#程序集统计报告#程序集名称：ViralProj183710#生物体名称：中东呼吸综合征相关冠状病毒（病毒）#种下名称：菌株=HCoV-EMC#隔离：HCoV-EMC/2012#出租车：1335626#生物项目：PRJNA485481#提交人：na#日期：2014-07-23#组件类型：na#释放类型：主要#组装水平：完整基因组#基因组表示：完整#组装方法：CLC Genomics Workbench第5.5.1版#测序技术：454；桑格双脱氧测序#与类型材料的关系：ICTV物种样本#RefSeq类别：参考基因组#GenBank组件加入：GCA_000901155.1#RefSeq组件加入：GCF_000901155.1#RefSeq程序集和GenBank程序集相同：是###组件单元：##GenBank单元访问参考序列单元访问程序集-单元名称##GCA_000901145.1 GCF_000901155.1一次装配##统计类型#统计描述#component-count唯一组件的数量#gc-perc gc-count/atgc-count百分比#完整组装中染色体和质粒的分子数#脚手架-L50长度大于或等于N50的脚手架数量#脚手架-N50脚手架长度，在该长度或更长的脚手架上，总装配底座的50%#脚手架-N75总装配底座75%在该长度或更长的连续面上的脚手架长度#脚手架-N90脚手架长度，在该长度或更长的长度上，90%的总底座位于该长度#脚手架-脚手架数量#spanned-gaps跨距间距的数量。跨距间隙是指脚手架内的间隙#顶级计数染色体或质粒、未定位/未定位支架、alt-loci支架和补丁支架的数量#total-gap-length间隙总长度#总长度总序列长度，包括基底和间隙#无上限长度不包括间隙的总长度#未扫描间隙未扫描间隙的数量。无窗格间隙是指脚手架之间的间隙##序列类型描述#所有统计数据涵盖了单元组装和指定分子中的所有序列。#分子统计涵盖了特定的分子。将给出分子名称和分子类型/loc。#非定标统计涵盖了分配给分子但没有位置的序列。将给出分子名称和分子类型/loc。#未定位统计涵盖未分配给组装中任何分子的序列。##单位名称分子名称分子类型/loc序列类型统计值全部全部全部总长度30119所有所有所有跨越间隙0所有所有所有未平移的间隙0所有所有所有脚手架-数量1所有所有所有脚手架-N50 30119所有所有所有脚手架-L50 1所有所有所有脚手架-N75 30119所有所有所有脚手架-N90 30119all all all all total-gap-长度0所有所有所有所有分子-计数1所有所有所有所有顶级count 1所有所有所有组件-计数1全部全部全部gc perc 41一次总成所有总长度30119一次装配全部未附加长度30119主要装配所有所有脚手架-数量1一次组装所有脚手架-N50 30119主装配所有所有跨距间隙0一次装配所有未装配间隙0初级组件所有所有gc-perc 41初级组装所有组装分子总长度30119初级组件所有组装分子未添加长度30119初级组装所有组装分子脚手架-数量1一次组装所有组装分子脚手架-N50 30119初级组装所有组装分子跨距间隙0初级组装所有组装分子非屏蔽间隙0初级组装所有组装分子gc-perc 41主组件所有未定标脚手架总长0一次装配所有未固定的脚手架-未附加长度0主要装配所有未固定脚手架-脚手架-数量0一次组装所有未固定脚手架-N50 0一次装配所有未校准脚手架跨距间隙0一次装配所有未固定脚手架未固定间隙0主要组件na段总长度30119主要组件na段全部未添加长度30119主要组件na段所有脚手架-数量1主装配na分段所有脚手架-N50 30119主组件na段所有跨距间隙0主组件na段所有未屏蔽间隙0初级组件na段所有gc-perc 41初级组装na片段组装分子总长度30119初级组装na段组装分子未附加长度30119初级组装na段组装分子支架-数量1初级组装na段组装分子支架-N50 30119初级组装na段组装分子跨距间隙0初级组装na段组装分子非键合间隙0初级组装na段组装分子gc-perc 41主要组件na分段未校准脚手架总长度0主要组件na分段未缩放脚手架未添加长度0主要组件na分段未固定脚手架-脚手架-数量0一次装配na节段非定标脚手架-N50 0主要组件na分段未校准脚手架跨距间隙0主要组件na分段未固定脚手架未固定间隙0