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期刊徽标生物
结晶学
国际标准编号:1399-0047

1999年1月发行

突出显示的插图

封面插图:兔肝果糖-1,6-二磷酸酶同四聚体的带状图,显示了催化和AMP结合位点的结合镁离子和硫酸根离子(第93页).

社论


《水晶学报》。(1999).D类551
doi:10.1107/S090744998016321

给编辑的信


《水晶学报》。(1999).D类552-3个
doi:10.1107/S090744998015790
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本文讨论了大分子结构数据沉积和释放的背景以及需要考虑的主要问题,并提出了一些建议。

《水晶学报》。(1999).D类554
doi:10.1107/S090744998016631

快速通信


《水晶学报》。(1999).D类555至7
doi:10.1107/S090744998013596
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MTCP-1晶体在2.0中的结晶后浸泡M(M)硫酸铵代替1.5M(M)结晶用硫酸铵将衍射分辨率从3.0提高到2.0º。

研究论文


《水晶学报》。(1999).D类558月24日
doi:10.1107/S090744998006234
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氨甲酰磷酸合成酶的三维结构大肠杆菌已确定并细化至2.1º分辨率。这种高分辨率的结构分析可以完整地描述与小亚基和大亚基相关的活性位点。

《水晶学报》。(1999).D类5525-30
doi:10.1107/S090744998006271
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从豚草种子中分离纯化了胰蛋白酶和α-淀粉酶双功能抑制剂。通过X射线衍射确定了其三维结构。

《水晶学报》。(1999).D类5531-45
doi:10.1107/S090744998006362
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牛心细胞色素的晶体结构分析c(c)用三种重原子衍生物的多重同晶置换(MIR)法测定了2.8°分辨率下的氧化酶。在二聚酶26个亚单位中的3606个氨基酸残基中,3560个氨基酸残余物位于用MIR相计算的电子密度图中。

《水晶学报》。(1999).D类5546-50
doi:10.1107/S090744998006568
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牛磷脂酶A正交型的X射线结构2已使用有序曲面循环以1.5º的分辨率进行细化。

《水晶学报》。(1999).D类5551至59
doi:10.1107/S09074499800660X
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利用多色中子束的新型单晶中子衍射仪可将数据收集时间减少约一个数量级。它特别适用于涉及生物大分子晶体的应用。它用于测定辅酶B晶体结构中溶剂分子的排列12年

《水晶学报》。(1999).D类5560-66
doi:10.1107/S090744998006623
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虹鳟溶菌酶(RBTL)与4-甲基伞形花序基壳二糖苷4MeU-(GlcNAc)的两种配合物2和壳三糖苷,4MeU-(GlcNAc)分别通过共结晶和浸泡方法制备,晶体结构已在2.0º分辨率下求解。

《水晶学报》。(1999).D类5567-76
doi:10.1107/S09074499800732X
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对鸡蛋白溶菌酶铱衍生物进行了多波长反常衍射(MAD)实验。结果表明,当重原子的吸收光谱中出现白线时,如何减少样品吸收导致的MAD数据中的系统误差。

《水晶学报》。(1999).D类5577-84
doi:10.1107/S090744998007677
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用高效液相色谱法测定了水稻矮缩病毒的晶体结构从头算逐步提高到20º分辨率。电子密度图显示了粒子内的RNA外壳以及由蛋白质组成的双层结构。

《水晶学报》。(1999).D类5585-92
doi:10.1107/S090744998007689
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HIV-1衣壳蛋白C末端结构域的晶体结构以2.6º的分辨率进行了精细化。蛋白质结晶为二聚体,其结构揭示了衣壳蛋白二聚体界面的细节,包括盐桥、氢键和范德瓦尔斯接触。

《水晶学报》。(1999).D类5593-102
doi:10.107/S0907444998008750
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兔肝果糖-1,6-二磷酸酶R型在2.3°分辨率下的晶体结构表明,它与猪肾中的酶同源。内源性镁2+离子在催化裂的金属结合部位结合。

