结晶学报D辑
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结构
生物学
第51卷
|
第4部分
国际标准编号:2059-7983
1995年7月发行
封面插图:
嘌呤核苷磷酸化酶的静电活性位点
鸟嘌呤的电势面和偶极。
使用渲染
色带++
和
斯巴达
。
研究论文
《水晶学报》。
(1995年)。
D类
51
,
405-406
https://doi.org/10.107/S090744995004045
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前言
J.P.Glusker公司
,
C.E.布格
和
L.J.德卢卡斯
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《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
407-417
https://doi.org/10.107/S090744994014526
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小分子晶体结构作为药物设计的结构基础
C.Pascard卡
小分子X射线结构与生物系统之间的关系。
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《水晶学报》。
(1995).
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51
,
418-427
https://doi.org/10.107/S090744995003313
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晶体中官能团周围的分子间相互作用:药物与生物大分子结合模型的数据
J.P.Glusker公司
概述了选定分子间相互作用的方向性。
这些数据来自晶体结构测定,可用于模拟药物-大分子相互作用。
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《水晶学报》。
(1995).
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51
,
428-449年
https://doi.org/10.107/S090744995003350
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锌蛋白酶的锌定向抑制剂
H.范伯格
,
H.M.格林布拉特
,
V.贝哈尔
,
C.吉隆
,
S.科恩
,
A.比诺
和
G.肖姆
对羧肽酶A的结晶、抑制和静电研究进一步详细介绍了锌原子和其他活性位点基团在锌蛋白酶底物结合和催化中的作用。
这些细节结合模型化合物研究,为该酶家族基于锌结合及其特定配位偏好的特异性抑制剂设计提供了一种合理的方法。
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《水晶学报》。
(1995).
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51
,
450-457
https://doi.org/10.1107/S907444994013508
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掌握
LORE公司
蛋白质结构的
B.C.芬泽尔
本文详细描述了在蛋白质结构建模中利用已知结构信息的软件。
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《水晶学报》。
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51
,
458-472
https://doi.org/10.107/S09074499401348X
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糖原磷酸化酶的葡萄糖类似物抑制剂:从晶体学分析到药物预测
网格
力场和
高尔夫
变量选择
K·A·沃森
,
E.P.米切尔
,
L.N.约翰逊
,
G.鲫鱼
,
J.C.儿子
,
C.J.F.比查德
,
G.W.J.舰队
,
N.G.Oikonamakos公司
,
M.孔图
和
S.E.Zographos公司
糖原磷酸化酶的几种葡萄糖类似物抑制剂已在晶体学、动力学和3D QSAR实验中进行了研究。
比较
N个
-甲基乙酰吡喃葡萄糖胺和类似的C-甲酰胺衍生物在
基
与葡萄糖相比提高了200倍。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
473-489
https://doi.org/10.1107/S90744499401084X
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抗病毒药物WIN51711与3型脊髓灰质炎病毒sabin株的结合:与鼻病毒14中药物结合的结构比较
C.N.Hiremath先生
,
R.A.格兰特
,
D.J.菲尔曼
和
J.M.霍格尔
比较了鹈鹕病毒和鼻病毒与抗病毒化合物狄沙利(WIN5l7ll)配合物的高分辨率晶体结构。
PDB参考
以下为:
1个piv
阅读文章
《水晶学报》。
(1995年)。
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51
,
490-495
https://doi.org/10.107/S090744994013491
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3型脊髓灰质炎病毒的WIN51711抗性突变体:衣壳残基在脱衣功能中的重要作用
A.G.莫瑟
,
J.-Y.斯格罗
和
R.R.鲁克特
使用抑制小核糖核酸病毒脱外壳第一阶段的衣壳结合药物来选择3型鹈鹕病毒的耐药突变体。
这些突变体将注意力集中在衣壳的某些部位,这些部位可能在病毒脱外壳中起重要作用。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
496-503
https://doi.org/10.107/S090744994011674
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人鼻病毒血清型14中四种含甲基四唑抗病毒化合物的结构
V.L.吉兰达
,
G.R.俄罗斯
,
P.J.Felock先生
,
T.R.贝利
,
T.带式输送机
,
D.J.奥尔德斯
,
J.吉尔斯
,
F.J.杜特科
,
G.D.戴安娜
,
D.C.果树
和
M.麦克米兰
在人鼻病毒14中测定了四种新型衣壳结合抗痘病毒化合物的结构。
这些结构用于更好地了解鼻病毒衣壳结合囊中的药物设计问题。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
504-510
https://doi.org/10.1107/S907444994011698
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流感病毒神经氨酸酶苯甲酸抑制剂
M.罗
,
M.J.杰德扎斯
,
S.Singh公司
,
C.L.白色
,
W.J.布鲁莱特
,
通用航空公司
和
W·G·拉沃尔
利用X射线晶体结构设计了流感病毒神经氨酸酶芳香抑制剂。
这种迭代策略的成功可以应用于其他药物设计目标。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
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51
,
511-521
https://doi.org/10.107/S090744994014514
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免疫抑制剂FK506(他克莫司)的主要结合蛋白的X射线结构比较
K.P.威尔逊
,
山下幸男
,
M.D.辛查克
,
