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化学
国际标准编号:2053-2296

2013年11月发布

关于的特别问题药物、药物发现和天然产品

客座编辑:Christopher S.Frampton教授(英国剑桥Pharmorphix)

突出显示的插图

封面插图:卡马西平三氟乙酸单醇酯的结构覆盖在其差异傅里叶图上[见Eberlin、Eddleston和Frampton(2013)。水晶女演员.C类69,1260-1266]. 这篇论文是关于药物、药物发现和天然产品.

社论


《水晶学报》。(2013).C类69,1205-1206
https://doi.org/10.107/S0108270113027960
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概述固态药物领域当前感兴趣的主题,并介绍本期特刊中的论文。

药物和天然产物


《水晶学报》。(2013).C类69,1207-1211
https://doi.org/10.107/S010827011302492X
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密度泛函理论(DFT)核磁共振预测,1H–1H总相关光谱(TOCSY)NMR和单晶X射线晶体学用于确认在三烯和四烯底物进行钌催化烯烃复分解后,形成双环戊烯基-β-氰基醇,而不是作为动力学产物的2,3,6,7-去氢癸烯基-α-氰基乙醇。

《水晶学报》。(2013).C类69,1212-1216
https://doi.org/10.107/S0108270113018842
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Glabridin是根中的一种物种特异性生物标记物光滑甘草(欧洲甘草,豆科)。立体化学分析,包括圆二色性、NMR数据和具有Bijvoet差异的X射线衍射数据集,证实了从天然来源纯化的玻璃桥蛋白仅在C3R(右)配置。

《水晶学报》。(2013).C类69,1217-1220
https://doi.org/10.107/S0108270113025936
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药物活性磺胺吡啶衍生物的一种新的多晶型N个-(6-甲基-2-吡啶基)均三甲苯磺酰胺是甲醇的相纯产物。分子采用通过力场计算为单个分子预测的构象。

《水晶学报》。(2013).C类69,1221-1224
https://doi.org/10.107/S0108270113025948
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高分辨率衍射数据支持我们的解释,即标题化合物由两个胺配位,而不是由一个胺和一个水配体配位。

《水晶学报》。(2013).C类69,1225-1228
https://doi.org/10.107/S010827011302595X
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(±)的制备、单晶X射线结构和溶液态核磁共振分析-苏式-甲基酯水解得到的利他林酸(±)-苏式-报道了哌甲酯。

《水晶学报》。(2013).C类69,1229-1233
https://doi.org/10.107/S0108270113026863
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根据现有的实验数据,并辅以分散校正密度泛函理论计算,给出了二水头孢拉定和二水头孢克洛的等结构晶体结构。晶体结构是孤立位置水合物的典型示例。

《水晶学报》。(2013).C类69,1234-1237
https://doi.org/10.107/S0108270113025961
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盐酸加博沙多(也称为THIP盐酸盐)在221 K下经历可逆的单晶到单晶转变。在298 K和220 K下测定了晶体结构。

《水晶学报》。(2013).C类69,1238-1242
https://doi.org/10.107/S0108270113025924
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(+)-6-氨基青霉素酸是多种半合成青霉素的前体,代表一种有序两性离子,晶体为非超面体孪晶。通过PIXEL方法对晶体堆积进行补充分析,揭示了能量最稳定的分子间相互作用能的性质和排名。

《水晶学报》。(2013).C类69,1243-1250
https://doi.org/10.1107/S010827011302126
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本报告阐明了针对分枝杆菌调节因子EthR的三种新抑制剂的晶体结构,EthR以前被确定为结核病药物增强剂的新靶点。此外,我们描述了如何将我们的结构测定结果用于开发对接协议,使用黄金面向未来生物信息学筛选。

《水晶学报》。(2013).C类69,1251-1259
https://doi.org/10.107/S0108270113028643
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从所应用的各种方法和所解决结构的复杂性两方面讨论了从粉末衍射数据中求解药物晶体结构。

