系统发育EM 用于检测系统发育中移位的EM算法的实现。 安装 上的稳定版本CRAN(起重机). 要获取最新版本(可能不稳定),可以使用开发工具包裹: 安装程序包("开发工具")开发工具::安装github(回购 = "pbastide/系统发育EM",裁判 = "发展") 文档 请参阅此处的程序包文档(参考和小插曲):http://pbastide.github.io/PhylogeneticEM/ (使用pkg向下). 参考文献: Bastide,P.,Mariadassou,M.和Robin,S.(2017),通过在树上使用移位随机过程来检测系统发育的自适应移位。英国皇家统计学会杂志:B辑(统计方法), 79(4):1067-1093,doi:10.1111/rssb.12206. Bastide,P.、Ané,C.、Robin,S.和Mariadassou,M.(2018),《多元相关性状的适应性变化推断》。系统生物学, 67(4), 662–680.doi:10.1093/sysbio/syy005.