实用工具和软件下载
基因组浏览器、Blat、liftOver和其他实用程序的源代码对非营利组织免费学术研究和个人使用。有关商业许可的信息，请参阅基因组浏览器许可证和Blat许可证要求。这些产品的源代码和可执行文件可以从我们的网上商店.
镜像基因组浏览器
您可以安装基因组的本地镜像副本在web服务器上浏览网站，无需编译整个源代码树并提供定制和隐私选项。
如果您遇到下载速度慢的问题，请尝试使用UDT启用的Rsync（UDR），其中提高远距离大数据传输的吞吐量。32位和64位版本可以下载在这里.
公用设施
这个实用程序目录提供的下载预编译的独立二进制文件：
- LiftOver（也可以通过web版本). 上链提升上链转换文件位于各个程序集下载部分。
-
布拉特
- 其他命令行实用程序（文件格式转换器、数据查询工具等）
运行不带参数的程序以查看指导性用法消息。我们所有的命令行工具都可以作为现成的二进制文件从下载服务器获得适用于各个操作系统。将所有命令行实用程序下载到目录中设置正确的权限位后，使用以下命令：
$rsync-aP hgdownload.soe.ucsc.edu:：genome/admin/exe/linux.x86_64//
请注意，使用https、curl或wget下载时出现“权限被拒绝”错误:为了让您的计算机运行新下载的实用程序，您需要更改文件允许操作系统运行程序的权限。要使实用程序可用，请下载工具并打开其“可执行”位：$wget（美元）https://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/liftOver网站$chmod+x/文件路径/实用程序名称$ ./文件路径/实用程序名称
例子：$chmod+x/home/user/liftover/liftover
另请参见：http://en.wikipedia.org/wiki/Chmod
请查看userApps自述文件有关从kent源树获取特定目录或下载的信息userApps.src.tgz构建并安装所有kent实用程序。请注意，商业下载和安装Blat和In-Silico PCR软件需要许可证，可从肯特信息学.
通过gbdb服务器进行数据访问
gbdb文件服务器通过服务器提供对基因组浏览器表引用的所有文件的访问在里面北美和欧洲以实现更快的下载。浏览器中的许多文件（如bigBed文件）以二进制格式宿主。例如，在hg38数据库中crispr.bb（克里斯普.bb）和crispr详细信息选项卡的文件CRISPR轨道可以使用以下URL找到：
可以使用工具从二进制文件中获取单个区域或整个基因组注释例如大床到床，可以作为为您的系统预编译的二进制文件（请参阅来源和实用程序下载部分). 这个大床到床工具还可用于获取给定范围内的特定特征子集，例如：
大床到床http://hgdownload.soe.ucsc.edu/gbdb/hg38/crispr/crispr.bb-chrom=chr21-开始=25000000-结束=30000000标准输出
GenArk Hub基因组的数据访问
这个GenArk集线器允许可视化之前在基因组浏览器上无法获得的数千个NCBI基因组。通过单击分支（例如灵长类）可以访问基础数据，找到您的有机体或程序集，然后单击第三列中的下载链接。直接链接到特定GCA或GCF程序集ID，您可以根据此示例对链接建模，其中ID由每三个字符的斜线分隔。
您可以在我们的常见问题解答部分.
通过公共MySql服务器访问数据
UCSC Genome Browser支持公共MySql服务器，其注释数据可用于筛选和查询。有关此服务的更多信息，请参阅我们的MySQL服务器第页。
使用JSON API进行数据访问
JSON API还可用于查询和下载JSON格式的gbdb数据。下面是两个例子分别介绍如何使用JSON API查询和下载数据。
http://api.genome.ucsc.edu/getData/track？genome=hg38;track=ncbiRefSeqOther；色度=chr21；开始=25000000；结束=30000000
wget-O-'http://api.genome.ucsc.edu/getData/track？genome=hg38;track=ncbiRefSeqOther；色度=chr21；开始=25000000；end=300000'>输出.json
有关更多信息，请参阅JSON API帮助页面.
多个程序集共享的数据