在随机物种树上建立与分子进化耦合的路径依赖多样化过程模型
了解影响物种出生和生存以及分子进化速度的二元性状的进化仍然具有挑战性。在这项工作中，我们提出了一个二元特征随机物种树的概率建模框架，其中物种数量及其特征由一个非对称的两类连续时间马尔可夫分支过程表示。该模型包括许多不同的参数，描述了所谓“简化”树上的特征和分子进化，该树仅由观察时的现存物种组成。我们通过考虑二元性状对dN/dS（非同义替换与同义替换的归一化比率）的影响来扩展我们的模型。我们还开发了一些机制，使我们能够了解与观察到的性状相关的系统发育树上的替代率。通过异交和自交植物物种的系统发育图说明了从模型中获得的特性，这使我们不仅可以研究分枝树比率，还可以研究分子比率和选择强度。
菲奇尔校长
手稿.pdf（316.4 Ko）
特勒充电器
| 原籍 |
菲奇尔斯（Fichiers）出品的par l’（les）auteur（s） |