医保断交三个月以上，累计缴费年限是不会清零，但医保的报销待遇将会被直接停止。
根据《医保断交规定》中的规定，参保人员未按规定及时足额缴纳医疗保险费的，从未按时足额缴纳的当月起，终止享受医疗保险待遇;中断后继续缴费的，必须按规定以补缴时当地上年度职工平均工资为缴费基数，将中断期间的全部欠费补齐。补缴时间计入连续缴费时间，但补缴期间不能享受统筹基金支付的待遇。
参保人员中止享受医疗保险待遇60天内(含60天)补缴医疗保险费的，从缴费次月起享受统筹基金支付的待遇;
中止享受医疗保险待遇60天以上至180天(含180天)补缴医疗保险的，从缴费当月开始计算，三个月后方可享受统筹基金支付的待遇;
中止享受医疗保险待遇180天以上补缴医疗保险费的，从缴费当月开始计算，6个月后方可享受统筹基金支付的待遇。
中断后未补缴的，视同重新参加医疗保险，中断前的缴费时间不计入连续缴费时间。
法律依据
《医保断交规定》规定 1、参保人员未按规定及时足额缴纳医疗保险费的，从未按时足额缴纳的当月起，终止享受医疗保险待遇;中断后继续缴费的，必须按规定以补缴时当地上年度职工平均工资为缴费基数，将中断期间的全部欠费补齐。补缴时间计入连续缴费时间，但补缴期间不能享受统筹基金支付的待遇。 2、参保人员中止享受医疗保险待遇60天内(含60天)补缴医疗保险费的，从缴费次月起享受统筹基金支付的待遇; 3、中止享受医疗保险待遇60天以上至180天(含180天)补缴医疗保险的，从缴费当月开始计算，三个月后方可享受统筹基金支付的待遇; 4、中止享受医疗保险待遇180天以上补缴医疗保险费的，从缴费当月开始计算，6个月后方可享受统筹基金支付的待遇。 5、中断后未补缴的，视同重新参加医疗保险，中断前的缴费时间不计入连续缴费时间。
