基因组监测是对病原体进行持续监测，并通过基因组测序分析其遗传相似性和差异性。该方法使用基因组测序技术监测遗传物质随时间的变化，为不同生物实体的进化、传播和特征提供有价值的见解。

世界卫生组织（WHO）已确定在其10年内需要协调和包容性的基因组监测第页 全球基因组监测战略世界各地的基因组监测战略正朝着更具协作性、有效性和成本效益的方法发展，例如通过水采样和基因组测序实现的方法。世卫组织还强调了用于抗击感染的抗菌药物对抗生素耐药性（AMR）造成的日益严重的威胁抗菌药物耐药性全球行动计划加拿大政府推出了泛加拿大框架-由加拿大公共卫生署牵头，支持和实施世卫组织的全球计划，并部署加拿大制定的计划来解决这一问题。