《水晶学报》。(2013).C类69,1260-1266
https://doi.org/10.1107/S10827011302859X
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已制备了卡马西平和10,11-二氢卡马西平甲磺酸盐形式,并通过多种分析技术进行了表征,包括100℃下的单晶X射线衍射K.结合其他卡马西平配合物的数据分析了这些配合物的结构数据,并对明显异常的三氟乙酸溶剂化物结构进行了重新测定。

《水晶学报》。(2013).C类69,1267-1272
https://doi.org/10.107/S0108270113029545
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标题共晶体中的分子以中性形式存在,并通过氢键组装成分子层。通过Hirshfeld表面分析评估异烟酰胺分子的环境差异。

《水晶学报》。(2013).C类69,1273-1278
https://doi.org/10.107/S0108270113029363
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介绍了琥珀酸洛沙平及其一水合物的结构测定。基于密度泛函理论的固定单元几何优化CASTEP公司作为一种补充工具,用于根据X射线粉末衍射数据确定晶体结构中的氢原子位置。

《水晶学报》。(2013).C类69,1279-1288
https://doi.org/10.107/S0108270113029533
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质子转移系统地生成分子盐被用于研究九种溴代苯甲酸与甲基吡啶的分子络合物,这些络合物显示出与化学计量有关的可预测合成子和常见的N-H­O电荷辅助氢键。

无机化合物


《水晶学报》。(2013).C类69,1289-1291
https://doi.org/10.107/S0108270113027145
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制备标题化合物通过固态的机械化学反应。它们在NaSc(BH)中结晶4)4由隔离[Yb(BH4)4]阴离子,通过BH与Yb四面体配位4组,由M(M)+阳离子(M(M)=Na,K),形成畸变三角棱镜。

《水晶学报》。(2013).C类69,1292-1300
https://doi.org/10.1107/S108270113028138
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氯化镁晶体2·8小时2O、 氯化镁2·12小时2O、 溴化镁2·6小时2O、 溴化镁2·9小时2O、 氯化镁2·8小时2O和MgI2·9小时2根据固液相图,O是在低于298 K的温度下从其水溶液中生长出来的。所有结构均由Mg(H)构成2O)6八面体。六水阳离子复合物的尺寸和角度非常相似,并且变化不是系统性的。

《水晶学报》。(2013).C类69,1301-1303
https://doi.org/10.107/S010827011302862X
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Na的Rietveld精化9Sc(备忘录4)6表明其结构由ScO形成的簇组成6八面体和三个Na1O6共享总边的八面体。通过使用桥接MoO共享顶点来连接簇4四面体,形成三维框架。

金属有机化合物


《水晶学报》。(2013).C类69,1304-1306
https://doi.org/10.107/S0108270113026267
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在有机-无机杂化材料的标题中,四氯锌酸盐阴离子和1-环己基哌嗪-1,4-二碘指示相互连接通过N-H­Cl和C-H­Cl氢键形成平行于(001)平面的层。环己基位于这些层之间,形成一个无限的三维网络。

《水晶学报》。(2013).C类69,1307-1310
https://doi.org/10.107/S010827011302475X
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一种新的镉络合物由[Cd构成的一维阶梯组成2(首席运营官)2]二聚体亚单位。氢键和π–π堆积相互作用的结合将一维阶梯延伸为三维超分子结构。

《水晶学报》。(2013).C类69,1311-1313
https://doi.org/10.107/S0108270113025377
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标题化合物是包含–Mn-O-C-O-Mn–链的二维网络。每一层都呈现出人字形,并通过分子间氢键与相邻层相互作用。

《水晶学报》。(2013).C类69,1314-1316
https://doi.org/10.107/S0108270113025614
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三维金属螺旋体由含嘌呤3-(6-oxo-6,9-di­hydro-1)的一维金属-有机螺旋体构成H(H)-嘌呤-1-基)丙酸配体和锌(II)离子。

