独资企业个人所得税由税务机关查账征收或者核定征收。采用查账征收方法的，以每一纳税年度的收入总额，减除成本、费用以及损失后的余额，为应纳税所得额；采用核定征收方法的。按企业销售收入乘上应税所得率来计算应纳税所得额。
法律依据：
《 中华人民共和国企业所得税法》第一条 在中华人民共和国境内，企业和其他取得收入的组织 （ 以下统称企业）为企业所得税的纳税人，依照本法的规定缴纳企业所得税。 个人独资企业、合伙企业不适用本法。 《 中华人民共和国个人所得税法》第二条第二款 居民个人取得前款第一项至第四项所得 （ 以下称综合所得），按纳税年度合并计算个人所得税；非居民个人取得前款第一项至第四项所得，按月或者按次分项计算个人所得税。纳税人取得前款第五项至第九项所得，依照本法规定分别计算个人所得税。
