集管结构遗传学2016年6月5日5B7ALYS37乙酰化人SUMO1的溶液结构压缩机模具ID:1;化合物2分子:与泛素相关的小改性剂1;COMPND 3链:A;化合物4碎片:UNP残留物1-97;化合物5异名:SUMO-1、GAP修饰蛋白1、GMP1、SMT3同源物3、SENTRIN、,化合物6泛素-血清学域蛋白PIC1,泛素样蛋白SMT3C,化合物7 SMT3C,泛素样蛋白UBL1;压缩机8工程:是;化合物9其他详细信息:LYS37乙酰化成熟小泛素相关COMPND 10修饰物1(SUMO1)残基1-14(mgsshhhhhsqdp)表示非-化合物11天然净化标签。这些残留物既没有分配也没有压缩机12包含在结构计算中。源MOL_ID:1;来源2 ORGANISM_SCIENTIFIC:HOMO SAPIENS;来源3有机物常见:人类;来源4 ORGANISM_TAXID:9606;来源5基因:SUMO1、SMT3C、SMT3H3、UBL1、OK/SW-CL.43;来源6表达_系统:大肠杆菌BL21(DE3);来源7 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID:469008;来源8 EXPRESSION_SYSTEM_STRAIN:BL21(DE3);来源9 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR_TYPE:PCDFDUET-1;来源10 EXPRESSION_SYSTEM_VECTOR:PCDFDUET-1;资料来源11其他详细信息:血浆PCDF PYLT-1,带K37止血块的SUMO插件来源12突变(带琥珀色密码子)和NEUMANN ET中描述的PACKRS-3来源13 AL.,MOL CELL,36,153,2009KEYWDS泛素样蛋白,乙酰化蛋白,结构基因组学EXPDTA溶液核磁共振数字20作者M.T.NAIK、N.NAIK、H.SHIH、T.HUANG第3版,23年11月15日,5B7A 1原子修订版2 23年10月11日5B7A 1备注版次1 2017年6月7日5B7A 0JRNL授权M.T.NAIK、N.NAIK、H.SHIH、T.HUANG人类相扑的JRNL乳头结构待发布的JRNL参考JRNL参考备注2备注2决议。不适用。备注3备注3精炼。备注3计划:X-PLOR NIH 2.34备注3作者:SCHWIETERS、KUSZEWSKI、TJANDRA和CLORE备注3备注3其他精炼备注:初始结构集合为备注3 CYANA通过半自动噪声分配计算得出。THE 备注3在火花和最终结构中手动验证分配备注3退火是在青色中进行的。结构和约束备注3 XPLOR-NIH进口的氰化物用于水的净化。,备注3初始结构集合由半自动计算备注CYANA的3个NOESY分配。任务是手动完成的备注3在火花和最终结构退火中进行了验证用蓝绿色备注3。蓝藻的结构和限制因素被引入请注意3 XPLOR-NIH,以获得净水。备注4备注4 5B7A符合格式V.3.30,2011年7月13日备注100备注100本条目已由PDBJ于2016年6月10日处理。备注100存款ID为D_1300000658。备注210备注210实验细节备注210实验类型:核磁共振备注210温度(开尔文):290备注210 PH:6.5备注210离子强度:100 MM KCL备注210压力:环境大气备注210样品含量:1 MM[U-100%13C;U-100%15N]备注210 SUMO1 K37AC,10毫米钾备注210磷酸盐,100 MM钾备注210氯化物,2 MM DTT,0.1 MM EDTA,备注210 0.001%叠氮化钠,90%水/10%备注210 D2O;1毫米[U-100%15N]SUMO1备注210 K37AC,10mm磷酸钾,备注210 100 MM氯化钾,2 MM备注210 DTT,0.1 MM EDTA,0.001%钠备注210 AZIDE,90%H2O/10%D2O;1毫米[U-备注210 100%15N]SUMO1 K37AC,10 MM备注210磷酸钾,100 MM备注210氯化钾,2毫米DTT,备注210 0.1 MM EDTA,0.001%钠备注210 AZIDE,10 MG/ML PF1噬菌体,90%备注210 H2O/10%D2O;1 MM SUMO1 K37AC,备注210 10 MM磷酸钾,100备注210 MM氯化钾,2 MM DTT,备注210 0.1 MM EDTA,0.001%钠备注210叠氮,90%H2O/10%D2O备注210备注210进行的核磁共振实验:2D 1H-15N HSQC;2D 1H-13C HSQC;备注210 3D HNCO;3D HNCA;3D HN(CO)CA;备注210 3D HNCACB;3D CBCA(CO)NH;三维备注210 HCCH-TOCSY;3D HCCH-COSY;三维备注210 HBHA(CO)NH;2D-HBCBCGCDHD;二维-备注210 HBCBCGCDCEHE;3D 1H~15N托西;备注210 2D 1H-1H NOESY;3D 1H-15N NOESY;备注210 3D 1H-13C NOESY;二维1H-15N HSQC备注210 IPAP;2D NOESY F1滤波;二维备注210噪声F2已过滤;二维NOESY F1/备注210 F2已过滤;二维TOCSY F1/F2备注210已过滤备注210光谱仪场强:500mhz;600兆赫;800兆赫;850备注210 MHZ备注210光谱仪型号:AVANCE;AVANCE三备注210光谱仪制造商:布鲁克备注210备注210结构测定。