扣税申报是填扣缴义务人还是综合年度要视情况而定：
1、通过扣缴义务人申报的，指的是向单位申报个人信息，每个月税务机关会把专项附加扣除相关信息全量推送至单位，单位可以从代扣缴软件获取员工已经报送的专项附加扣除信息，并从中计算出员工应预扣预缴的税款，再向税务机关办理全员全额纳税申报；
2、综合所得年度自行申报的，指的是直接向税务机关申报，即每个月单位发放工资时正常扣税，然后由纳税人自己在第二年去税务机关办理汇算清缴，并将有关信息提供给税务机关，让税务部门其办理退税。
根据相关规定，如果是单位职工的话最好选择扣缴义务人申报方式，就不用另外去税务部门办理退税了。而若是自由职业者或者个体户的话，可以选择综合所得年度自行申报方式。
那么税务申报的截止日期是多少？
根据《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》第一百零九条规定，“税收征管法及本细则所规定期限的最后一日是法定休假日的，以休假日期满的次日为期限的最后一日;在期限内有连续三日以上法定休假日的，按休假日天数顺延。”
按照现行各税种的《条例》及其实施细则的规定:营业税、城建税、教育费附加等申报期限都是自期满之日起15日内申报缴纳。
企业所得税:按照现行税法规定，企业应当自月份或者季度终了之日起十五日内，向税务机关报送预缴企业所得税纳税申报表，预缴税款。具体按月还是按季，主管税务机关会以书面的形式告知您的。
综上所述，以上内容就是关于扣税申报的相关问题解答了，怎么能对您有所帮助。《中华人民共和国个人所得税法》
第十条 有下列情形之一的，纳税人应当依法办理纳税申报：
（一）取得综合所得需要办理汇算清缴；
（二）取得应税所得没有扣缴义务人；
（三）取得应税所得，扣缴义务人未扣缴税款；
（四）取得境外所得；
（五）因移居境外注销中国户籍；
（六）非居民个人在中国境内从两处以上取得工资、薪金所得；
（七）国务院规定的其他情形。
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