《水晶学报》。(2013).C类69,1317-1321
https://doi.org/10.107/S0108270113025973
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3,4-二羟基-1,6-双(4-甲氧基苯基)六-2,4-二烯-1,6-二酮表现出双烯二酮互变异构形式,并与其4-甲基苯基类似物进行了比较。在2-羟基-4-(4-甲氧基苯基)-4-氧代-2-烯酸钾盐中,有机物种通过羧酸和羧酸之间的强氢键连接。

《水晶学报》。(2013).C类69,1322-1327
https://doi.org/10.107/S0108270113026450
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基于Na的两种新型无机-有机配位聚合物制备了具有半刚性V形二羧酸配体的阳离子,并对其进行了结构表征。

《水晶学报》。(2013).C类69,1328-1331
https://doi.org/10.107/S0108270113027182
链接到html
在一个新的三维Cd中镉(NO)水热组装制备的复合物)2·4小时2O、 1,4-双[2-(吡啶-4-基)乙烯基]苯和2,2′-(1,4-苯基)二乙酸,每个Cd中心位于扭曲的五角双锥配位环境中。通过对Cd的处理,可以将三维网络视为类金刚石网络原子作为节点,苯和二乙酸配体作为连接体。

《水晶学报》。(2013).C类69,1332-1335
https://doi.org/10.107/S010827011302711X
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镉的一维聚合物结构与磺胺喹喔啉通过分子间氢键进一步稳定。荧光光谱显示该配合物发出强烈的蓝色荧光。热分析表明,该框架在663K以下是稳定的。

《水晶学报》。(2013).C类69,1336-1339
https://doi.org/10.107/S0108270113027194
链接到html
在178 K以上,2-[(2-氧化亚苄基)氨基]-乙醇酸盐的双核锡(IV)络合物无序。93 K下的晶体结构包含两个有序分子。相变对应于与Sn结合的乙烯基的有序-无序转变四、原子。

《水晶学报》。(2013).C类69,1340-1343
https://doi.org/10.107/S0108270113026292
链接到html
新型阴离子管状镉在水热条件下合成了基于5-(羧基-甲氧基)苯-1,3-二羧酸配体的含4-氨基吡啶阳离子的配位聚合物。在固态中,4-氨基吡啶阳离子通过氢键与配体和溶剂水分子的O原子受体结合,支撑结构。

《水晶学报》。(2013).C类69,1344-1347
https://doi.org/10.107/S0108270113026620

《水晶学报》。(2013).C类69,1348-1350
https://doi.org/10.107/S0108270113027212
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在乙酸和6-氯-2的双核锌(II)络合物中-{(电子)-[(吡啶-2-基)甲基亚氨基]-甲基}酚酸盐,Zn阳离子的五坐标几何结构不同,一个采用畸变的三角双锥几何结构,另一个采用方形锥几何结构。

《水晶学报》。(2013).C类69,1351-1356
https://doi.org/10.107/S0108270113027108
链接到html
当与常见的杂芳香族三羧基八面体配合物[Fe(phen)]结合时,双腈-π相互作用与电荷扩散共轭四氰基丙烷阴离子的晶体堆积有关]2−.

《水晶学报》。(2013).C类69,1357-1361
https://doi.org/10.107/S0108270113027091
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标题配合物中的铜原子在扭曲的三角双锥环境中由两个5,5′-二甲基-2,2′-双吡啶配体的四个N原子和一个二氰胺阴离子的一个N原子五配位,二氰胺负离子在赤道平面上以单齿方式配位。结构由C-H…N和C-H…稳定X(X)氢键(X(X)=F和O)和吡啶环之间的π–π相互作用。

《水晶学报》。(2013).C类69,1362-1366
https://doi.org/10.107/S0108270113027996
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与吡啶-2,6-二羧酸末端配体螯合的两个五配位水铜(II)中心通过1,2-双(吡啶-3-基氧基)乙烷间隔基桥接。该结构包括一个分解良好的环状水四聚体,它作为一个亚基形成更大的聚集体。

