分辨率下大分子包络的定相,对MASC方法进行了完整的阐述。
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(2000).
天
56
,
1304-1311
doi:10.1107/S0907444900008982
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室内低分辨率X射线晶体学
G.埃文斯
,
P.罗维斯
和
G.布里科内
对标准内部X射线衍射相机(Elliot-GX13/300 mm MAR IP)进行了改进,允许测量极低分辨率的衍射强度(>200º)。
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《水晶学报》。
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56
,
1312-1315
doi:10.1107/S0907444900008970
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过采样相位法
J.苗
,
J·柯兹
和
D.赛尔
比奈奎斯特频率更精细地对有限样品的衍射图案进行采样,对应于样品周围无密度区域的电子密度。
此无密度区域可用于直接从衍射图案中检索相位信息。
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,
1316-1323
doi:10.1107/S0907444900008490
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分子精细化和完善的原子先验分布建模
P.罗维斯
,
E.布兰科
,
C.冯海因
,
G.埃文斯
和
G.布里科内
单形指数模型给出了大分子晶体结构缺失部分和本体溶剂的概率分布的紧凑表示。
这些分布用于局部结构的最大似然精化和最大熵补全。
PDB参考
:
猪胰腺弹性蛋白酶,1lvy
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《水晶学报》。
(2000).
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56
,
1324-1331
doi:10.1107/S090744900010283
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基于小波分析的低分辨率相位扩展
P.主要
和
J.威尔逊
小波系数的预测值用于将相位从10Å扩展到6-7Å左右。
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56
,
1332-1340
doi:10.1010/S0907444900010908
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利用局部相关将畴结构对接到低温电子显微术的图谱中
A.M.罗斯曼
通过将组分的原子结构对接到低温电子显微镜图中,可以建立大分子复合物的原子模型。
提出了一种基于局部真实空间关联的方法,并通过将GroEL晶体结构中的畴对接到低聚物的低温电子显微镜图中进行了验证。
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《水晶学报》。
(2000).
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56
,
1341-1349
doi:10.1107/S0907444900009562
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将原子模型拟合到电子显微镜图中
M.G.Rossmann先生
本文描述了利用组件结构的高、近原子分辨率晶体学结果解释低分辨率低温电子显微镜结果的技术和示例。
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(2000).
天
56
,
1350-1357
doi:10.1107/S0907444900009410
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当二合一无法实现时:在空间位阻和部分占用的情况下进行装配
E.Thouvenin公司
和
E.休厄特
提出了两种在存在空间位阻的情况下将X射线与EM数据拟合的技术,并将其应用于轮状病毒-Fab复合物。
由于已知Fab和与病毒蛋白结合的Fab的X射线结构,这是一个很好的测试案例。
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