#程序集统计报告#组件名称：ASM985889v3#生物体名称：严重急性呼吸综合征冠状病毒2（病毒）#隔离物：武汉-Hu-1#税号：2697049#生物项目：PRJNA485481#提交人：na#日期：2020-01-17#组件类型：na#释放类型：主要#组装水平：完整基因组#基因组表示：完整#装配方法：Megahit v.V1.1.3#测序技术：Illumina#与类型材料的关系：ICTV附加隔离#RefSeq类别：参考基因组#GenBank组件加入：GCA_009858895.3#RefSeq组件加入：GCF_009858895.2#RefSeq程序集和GenBank程序集相同：是###组件单元：##GenBank单元登录RefSeq单元登录Assembly单元名称##GCA_009858905.3 GCF_0098589 05.2一次装配##统计数据类型#统计描述#component-count唯一组件的数量#gc-perc gc-count/atgc-count百分比#完整组装中染色体和质粒的分子数#脚手架-L50长度大于或等于N50长度的脚手架数量#脚手架-N50脚手架长度，在该长度或更长的脚手架上，总装配底座的50%#脚手架-N75总装配底座75%在该长度或更长的连续面上的脚手架长度#脚手架-N90脚手架长度，在该长度或更长的长度上，90%的总底座位于该长度#脚手架-脚手架数量#spanned-gaps跨距间距的数量。跨距间隙是指脚手架内的间隙#顶级计数染色体或质粒、未定位/未定位支架、alt-loci支架和补丁支架的数量#total-gap-length间隙总长度#总长度总序列长度，包括基底和间隙#未附加长度总长度（不包括间隙）#未平移的间隙未平移的间隙数。无窗格间隙是指脚手架之间的间隙##序列类型描述#所有统计数据涵盖了单元组装和指定分子中的所有序列。#分子统计涵盖了特定的分子。将给出分子名称和分子类型/loc。#非定标统计涵盖了分配给分子但没有位置的序列。将给出分子名称和分子类型/loc。#未定位统计涵盖未分配给组装中任何分子的序列。##单位名称分子名称分子类型/loc序列类型统计值全部全部全部总长度29903所有所有所有跨越间隙0所有所有所有所有未规划间隙0所有所有所有脚手架-数量1所有所有所有脚手架-N50 29903所有所有所有脚手架-L50 1所有所有所有脚手架-N75 29903所有所有所有脚手架-N90 29903all all all all total-gap-长度0所有所有所有所有分子-计数1所有所有所有顶级计数1所有所有所有组件-计数1所有所有所有所有gc-perc 38一次装配全部全部总长度29903一次装配全部未附加长度29903主要装配所有所有脚手架-数量1主要装配所有脚手架-N50 29903主程序集所有所有跨越的间隙0一次装配所有未装配间隙0初级组件所有所有gc-perc 38初级组装所有组装分子总长度29903初级组件所有组装分子未添加长度29903初级组装所有组装分子脚手架-数量1一次组装所有组装分子脚手架-N50 29903初级组装所有组装分子跨距间隙0初级组装所有组装分子非屏蔽间隙0初级组装所有组装分子gc-perc 38一次装配所有未校准脚手架总长度0主组件所有未定标脚手架无上限长度0主要装配所有未固定脚手架-脚手架-数量0一次组装所有未固定脚手架-N50 0一次装配所有未校准脚手架跨距间隙0一次装配所有未固定脚手架未固定间隙0主要组件na段总长度29903主要组件na段全部未添加长度29903主要组件na段所有脚手架-数量1主装配na段所有脚手架-N50 29903主组件na段所有跨距间隙0主组件na段所有未屏蔽间隙0初级组件na段所有gc-perc 38初级组装na段组装分子总长度29903初级组装na段组装分子未附加长度29903初级组装na段组装分子支架-数量1初级组装na段组装分子支架-N50 29903初级组装na段组装分子跨距间隙0初级组装na段组装分子非键合间隙0初级组装na片段组装分子gc-perc 38主要组件na分段未校准脚手架总长度0主组件na节段未定标脚手架无上限长度0主要组件na分段未固定脚手架-脚手架-数量0主要装配na分段未固定脚手架-N50 0主要组件na分段未校准脚手架跨距间隙0主要组件na分段未固定脚手架未固定间隙0