《水晶学报》。(1999).D类55103-113
doi:10.1107/S090744998008725
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BPTI由硫氰酸盐结晶为癸聚物。这十个分子聚集成一个球状胶束状颗粒,具有强烈的内部接触。

《水晶学报》。(1999).D类55114-121
doi:10.1107/S090744998008713
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正交母鸡蛋清溶菌酶的晶体结构以1.7°的分辨率得到了细化。晶体形态与分子间大分子键的相关性A类B类C类进行了半定量评估。

《水晶学报》。(1999).D类55第122页至第128页
doi:10.1107/S09074499800938X
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载脂蛋白E(apoE)的低密度脂蛋白(LDL)受体结合区的2E8抗体的CDRH2模拟LDL受体重复序列5。因此,2E8结构为静电主导的载脂蛋白E-LDL受体相互作用提供了初始模型。

《水晶学报》。(1999).D类55129-138
doi:10.1107/S090744998009640

《水晶学报》。(1999).D类55139-148
doi:10.1107/S09074499801052X
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本文讨论了南瓜籽中两种类似胰蛋白酶抑制剂与牛和阴离子鲑鱼胰蛋白酶复合体的一级和二级结合,以解释胰蛋白酶中的底物识别。

《水晶学报》。(1999).D类55149-156
doi:10.1107/S090744998010890
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结晶研究(包括二维相图)产生了两种适用于结构测定的N-末端截断酵母天冬氨酰-tRNA合成酶晶体形式。

《水晶学报》。(1999).D类55157-167
doi:10.1010/S090744499800626X
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从MASC数据中提取了三种分子量非常不同的蛋白质的包膜结构因子的模量,并将其与从模型包膜获得的值进行了比较。在这三种情况下都显示了有序异常位点的存在及其MAD效应。

《水晶学报》。(1999年)。D类55168-172
doi:10.1107/S090744998006374
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一种已知的小蛋白RNAP1,含有800多个非H原子,不比硫重,已经用穆尔坦88.客观程序给出了一个详细的结构,显示了从1.17º分辨率数据开始的所有原子。

《水晶学报》。(1999).D类55173-180
doi:10.1107/S090744998006611
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平均原子位移参数之间的相关系数(B类高分辨率蛋白质结构中的主链和侧链原子的值)分布在与所使用的精制包相关的广泛范围内。频率分布B类C时的值α原子可能被开发成一种定性验证工具。

《水晶学报》。(1999).D类55181-190
doi:10.1107/S090744998006635
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利用青霉素同源模型,通过分子置换生成天冬氨酸蛋白酶青霉素天然晶体结构的初始相。结果表明,交叉验证、扭角动力学模拟退火和最大似然目标函数的组合可以有效地进行精细化,即使初始分子置换相电子密度图不允许手动重建。

《水晶学报》。(1999).D类55191-205
doi:10.1107/S090744998006684
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SFCHECK(SF检查)整理了一些客观标准,用于评估X射线数据的质量以及评估模型与这些数据的一致性。它用于分析蛋白质和核酸的晶体结构,这些晶体结构也含有水和其他小分子。

《水晶学报》。(1999年)。D类55206-218
doi:10.1107/S090744998007161
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在一张差分电子密度图中,故意将水分子从结构因子计算中删除,该图包含了有关晶体结构正确性的丰富信息。程序尽职调查以自动化的方式使用这些信息来获得晶体结构准确性的本地和全球指标。

《水晶学报》。(1999).D类55219-224
doi:10.1107/S090744998007331
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通过改进free,可以实现更精确的结构因素。改变了缩放程序,允许减小验证集的大小,并使用验证振幅的近似值,从而得到更准确的电子密度图。改进对于真实空间优化效果最好,但也适用于模型构建和阶段优化。