《水晶学报》。(2013).C类69,1367-1372
https://doi.org/10.107/S010827011302845X
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利用实验室X射线数据测定了双(4-甲基苯胺)和双(4-碘苯胺)五钼酸盐的晶体结构,并用总能量最小化方法进行了细化。所获得的结构呈现由弱键(除离子相互作用外)结合的交替有机阳离子和无机聚阴离子层。

《水晶学报》。(2013).C类69,1373-1377
https://doi.org/10.107/S0108270113027984
链接到html
一种新型一维无限配位聚合物N个′-(2-羟基-苄叉)-2-(萘-2-氧基)乙酰肼和2-羟基-三核镍配合物-N个报道了由氢键相互作用构成的一维网络结构的′-(2-氧代-2-苯氧乙基)苯甲酰肼。

《水晶学报》。(2013).C类69,1378-1382
https://doi.org/10.107/S0108270113027881
链接到html
在单核Nd中配合物,三种螯合2,4-二氧代-1,2,3,4-四氢嘧啶-5-羧酸配体和三种水配体在阳离子周围形成一个扭曲的单包方反棱镜。复杂的氢键网络导致了密集的填充结构(填充指数=77.7%)

有机化合物


《水晶学报》。(2013).C类69,1383-1389
https://doi.org/10.107/S0108270113025869
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一系列N个-提出了(2-苯基乙基)硝基苯胺衍生物,表明官能团的适度变化会导致分子构象、分子间相互作用和堆积的显著差异。

《水晶学报》。(2013).C类69,1390-1396
https://doi.org/10.107/S010827011302581X
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脯氨酸(Pro)以中性形式存在于N个-乙酰基-L(左)-脯氨酸一水合物,在N个-苄基-L(左)-脯氨酸。中性形式的水分子的存在以及两种形式之间电离状态的差异对各自的分子间方案产生了重大影响。

《水晶学报》。(2013).C类69,1397-1401
https://doi.org/10.107/S0108270113025341
链接到html
三个N个-[2-(吡啶-2-基)乙基]-取代的磺酰胺在结构上几乎相同,最显著的不同是在N-碳-C-C扭转角中引入甲基对位磺酰胺部分的位置。这些化合物是形成新金属配合物的潜在配体。

《水晶学报》。(2013).C类69,1402-1407
https://doi.org/10.107/S0108270113028874
链接到html
两种6-氨基尿嘧啶二甲基乙酰胺单溶剂和一种1-甲基吡咯烷-2-酮单溶剂的结构显示出将尿嘧啶分子连接到各自溶剂分子的N-H·O氢键结合模式。形成R_{2}^{2}(8) 6-氨基尿嘧啶分子之间的N-H…O氢键基序只能在二维框架中找到,而R_{3}^{3}(14) 当6-氨基尿嘧啶分子形成之字形链时,会出现N-H·O模式。

《水晶学报》。(2013).C类69,1408-1410
https://doi.org/10.107/S0108270113028631
链接到html
糖原磷酸酶a(GPa)抑制剂(IC)的晶体结构506.3µM(M))由四个不同的共轭π系统组成,由围绕C的可旋转键分隔服务提供商原子。分子通过环状N-H…O氢键基序连接到围绕晶体对称中心排列的二聚体。

《水晶学报》。(2013).C类69,1411-1413
https://doi.org/10.107/S0108270113028461
链接到html
对映体的绝对构型反对的-测定了蒽-2-碳氧基酸的头对头环二聚体。二聚体与L(左)-脯氨酸通过九元氢键环[R_{2}^{2}(9) ],同时加入二氯甲烷分子来填充空隙。

附录和勘误表


《水晶学报》。(2013).C类69,1414
https://doi.org/10.107/S010827011302756X

特殊问题和虚拟问题

封面.gif

结晶学报C辑正在计划一期关于

核磁共振晶体学

2016年11月出版的最新特刊

蝎子:金婚纪念日

有关详细信息,请访问特殊问题第页。

最新的虚拟问题特征配位聚合物,带有介绍Len Barbour著。

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