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结构
生物学
第51卷
|
第5部分
国际标准编号:2059-7983
1995年9月发行
封面插图:
嘌呤核苷磷酸化酶的静电活性位点
鸟嘌呤的电势面和偶极。
使用渲染
色带++
和
斯巴达
.
研究论文
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
609-618
https://doi.org/10.107/S090744994013247
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差异细化:获取两个相关结构之间的差异
T.C.特威利格
和
J.贝伦岑
讨论了在先前已确定密切相关结构的情况下,对大分子结构进行差异细化的优点。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
619-625年
https://doi.org/10.1107/S907444994013478
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谷胱甘肽化人溶菌酶的结构:二硫键形成过程中的折叠中间体模拟物
K.稻田
,
K.米奇
,
菊池先生
,
谷山Y
和
松岛先生
突变型人类溶菌酶C77A-a的三维结构,其中残基Cys77被丙氨酸取代,已被精炼为
R(右)
值0.125,使用分辨率范围为10.0-1.8º的8230次反射。
PDB参考
:
1小时
阅读文章
《水晶学报》。
(1995年)。
D类
51
,
626-628
https://doi.org/10.107/S09074499401351X
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关于相位关系在复杂结构中的应用。
三十五、。
2-Zn胰岛素的一些实验
穆克吉
和
M.M.伍尔夫森
在合适的条件下,直接法可以成功地解决不对称单元中800多个独立原子的蛋白质。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
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51
,
629-646
https://doi.org/10.107/S090744994013521
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2.2°分辨率下精制的人二铁酸乳铁蛋白的结构
M.哈里达斯
,
B.F.安德森
和
E.N.贝克
利用同步加速器数据以2.2º的分辨率,通过受限最小二乘法对不同形式的人铁结合蛋白乳铁蛋白的结构进行了精细化。
PDB参考
:
1千克
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
647-653
https://doi.org/10.107/S090744994013958
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半铬血红蛋白的三维结构
砂尾藻
D.T.米切尔
,
S.R.恩斯特
,
吴先生
和
M.L.哈克特
描述了单体半铬血红蛋白的X射线结构。
半胱氨酸是低自旋铁血红蛋白,其第六铁配位位点充满氮基,通常是末端组氨酸的咪唑。
PDB参考
:
1磅
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《水晶学报》。
(1995).
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51
,
654-662
https://doi.org/10.107/S090744994013612
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1.65º分辨率下六方火鸡卵白溶菌酶的结构
P.L.豪厄尔
该结构为硫氰酸盐与精氨酸残基结合的模式提供了直接证据,并为硫氰酸盐在结晶碱性蛋白质方面的效率提供了可能的机制。
PDB参考
:
1头巾
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《水晶学报》。
(1995).
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51
,
663-681
https://doi.org/10.107/S090744994014484
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0.83℃和130 K下蛋白质crambin的全矩阵精炼
B.Stec公司
,
R.Zhou先生
和
M.M.提特
小蛋白crambin的无约束全矩阵求精揭示了与约束求精的一些差异,并根据结构因子数据对误差进行了估计。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
682-694
https://doi.org/10.107/S090744994014496
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分子置换求解TEM1β-内酰胺酶结构和S235A突变体的精细结构
E.Fonzé
,
P.查利尔
,
Y.托斯
,
M.Vermeire先生
,
十、Raquet
,
A.杜布斯
和
J.-M.Frère先生
在酶具有多种氨基酸序列的情况下,测试了分子置换方法的局限性。
解决了一种新的A类β-内酰胺酶和一种活性位点突变。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
695-702
https://doi.org/10.107/S090744994015040
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快速
从头算
蛋白质结构溶剂包络的计算
G.W.哈里斯
已经为
从头算
计算高分子结构的低分辨率溶剂包络线。
衍生相可用于生成低分辨率电子密度分子包络。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
703-710
https://doi.org/10.107/S090744994014794
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核糖核酸酶A的水依赖性结构域运动和柔韧性及其水化壳的不变特征。
