跳到内容

scrm/scrm-r

存储库文件导航

scrm R包

供应链风险管理是进化的聚合模拟器生物序列。它可以作为命令行程序在scrm.github.io公司.

此R包包含一份副本供应链风险管理,包装方便在R中使用。

安装

建议使用当前的CRAN版本。它可以安装从R内使用

install.packages('scrm')

用法

使用函数scrm::scrm()打电话给供应链风险管理:

图书馆(“crm”)sum_stats<-scrm('5 1-r 10 100-t 5-oSFS')

帮助和文档

  • 的基本用法scrm::scrm()在其R帮助页面中进行了解释帮助('scrm').
  • 包装上有一个小插曲供应链风险管理的命令行参数:小插曲(“crm-Arguments”).
  • 命令行程序的联机文档位于scrm的Wiki.

引用

使用时请引用以下文章供应链风险管理在出版物中:

Paul R.Staab、Sha Zhu、Dirk Metzler和Gerton Lunter。scrm:使用近似合并有效地模拟长序列带重组.生物信息学(2015)31(10):1680-1682。doi:10.1093/bioinformatics/btu861.

错误报告

请通过报告任何问题问题跟踪器或通过电子邮件发送至发展(点)保禄.

请包括您正在使用的版本以及导致问题,包括报告中的种子(如果适用)。此外,您也可以在那里自由推荐功能。