病毒序列

对15万名新冠肺炎阳性患者的病毒样本进行测序

CanCOGeN的VirusSeq计划正在对来自新冠肺炎阳性人群的150000份病毒样本进行测序，并在各省和国际间进一步协调病毒测序和相关临床/流行病学数据收集。

这项工作使加拿大能够追踪导致新型冠状病毒肺炎的SARS-CoV-2病毒是如何变化和传播的，提供了有关病毒传播趋势和可能影响病毒检测或治疗或疫苗有效性的病毒变化的关键数据。

随着SARS-CoV-2在个体间传播，病毒继续变异。通过病毒的基因组测序可以追踪这些变化。然后，这些变化可用于生成该病毒及其“后代”的“家谱”，帮助研究人员关联相关病例。病毒的变化也会改变疾病的严重程度或传播能力。因此，病毒基因组序列数据已成为公共卫生官员更好地跟踪病毒变化和传播的重要工具。

病毒时间表

2019年11月

人类冠状病毒SARS-CoV-2是导致新冠肺炎疫情爆发的病毒，于2019年11月下旬首次出现，在四个月内达到大流行状态，传播到至少177个国家，导致现代历史上人类活动最大的一次中断。

2019年11月

2020年1月

2020年1月10日第一个基因组序列的快速发布对全球控制新型冠状病毒及其影响的努力至关重要。这不仅使疫苗和抗病毒治疗开发得以启动，而且使关键的分子诊断测试得以设计并在向世卫组织报告该疾病后的一个月内共享。然而，这些诊断测试只能确定一个人是否患有新冠肺炎。基因组序列还可以确定病例之间的相关性，因此可以用来追踪病毒的来源，并进一步确定病毒在国内和国际上的传播方式。加拿大。

Genome Canada率先提出了新的国家病毒基因组学网络。

2020年1月

2020年2月至今

基因组序列与相关数据迅速共享，是确认病毒跨境传播来源和确定社区传播信息政策以控制疫情的关键。持续的基因组测序工作对于病毒的局部入侵和传播建模至关重要。随着社区传播新型冠状病毒肺炎病例数量的增加，流行病学调查和追踪将越来越多地依赖基因组数据作为证据来检测集群。在病例数量减少后继续进行基于基因组的监测，对于确定和控制有第二次流行波风险的集群的来源也至关重要。

2020年2月至今

展望未来

随着病毒的进化，还可以追踪与疾病严重程度或最终耐药性相关的基因组序列变化，并可能为患者管理提供信息。

单击此处了解有关CanCOGeN病毒seq的治理.

展望未来

为什么要对这种病毒进行测序？

识别并跟踪区域、省级、国家和国际范围内的传播趋势

帮助检测新的病例/疫情集群

发现可能影响

•检测方法（PCR、血清学）
•临床结果（紧张程度）和传播
•医疗措施、治疗和疫苗的有效性

有关更多信息，请访问CanCOGeN VirusSeq网站

冠状病毒病（COVID-19）：疫情更新

查看加拿大一段时间内的总病例、活动病例、恢复病例、检测或死亡的现状。

资源

SARS-CoV-2基因组示意图，说明其编码的蛋白质的复杂性。基因组包含两个开放阅读框（ORF1a和ORF1b），编码多蛋白1a和1b。这些多蛋白在翻译后被切割成各自的蛋白质成分。基因组还编码其他蛋白质，包括独立翻译的结构蛋白（最显著的是Spike/S蛋白/基因）。SARS-CoV-2基因组编码的每个蛋白质都单独显示，并且在选定的蛋白质中注释不同的功能/结构域。

挑战领域

主动性