酶的两种低湿度晶体的X射线研究
R.V.R.基尚
,
N.R.Chandra公司
,
C.Sudarsanakumar公司
,
K.Suguna公司
和
M.维贾扬
以高分辨率测定了两种低湿度结晶形式的木红菌内切酶A的结构。
与其他相关形式相比,它们提供了有关酶的流动性、水化壳的不变特征以及脱水与酶作用之间可能的关系的信息。
PDB参考
:
1瑞尔
;
1rhb(相对湿度)
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
711-717
https://doi.org/10.107/S090744995001041
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天青蛋白突变镍-Trp48Met的结构
铜绿假单胞菌
分辨率为2.2º
L.-C.蔡
,
L.Sjölin先生
,
V.兰格
,
N.博南德
,
B.G.卡尔森
,
T.Vänngárd公司
,
C.哈曼
和
H.Nar公司
天青蛋白突变体镍-Trp48Met的晶体结构
铜绿假单胞菌
已解为最终晶体学
R(右)
分辨率为17.0%至2.2º。
在Trp48残基上进行突变,以研究其在长程电子转移途径中的作用。
PDB参考
:
1纳米锆
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
718-724
https://doi.org/10.107/S090744995000035
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火鸡蛋溶菌酶复合物的X射线结构-
N个
-乙酰壳聚糖。
α-异构体的识别和结合
K·哈拉塔
和
M.穆拉基
含di的火鸡蛋溶菌酶复合物的晶体结构-
N个
-乙酰壳二糖证明糖以催化反应中未假定的方式结合。
PDB参考
:
1盎司
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
725-730
https://doi.org/10.107/S090744995000333
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第二晶型阴离子鲑鱼胰蛋白酶的结构
G.I.Berglund公司
,
A.O.斯马洛斯
,
A.霍德维克
和
N.P.威拉森
阴离子鲑鱼胰蛋白酶的第二晶体结构在1.83℃下得到了精制。
结构与第一种形式的结构一致,但硫酸盐离子和第二种苯甲脒分子(前者中不存在)以明确的密度位于后者中。
PDB参考
:
一位
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
731-739
https://doi.org/10.107/S090744995001156
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碲隆-亚砜基二氢叶酸还原酶的表达、表征及晶体学分析
J.O.Boles博士
,
K.莱温斯基
,
M.G.Kunkle先生
,
M.Hatada先生
,
莱比奥达
,
R.B.邓拉普
和
J.D.奥多姆
本文描述了一种将碲隆硫堇生物掺入蛋白质的实用方法。
讨论了该工艺的意外选择性。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995年)。
D类
51
,
740-748
https://doi.org/10.107/S090744995001284
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直接旋转函数:旋转Patterson相关搜索在分子替换中的应用
W.L.德拉诺
和
A.T.Brünger
直接旋转函数包括搜索模型的所有自Patterson向量。
对于两个困难的分子替换测试用例,它产生了比其他旋转函数更好的信噪比。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
749-759
https://doi.org/10.1107/S90744499500399
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用并行计算机进行非晶体学对称平均的相位细化和扩展
科纳·哈塞根硕士
,
Z.Zhang先生
,
R.E.林奇
,
D.C.马里内斯库
,
A.哈德菲尔德
,
J.K.穆克尔鲍尔
,
S.Munshi公司
,
L.Tong先生
和
M.G.Rossmann先生
电子密度平均。
快速傅里叶综合和快速傅里尔分析程序已被用于并行计算系统。
这些都与利用非晶体学对称性和溶剂压平进行迭代相位改进和扩展有关。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
760-766
https://doi.org/10.107/S090744995001491
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一种二聚血红蛋白的X射线结构测定
砂尾藻
D.T.米切尔
,
S.R.恩斯特
和
M.L.哈克特
海参配体二聚血红蛋白的结构与蛤血红蛋白的血红素-血红素接触密切。
PDB参考
:
1小时
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
767-771
https://doi.org/10.1107/S907444995001570
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脱氧胞苷-3',5'-鸟苷(3',5'-dCpdG)与核糖核酸酶以1.9°分辨率共结晶结晶络合物的结构
J.N.Listgarten公司
,
D.梅斯
,
L.Wyns公司
,
C.F.阿吉拉尔
和
R.A.帕尔默
牛核糖核酸酶A与二核苷酸脱氧胞苷基-3',5-鸟苷共结晶的X射线结构以1.9º的分辨率进行了测定,并用约束最小二乘法对其进行了精细化
R(右)
=0.218,对于7807次反射。
该结构确定了最近观察到的亚稳态类似物胞苷基-2’-5’-鸟苷和脱氧胞苷基-3’~5’-鸟肽的逆行附着模式,在浸泡的RNase A晶体中也存在于共晶络合物中。
PDB参考
:
1立方厘米
阅读文章
《水晶学报》。
(1995年)。
D类
51
,
772-779
https://doi.org/10.107/S090744995000436
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聚乙二醇水溶液的非饱和性:在蒸汽扩散实验中用作高分子结晶剂的后果