备注210使用的软件:CYANA、TOPSPIN 3.2、SPARKY 3.113备注210使用的方法:扭角动力学,DGSA-备注210模拟距离几何备注210退火备注210备注210符合项,计算数量:400备注210符合项,提交数量:20备注210符合性,选择标准:最低的结构备注210能源备注210备注210本系列中最具代表性的一致性:1备注210备注210备注:核磁共振数据是在295K使用SHIGEMI核磁共振管采集的。备注215备注215核磁共振研究注释215本条目中的坐标是由解生成的备注215核磁共振数据。蛋白质数据库公约要求备注215晶体1和秤记录,但在备注215这些记录毫无意义。备注300备注300生物分子:1备注300有关作者提供的和/或程序,请参阅备注350备注300中生成的结构装配信息备注300此条目。备注还可能提供有关备注300埋地面积。备注350注释350表示已知的完整多聚体的坐标备注350生物意义上的齐聚状态备注350应用生物转化可以生成分子记住下面给出的350。非晶态和备注:给出了350个晶体分析操作。备注350备注350生物分子:1备注350作者确定的生物单位:单体备注350将以下内容应用于链条:A备注350生物1 1.0000000.000000 0.000000 0.00000 0.00000备注350 BIOMT2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000备注350生物3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000备注465备注465缺失残留物备注465以下残留物不在备注465实验。(RES=剩余名称;C=链标识符;备注465 SSSEQ=序列号;I=插入代码。)备注465型号1-20备注465 RES C SSSEQI备注465 MET A-13备注465 GLY A-12备注465 SER A-11备注465 sera-10备注465 HIS A-9备注465 HIS A-8备注465 HIS A-7备注465 HIS A-6备注465 HIS A-5备注465他的A-4备注465 SER A-3备注465 GLN A-2备注465 ASP A-1备注465 PRO A 0备注500评论500几何学和立体化学备注500副标题:密切接触者备注500备注500以下原子紧密接触。备注500备注500 ATM1 RES C SSEQI ATM2 RES S C SSEQUI距离备注500 HZ2 LYS A 48 OD1 ASP A 73 1.56备注500备注500备注:空备注500评论500几何学和立体化学备注500主题:扭转角备注500在预期的拉马钱德兰区域外标注500个扭转角:备注500(M=型号;RES=剩余名称;C=链标识符;备注500 SSEQ=序列号;I=插入代码)。备注500备注500标准表:备注500格式:(10X,I3,1X,A3,1X,A1,I4,A1,4X,F7.2,3X,F7.2)备注500备注500个预期值:GJ KLEYWEGT和TA JONES(1996)。PHI/PSI-记下500首合唱:拉马钱德朗重审。结构4,1395-1400备注500备注500米分辨率CSSEQI PSI PHI备注500 1 ALA 72 77.08-102.12备注500 1 ASN A 74-31.48-151.11备注500 1 GLU A 83-159.96-146.61备注500 1 GLU A 93 136.01 179.95备注500 2 ASP A 15-53.90-124.17备注500 2 VAL A 38-167.21-109.66备注500 2 ASP A 73 22.48 45.77备注500 2 ASN A 74-14.40-147.51备注500 2 GLU A 93 130.16 177.74备注500 3 SER A 2 8.48-152.72备注500 3 GLN A 4 179.20-57.92备注500 3 PRO A 8-160.27-66.96备注500 3 GLU A 67 29.67 49.99备注500 3 ALA 72 77.12-108.44备注500 3 ASN A 74-39.99-153.86备注500 3 GLU A 93 116.69-178.86备注500 4 PRO A 8-158.98-70.03备注500 4 ASP A 15-71.78-109.96备注500 4 ASN A 74-24.50-149.65备注500 4 GLU A 93 105.30-167.81备注500 5 ASP A 3-23.41 71.37备注500 5 PRO A 8-173.98-69.67备注500 5 ALA 72 76.86-104.18备注500 5 ASN A 74-25.70-153.42备注500 5 GLU A 83-157.73-144.41备注500 5 GLU A 93 115.69-178.55备注500 6 PRO A 8-157.34-78.40备注500 6 THR A 10 47.26-87.74备注500 6 ASP A 15-41.38 80.51备注500 6 ASP A 73 23.96 48.48备注500 6 ASN A 74-21.84-148.98备注500 6 GLU A 93 140.83-172.45备注500 7 PRO A 8-75.98-61.67备注500 7 THR A 10 23.47 