《水晶学报》。(1999).D类55225-229
doi:10.1107/S090744998007914
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正确的NCS旋转轴可以在令人惊讶的低电子密度图中识别和定位。所述程序使用合理的计算时间执行整体搜索。

《水晶学报》。(1999).D类55230-237
doi:10.1107/S090744998008208
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计算了主链肽单元和氨基酸侧链基团的球散射因子,分辨率为3º通过德拜公式。它们也由单高斯公式近似。

《水晶学报》。(1999).D类55238至242
网址:10.1107/S090744998010038
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描述了一种用于估计未观测到的Laue衍射斑的反射强度的最大熵算法。测试结果表明,这种方法能够产生有用的数据来填补“低分辨率洞”。

《水晶学报》。(1999).D类55243-246
doi:10.1107/S090744998011342
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利用溶液X射线散射数据确定了亚硝酸盐还原酶(NiR)的低分辨率分子形状,并用分子搜索方法将其定位在晶体单位细胞中。获得了良好的低分辨率相位,从中可以尝试相位扩展。

《水晶学报》。(1999).D类55247-255
doi:10.1107/S09074499801405X
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利用FFT对原子热参数进行各向异性细化,为大分子模型的重参数化开辟了新的前景。

结晶纸


《水晶学报》。(1999).D类55256-259
doi:10.1107/S01084444998002590
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生长了大肠杆菌素E9 DNA酶域及其同源免疫蛋白Im9的1:1复合物单晶。他们属于太空小组P(P)212121衍射至2.15º分辨率。还制备了硒代蛋氨酸取代蛋白晶体,用于MAD相位实验。

《水晶学报》。(1999).D类55260-262
doi:10.1107/S090744998005265
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小鼠I类主要组织相容性抗原复合物H–2D的截短可溶性形式d日被克隆、表达、重折叠在体外并在与小鼠β的复合物中结晶2来自gp160 HIV-1蛋白的V3-lop的微球蛋白和肽RGPGRAFVTI。属于空间群的晶体P(P)212121具有单元格尺寸= 51.3,b条= 92.5,c(c)=108.8μs。

《水晶学报》。(1999).D类55263-265
doi:10.1107/S090744998006672
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RuvA在大肠杆菌,纯化并与由四个18-碱基脱氧寡核苷酸制成的合成Holliday连接底物共结晶。以醋酸钠为沉淀剂的悬挂滴气相扩散法生长的晶体衍射为6º,属于空间群C类2,带单元格参数= 148,b条=148,c(c)=106°,β=123°。

《水晶学报》。(1999).D类55266-268
doi:10.1107/S090744998006908
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本文描述了类胡萝卜素结合蛋白V的纯化、结晶和初步X射线分析600软骨细胞的维莱拉菌

《水晶学报》。(1999).D类55269-271
doi:10.1107/S090744998007756
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一种新型含组氨酸磷酸转移(HPt)结构域的磷酸酶SixA的晶体大肠杆菌获得了传感器激酶ArcB。晶体属于太空群P(P)212121(=39.26,b条=48.62和c(c)=83.18º),使用同步辐射衍射高达1.5º分辨率。

《水晶学报》。(1999).D类55272-275
doi:10.1107/S090744998007768
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ras家族小GTP结合蛋白鸟嘌呤交换因子的初步晶体学分析

《水晶学报》。(1999).D类55276-278
doi:10.1107/S090744998007860
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人转甲状腺素、人视黄醇结合蛋白和抗视黄醇绑定蛋白Fab的大分子复合物已结晶。使用同步辐射,晶体衍射到3.36埃的分辨率极限。

《水晶学报》。(1999).D类55279-280
doi:10.1107/S090744998008270

《水晶学报》。(1999).D类55281-284
doi:10.107/S0907444998008506
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与HIV-1 RNA二聚化起始位点相对应的23-mer RNA已结晶。晶体有时由半面体孪晶,相应的X射线数据需要在使用前进行特殊处理。