S.V.阿拉卡利
,
J.R.勒夫特
和
G.T.德提塔
测量已知浓度下盐的聚乙二醇8000浓度,其与水蒸汽压相等。
当PEG用作蒸汽扩散实验中的结晶剂时,结果具有实际意义。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
780-785
https://doi.org/10.107/S090744995002277
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伴侣盐、聚乙二醇和蒸汽扩散结晶中的平衡速率
J.R.勒夫特
和
G.T.德提塔
在以聚乙二醇为唯一结晶剂的蒸汽扩散实验中,液滴与储层的平衡速度可能很慢。
向液滴和储液罐中添加适量的盐可以大大加快平衡过程。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
786-791
https://doi.org/10.107/S09074499500299X
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蒸汽扩散结晶中的水平衡速率:取决于蒸汽空间中空气的残余压力
G.T.德提塔
和
J.R.勒夫特
坐滴蒸汽扩散实验中的水平衡速率对蒸汽空间中空气的残余压力敏感,这表明水在蒸汽空间中的传输是蒸汽扩散结晶中的速率限制步骤。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995年)。
D类
51
,
792-804
https://doi.org/10.107/S090744995003027
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Pf1丝状噬菌体:利用3.3º分辨率X射线纤维衍射数据通过模拟退火改进分子模型
A.冈萨雷斯
,
C.中堂
和
D.A.马文
猪流感病毒Pf1的外壳蛋白亚单位是通过极性相互作用在病毒体内紧密结合的轻度弯曲的α螺旋。
PDB参考
:
4ifm公司
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
805-813
https://doi.org/10.1107/S90744499500045X
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2.1°分辨率下Cu-取代醇脱氢酶的精细结构
S.Al-Karadaghi公司
,
E.S.Cedergren-Zeppezauer公司
,
Z.道特
和
K·S·威尔逊
活性部位金属取代乙醇脱氢酶(LADH)经常用于该酶的功能研究。
CuII离子的插入使蓝色蛋白质的光谱特性与铜氧还蛋白相似。
三元LADH-NADH-DMSO络合物中的铜具有三角几何结构,CuII几乎位于NS中
2
-配体平面和DMSO距离金属约3.2º。
PDB参考
:
2氧化锡
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
814-818
https://doi.org/10.107/S090744995000655
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用汞在1°波长下定相
C.杜马
,
S.Duquerroy公司
和
J.贾宁
半胱氨酸突变体的汞衍生物
粘液菌
核苷二磷酸激酶和龙虾烯醇化酶在低于汞的波长下用于数据收集
L(左)
三
吸收边缘。
SIRAS相产生的电子密度图在溶剂压平后可以解释。
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:
1npk(单位:千帕)
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(1995).
D类
51
,
819-823年
https://doi.org/10.1107/S907444995000643
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前羧肽酶A三元配合物晶体的半面体孪晶测定和初步结构分析
F.X.戈米斯·吕斯
,
一、菲塔
,
R.基弗绍尔
,
R.Huber公司
,
F.X.阿维利斯
和
J.纳瓦扎
本出版物介绍了一种在有Patterson-search解决方案或其他类型相位可用的情况下,对偶数据进行反褶积的方法。
PDB参考
:
1品脱
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,
824-826
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人血浆谷胱甘肽过氧化物酶的结晶及初步X射线衍射分析
B.任
,
W.黄
,
B.奥克森
和
R.拉登斯坦
人血浆中谷胱甘肽过氧化物酶的胞外形式已经结晶。
初步的X射线衍射分析表明,这种酶的四聚体可能具有(222)对称性。
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,
827-829
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氨甲酰磷酸合成酶的结晶和初步X射线晶体学分析
大肠杆菌
J.B.托登
,
F.M.Raushel先生
,
S.玛丽亚
,
D.R.Tomchick博士
和
I.射线
氨甲酰磷酸合成酶
大肠杆菌
在pH为8的条件下,在L-鸟氨酸、MnCl的存在下结晶
2
和ADP使用PEG 8000和NEt
4
氯和氯化钾。
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(1995).
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51
,
830-832
https://doi.org/10.1107/S907444994013533
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甘油脱氢酶的结晶
嗜热脂肪芽孢杆菌
K·W·威尔金森
,
P.J.贝克
,
D.W.赖斯
,
T.J.斯蒂尔曼
,
M.G.戈尔
,
O.克劳斯
和
T.阿特金森
NAD+连接的甘油脱氢酶的晶体是从
嗜热脂肪杆菌
对这些晶体的分析将为这种酶所属的一类多元醇脱氢酶提供结构框架。
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(1995).