S.H.罗斯坦
,
M.A.Murcko先生
,
J.博格
,
J.A.汤姆森
,
M.J.菲茨吉本
,
J.R.布莱克
和
纳维亚文学硕士
FKBPl2的结构首次以未标记形式报道,并与18种抑制剂复合。
对这些结构的分析表明,FKBP12具有局部柔性。
PDB参考
以下为:
1英尺/小时
;
1千焦
;
1英尺/小时
阅读文章
《水晶学报》。
(1995年)。
D类
51
,
522-528
https://doi.org/10.107/S090744994014502
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免疫抑制剂FK506的主要结合蛋白FKBP12非大环抑制剂的设计、合成和结构
D.M.Armistead先生
,
M.C.巴迪亚
,
D.D.Deininger博士
,
J.P.达菲
,
J.O.桑德斯
,
R.D.Tung先生
,
J.A.汤姆森
,
M.T.德森佐
,
O.富特
,
D.J.利文斯顿
,
M.A.默奇科
,
山下幸男
和
纳维亚文学硕士
简单的非大环抑制剂与FKBPl2的结合与FK506一样紧密,并能有效抑制该酶的肽基脯氨酰异构酶活性。
介绍了其中一种与FKBPI2配合物的结构。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
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51
,
529-535
https://doi.org/10.107/S090744994011704
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嘌呤核苷磷酸化酶抑制剂的结构设计
Y.S.巴布
,
S.E.伊里克
,
C.E.布格
,
M.D.埃里昂
,
W.C.Guida公司
,
J.A.蒙哥马利
和
J.A.Secrist三
基于结构的药物设计技术已被用于设计和合成新型有效的嘌呤核苷磷酸化酶抑制剂。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
536-540
https://doi.org/10.107/S090744995000448
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物品统计
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嘌呤核苷磷酸化酶抑制剂相对结合亲和力的计算
M.卡森
,
Z.杨
,
Y.S.巴布
和
J.A.蒙哥马利
实验测量的抑制剂与嘌呤核苷磷酸化酶的结合常数与使用
X-PLOR公司
,
德尔菲
和
软对接
结果好坏参半。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
541-549
https://doi.org/10.107/S090744995002678
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预测非天然九肽与I类MHC蛋白结合的分子动力学和基于结构的药物设计
L.披萨
,
D.罗格南
,
G.民俗
和
A.Daser公司
根据I类MHC蛋白的晶体结构,非天然肽已被成功设计为靶蛋白的高亲和力配体。
PDB参考
以下为:
1罗尔
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
550-559
https://doi.org/10.107/S090744994013132
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凝血酶的活性模拟抑制
I.I.马修斯
和
A.塔林斯基
测定了两种凝血酶模拟抑制剂复合物的结构。
一种是基于构象受限的双环β-孪晶,而另一种是模拟两种不同的活性位点结合模式。
PDB参考
以下为:
3帽子
;
每秒1帧
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《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
560-566
https://doi.org/10.107/S090744994011686
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凝血酶抑制剂复合物的结合亲和力与非结合相互作用能的相关性
P.D.J.格罗滕胡斯
和
P.J.M.范加伦
在能量最小化过程中,酶受到限制,静电降低时,评估凝血酶和35种抑制剂之间结合的几种经验建模方案显示出最佳预测值。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995年)。
D类
51
,
567-574
https://doi.org/10.107/S090744995003003
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锥虫硫蛋白还原酶两种独立结构的比较
束状Critidia fasculata
C.S.债券
,
A.H.费尔兰姆
和
W.N.亨特
锥虫硫蛋白还原酶是锥虫感染化疗的靶点。
两种晶体形式的详细比较为药物设计提供了一个共识模板。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
575-589
https://doi.org/10.107/S090744995003015
份额
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来自
布氏锥虫
F.M.D.Vellieux公司
,
J.哈伊杜
和
W.G.J.霍尔
通过分子置换、密度修正和模拟退火(包括非晶体学对称性约束和约束)校正相结合的方法,从劳厄数据中以3.2°的分辨率求解了3-磷酸甘油醛脱氢酶的结构。
描述了这种酶的三维结构,并将其与
嗜热脂肪芽孢杆菌
。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
590-596
https://doi.org/10.107/S090744995001405
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不同结构分子与链霉亲和素结合的结晶和热力学比较
P.C.韦伯
,
M.W.潘托利亚诺
和
F.R.萨勒姆
比较了链霉亲和素配体的三种结构类型,包括d-生物素、2-[(4'-羟基苯基)-偶氮]苯甲酸盐和肽NH2-苯基-Ser-His-Pro-Gln-Asn-Thr-COOH的结晶结构和热力学结合参数。
对这些结构和热力学观察的描述强调了提高配体亲和力的潜在策略的多样性。
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
597-604
https://doi.org/10.107/S090744995001910
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抑制剂与Ht-d结合的结构分析
一、肉毒杆菌
,
L.披萨
,
J.D.香农
,
J.W.福克斯
和
E.F.梅耶
对以2.0°分辨率溶解的天然和抑制金属蛋白酶Ht-d的结构进行了理论研究。
这项研究表明了Ht-d和哺乳动物金属蛋白酶之间的结构联系,有助于理解天然和合成抑制剂与金属蛋白酶结合的机制。
PDB参考
以下为:
1小时
阅读文章
《水晶学报》。
(1995).
D类
51
,
605-608
https://doi.org/10.107/S090744994013995
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猪醛还原酶-NADPH二元复合物的结晶及初步结构
O.埃尔-卡巴尼
,
K.法官
,
S.L.吉内尔
,
L.J.德卢卡斯
和
T.G.弗林
在猪醛还原酶的晶体结构中,NADPH二元络合物由一个环固定。
NADPH的结合和解离需要构象变化。
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