《水晶学报》。(1999).D类55285-286
doi:10.1107/S090744998008518
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ATP-结合盒(ABC)蛋白MalK是ABC转运复合物的能量提供成分,该转运复合物跨膜转运麦芽糖和麦芽糊精。获得的MalK蛋白晶体衍射到约3.0º的分辨率。

《水晶学报》。(1999).D类55287-290
doi:10.1107/S09074499800852X
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嘧啶核苷磷酸化酶嗜热脂肪芽孢杆菌已在太空小组中克隆、纯化和结晶P(P)21在底物模拟抑制剂假尿苷存在下(衍射至2.7°)。

《水晶学报》。(1999).D类55291-293年
doi:10.1010/S090744499800866X
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YPD1表示为大肠杆菌纯化至均匀并结晶。使用PEG 4000作为沉淀剂通过悬滴蒸气扩散获得晶体。初步的X射线衍射分析表明,这些晶体属于四方空间群P(P)4212或P(P)41212个,单位-中心尺寸=b条= 52.71,c(c)= 244.02 Å.

《水晶学报》。(1999).D类55294-296
doi:10.1107/S090744998009019
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木糖异构酶来自嗜钙杆菌显示了363 K时的最大活性。它已结晶成正交空间群P(P)212121

《水晶学报》。(1999).D类55297-298
doi:10.1107/S09074499800941X
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NADH氧化酶来自水曲霉已结晶,并使用同步辐射对晶体进行了表征。它们属于具有单位-细胞尺寸的空间群P622=b条=89.9和c(c)= 491.6 Å.

《水晶学报》。(1999).D类55299-301
doi:10.1107/S09074499801004X
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基因编码空肠弯曲菌铁蛋白是一种原核铁蛋白,已经过表达并纯化了该蛋白。初步结晶和衍射研究表明该晶体属于432空间组(=151.52Å)。分子置换的结构解决方案正在进行中。

《水晶学报》。(1999).D类55302-304
doi:10.1107/S09074499801021X
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通过镍亲和色谱法克隆、过表达和纯化组氨酸标记的RluC。在pH 8.0下用醋酸钠沉淀生长的蛋白质水解衍生片段的晶体属于空间群P(P)321,单位尺寸=b条= 97.1,c(c)=86.3?,在晶体不对称单元中有两个分子。

《水晶学报》。(1999).D类55305-306
doi:10.1107/S090744998010233
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邻氨基苯甲酸合成酶催化氯氨酸合成色氨酸的第一步。部分复合物的色氨酸抑制形式鼠伤寒沙门氏菌已在太空群中结晶P(P)21212个带尺寸= 116.7,b条=101.2和c(c)= 66.8 Å.

《水晶学报》。(1999年)。D类55307-309
doi:10.1107/S090744998010245
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异-2天青素是甲胺脱氢酶的电子受体,使用两种沉淀剂:聚乙二醇4000和硫酸铵结晶。本文给出了获得的晶体的初步数据。

《水晶学报》。(1999).D类55310-313
doi:10.1107/S090744998010257
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L的晶体结构8S公司8rubisco来自A.嗜中性粒细胞分辨率为3.2º。小亚基中的35分辨率延伸形成一个结构基序,其中四个亚基的反平行链有助于形成一个新的八标记β-桶。

《水晶学报》。(1999).D类55314年至316年
doi:10.107/S0907444998010269
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源于链球菌蛋白G的结构域已被用于获得抗体Fab片段与细菌病原体肽抗原复合物的晶体脑膜炎奈瑟菌

《水晶学报》。(1999年)。D类55317-319
doi:10.1107/S090744998010592
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磷脂酶D来自抗生素链球菌已结晶为六种晶体形式,其中VI型晶体适合于X射线结构测定。

《水晶学报》。(1999).D类55320-322
doi:10.1107/S090744998010816
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晶体卡罗托沃拉肠杆菌ssp。卡罗托沃拉聚谷氨酰胺酶已经被培养。它们在不对称单元中有一个单分子,衍射到1.9º。