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51
,
833-834年
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其他晶型
E类
.
大肠杆菌
II类果糖-1,6-二磷酸醛缩酶
北川Y.Kitagawa
,
G.A.伦纳德
,
S.J.哈罗普
,
M.R.Peterson先生
和
W.N.亨特
结晶实验
大肠杆菌
II类醛缩酶产生了新的正交和单斜形式,以帮助结构溶解。
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,
835-836
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谷氨酸特异性蛋白酶的结晶和初步X射线晶体学研究
地衣芽孢杆菌
与Z-Leu-Glu-CH的络合物
2
氯
K.Kitadokoro公司
谷氨酸特异性蛋白酶
地衣芽孢杆菌
已与抑制剂Z-Leu-Glu-CH形成络合物结晶
2
氯。
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51
,
837-839
https://doi.org/10.107/S090744995000904
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NADP-特异性谷氨酸脱氢酶的结晶和初步X射线分析
粗糙神经孢子虫
T.J.斯蒂尔曼
,
K.S.P.叶
和
D.W.赖斯
NADP连接的谷氨酸脱氢酶来自
粗糙神经孢子虫
已结晶,完整的结构测定将有助于理解用自然发生突变体的杂交六聚体观察到的等位基因间互补的分子基础。
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(1995).
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51
,
840-841
https://doi.org/10.107/S090744995001168
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嗜热生物精氨酸酶的结晶和初步X射线衍射研究
钙华芽孢杆菌
C.A.史密斯
,
M.I.普拉切特
和
E.N.贝克
极端嗜热菌产生的精氨酸酶晶体,
钙华芽孢杆菌
,已经制备成适合于通过X射线晶体学进行高分辨率结构测定的形式。
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51
,
842-844
https://doi.org/10.107/S090744995001144
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氯过氧化物酶的初步晶体学分析
烟曲霉Caldarimoyces fumago
桑达拉穆斯先生
,
J.M.毛罗
,
A.M.沙利文
,
J.特纳
和
T.L.普洛斯
过氧化物酶。
已知的血红素酶催化剂中种类最多的,已在两个空间群中结晶,这两个空间组均适用于高分辨率X射线研究。
获得了重原子衍生物,活性中心位于初始电子密度图中。
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(1995).
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51
,
845-847
https://doi.org/10.107/S090744995001569
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咪唑甘油磷酸脱水酶的结晶及亚基组装和四级结构分析
酿酒酵母
K·W·威尔金森
,
P.J.贝克
,
D.W.赖斯
,
H.F.罗杰斯
,
T.J.斯蒂尔曼
,
T.霍克斯
,
P.托马斯
和
L.爱德华兹
结晶和光散射研究表明,咪唑甘油磷酸酯脱水酶经历了锰依赖的组装,形成了一个基于432对称性的四级结构为24聚体的粒子。
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(1995).
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51
,
848-849年
https://doi.org/10.1107/S907444995001892
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锌结合蛋白新家族玉米ZBP14蛋白的结晶和初步X射线分析
B.肖
,
K.罗宾逊
,
A.艾特肯
和
M.Hirshberg先生
玉米ZBPl4蛋白的结晶和初步X射线分析。
锌结合蛋白一个新家族的成员。
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(1995).
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51
,
850-852
https://doi.org/10.1107/S907444995002290
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猫杯状病毒两种密度种群的结晶和初步X射线分析
L.Zhou(L.周)
和
M.罗
基于流感病毒神经氨酸酶的晶体结构,设计了一系列新型芳香族抑制剂。
这些抑制剂可能是口服活性抗流感药物。
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(1995).
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51
,
853-855
https://doi.org/10.107/S090744995002265
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改进的Crowther and Blow
T型
1
部分搜索模型的转换函数
C.L.劳森
对标准翻译函数的简单修改可以减少部分搜索模型案例的系统错误。
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1个rr
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(1995).
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51
,
856-857
https://doi.org/10.107/S09074499500268X
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壳聚糖酶的结晶及初步X射线晶体学分析
环状芽孢杆菌
MH-K1型
J.-I.斋藤
,
Y.Nagata(永田)
,
A.安藤
,
A.基塔
和
K.三木
壳聚糖酶来自
环状芽孢杆菌
使用硫酸铵作为沉淀剂结晶MH-KI。
正交晶体衍射X射线的分辨率至少为2.3º,适用于高分辨率结构分析。
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《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
858
https://doi.org/10.107/S090744995003106
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作者:S.Neidle
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