生物振荡器随机模型与确定性模型的比较

摘要

我们研究生物振荡器的行为，特别是分析具有振荡行为的基因电路。在确定性和随机模型中实现系统，我们使用各种测试比较了这两个模型，并分析了随机噪声对这些振荡的影响。我们首先研究了体积的影响，发现在小系统体积下，随机事件会导致系统出现更多的零星振荡和更长的振荡周期。接下来，我们开发分类系统来识别模型开始出现振荡的参数空间中的边界。由于持续波动，这在随机模型中更具挑战性。我们比较了确定性和随机模型的不同分析方法，并可视化了每个模型中导致振荡的条件。我们发现随机模型中的振荡参数范围比确定性模型中的大。最后，我们发现mRNA生成速率的增加会在系统中产生更大的噪声，并放大随机系统和确定性系统之间的差异。