《水晶学报》。(1999).D类55323-325
doi:10.1010/S0907444998004934
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使用蒸汽扩散法和聚乙二醇作为沉淀剂结晶生物素结合RNA。晶体衍射到2.8Å,属于空间群P(P)4222

《水晶学报》。(1999).D类55326-328
doi:10.1107/S090744998004922
链接到html
亲和力纯化在体外所选RNA产生高度衍射的适配体-配体复合物晶体。

《水晶学报》。(1999).D类55329-331
doi:10.1107/S090744998008920
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硫酸盐还原菌丙酮酸铁氧还蛋白氧化还原酶的两种晶体形式非洲脱硫弧菌已获得。他们属于太空组P(P)212121并使用同步辐射衍射到2.3Å的分辨率。

《水晶学报》。(1999).D类55332-334
doi:10.1107/S090744998011780
链接到html
大肠杆菌蛋氨酸-tRNA_f^{\rm已见}甲酰基转移酶及其产物甲酰基甲亚砜引发剂tRNA已经结晶。晶体衍射到2.8°分辨率。

短通信


《水晶学报》。(1999).D类55335-337
doi:10.1107/S090744998011068
链接到html
牛胰蛋白酶抑制剂的结构以一种新的晶体形式被解决,其中蛋白质分子产生十聚体。

《水晶学报》。(1999).D类55338-340
doi:10.1107/S090744998007513
链接到html
詹纳西伊先生纤维蛋白同源物被过度表达、纯化和结晶。晶体衍射到1.8º的分辨率。

《水晶学报》。(1999).D类55341-344
doi:10.1107/S090744998006593
链接到html
从中国蝎毒中分离纯化出三种具有生物活性的变异神经毒素,包括一种异常酸性和一种中性成分,为研究结构-功能关系提供了一个有价值的体系。

《水晶学报》。(1999).D类55345-346
doi:10.1107/S090744998008130
链接到html
在中温条件下实现了乳清酸磷酸核糖转移酶的结晶。

《水晶学报》。(1999).D类55347-349
doi:10.1107/S09074499800821X
链接到html
重组尿嘧啶磷酸核糖转移酶(UPRT)弓形虫表示为大肠杆菌并通过组合色谱步骤从无细胞提取物中纯化。蛋白质是用悬滴蒸汽扩散技术以磷酸铵为沉淀剂结晶的,并给出了单元尺寸=b条= 119.9,c(c)=70.8Ω,每个不对称单元有两个分子。

《水晶学报》。(1999).D类55350-352
doi:10.1107/S090744998008658
链接到html
寄生虫活性蛇毒蛋白的纯化和结晶埃及血吸虫报道了一种膜锚定蛋白。晶体属于三角空间群P(P)221或P(P)121,带=b条= 64.7,c(c)=186.7Å。α=90.0,β=90.0和γ=120.0°,衍射到2.2Å。

《水晶学报》。(1999).D类55353-355
doi:10.1107/S090744998008919
链接到html
描述了一种获得植物凝集素伴刀豆球蛋白A共晶体的有效方法。如果晶体学对其他生物物理技术产生影响,则需要快速结晶和结构测定。

《水晶学报》。(1999).D类55356-359
doi:10.1107/S090744998009032
链接到html
本文介绍了与黏着斑激酶相关的GTPase调节蛋白BH(GTPase激活)结构域的表达、纯化和结晶。原生晶体衍射至2.15º,已收集到完整的数据集。

《水晶学报》。(1999).D类55360-362
网址:10.1107/S090744998010701
链接到html
通过比较大豆抑制剂与哺乳动物和昆虫α-淀粉酶的相互作用模式,可以了解蛋白质抑制剂所起抑制作用的主要规律。

国际结晶学联合会


《水晶学报》。(1999).D类55363-368
doi:10.1010/S0907444998015443
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