40.76备注500 7 ASP A 12-85.89-128.93备注500 7 GLU A 67 28.44 48.15备注500 7 ALA 72 75.19-102.26备注500 7 ASP A 73 24.66 46.85备注500 7 ASN A 74-20.33-148.57备注500 7 GLU A 93 124.06-173.71备注500 8 PRO A 8-80.82-60.47备注500 8 SER A 9 87.82 64.92备注500 8 GLU A 67 28.76 47.99备注500 8 ALA A 72 77.99-102.17备注500 8 ASP A 73 29.37 42.40备注500 8 ASN A 74-24.28-148.78备注500 8 GLU A 83-159.98-136.18备注500 8 GLU A 93 123.85-173.91备注500 9 ASP A 73 21.73 48.73备注500 9 ASN A 74-18.74-146.77备注500请注意500,此入口有122个拉马钱德兰出口。备注500备注500备注:空备注900备注900个相关条目备注900相关ID:2N1V相关DB:PDB备注900相关ID:25576相关DB:BMRB备注900相关ID:36000相关DB:BMRBDBREF 5B7A A 1 97 UNP P63165 SUMO1_人类1 97SEQADV 5B7A MET A-13 UNP P63165引发蛋氨酸SEQADV 5B7A GLY A-12 UNP P63165表达标签SEQADV 5B7A SER A-11 UNP P63165表达标签SEQADV 5B7A SER A-10 UNP P63165表达标签SEQADV 5B7A HIS A-9 UNP P63165表达标签SEQADV 5B7A HIS A-8 UNP P63165表达标签SEQADV 5B7A HIS A-7 UNP P63165表达标签SEQADV 5B7A HIS A-6 UNP P63165表达标签SEQADV 5B7A HIS A-5 UNP P63165表达标签SEQADV 5B7A HIS A-4 UNP P63165表达标签SEQADV 5B7A SER A-3 UNP P63165表达标签SEQADV 5B7A GLN A-2 UNP P63165表达标签SEQADV 5B7A ASP A-1 UNP P63165表达标签SEQADV 5B7A PRO A 0 UNP P63165表达标签序列1一个111遇到GLY SER SER HIS HIS HIS SER GLN ASPSEQRES 2 A 111 PRO MET SER ASP GLN GLU ALA LYS PRO SER THR GLU ASP序列3 A 111 LEU GLY ASP LYS LYS GLU GLY GLU TYR ILE LYS LEU LYS序列4 A 111 VAL ILE GLY GLN ASP SER SER GLU ILE HIS PHE ALY VAL第5集111个LYS通过他的LEU LYS LYS LEU LYS GLU SER TYR遇见了他序列6 A 111 CYS GLN ARG GLN GLY VAL PRO MET ASN SER LEU ARG PHE序列7 A 111 LEU PHE GLU GLY GLN ARG ILE ALA ASP ASN HIS THR PROSEQRES 8 A 111 LYS GLU LEU GLY遇到GLU GLU GLU ASP-VAL ILE GLU-VAL序列9 A 111轮胎GLN GLU GLN THR GLYMODRES 5B7A ALY A 37 LYS改性残渣HET ALY A 37 26号海坦ALY N(6)-乙酰水杨酸配方1 ALY C8 H16 N2 O3螺旋1 AA1 LEU A 44 GLY A 56 1 13表1 AA1 5 GLU A 33 LYS A 39 0表2 AA1 5 TYR A 21 GLY A 28-1 N ILE A 22 O VAL A 38表3 AA1 5 VAL A 87 GLN A 92 1 O VAL A 90 N ILE A 27表4 AA1 5 LEU A 62 PHE A 66-1 N LEU A 65 O GLU A 89表5 AA1 5 GLN A 69 ILE A 71-1 O ILE A 71N PHE A 64链路C PHE A 36 N ALY A 37 1555 1555 1.31链路C ALY A 37 N VAL A 38 1555 1555 1.30晶体1 1.000 1.000 1.00090.00 90.00 90.00P 1原始X1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 0.00000ORIGX2 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 0.00000ORIGX3 0.000000 0.000000 1.0000000.00000比例尺1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 0.00000比例尺2 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000比例尺3 0.000000 0.000000 1.0000000.00000型号1